RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442563.5

RABGEF1-204, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 4

Gene RABGEF1, Length 553 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-204ENST00000442563 UPP2O95045 317 aa18.71■□□□□ 0.59
RABGEF1-204ENST00000442563 CA3P07451 260 aa18.71■□□□□ 0.59
RABGEF1-204ENST00000442563 STAG3L1P0CL83 205 aa18.71■□□□□ 0.59
RABGEF1-204ENST00000442563 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP18.71■□□□□ 0.59
RABGEF1-204ENST00000442563 GLRA2P23416 452 aa18.71■□□□□ 0.59
RABGEF1-204ENST00000442563 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP18.71■□□□□ 0.59
RABGEF1-204ENST00000442563 SARSP49591 514 aaKnown RBP18.71■□□□□ 0.59
RABGEF1-204ENST00000442563 PTENP60484 403 aa18.71■□□□□ 0.59
RABGEF1-204ENST00000442563 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP18.71■□□□□ 0.59
RABGEF1-204ENST00000442563 TMEM119Q4V9L6 283 aa18.71■□□□□ 0.59
RABGEF1-204ENST00000442563 Q7L0L9 218 aa18.71■□□□□ 0.59
RABGEF1-204ENST00000442563 NPAS4Q8IUM7 802 aa18.71■□□□□ 0.59
RABGEF1-204ENST00000442563 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP18.71■□□□□ 0.59
RABGEF1-204ENST00000442563 ASAP3Q8TDY4 903 aa18.71■□□□□ 0.59
RABGEF1-204ENST00000442563 CALML4Q96GE6 196 aa18.71■□□□□ 0.59
RABGEF1-204ENST00000442563 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa18.71■□□□□ 0.59
RABGEF1-204ENST00000442563 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP18.71■□□□□ 0.59
RABGEF1-204ENST00000442563 ELAC1Q9H777 363 aaKnown RBP18.71■□□□□ 0.59
RABGEF1-204ENST00000442563 PPP6R2O75170 966 aa18.7■□□□□ 0.58
RABGEF1-204ENST00000442563 CSDE1O75534 798 aaKnown RBP18.7■□□□□ 0.58
RABGEF1-204ENST00000442563 YEATS4O95619 227 aa18.7■□□□□ 0.58
RABGEF1-204ENST00000442563 BRD1O95696 1058 aa18.7■□□□□ 0.58
RABGEF1-204ENST00000442563 PHKA2P46019 1235 aa18.7■□□□□ 0.58
RABGEF1-204ENST00000442563 TAP1Q03518 808 aa18.7■□□□□ 0.58
RABGEF1-204ENST00000442563 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP18.7■□□□□ 0.58
RABGEF1-204ENST00000442563 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP18.7■□□□□ 0.58
RABGEF1-204ENST00000442563 PPP2R2DQ66LE6 453 aa18.7■□□□□ 0.58
RABGEF1-204ENST00000442563 FAM117BQ6P1L5 589 aa18.7■□□□□ 0.58
RABGEF1-204ENST00000442563 MAEAQ7L5Y9 396 aa18.7■□□□□ 0.58
RABGEF1-204ENST00000442563 KCNK18Q7Z418 384 aa18.7■□□□□ 0.58
RABGEF1-204ENST00000442563 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP18.7■□□□□ 0.58
RABGEF1-204ENST00000442563 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP18.7■□□□□ 0.58
RABGEF1-204ENST00000442563 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP18.7■□□□□ 0.58
RABGEF1-204ENST00000442563 TRAIPQ9BWF2 469 aa18.7■□□□□ 0.58
RABGEF1-204ENST00000442563 CSRNP2Q9H175 543 aa18.7■□□□□ 0.58
RABGEF1-204ENST00000442563 DACT1Q9NYF0 836 aa18.7■□□□□ 0.58
RABGEF1-204ENST00000442563 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP18.7■□□□□ 0.58
RABGEF1-204ENST00000442563 DGKIO75912 1065 aa18.69■□□□□ 0.58
RABGEF1-204ENST00000442563 FGFR4P22455 802 aa18.69■□□□□ 0.58
RABGEF1-204ENST00000442563 CAPSQ13938 189 aa18.69■□□□□ 0.58
RABGEF1-204ENST00000442563 STK38Q15208 465 aa18.69■□□□□ 0.58
RABGEF1-204ENST00000442563 FAM102BQ5T8I3 360 aa18.69■□□□□ 0.58
RABGEF1-204ENST00000442563 RINT1Q6NUQ1 792 aa18.69■□□□□ 0.58
RABGEF1-204ENST00000442563 C1orf186Q6ZWK4 172 aa18.69■□□□□ 0.58
RABGEF1-204ENST00000442563 CATSPER4Q7RTX7 472 aa18.69■□□□□ 0.58
RABGEF1-204ENST00000442563 KIFAP3Q92845 792 aa18.69■□□□□ 0.58
RABGEF1-204ENST00000442563 ZNF689Q96CS4 500 aaPredicted RBP18.69■□□□□ 0.58
RABGEF1-204ENST00000442563 YME1L1Q96TA2 773 aa18.69■□□□□ 0.58
RABGEF1-204ENST00000442563 TIPINQ9BVW5 301 aa18.69■□□□□ 0.58
RABGEF1-204ENST00000442563 GPRC5CQ9NQ84 441 aa18.69■□□□□ 0.58
RABGEF1-204ENST00000442563 KCND2Q9NZV8 630 aa18.69■□□□□ 0.58
RABGEF1-204ENST00000442563 CFAP45Q9UL16 551 aa18.69■□□□□ 0.58
RABGEF1-204ENST00000442563 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa18.69■□□□□ 0.58
RABGEF1-204ENST00000442563 TTC3P53804 2025 aa18.69■□□□□ 0.58
RABGEF1-204ENST00000442563 LOXHD1Q8IVV2 1947 aa18.68■□□□□ 0.58
RABGEF1-204ENST00000442563 ARID2Q68CP9 1835 aa18.68■□□□□ 0.58
RABGEF1-204ENST00000442563 A0A0U1RQF3 1178 aa18.68■□□□□ 0.58
RABGEF1-204ENST00000442563 SPTLC2O15270 562 aa18.68■□□□□ 0.58
RABGEF1-204ENST00000442563 PLA2G4BP0C869 781 aa18.68■□□□□ 0.58
RABGEF1-204ENST00000442563 GUCY2CP25092 1073 aa18.68■□□□□ 0.58
RABGEF1-204ENST00000442563 SLC12A3P55017 1021 aa18.68■□□□□ 0.58
RABGEF1-204ENST00000442563 GRIN2CQ14957 1233 aa18.68■□□□□ 0.58
RABGEF1-204ENST00000442563 PPP2R5AQ15172 486 aa18.68■□□□□ 0.58
RABGEF1-204ENST00000442563 EPSTI1Q96J88 318 aa18.68■□□□□ 0.58
RABGEF1-204ENST00000442563 MINDY3Q9H8M7 445 aa18.68■□□□□ 0.58
RABGEF1-204ENST00000442563 TMEM161AQ9NX61 479 aa18.68■□□□□ 0.58
RABGEF1-204ENST00000442563 LRFN2Q9ULH4 789 aa18.68■□□□□ 0.58
RABGEF1-204ENST00000442563 ZDHHC9Q9Y397 364 aa18.68■□□□□ 0.58
RABGEF1-204ENST00000442563 PTPRSQ13332 1948 aa18.67■□□□□ 0.58
RABGEF1-204ENST00000442563 LCHNA4D1U4 455 aa18.67■□□□□ 0.58
RABGEF1-204ENST00000442563 AXLP30530 894 aa18.67■□□□□ 0.58
RABGEF1-204ENST00000442563 NAMPTP43490 491 aa18.67■□□□□ 0.58
RABGEF1-204ENST00000442563 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP18.67■□□□□ 0.58
RABGEF1-204ENST00000442563 FAM161BQ96MY7 647 aa18.67■□□□□ 0.58
RABGEF1-204ENST00000442563 GUCD1Q96NT3 240 aa18.67■□□□□ 0.58
RABGEF1-204ENST00000442563 CLIC6Q96NY7 704 aa18.67■□□□□ 0.58
RABGEF1-204ENST00000442563 PLIN2Q99541 437 aa18.67■□□□□ 0.58
RABGEF1-204ENST00000442563 CDX2Q99626 313 aaPredicted RBP18.67■□□□□ 0.58
RABGEF1-204ENST00000442563 C17orf75Q9HAS0 396 aa18.67■□□□□ 0.58
RABGEF1-204ENST00000442563 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP18.67■□□□□ 0.58
RABGEF1-204ENST00000442563 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa18.67■□□□□ 0.58
RABGEF1-204ENST00000442563 CCDC39Q9UFE4 941 aa18.67■□□□□ 0.58
RABGEF1-204ENST00000442563 KCNG1Q9UIX4 513 aa18.67■□□□□ 0.58
RABGEF1-204ENST00000442563 LINC01553A4QN01 128 aa18.66■□□□□ 0.58
RABGEF1-204ENST00000442563 ZNF623O75123 536 aa18.66■□□□□ 0.58
RABGEF1-204ENST00000442563 ARHGEF15O94989 841 aa18.66■□□□□ 0.58
RABGEF1-204ENST00000442563 SLC34A2O95436 690 aa18.66■□□□□ 0.58
RABGEF1-204ENST00000442563 EOMESO95936 686 aa18.66■□□□□ 0.58
RABGEF1-204ENST00000442563 SKIP12755 728 aa18.66■□□□□ 0.58
RABGEF1-204ENST00000442563 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP18.66■□□□□ 0.58
RABGEF1-204ENST00000442563 DDIT3P35638 169 aa18.66■□□□□ 0.58
RABGEF1-204ENST00000442563 TXLNAP40222 546 aa18.66■□□□□ 0.58
RABGEF1-204ENST00000442563 ERVK-21P61565 698 aa18.66■□□□□ 0.58
RABGEF1-204ENST00000442563 MBTD1Q05BQ5 628 aa18.66■□□□□ 0.58
RABGEF1-204ENST00000442563 KARSQ15046 597 aaKnown RBP18.66■□□□□ 0.58
RABGEF1-204ENST00000442563 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP18.66■□□□□ 0.58
RABGEF1-204ENST00000442563 USP49Q70CQ1 688 aa18.66■□□□□ 0.58
RABGEF1-204ENST00000442563 ECHDC2Q86YB7 292 aa18.66■□□□□ 0.58
RABGEF1-204ENST00000442563 KCNG4Q8TDN1 519 aa18.66■□□□□ 0.58
RABGEF1-204ENST00000442563 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.8 ms