RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000459758.5

TTLL3-222, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 3, human

TSL 4

Gene TTLL3, Length 555 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTLL3-222	ENST00000459758	TEX13B	Q9BXU2	312 aa		12.52	□□□□□ -0.41
TTLL3-222	ENST00000459758	ACAD9	Q9H845	621 aa		12.52	□□□□□ -0.41
TTLL3-222	ENST00000459758	ABCB6	Q9NP58	842 aa		12.52	□□□□□ -0.41
TTLL3-222	ENST00000459758	RNF146	Q9NTX7	359 aa		12.52	□□□□□ -0.41
TTLL3-222	ENST00000459758	HDAC6	Q9UBN7	1215 aa		12.52	□□□□□ -0.41
TTLL3-222	ENST00000459758	HACL1	Q9UJ83	578 aa		12.52	□□□□□ -0.41
TTLL3-222	ENST00000459758	SBF1	O95248	1867 aa		12.51	□□□□□ -0.41
TTLL3-222	ENST00000459758	DOCK5	Q9H7D0	1870 aa		12.51	□□□□□ -0.41
TTLL3-222	ENST00000459758	POLR2A	P24928	1970 aa	Known RBP	12.51	□□□□□ -0.41
TTLL3-222	ENST00000459758		A0A087X0T9	212 aa		12.51	□□□□□ -0.41
TTLL3-222	ENST00000459758		F8VZ95	297 aa		12.51	□□□□□ -0.41
TTLL3-222	ENST00000459758	OPA1	O60313	960 aa		12.51	□□□□□ -0.41
TTLL3-222	ENST00000459758	DGAT1	O75907	488 aa		12.51	□□□□□ -0.41
TTLL3-222	ENST00000459758	SEC31A	O94979	1220 aa	Known RBP	12.51	□□□□□ -0.41
TTLL3-222	ENST00000459758	TMEM253	P0C7T8	217 aa		12.51	□□□□□ -0.41
TTLL3-222	ENST00000459758	FAM228B	P0C875	321 aa		12.51	□□□□□ -0.41
TTLL3-222	ENST00000459758	HSPA6	P17066	643 aa		12.51	□□□□□ -0.41
TTLL3-222	ENST00000459758	TNFAIP3	P21580	790 aa		12.51	□□□□□ -0.41
TTLL3-222	ENST00000459758	DSG3	P32926	999 aa		12.51	□□□□□ -0.41
TTLL3-222	ENST00000459758	NOP2	P46087	812 aa	Known RBP	12.51	□□□□□ -0.41
TTLL3-222	ENST00000459758	AARS	P49588	968 aa	Known RBP eCLIP	12.51	□□□□□ -0.41
TTLL3-222	ENST00000459758	GMPS	P49915	693 aa	Predicted RBP	12.51	□□□□□ -0.41
TTLL3-222	ENST00000459758	CYP2J2	P51589	502 aa		12.51	□□□□□ -0.41
TTLL3-222	ENST00000459758	VAMP7	P51809	220 aa		12.51	□□□□□ -0.41
TTLL3-222	ENST00000459758	UBXN2A	P68543	259 aa		12.51	□□□□□ -0.41
TTLL3-222	ENST00000459758	PAK2	Q13177	524 aa		12.51	□□□□□ -0.41
TTLL3-222	ENST00000459758	XKR9	Q5GH70	373 aa		12.51	□□□□□ -0.41
TTLL3-222	ENST00000459758	HAUS6	Q7Z4H7	955 aa		12.51	□□□□□ -0.41
TTLL3-222	ENST00000459758	NOA1	Q8NC60	698 aa	Known RBP	12.51	□□□□□ -0.41
TTLL3-222	ENST00000459758	CHST13	Q8NET6	341 aa		12.51	□□□□□ -0.41
TTLL3-222	ENST00000459758	COG1	Q8WTW3	980 aa		12.51	□□□□□ -0.41
TTLL3-222	ENST00000459758	KCNN1	Q92952	543 aa		12.51	□□□□□ -0.41
TTLL3-222	ENST00000459758	FIZ1	Q96SL8	496 aa		12.51	□□□□□ -0.41
TTLL3-222	ENST00000459758	RUFY1	Q96T51	708 aa		12.51	□□□□□ -0.41
TTLL3-222	ENST00000459758	INTS2	Q9H0H0	1204 aa	Known RBP	12.51	□□□□□ -0.41
TTLL3-222	ENST00000459758	MLXIP	Q9HAP2	919 aa		12.51	□□□□□ -0.41
TTLL3-222	ENST00000459758	RAVER2	Q9HCJ3	691 aa	Known RBP	12.51	□□□□□ -0.41
TTLL3-222	ENST00000459758	STIM2	Q9P246	746 aa		12.51	□□□□□ -0.41
TTLL3-222	ENST00000459758	DNAJC12	Q9UKB3	198 aa		12.51	□□□□□ -0.41
TTLL3-222	ENST00000459758	ADAMTS5	Q9UNA0	930 aa		12.51	□□□□□ -0.41
TTLL3-222	ENST00000459758	NCAN	O14594	1321 aa		12.51	□□□□□ -0.41
TTLL3-222	ENST00000459758	SSC5D	A1L4H1	1573 aa		12.51	□□□□□ -0.41
TTLL3-222	ENST00000459758	TESPA1	A2RU30	521 aa	Predicted RBP	12.5	□□□□□ -0.41
TTLL3-222	ENST00000459758	ZC3H11A	O75152	810 aa	Known RBP eCLIP	12.5	□□□□□ -0.41
TTLL3-222	ENST00000459758	PALM	O75781	387 aa		12.5	□□□□□ -0.41
TTLL3-222	ENST00000459758	MYCL	P12524	364 aa	Predicted RBP	12.5	□□□□□ -0.41
TTLL3-222	ENST00000459758	KLRC1	P26715	233 aa		12.5	□□□□□ -0.41
TTLL3-222	ENST00000459758	TNNT3	P45378	269 aa	Predicted RBP	12.5	□□□□□ -0.41
TTLL3-222	ENST00000459758	CASP4	P49662	377 aa		12.5	□□□□□ -0.41
TTLL3-222	ENST00000459758	MFAP3	P55082	362 aa		12.5	□□□□□ -0.41
TTLL3-222	ENST00000459758	HADHB	P55084	474 aa	Known RBP	12.5	□□□□□ -0.41
TTLL3-222	ENST00000459758	MRPS9	P82933	396 aa	Known RBP	12.5	□□□□□ -0.41
TTLL3-222	ENST00000459758	ARID5A	Q03989	594 aa		12.5	□□□□□ -0.41
TTLL3-222	ENST00000459758	MAPK7	Q13164	816 aa		12.5	□□□□□ -0.41
TTLL3-222	ENST00000459758	KIF22	Q14807	665 aa		12.5	□□□□□ -0.41
TTLL3-222	ENST00000459758	TCEAL1	Q15170	157 aa		12.5	□□□□□ -0.41
TTLL3-222	ENST00000459758	ALS2CL	Q60I27	953 aa		12.5	□□□□□ -0.41
TTLL3-222	ENST00000459758	MIS18BP1	Q6P0N0	1132 aa		12.5	□□□□□ -0.41
TTLL3-222	ENST00000459758	NSMF	Q6X4W1	530 aa		12.5	□□□□□ -0.41
TTLL3-222	ENST00000459758	CCNI2	Q6ZMN8	369 aa	Predicted RBP	12.5	□□□□□ -0.41
TTLL3-222	ENST00000459758	VSIG10L	Q86VR7	867 aa		12.5	□□□□□ -0.41
TTLL3-222	ENST00000459758	ACTRT1	Q8TDG2	376 aa		12.5	□□□□□ -0.41
TTLL3-222	ENST00000459758	TMC2	Q8TDI7	906 aa		12.5	□□□□□ -0.41
TTLL3-222	ENST00000459758	RFFL	Q8WZ73	363 aa		12.5	□□□□□ -0.41
TTLL3-222	ENST00000459758	UIMC1	Q96RL1	719 aa		12.5	□□□□□ -0.41
TTLL3-222	ENST00000459758	NTPCR	Q9BSD7	190 aa	Known RBP	12.5	□□□□□ -0.41
TTLL3-222	ENST00000459758	TLR10	Q9BXR5	811 aa		12.5	□□□□□ -0.41
TTLL3-222	ENST00000459758	SIX2	Q9NPC8	291 aa		12.5	□□□□□ -0.41
TTLL3-222	ENST00000459758	SUCLA2	Q9P2R7	463 aa	Predicted RBP	12.5	□□□□□ -0.41
TTLL3-222	ENST00000459758	AMFR	Q9UKV5	643 aa		12.5	□□□□□ -0.41
TTLL3-222	ENST00000459758	DUSP10	Q9Y6W6	482 aa		12.5	□□□□□ -0.41
TTLL3-222	ENST00000459758	IGSF9B	Q9UPX0	1349 aa		12.5	□□□□□ -0.41
TTLL3-222	ENST00000459758	GOLGA6L10	A0A0M3HER8	536 aa		12.49	□□□□□ -0.41
TTLL3-222	ENST00000459758	ANKRD62	A6NC57	917 aa		12.49	□□□□□ -0.41
TTLL3-222	ENST00000459758	SFI1	A8K8P3	1242 aa		12.49	□□□□□ -0.41
TTLL3-222	ENST00000459758	MIF4GD	A9UHW6	222 aa	Known RBP	12.49	□□□□□ -0.41
TTLL3-222	ENST00000459758	DDX39A	O00148	427 aa	Known RBP	12.49	□□□□□ -0.41
TTLL3-222	ENST00000459758	NFKBIE	O00221	500 aa		12.49	□□□□□ -0.41
TTLL3-222	ENST00000459758	EVI5	O60447	810 aa		12.49	□□□□□ -0.41
TTLL3-222	ENST00000459758	NR3C2	P08235	984 aa		12.49	□□□□□ -0.41
TTLL3-222	ENST00000459758	PTPRA	P18433	802 aa		12.49	□□□□□ -0.41
TTLL3-222	ENST00000459758	EIF2AK2	P19525	551 aa	Known RBP	12.49	□□□□□ -0.41
TTLL3-222	ENST00000459758	GART	P22102	1010 aa		12.49	□□□□□ -0.41
TTLL3-222	ENST00000459758	SPP2	Q13103	211 aa		12.49	□□□□□ -0.41
TTLL3-222	ENST00000459758	ITGB3BP	Q13352	177 aa	Predicted RBP	12.49	□□□□□ -0.41
TTLL3-222	ENST00000459758	CUL1	Q13616	776 aa		12.49	□□□□□ -0.41
TTLL3-222	ENST00000459758	DRAP1	Q14919	205 aa	Predicted RBP	12.49	□□□□□ -0.41
TTLL3-222	ENST00000459758	ZC2HC1C	Q53FD0	456 aa	Predicted RBP	12.49	□□□□□ -0.41
TTLL3-222	ENST00000459758	BRDT	Q58F21	947 aa	Predicted RBP	12.49	□□□□□ -0.41
TTLL3-222	ENST00000459758	SNRNP48	Q6IEG0	339 aa	Known RBP	12.49	□□□□□ -0.41
TTLL3-222	ENST00000459758	DPY19L2P1	Q6NXN4	242 aa		12.49	□□□□□ -0.41
TTLL3-222	ENST00000459758	ZNF571	Q7Z3V5	609 aa	Predicted RBP	12.49	□□□□□ -0.41
TTLL3-222	ENST00000459758	PEX26	Q7Z412	305 aa		12.49	□□□□□ -0.41
TTLL3-222	ENST00000459758	CCDC26	Q8TAB7	109 aa		12.49	□□□□□ -0.41
TTLL3-222	ENST00000459758	WHAMM	Q8TF30	809 aa		12.49	□□□□□ -0.41
TTLL3-222	ENST00000459758	DHX38	Q92620	1227 aa	Known RBP	12.49	□□□□□ -0.41
TTLL3-222	ENST00000459758	CAVIN3	Q969G5	261 aa		12.49	□□□□□ -0.41
TTLL3-222	ENST00000459758	CCDC102A	Q96A19	550 aa		12.49	□□□□□ -0.41
TTLL3-222	ENST00000459758	RUNDC3B	Q96NL0	473 aa		12.49	□□□□□ -0.41
TTLL3-222	ENST00000459758	INPP4A	Q96PE3	977 aa	Predicted RBP	12.49	□□□□□ -0.41

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