RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000438888.5

PRAME-208, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 4

Gene PRAME, Length 566 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-208ENST00000438888 C9IYK1 514 aa13.93□□□□□ -0.18
PRAME-208ENST00000438888 WNT7AO00755 349 aa13.93□□□□□ -0.18
PRAME-208ENST00000438888 CHMP2AO43633 222 aa13.93□□□□□ -0.18
PRAME-208ENST00000438888 FGF18O76093 207 aa13.93□□□□□ -0.18
PRAME-208ENST00000438888 PSAPP07602 524 aa13.93□□□□□ -0.18
PRAME-208ENST00000438888 CYP3A4P08684 503 aa13.93□□□□□ -0.18
PRAME-208ENST00000438888 NASPP49321 788 aaPredicted RBP13.93□□□□□ -0.18
PRAME-208ENST00000438888 USP11P51784 963 aa13.93□□□□□ -0.18
PRAME-208ENST00000438888 CRYBB1P53674 252 aaPredicted RBP13.93□□□□□ -0.18
PRAME-208ENST00000438888 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP13.93□□□□□ -0.18
PRAME-208ENST00000438888 LETM2Q2VYF4 491 aa13.93□□□□□ -0.18
PRAME-208ENST00000438888 ODR4Q5SWX8 454 aa13.93□□□□□ -0.18
PRAME-208ENST00000438888 PLPP4Q5VZY2 271 aa13.93□□□□□ -0.18
PRAME-208ENST00000438888 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP13.93□□□□□ -0.18
PRAME-208ENST00000438888 SLC24A5Q71RS6 500 aa13.93□□□□□ -0.18
PRAME-208ENST00000438888 LRRC71Q8N4P6 559 aa13.93□□□□□ -0.18
PRAME-208ENST00000438888 COLGALT1Q8NBJ5 622 aa13.93□□□□□ -0.18
PRAME-208ENST00000438888 RNF169Q8NCN4 708 aa13.93□□□□□ -0.18
PRAME-208ENST00000438888 SMRP1Q8NCR6 262 aa13.93□□□□□ -0.18
PRAME-208ENST00000438888 CRYGNQ8WXF5 182 aa13.93□□□□□ -0.18
PRAME-208ENST00000438888 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP13.93□□□□□ -0.18
PRAME-208ENST00000438888 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP13.93□□□□□ -0.18
PRAME-208ENST00000438888 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP13.93□□□□□ -0.18
PRAME-208ENST00000438888 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa13.93□□□□□ -0.18
PRAME-208ENST00000438888 TLR9Q9NR96 1032 aa13.93□□□□□ -0.18
PRAME-208ENST00000438888 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP13.93□□□□□ -0.18
PRAME-208ENST00000438888 TBC1D22BQ9NU19 505 aa13.93□□□□□ -0.18
PRAME-208ENST00000438888 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP13.93□□□□□ -0.18
PRAME-208ENST00000438888 CEP131Q9UPN4 1083 aa13.93□□□□□ -0.18
PRAME-208ENST00000438888 USP15Q9Y4E8 981 aaPredicted RBP13.93□□□□□ -0.18
PRAME-208ENST00000438888 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa13.93□□□□□ -0.18
PRAME-208ENST00000438888 CLIC4Q9Y696 253 aa13.93□□□□□ -0.18
PRAME-208ENST00000438888 LOXHD1Q8IVV2 1947 aa13.92□□□□□ -0.18
PRAME-208ENST00000438888 CCNT1O60563 726 aaKnown RBP13.92□□□□□ -0.18
PRAME-208ENST00000438888 GPR32O75388 356 aa13.92□□□□□ -0.18
PRAME-208ENST00000438888 YEATS4O95619 227 aa13.92□□□□□ -0.18
PRAME-208ENST00000438888 BMP15O95972 392 aa13.92□□□□□ -0.18
PRAME-208ENST00000438888 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP13.92□□□□□ -0.18
PRAME-208ENST00000438888 MCM7P33993 719 aa13.92□□□□□ -0.18
PRAME-208ENST00000438888 PBX3P40426 434 aa13.92□□□□□ -0.18
PRAME-208ENST00000438888 NLRP11P59045 1033 aaKnown RBP13.92□□□□□ -0.18
PRAME-208ENST00000438888 ERVFC1P60507 584 aa13.92□□□□□ -0.18
PRAME-208ENST00000438888 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP13.92□□□□□ -0.18
PRAME-208ENST00000438888 STK38Q15208 465 aa13.92□□□□□ -0.18
PRAME-208ENST00000438888 ZNF174Q15697 407 aa13.92□□□□□ -0.18
PRAME-208ENST00000438888 RPGRIP1Q96KN7 1286 aa13.92□□□□□ -0.18
PRAME-208ENST00000438888 SPATA32Q96LK8 384 aa13.92□□□□□ -0.18
PRAME-208ENST00000438888 SCLT1Q96NL6 688 aa13.92□□□□□ -0.18
PRAME-208ENST00000438888 MAP7D2Q96T17 732 aa13.92□□□□□ -0.18
PRAME-208ENST00000438888 APOL5Q9BWW9 433 aa13.92□□□□□ -0.18
PRAME-208ENST00000438888 PCDHA10Q9Y5I2 948 aa13.92□□□□□ -0.18
PRAME-208ENST00000438888 MAFBQ9Y5Q3 323 aaPredicted RBP13.92□□□□□ -0.18
PRAME-208ENST00000438888 GOLGA6L22H0YM25 854 aa13.91□□□□□ -0.18
PRAME-208ENST00000438888 EDIL3O43854 480 aa13.91□□□□□ -0.18
PRAME-208ENST00000438888 TDP2O95551 362 aa13.91□□□□□ -0.18
PRAME-208ENST00000438888 EYA4O95677 639 aa13.91□□□□□ -0.18
PRAME-208ENST00000438888 COASYQ13057 564 aa13.91□□□□□ -0.18
PRAME-208ENST00000438888 PTPAQ15257 358 aa13.91□□□□□ -0.18
PRAME-208ENST00000438888 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP13.91□□□□□ -0.18
PRAME-208ENST00000438888 PPP4R3AQ6IN85 833 aa13.91□□□□□ -0.18
PRAME-208ENST00000438888 EFCAB12Q6NXP0 572 aa13.91□□□□□ -0.18
PRAME-208ENST00000438888 LLGL2Q6P1M3 1020 aa13.91□□□□□ -0.18
PRAME-208ENST00000438888 MOXD1Q6UVY6 613 aa13.91□□□□□ -0.18
PRAME-208ENST00000438888 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP13.91□□□□□ -0.18
PRAME-208ENST00000438888 LINC00301Q8NCQ3 95 aa13.91□□□□□ -0.18
PRAME-208ENST00000438888 VN1R2Q8NFZ6 395 aa13.91□□□□□ -0.18
PRAME-208ENST00000438888 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP13.91□□□□□ -0.18
PRAME-208ENST00000438888 GJA10Q969M2 543 aa13.91□□□□□ -0.18
PRAME-208ENST00000438888 FBXL18Q96ME1 805 aa13.91□□□□□ -0.18
PRAME-208ENST00000438888 GDPD2Q9HCC8 539 aa13.91□□□□□ -0.18
PRAME-208ENST00000438888 ENTPD7Q9NQZ7 604 aa13.91□□□□□ -0.18
PRAME-208ENST00000438888 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP13.91□□□□□ -0.18
PRAME-208ENST00000438888 TMEM161AQ9NX61 479 aa13.91□□□□□ -0.18
PRAME-208ENST00000438888 RCOR1Q9UKL0 485 aa13.91□□□□□ -0.18
PRAME-208ENST00000438888 PLXNA4Q9HCM2 1894 aa13.91□□□□□ -0.18
PRAME-208ENST00000438888 CYP3A7-CYP3A51PA0A087WV96 503 aa13.9□□□□□ -0.18
PRAME-208ENST00000438888 WDR64B1ANS9 1081 aa13.9□□□□□ -0.18
PRAME-208ENST00000438888 NEMFO60524 1076 aa13.9□□□□□ -0.18
PRAME-208ENST00000438888 OATP04181 439 aa13.9□□□□□ -0.18
PRAME-208ENST00000438888 LAG3P18627 525 aa13.9□□□□□ -0.18
PRAME-208ENST00000438888 FGFR4P22455 802 aa13.9□□□□□ -0.18
PRAME-208ENST00000438888 SP100P23497 879 aaPredicted RBP13.9□□□□□ -0.18
PRAME-208ENST00000438888 CYP3A7P24462 503 aa13.9□□□□□ -0.18
PRAME-208ENST00000438888 CIITAP33076 1130 aa13.9□□□□□ -0.18
PRAME-208ENST00000438888 PRKCEQ02156 737 aa13.9□□□□□ -0.18
PRAME-208ENST00000438888 UBE3AQ05086 875 aa13.9□□□□□ -0.18
PRAME-208ENST00000438888 DSC3Q14574 896 aa13.9□□□□□ -0.18
PRAME-208ENST00000438888 SLC39A14Q15043 492 aa13.9□□□□□ -0.18
PRAME-208ENST00000438888 UGCGQ16739 394 aa13.9□□□□□ -0.18
PRAME-208ENST00000438888 DUSP6Q16828 381 aa13.9□□□□□ -0.18
PRAME-208ENST00000438888 ABI1Q8IZP0 508 aa13.9□□□□□ -0.18
PRAME-208ENST00000438888 TMEM87AQ8NBN3 555 aa13.9□□□□□ -0.18
PRAME-208ENST00000438888 KCNG4Q8TDN1 519 aa13.9□□□□□ -0.18
PRAME-208ENST00000438888 LENG9Q96B70 501 aa13.9□□□□□ -0.18
PRAME-208ENST00000438888 FAM167AQ96KS9 214 aa13.9□□□□□ -0.18
PRAME-208ENST00000438888 TCF25Q9BQ70 676 aa13.9□□□□□ -0.18
PRAME-208ENST00000438888 CWH43Q9H720 699 aa13.9□□□□□ -0.18
PRAME-208ENST00000438888 DISC1Q9NRI5 854 aa13.9□□□□□ -0.18
PRAME-208ENST00000438888 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP13.9□□□□□ -0.18
PRAME-208ENST00000438888 SPTLC2O15270 562 aa13.89□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.5 ms