RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000459482.1

SNORD11.1-201, Transcript of small nucleolar RNA, C/D box 11, humanhuman

BASIC

Gene SNORD11, Length 85 nt, Biotype snoRNA, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNORD11.1-201ENST00000459482 WDR92Q96MX6 357 aa6.65□□□□□ -1.34
SNORD11.1-201ENST00000459482 GPHA2Q96T91 129 aa6.65□□□□□ -1.34
SNORD11.1-201ENST00000459482 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
SNORD11.1-201ENST00000459482 VTA1Q9NP79 307 aa6.65□□□□□ -1.34
SNORD11.1-201ENST00000459482 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
SNORD11.1-201ENST00000459482 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP6.65□□□□□ -1.34
SNORD11.1-201ENST00000459482 TMPRSS11EQ9UL52 423 aa6.65□□□□□ -1.34
SNORD11.1-201ENST00000459482 JAG2Q9Y219 1238 aa6.65□□□□□ -1.34
SNORD11.1-201ENST00000459482 MYPNQ86TC9 1320 aa6.65□□□□□ -1.35
SNORD11.1-201ENST00000459482 KDM1AO60341 852 aa6.64□□□□□ -1.35
SNORD11.1-201ENST00000459482 PFKMP08237 780 aa6.64□□□□□ -1.35
SNORD11.1-201ENST00000459482 POU3F3P20264 500 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
SNORD11.1-201ENST00000459482 ADCY7P51828 1080 aa6.64□□□□□ -1.35
SNORD11.1-201ENST00000459482 Q6ZSN1 163 aa6.64□□□□□ -1.35
SNORD11.1-201ENST00000459482 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
SNORD11.1-201ENST00000459482 CLEC14AQ86T13 490 aa6.64□□□□□ -1.35
SNORD11.1-201ENST00000459482 LYSMD2Q8IV50 215 aa6.64□□□□□ -1.35
SNORD11.1-201ENST00000459482 CMIPQ8IY22 773 aa6.64□□□□□ -1.35
SNORD11.1-201ENST00000459482 FERMT2Q96AC1 680 aa6.64□□□□□ -1.35
SNORD11.1-201ENST00000459482 KLC2Q9H0B6 622 aa6.64□□□□□ -1.35
SNORD11.1-201ENST00000459482 IFT22Q9H7X7 185 aa6.64□□□□□ -1.35
SNORD11.1-201ENST00000459482 USP18Q9UMW8 372 aa6.64□□□□□ -1.35
SNORD11.1-201ENST00000459482 EDARQ9UNE0 448 aa6.64□□□□□ -1.35
SNORD11.1-201ENST00000459482 VWA7Q9Y334 891 aa6.64□□□□□ -1.35
SNORD11.1-201ENST00000459482 SLC26A4O43511 780 aa6.63□□□□□ -1.35
SNORD11.1-201ENST00000459482 RAD17O75943 681 aa6.63□□□□□ -1.35
SNORD11.1-201ENST00000459482 INSRRP14616 1297 aa6.63□□□□□ -1.35
SNORD11.1-201ENST00000459482 MANFP55145 182 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
SNORD11.1-201ENST00000459482 BPIFB4P59827 614 aa6.63□□□□□ -1.35
SNORD11.1-201ENST00000459482 FOXL1Q12952 345 aa6.63□□□□□ -1.35
SNORD11.1-201ENST00000459482 TCIRG1Q13488 830 aa6.63□□□□□ -1.35
SNORD11.1-201ENST00000459482 RIN1Q13671 783 aa6.63□□□□□ -1.35
SNORD11.1-201ENST00000459482 TRIM25Q14258 630 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
SNORD11.1-201ENST00000459482 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
SNORD11.1-201ENST00000459482 CT83Q5H943 113 aa6.63□□□□□ -1.35
SNORD11.1-201ENST00000459482 ANKRD53Q8N9V6 530 aa6.63□□□□□ -1.35
SNORD11.1-201ENST00000459482 SHCBP1Q8NEM2 672 aa6.63□□□□□ -1.35
SNORD11.1-201ENST00000459482 TTC1Q99614 292 aa6.63□□□□□ -1.35
SNORD11.1-201ENST00000459482 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
SNORD11.1-201ENST00000459482 DEF6Q9H4E7 631 aa6.63□□□□□ -1.35
SNORD11.1-201ENST00000459482 H2AFYO75367 372 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
SNORD11.1-201ENST00000459482 EYA4O95677 639 aa6.62□□□□□ -1.35
SNORD11.1-201ENST00000459482 SOX5P35711 763 aa6.62□□□□□ -1.35
SNORD11.1-201ENST00000459482 STAT4Q14765 748 aa6.62□□□□□ -1.35
SNORD11.1-201ENST00000459482 TAF7LQ5H9L4 462 aa6.62□□□□□ -1.35
SNORD11.1-201ENST00000459482 CCDC62Q6P9F0 684 aa6.62□□□□□ -1.35
SNORD11.1-201ENST00000459482 GAREM2Q75VX8 874 aa6.62□□□□□ -1.35
SNORD11.1-201ENST00000459482 PIK3C3Q8NEB9 887 aa6.62□□□□□ -1.35
SNORD11.1-201ENST00000459482 GCDHQ92947 438 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
SNORD11.1-201ENST00000459482 DVL3Q92997 716 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
SNORD11.1-201ENST00000459482 GFM2Q969S9 779 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
SNORD11.1-201ENST00000459482 SLC7A6OSQ96CW6 309 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
SNORD11.1-201ENST00000459482 C1QTNF3Q9BXJ4 246 aa6.62□□□□□ -1.35
SNORD11.1-201ENST00000459482 USP36Q9P275 1121 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
SNORD11.1-201ENST00000459482 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
SNORD11.1-201ENST00000459482 TOX4O94842 621 aa6.61□□□□□ -1.35
SNORD11.1-201ENST00000459482 LPLP06858 475 aa6.61□□□□□ -1.35
SNORD11.1-201ENST00000459482 VIL1P09327 827 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
SNORD11.1-201ENST00000459482 MSX2P35548 267 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
SNORD11.1-201ENST00000459482 CD69Q07108 199 aa6.61□□□□□ -1.35
SNORD11.1-201ENST00000459482 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
SNORD11.1-201ENST00000459482 PITRM1Q5JRX3 1037 aa6.61□□□□□ -1.35
SNORD11.1-201ENST00000459482 LCE5AQ5TCM9 118 aa6.61□□□□□ -1.35
SNORD11.1-201ENST00000459482 ZNF662Q6ZS27 426 aa6.61□□□□□ -1.35
SNORD11.1-201ENST00000459482 FRMD7Q6ZUT3 714 aa6.61□□□□□ -1.35
SNORD11.1-201ENST00000459482 ADGRE4PQ86SQ3 457 aa6.61□□□□□ -1.35
SNORD11.1-201ENST00000459482 RASSF3Q86WH2 238 aa6.61□□□□□ -1.35
SNORD11.1-201ENST00000459482 ZNF808Q8N4W9 903 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
SNORD11.1-201ENST00000459482 PLA2G15Q8NCC3 412 aa6.61□□□□□ -1.35
SNORD11.1-201ENST00000459482 GPR20Q99678 358 aa6.61□□□□□ -1.35
SNORD11.1-201ENST00000459482 SLC6A15Q9H2J7 730 aa6.61□□□□□ -1.35
SNORD11.1-201ENST00000459482 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa6.61□□□□□ -1.35
SNORD11.1-201ENST00000459482 SLC30A1Q9Y6M5 507 aa6.61□□□□□ -1.35
SNORD11.1-201ENST00000459482 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa6.6□□□□□ -1.35
SNORD11.1-201ENST00000459482 RAB11FIP3O75154 756 aa6.6□□□□□ -1.35
SNORD11.1-201ENST00000459482 GAAP10253 952 aa6.6□□□□□ -1.35
SNORD11.1-201ENST00000459482 ACO1P21399 889 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
SNORD11.1-201ENST00000459482 CNGA1P29973 690 aa6.6□□□□□ -1.35
SNORD11.1-201ENST00000459482 SELENOPP49908 381 aa6.6□□□□□ -1.35
SNORD11.1-201ENST00000459482 TMPRSS15P98073 1019 aa6.6□□□□□ -1.35
SNORD11.1-201ENST00000459482 PPARAQ07869 468 aa6.6□□□□□ -1.35
SNORD11.1-201ENST00000459482 SPDYAQ5MJ70 313 aa6.6□□□□□ -1.35
SNORD11.1-201ENST00000459482 KRT26Q7Z3Y9 468 aa6.6□□□□□ -1.35
SNORD11.1-201ENST00000459482 SPRED1Q7Z699 444 aa6.6□□□□□ -1.35
SNORD11.1-201ENST00000459482 SLC41A1Q8IVJ1 513 aa6.6□□□□□ -1.35
SNORD11.1-201ENST00000459482 COG1Q8WTW3 980 aa6.6□□□□□ -1.35
SNORD11.1-201ENST00000459482 RABGGTAQ92696 567 aa6.6□□□□□ -1.35
SNORD11.1-201ENST00000459482 ADOQ96SZ5 270 aa6.6□□□□□ -1.35
SNORD11.1-201ENST00000459482 ING3Q9NXR8 418 aa6.6□□□□□ -1.35
SNORD11.1-201ENST00000459482 PLA2G3Q9NZ20 509 aa6.6□□□□□ -1.35
SNORD11.1-201ENST00000459482 ZC3H11BA0A1B0GUI2 810 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
SNORD11.1-201ENST00000459482 ZEB2O60315 1214 aa6.59□□□□□ -1.35
SNORD11.1-201ENST00000459482 COMTP21964 271 aa6.59□□□□□ -1.35
SNORD11.1-201ENST00000459482 SESN2P58004 480 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
SNORD11.1-201ENST00000459482 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP6.59□□□□□ -1.35
SNORD11.1-201ENST00000459482 GRM7Q14831 915 aa6.59□□□□□ -1.35
SNORD11.1-201ENST00000459482 CDYL2Q8N8U2 506 aa6.59□□□□□ -1.35
SNORD11.1-201ENST00000459482 PPP1R14CQ8TAE6 165 aa6.59□□□□□ -1.35
SNORD11.1-201ENST00000459482 GAB3Q8WWW8 586 aa6.59□□□□□ -1.35
SNORD11.1-201ENST00000459482 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17 ms