RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000459627.1

SH3BP5-208, Transcript of SH3 domain binding protein 5, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP5, Length 473 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP5-208ENST00000459627 ECM1Q16610 540 aa26.64■■□□□ 1.86
SH3BP5-208ENST00000459627 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP26.64■■□□□ 1.86
SH3BP5-208ENST00000459627 CATSPER4Q7RTX7 472 aa26.64■■□□□ 1.86
SH3BP5-208ENST00000459627 ECHDC2Q86YB7 292 aa26.64■■□□□ 1.86
SH3BP5-208ENST00000459627 ZNF710Q8N1W2 664 aa26.64■■□□□ 1.86
SH3BP5-208ENST00000459627 ASAP3Q8TDY4 903 aa26.64■■□□□ 1.86
SH3BP5-208ENST00000459627 CLP1Q92989 425 aaKnown RBP26.64■■□□□ 1.86
SH3BP5-208ENST00000459627 TUFT1Q9NNX1 390 aa26.64■■□□□ 1.86
SH3BP5-208ENST00000459627 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP26.64■■□□□ 1.86
SH3BP5-208ENST00000459627 FOXD4L1Q9NU39 408 aa26.64■■□□□ 1.86
SH3BP5-208ENST00000459627 TMEM161AQ9NX61 479 aa26.64■■□□□ 1.86
SH3BP5-208ENST00000459627 THEGQ9P2T0 379 aa26.64■■□□□ 1.86
SH3BP5-208ENST00000459627 PPME1Q9Y570 386 aa26.64■■□□□ 1.86
SH3BP5-208ENST00000459627 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP26.64■■□□□ 1.86
SH3BP5-208ENST00000459627 PP2D1A8MPX8 630 aa26.63■■□□□ 1.85
SH3BP5-208ENST00000459627 CDC42EP1Q00587 391 aa26.63■■□□□ 1.85
SH3BP5-208ENST00000459627 FERMT3Q86UX7 667 aa26.63■■□□□ 1.85
SH3BP5-208ENST00000459627 RNF149Q8NC42 400 aa26.63■■□□□ 1.85
SH3BP5-208ENST00000459627 IL27Q8NEV9 243 aa26.63■■□□□ 1.85
SH3BP5-208ENST00000459627 GPRC5CQ9NQ84 441 aa26.63■■□□□ 1.85
SH3BP5-208ENST00000459627 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP26.63■■□□□ 1.85
SH3BP5-208ENST00000459627 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP26.62■■□□□ 1.85
SH3BP5-208ENST00000459627 CUL4AQ13619 759 aa26.62■■□□□ 1.85
SH3BP5-208ENST00000459627 SPOUT1Q5T280 376 aaKnown RBP26.62■■□□□ 1.85
SH3BP5-208ENST00000459627 EXOC8Q8IYI6 725 aa26.62■■□□□ 1.85
SH3BP5-208ENST00000459627 TCP11Q8WWU5 503 aa26.62■■□□□ 1.85
SH3BP5-208ENST00000459627 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP26.62■■□□□ 1.85
SH3BP5-208ENST00000459627 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP26.62■■□□□ 1.85
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SH3BP5-208ENST00000459627 CUL9Q8IWT3 2517 aa26.62■■□□□ 1.85
SH3BP5-208ENST00000459627 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP26.61■■□□□ 1.85
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SH3BP5-208ENST00000459627 LPPQ93052 612 aa26.61■■□□□ 1.85
SH3BP5-208ENST00000459627 MRPL38Q96DV4 380 aaKnown RBP26.61■■□□□ 1.85
SH3BP5-208ENST00000459627 POLD4Q9HCU8 107 aa26.61■■□□□ 1.85
SH3BP5-208ENST00000459627 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP26.61■■□□□ 1.85
SH3BP5-208ENST00000459627 LRWD1Q9UFC0 647 aa26.61■■□□□ 1.85
SH3BP5-208ENST00000459627 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP26.61■■□□□ 1.85
SH3BP5-208ENST00000459627 MYO7AQ13402 2215 aa26.6■■□□□ 1.85
SH3BP5-208ENST00000459627 C5orf67F2Z3F1 127 aa26.6■■□□□ 1.85
SH3BP5-208ENST00000459627 CDC25AP30304 524 aa26.6■■□□□ 1.85
SH3BP5-208ENST00000459627 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP26.6■■□□□ 1.85
SH3BP5-208ENST00000459627 CLLU1OSQ5K130 101 aa26.6■■□□□ 1.85
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SH3BP5-208ENST00000459627 ERMNQ8TAM6 284 aa26.6■■□□□ 1.85
SH3BP5-208ENST00000459627 CASD1Q96PB1 797 aa26.6■■□□□ 1.85
SH3BP5-208ENST00000459627 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP26.6■■□□□ 1.85
SH3BP5-208ENST00000459627 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP26.6■■□□□ 1.85
SH3BP5-208ENST00000459627 ELAC1Q9H777 363 aaKnown RBP26.6■■□□□ 1.85
SH3BP5-208ENST00000459627 ATG2AQ2TAZ0 1938 aa26.6■■□□□ 1.85
SH3BP5-208ENST00000459627 DGAT1O75907 488 aa26.59■■□□□ 1.85
SH3BP5-208ENST00000459627 DNAJB1P25685 340 aa26.59■■□□□ 1.85
SH3BP5-208ENST00000459627 RPA1P27694 616 aa26.59■■□□□ 1.85
SH3BP5-208ENST00000459627 CAPSQ13938 189 aa26.59■■□□□ 1.85
SH3BP5-208ENST00000459627 KLHL23Q8NBE8 558 aa26.59■■□□□ 1.85
SH3BP5-208ENST00000459627 HELQQ8TDG4 1101 aa26.59■■□□□ 1.85
SH3BP5-208ENST00000459627 NACC1Q96RE7 527 aa26.59■■□□□ 1.85
SH3BP5-208ENST00000459627 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP26.59■■□□□ 1.85
SH3BP5-208ENST00000459627 RWDD3Q9Y3V2 267 aa26.59■■□□□ 1.85
SH3BP5-208ENST00000459627 XIRP2A4UGR9 3374 aa26.58■■□□□ 1.85
SH3BP5-208ENST00000459627 A0A0U1RQF3 1178 aa26.58■■□□□ 1.85
SH3BP5-208ENST00000459627 MEIS3P2A8K0S8 358 aa26.58■■□□□ 1.85
SH3BP5-208ENST00000459627 GAS2O43903 313 aaKnown RBP26.58■■□□□ 1.85
SH3BP5-208ENST00000459627 ITGB1P05556 798 aa26.58■■□□□ 1.85
SH3BP5-208ENST00000459627 RB1P06400 928 aa26.58■■□□□ 1.85
SH3BP5-208ENST00000459627 GLRA2P23416 452 aa26.58■■□□□ 1.85
SH3BP5-208ENST00000459627 ARL2P36404 184 aa26.58■■□□□ 1.85
SH3BP5-208ENST00000459627 PTPROQ16827 1216 aa26.58■■□□□ 1.85
SH3BP5-208ENST00000459627 LRRC55Q6ZSA7 311 aa26.58■■□□□ 1.85
SH3BP5-208ENST00000459627 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP26.58■■□□□ 1.85
SH3BP5-208ENST00000459627 SNX29Q8TEQ0 813 aa26.58■■□□□ 1.85
SH3BP5-208ENST00000459627 CWH43Q9H720 699 aa26.58■■□□□ 1.85
SH3BP5-208ENST00000459627 PLAGL2Q9UPG8 496 aa26.58■■□□□ 1.85
SH3BP5-208ENST00000459627 VCANP13611 3396 aa26.57■■□□□ 1.84
SH3BP5-208ENST00000459627 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP26.57■■□□□ 1.84
SH3BP5-208ENST00000459627 PBX3P40426 434 aa26.57■■□□□ 1.84
SH3BP5-208ENST00000459627 PHKA2P46019 1235 aa26.57■■□□□ 1.84
SH3BP5-208ENST00000459627 RILPL1Q5EBL4 403 aa26.57■■□□□ 1.84
SH3BP5-208ENST00000459627 TCEAL5Q5H9L2 206 aa26.57■■□□□ 1.84
SH3BP5-208ENST00000459627 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa26.57■■□□□ 1.84
SH3BP5-208ENST00000459627 TMEM117Q9H0C3 514 aa26.57■■□□□ 1.84
SH3BP5-208ENST00000459627 CHST12Q9NRB3 414 aa26.57■■□□□ 1.84
SH3BP5-208ENST00000459627 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa26.57■■□□□ 1.84
SH3BP5-208ENST00000459627 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP26.57■■□□□ 1.84
SH3BP5-208ENST00000459627 KIAA1024Q9UPX6 916 aa26.57■■□□□ 1.84
SH3BP5-208ENST00000459627 ARHGEF35A5YM69 484 aa26.56■■□□□ 1.84
SH3BP5-208ENST00000459627 ASAP2O43150 1006 aa26.56■■□□□ 1.84
SH3BP5-208ENST00000459627 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP26.56■■□□□ 1.84
SH3BP5-208ENST00000459627 KCNQ1P51787 676 aa26.56■■□□□ 1.84
SH3BP5-208ENST00000459627 CAMK1Q14012 370 aa26.56■■□□□ 1.84
SH3BP5-208ENST00000459627 IGSF22Q8N9C0 903 aa26.56■■□□□ 1.84
SH3BP5-208ENST00000459627 CPB2Q96IY4 423 aa26.56■■□□□ 1.84
SH3BP5-208ENST00000459627 ASB2Q96Q27 587 aa26.56■■□□□ 1.84
SH3BP5-208ENST00000459627 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP26.56■■□□□ 1.84
SH3BP5-208ENST00000459627 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP26.56■■□□□ 1.84
SH3BP5-208ENST00000459627 DACT1Q9NYF0 836 aa26.56■■□□□ 1.84
SH3BP5-208ENST00000459627 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa26.56■■□□□ 1.84
SH3BP5-208ENST00000459627 PLXNA4Q9HCM2 1894 aa26.55■■□□□ 1.84
SH3BP5-208ENST00000459627 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa26.55■■□□□ 1.84
SH3BP5-208ENST00000459627 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP26.55■■□□□ 1.84
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