RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000444916.5

SH3BP4-205, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 4

Gene SH3BP4, Length 570 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-205ENST00000444916 CMTR2Q8IYT2 770 aaKnown RBP15.78■□□□□ 0.12
SH3BP4-205ENST00000444916 C4orf32Q8N8J7 132 aa15.78■□□□□ 0.12
SH3BP4-205ENST00000444916 ERMNQ8TAM6 284 aa15.78■□□□□ 0.12
SH3BP4-205ENST00000444916 TCP11Q8WWU5 503 aa15.78■□□□□ 0.12
SH3BP4-205ENST00000444916 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP15.78■□□□□ 0.12
SH3BP4-205ENST00000444916 TMEM143Q96AN5 459 aa15.78■□□□□ 0.12
SH3BP4-205ENST00000444916 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP15.78■□□□□ 0.12
SH3BP4-205ENST00000444916 UBE2ZQ9H832 354 aaPredicted RBP15.78■□□□□ 0.12
SH3BP4-205ENST00000444916 LRFN2Q9ULH4 789 aa15.78■□□□□ 0.12
SH3BP4-205ENST00000444916 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa15.78■□□□□ 0.12
SH3BP4-205ENST00000444916 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa15.78■□□□□ 0.12
SH3BP4-205ENST00000444916 FNDC1Q4ZHG4 1894 aaPredicted RBP15.78■□□□□ 0.12
SH3BP4-205ENST00000444916 KIAA1671Q9BY89 1806 aa15.78■□□□□ 0.12
SH3BP4-205ENST00000444916 WDFY4Q6ZS81 3184 aa15.77■□□□□ 0.12
SH3BP4-205ENST00000444916 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa15.77■□□□□ 0.12
SH3BP4-205ENST00000444916 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP15.77■□□□□ 0.121e-10■■■■■ 44.1
SH3BP4-205ENST00000444916 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP15.77■□□□□ 0.12
SH3BP4-205ENST00000444916 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP15.77■□□□□ 0.122e-6■■■□□ 14.7
SH3BP4-205ENST00000444916 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP15.77■□□□□ 0.125e-7■■■□□ 15.8
SH3BP4-205ENST00000444916 FAM189BP81408 668 aa15.77■□□□□ 0.12
SH3BP4-205ENST00000444916 PTGDRQ13258 359 aa15.77■□□□□ 0.12
SH3BP4-205ENST00000444916 RILPL1Q5EBL4 403 aa15.77■□□□□ 0.12
SH3BP4-205ENST00000444916 CATSPER3Q86XQ3 398 aa15.77■□□□□ 0.12
SH3BP4-205ENST00000444916 KSR1Q8IVT5 923 aa15.77■□□□□ 0.12
SH3BP4-205ENST00000444916 CLP1Q92989 425 aaKnown RBP15.77■□□□□ 0.12
SH3BP4-205ENST00000444916 NLRP4Q96MN2 994 aa15.77■□□□□ 0.12
SH3BP4-205ENST00000444916 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP15.77■□□□□ 0.12
SH3BP4-205ENST00000444916 MTRQ99707 1265 aa15.77■□□□□ 0.12
SH3BP4-205ENST00000444916 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP15.77■□□□□ 0.12
SH3BP4-205ENST00000444916 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP15.77■□□□□ 0.12
SH3BP4-205ENST00000444916 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP15.77■□□□□ 0.12
SH3BP4-205ENST00000444916 LMCD1Q9NZU5 365 aa15.77■□□□□ 0.12
SH3BP4-205ENST00000444916 RWDD3Q9Y3V2 267 aa15.77■□□□□ 0.12
SH3BP4-205ENST00000444916 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa15.77■□□□□ 0.12
SH3BP4-205ENST00000444916 PPAN-P2RY11A0A0B4J1V8 794 aaPredicted RBP15.76■□□□□ 0.11
SH3BP4-205ENST00000444916 LAD1O00515 517 aa15.76■□□□□ 0.11
SH3BP4-205ENST00000444916 MED24O75448 989 aa15.76■□□□□ 0.11
SH3BP4-205ENST00000444916 CSDE1O75534 798 aaKnown RBP15.76■□□□□ 0.11
SH3BP4-205ENST00000444916 DGAT1O75907 488 aa15.76■□□□□ 0.11
SH3BP4-205ENST00000444916 LINC00271P0C7V0 271 aa15.76■□□□□ 0.11
SH3BP4-205ENST00000444916 IL9P15248 144 aa15.76■□□□□ 0.11
SH3BP4-205ENST00000444916 IBSPP21815 317 aaPredicted RBP15.76■□□□□ 0.11
SH3BP4-205ENST00000444916 FGFR4P22455 802 aa15.76■□□□□ 0.11
SH3BP4-205ENST00000444916 KCNA5P22460 613 aa15.76■□□□□ 0.11
SH3BP4-205ENST00000444916 RPA1P27694 616 aa15.76■□□□□ 0.11
SH3BP4-205ENST00000444916 RARRES1P49788 294 aa15.76■□□□□ 0.11
SH3BP4-205ENST00000444916 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa15.76■□□□□ 0.11
SH3BP4-205ENST00000444916 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP15.76■□□□□ 0.11
SH3BP4-205ENST00000444916 HAUS3Q68CZ6 603 aa15.76■□□□□ 0.11
SH3BP4-205ENST00000444916 FAM178BQ8IXR5 827 aa15.76■□□□□ 0.11
SH3BP4-205ENST00000444916 GJD3Q8N144 294 aa15.76■□□□□ 0.11
SH3BP4-205ENST00000444916 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP15.76■□□□□ 0.11
SH3BP4-205ENST00000444916 PIGOQ8TEQ8 1089 aa15.76■□□□□ 0.11
SH3BP4-205ENST00000444916 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP15.76■□□□□ 0.11
SH3BP4-205ENST00000444916 ELAC1Q9H777 363 aaKnown RBP15.76■□□□□ 0.11
SH3BP4-205ENST00000444916 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa15.76■□□□□ 0.11
SH3BP4-205ENST00000444916 IFT122Q9HBG6 1241 aa15.76■□□□□ 0.11
SH3BP4-205ENST00000444916 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa15.76■□□□□ 0.11
SH3BP4-205ENST00000444916 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP15.76■□□□□ 0.11
SH3BP4-205ENST00000444916 TMEM161AQ9NX61 479 aa15.76■□□□□ 0.11
SH3BP4-205ENST00000444916 C5orf67F2Z3F1 127 aa15.75■□□□□ 0.11
SH3BP4-205ENST00000444916 H3BNC9 293 aa15.75■□□□□ 0.11
SH3BP4-205ENST00000444916 ASAP2O43150 1006 aa15.75■□□□□ 0.11
SH3BP4-205ENST00000444916 CTNNB1P35222 781 aa15.75■□□□□ 0.11
SH3BP4-205ENST00000444916 PRPHP41219 470 aa15.75■□□□□ 0.11
SH3BP4-205ENST00000444916 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP15.75■□□□□ 0.11
SH3BP4-205ENST00000444916 FERMT3Q86UX7 667 aa15.75■□□□□ 0.11
SH3BP4-205ENST00000444916 NACC1Q96RE7 527 aa15.75■□□□□ 0.11
SH3BP4-205ENST00000444916 RAB34Q9BZG1 259 aa15.75■□□□□ 0.11
SH3BP4-205ENST00000444916 CHST12Q9NRB3 414 aa15.75■□□□□ 0.11
SH3BP4-205ENST00000444916 DACT1Q9NYF0 836 aa15.75■□□□□ 0.11
SH3BP4-205ENST00000444916 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP15.75■□□□□ 0.11
SH3BP4-205ENST00000444916 RB1P06400 928 aa15.74■□□□□ 0.11
SH3BP4-205ENST00000444916 MUTP22033 750 aa15.74■□□□□ 0.11
SH3BP4-205ENST00000444916 BMPR1AP36894 532 aa15.74■□□□□ 0.11
SH3BP4-205ENST00000444916 GATMP50440 423 aa15.74■□□□□ 0.11
SH3BP4-205ENST00000444916 GPM6BQ13491 265 aa15.74■□□□□ 0.11
SH3BP4-205ENST00000444916 PDIA5Q14554 519 aa15.74■□□□□ 0.11
SH3BP4-205ENST00000444916 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP15.74■□□□□ 0.11
SH3BP4-205ENST00000444916 LEXMQ3ZCV2 418 aa15.74■□□□□ 0.11
SH3BP4-205ENST00000444916 POTEGQ6S5H5 508 aa15.74■□□□□ 0.11
SH3BP4-205ENST00000444916 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa15.74■□□□□ 0.11
SH3BP4-205ENST00000444916 IGSF22Q8N9C0 903 aa15.74■□□□□ 0.11
SH3BP4-205ENST00000444916 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP15.74■□□□□ 0.11
SH3BP4-205ENST00000444916 LRWD1Q9UFC0 647 aa15.74■□□□□ 0.11
SH3BP4-205ENST00000444916 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP15.74■□□□□ 0.11
SH3BP4-205ENST00000444916 STK24Q9Y6E0 443 aa15.74■□□□□ 0.11
SH3BP4-205ENST00000444916 TRIOO75962 3097 aa15.74■□□□□ 0.11
SH3BP4-205ENST00000444916 A0A087WWV3 80 aa15.73■□□□□ 0.11
SH3BP4-205ENST00000444916 A0A0U1RQF3 1178 aa15.73■□□□□ 0.11
SH3BP4-205ENST00000444916 PRR33A8MZF0 331 aa15.73■□□□□ 0.11
SH3BP4-205ENST00000444916 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa15.73■□□□□ 0.11
SH3BP4-205ENST00000444916 PDCP20941 246 aa15.73■□□□□ 0.11
SH3BP4-205ENST00000444916 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP15.73■□□□□ 0.11
SH3BP4-205ENST00000444916 PTPROQ16827 1216 aa15.73■□□□□ 0.11
SH3BP4-205ENST00000444916 FAM102BQ5T8I3 360 aa15.73■□□□□ 0.11
SH3BP4-205ENST00000444916 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP15.73■□□□□ 0.11
SH3BP4-205ENST00000444916 CATSPER4Q7RTX7 472 aa15.73■□□□□ 0.11
SH3BP4-205ENST00000444916 ECHDC2Q86YB7 292 aa15.73■□□□□ 0.11
SH3BP4-205ENST00000444916 RNF149Q8NC42 400 aa15.73■□□□□ 0.11
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