RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000455580.5

PPP1CB-208, Transcript of protein phosphatase 1 catalytic subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene PPP1CB, Length 721 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1CB-208ENST00000455580 DACT1Q9NYF0 836 aa26.85■■□□□ 1.89
PPP1CB-208ENST00000455580 PCDHB12Q9Y5F1 795 aa26.85■■□□□ 1.89
PPP1CB-208ENST00000455580 BRWD1Q9NSI6 2320 aa26.85■■□□□ 1.89
PPP1CB-208ENST00000455580 FNDC1Q4ZHG4 1894 aaPredicted RBP26.85■■□□□ 1.89
PPP1CB-208ENST00000455580 MYO7AQ13402 2215 aa26.84■■□□□ 1.89
PPP1CB-208ENST00000455580 EOMESO95936 686 aa26.84■■□□□ 1.89
PPP1CB-208ENST00000455580 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP26.84■■□□□ 1.89
PPP1CB-208ENST00000455580 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP26.84■■□□□ 1.89
PPP1CB-208ENST00000455580 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP26.84■■□□□ 1.89
PPP1CB-208ENST00000455580 POF1BQ8WVV4 589 aa26.84■■□□□ 1.89
PPP1CB-208ENST00000455580 IFT122Q9HBG6 1241 aa26.84■■□□□ 1.89
PPP1CB-208ENST00000455580 LYPLA2O95372 231 aa26.83■■□□□ 1.89
PPP1CB-208ENST00000455580 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP26.83■■□□□ 1.892e-7■□□□□ 10.6
PPP1CB-208ENST00000455580 HYAL1Q12794 435 aa26.83■■□□□ 1.89
PPP1CB-208ENST00000455580 XKR9Q5GH70 373 aa26.83■■□□□ 1.89
PPP1CB-208ENST00000455580 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa26.83■■□□□ 1.89
PPP1CB-208ENST00000455580 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP26.83■■□□□ 1.89
PPP1CB-208ENST00000455580 TMEM143Q96AN5 459 aa26.83■■□□□ 1.89
PPP1CB-208ENST00000455580 NLRP4Q96MN2 994 aa26.83■■□□□ 1.89
PPP1CB-208ENST00000455580 TRAIPQ9BWF2 469 aa26.83■■□□□ 1.89
PPP1CB-208ENST00000455580 TMEM60Q9H2L4 133 aa26.83■■□□□ 1.89
PPP1CB-208ENST00000455580 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP26.83■■□□□ 1.89
PPP1CB-208ENST00000455580 HCSTQ9UBK5 93 aa26.83■■□□□ 1.89
PPP1CB-208ENST00000455580 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa26.83■■□□□ 1.89
PPP1CB-208ENST00000455580 KIAA1671Q9BY89 1806 aa26.82■■□□□ 1.88
PPP1CB-208ENST00000455580 GAS2O43903 313 aaKnown RBP26.82■■□□□ 1.88
PPP1CB-208ENST00000455580 ATP2B1P20020 1258 aa26.82■■□□□ 1.88
PPP1CB-208ENST00000455580 CTC1Q2NKJ3 1217 aa26.82■■□□□ 1.88
PPP1CB-208ENST00000455580 LRRC55Q6ZSA7 311 aa26.82■■□□□ 1.88
PPP1CB-208ENST00000455580 COLGALT1Q8NBJ5 622 aa26.82■■□□□ 1.88
PPP1CB-208ENST00000455580 CLDND1Q9NY35 253 aa26.82■■□□□ 1.88
PPP1CB-208ENST00000455580 ASAP2O43150 1006 aa26.81■■□□□ 1.88
PPP1CB-208ENST00000455580 IRS1P35568 1242 aa26.81■■□□□ 1.88
PPP1CB-208ENST00000455580 LTBRP36941 435 aa26.81■■□□□ 1.88
PPP1CB-208ENST00000455580 UBE3AQ05086 875 aa26.81■■□□□ 1.88
PPP1CB-208ENST00000455580 TCP11Q8WWU5 503 aa26.81■■□□□ 1.88
PPP1CB-208ENST00000455580 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP26.81■■□□□ 1.88
PPP1CB-208ENST00000455580 H3BQ06 376 aaPredicted RBP26.8■■□□□ 1.88
PPP1CB-208ENST00000455580 CSPG5O95196 566 aa26.8■■□□□ 1.88
PPP1CB-208ENST00000455580 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP26.8■■□□□ 1.88
PPP1CB-208ENST00000455580 LAG3P18627 525 aa26.8■■□□□ 1.88
PPP1CB-208ENST00000455580 MCM7P33993 719 aa26.8■■□□□ 1.88
PPP1CB-208ENST00000455580 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa26.8■■□□□ 1.88
PPP1CB-208ENST00000455580 EMC2Q15006 297 aa26.8■■□□□ 1.88
PPP1CB-208ENST00000455580 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa26.8■■□□□ 1.88
PPP1CB-208ENST00000455580 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP26.8■■□□□ 1.88
PPP1CB-208ENST00000455580 CLLU1OSQ5K130 101 aa26.8■■□□□ 1.88
PPP1CB-208ENST00000455580 EP400NLQ6ZTU2 488 aa26.8■■□□□ 1.88
PPP1CB-208ENST00000455580 CATSPER4Q7RTX7 472 aa26.8■■□□□ 1.88
PPP1CB-208ENST00000455580 ABI1Q8IZP0 508 aa26.8■■□□□ 1.88
PPP1CB-208ENST00000455580 FAM184AQ8NB25 1140 aa26.8■■□□□ 1.88
PPP1CB-208ENST00000455580 RNF169Q8NCN4 708 aa26.8■■□□□ 1.88
PPP1CB-208ENST00000455580 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP26.8■■□□□ 1.88
PPP1CB-208ENST00000455580 ANKEF1Q9NU02 776 aa26.8■■□□□ 1.88
PPP1CB-208ENST00000455580 GRXCR2A6NFK2 248 aa26.79■■□□□ 1.88
PPP1CB-208ENST00000455580 FGF18O76093 207 aa26.79■■□□□ 1.88
PPP1CB-208ENST00000455580 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa26.79■■□□□ 1.88
PPP1CB-208ENST00000455580 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP26.79■■□□□ 1.882e-10■■■■■ 35
PPP1CB-208ENST00000455580 PHKA2P46019 1235 aa26.79■■□□□ 1.88
PPP1CB-208ENST00000455580 RABEP1Q15276 862 aa26.79■■□□□ 1.88
PPP1CB-208ENST00000455580 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP26.79■■□□□ 1.88
PPP1CB-208ENST00000455580 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa26.79■■□□□ 1.88
PPP1CB-208ENST00000455580 IGFLR1Q9H665 355 aa26.79■■□□□ 1.88
PPP1CB-208ENST00000455580 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa26.79■■□□□ 1.88
PPP1CB-208ENST00000455580 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP26.79■■□□□ 1.88
PPP1CB-208ENST00000455580 ATG2AQ2TAZ0 1938 aa26.78■■□□□ 1.88
PPP1CB-208ENST00000455580 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP26.78■■□□□ 1.88
PPP1CB-208ENST00000455580 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP26.78■■□□□ 1.88
PPP1CB-208ENST00000455580 TWF2Q6IBS0 349 aaKnown RBP26.78■■□□□ 1.88
PPP1CB-208ENST00000455580 FERMT3Q86UX7 667 aa26.78■■□□□ 1.88
PPP1CB-208ENST00000455580 THNSL1Q8IYQ7 743 aa26.78■■□□□ 1.88
PPP1CB-208ENST00000455580 LRRC43Q8N309 656 aa26.78■■□□□ 1.88
PPP1CB-208ENST00000455580 PPP2R3CQ969Q6 453 aa26.78■■□□□ 1.88
PPP1CB-208ENST00000455580 MTRQ99707 1265 aa26.78■■□□□ 1.88
PPP1CB-208ENST00000455580 MINDY3Q9H8M7 445 aa26.78■■□□□ 1.88
PPP1CB-208ENST00000455580 NCOR1O75376 2440 aa26.78■■□□□ 1.88
PPP1CB-208ENST00000455580 ZNF623O75123 536 aa26.77■■□□□ 1.88
PPP1CB-208ENST00000455580 SKIP12755 728 aa26.77■■□□□ 1.88
PPP1CB-208ENST00000455580 IL9P15248 144 aa26.77■■□□□ 1.88
PPP1CB-208ENST00000455580 PLCB3Q01970 1234 aa26.77■■□□□ 1.88
PPP1CB-208ENST00000455580 ADAM15Q13444 863 aa26.77■■□□□ 1.88
PPP1CB-208ENST00000455580 ZNF174Q15697 407 aa26.77■■□□□ 1.88
PPP1CB-208ENST00000455580 ADGRD2Q7Z7M1 963 aa26.77■■□□□ 1.88
PPP1CB-208ENST00000455580 HELQQ8TDG4 1101 aa26.77■■□□□ 1.88
PPP1CB-208ENST00000455580 POTEMA6NI47 508 aa26.76■■□□□ 1.87
PPP1CB-208ENST00000455580 DGAT1O75907 488 aa26.76■■□□□ 1.87
PPP1CB-208ENST00000455580 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa26.76■■□□□ 1.87
PPP1CB-208ENST00000455580 DLX2Q07687 328 aaPredicted RBP26.76■■□□□ 1.87
PPP1CB-208ENST00000455580 KCNT2Q6UVM3 1135 aa26.76■■□□□ 1.87
PPP1CB-208ENST00000455580 NOSTRINQ8IVI9 506 aa26.76■■□□□ 1.87
PPP1CB-208ENST00000455580 FAM178BQ8IXR5 827 aa26.76■■□□□ 1.87
PPP1CB-208ENST00000455580 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa26.76■■□□□ 1.87
PPP1CB-208ENST00000455580 FAM105AQ9NUU6 356 aa26.76■■□□□ 1.87
PPP1CB-208ENST00000455580 LZTS1Q9Y250 596 aa26.76■■□□□ 1.87
PPP1CB-208ENST00000455580 RARRES1P49788 294 aa26.75■■□□□ 1.87
PPP1CB-208ENST00000455580 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP26.75■■□□□ 1.87
PPP1CB-208ENST00000455580 RNF149Q8NC42 400 aa26.75■■□□□ 1.87
PPP1CB-208ENST00000455580 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa26.75■■□□□ 1.87
PPP1CB-208ENST00000455580 PIGOQ8TEQ8 1089 aa26.75■■□□□ 1.87
PPP1CB-208ENST00000455580 ZNF558Q96NG5 402 aa26.75■■□□□ 1.87
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