RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000435020.1

RPS28P8-201, Transcript of ribosomal protein S28 pseudogene 8, humanhuman

BASIC

Gene RPS28P8, Length 208 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS28P8-201ENST00000435020 BLIDQ8IZY5 108 aa9.54□□□□□ -0.88
RPS28P8-201ENST00000435020 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
RPS28P8-201ENST00000435020 SLC39A11Q8N1S5 342 aa9.54□□□□□ -0.88
RPS28P8-201ENST00000435020 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
RPS28P8-201ENST00000435020 TEKT3Q9BXF9 490 aa9.54□□□□□ -0.88
RPS28P8-201ENST00000435020 MINDY3Q9H8M7 445 aa9.54□□□□□ -0.88
RPS28P8-201ENST00000435020 IFT122Q9HBG6 1241 aa9.54□□□□□ -0.88
RPS28P8-201ENST00000435020 KCNJ14Q9UNX9 436 aa9.54□□□□□ -0.88
RPS28P8-201ENST00000435020 CEP131Q9UPN4 1083 aa9.54□□□□□ -0.88
RPS28P8-201ENST00000435020 STK36Q9NRP7 1315 aa9.54□□□□□ -0.88
RPS28P8-201ENST00000435020 NOTCH4Q99466 2003 aa9.53□□□□□ -0.88
RPS28P8-201ENST00000435020 A0A087WZ62 844 aa9.53□□□□□ -0.88
RPS28P8-201ENST00000435020 PFKFB2O60825 505 aa9.53□□□□□ -0.88
RPS28P8-201ENST00000435020 REC8O95072 547 aa9.53□□□□□ -0.88
RPS28P8-201ENST00000435020 EFEMP2O95967 443 aa9.53□□□□□ -0.88
RPS28P8-201ENST00000435020 ALADP13716 330 aa9.53□□□□□ -0.88
RPS28P8-201ENST00000435020 LAG3P18627 525 aa9.53□□□□□ -0.88
RPS28P8-201ENST00000435020 PHKA2P46019 1235 aa9.53□□□□□ -0.88
RPS28P8-201ENST00000435020 AFF1P51825 1210 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
RPS28P8-201ENST00000435020 NLRP5P59047 1200 aa9.53□□□□□ -0.88
RPS28P8-201ENST00000435020 FGD1P98174 961 aa9.53□□□□□ -0.88
RPS28P8-201ENST00000435020 PPP2R5CQ13362 524 aa9.53□□□□□ -0.88
RPS28P8-201ENST00000435020 INF2Q27J81 1249 aa9.53□□□□□ -0.88
RPS28P8-201ENST00000435020 XKR3Q5GH77 459 aa9.53□□□□□ -0.88
RPS28P8-201ENST00000435020 PLA2G4FQ68DD2 849 aa9.53□□□□□ -0.88
RPS28P8-201ENST00000435020 EP400NLQ6ZTU2 488 aa9.53□□□□□ -0.88
RPS28P8-201ENST00000435020 CKAP2LQ8IYA6 745 aa9.53□□□□□ -0.88
RPS28P8-201ENST00000435020 HELQQ8TDG4 1101 aa9.53□□□□□ -0.88
RPS28P8-201ENST00000435020 FAM122AQ96E09 287 aa9.53□□□□□ -0.88
RPS28P8-201ENST00000435020 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
RPS28P8-201ENST00000435020 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa9.53□□□□□ -0.88
RPS28P8-201ENST00000435020 LRFN2Q9ULH4 789 aa9.53□□□□□ -0.88
RPS28P8-201ENST00000435020 AKT3Q9Y243 479 aa9.53□□□□□ -0.88
RPS28P8-201ENST00000435020 DNAH14Q0VDD8 3507 aa9.53□□□□□ -0.88
RPS28P8-201ENST00000435020 GVINP1Q7Z2Y8 2422 aa9.53□□□□□ -0.88
RPS28P8-201ENST00000435020 FAM186AA6NE01 2351 aa9.52□□□□□ -0.88
RPS28P8-201ENST00000435020 C2orf71A6NGG8 1288 aa9.52□□□□□ -0.89
RPS28P8-201ENST00000435020 ZBTB39O15060 712 aa9.52□□□□□ -0.89
RPS28P8-201ENST00000435020 EOMESO95936 686 aa9.52□□□□□ -0.89
RPS28P8-201ENST00000435020 IBSPP21815 317 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
RPS28P8-201ENST00000435020 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
RPS28P8-201ENST00000435020 NDUFV1P49821 464 aa9.52□□□□□ -0.89
RPS28P8-201ENST00000435020 NPEPPSP55786 919 aa9.52□□□□□ -0.89
RPS28P8-201ENST00000435020 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
RPS28P8-201ENST00000435020 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa9.52□□□□□ -0.89
RPS28P8-201ENST00000435020 STK3Q13188 491 aa9.52□□□□□ -0.89
RPS28P8-201ENST00000435020 MTERF2Q49AM1 385 aa9.52□□□□□ -0.89
RPS28P8-201ENST00000435020 UBXN11Q5T124 520 aa9.52□□□□□ -0.89
RPS28P8-201ENST00000435020 PLPP4Q5VZY2 271 aa9.52□□□□□ -0.89
RPS28P8-201ENST00000435020 PPP4R3AQ6IN85 833 aa9.52□□□□□ -0.89
RPS28P8-201ENST00000435020 ANKRD54Q6NXT1 300 aa9.52□□□□□ -0.89
RPS28P8-201ENST00000435020 MIER3Q7Z3K6 550 aa9.52□□□□□ -0.89
RPS28P8-201ENST00000435020 ZNF710Q8N1W2 664 aa9.52□□□□□ -0.89
RPS28P8-201ENST00000435020 LRRC43Q8N309 656 aa9.52□□□□□ -0.89
RPS28P8-201ENST00000435020 EDAQ92838 391 aa9.52□□□□□ -0.89
RPS28P8-201ENST00000435020 LPPQ93052 612 aa9.52□□□□□ -0.89
RPS28P8-201ENST00000435020 ASIC4Q96FT7 647 aa9.52□□□□□ -0.89
RPS28P8-201ENST00000435020 MAP7D2Q96T17 732 aa9.52□□□□□ -0.89
RPS28P8-201ENST00000435020 DHX33Q9H6R0 707 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
RPS28P8-201ENST00000435020 TLE6Q9H808 572 aa9.52□□□□□ -0.89
RPS28P8-201ENST00000435020 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa9.52□□□□□ -0.89
RPS28P8-201ENST00000435020 NRBP2Q9NSY0 501 aa9.52□□□□□ -0.89
RPS28P8-201ENST00000435020 SAMM50Q9Y512 469 aa9.52□□□□□ -0.89
RPS28P8-201ENST00000435020 PCDHB12Q9Y5F1 795 aa9.52□□□□□ -0.89
RPS28P8-201ENST00000435020 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa9.52□□□□□ -0.89
RPS28P8-201ENST00000435020 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
RPS28P8-201ENST00000435020 ZNF623O75123 536 aa9.51□□□□□ -0.89
RPS28P8-201ENST00000435020 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
RPS28P8-201ENST00000435020 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP9.51□□□□□ -0.89
RPS28P8-201ENST00000435020 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa9.51□□□□□ -0.89
RPS28P8-201ENST00000435020 ODR4Q5SWX8 454 aa9.51□□□□□ -0.89
RPS28P8-201ENST00000435020 GALNT17Q6IS24 598 aa9.51□□□□□ -0.89
RPS28P8-201ENST00000435020 AGMOQ6ZNB7 445 aa9.51□□□□□ -0.89
RPS28P8-201ENST00000435020 BMP8AQ7Z5Y6 402 aa9.51□□□□□ -0.89
RPS28P8-201ENST00000435020 MRPL10Q7Z7H8 261 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
RPS28P8-201ENST00000435020 THNSL1Q8IYQ7 743 aa9.51□□□□□ -0.89
RPS28P8-201ENST00000435020 MRPL43Q8N983 215 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
RPS28P8-201ENST00000435020 FBXL18Q96ME1 805 aa9.51□□□□□ -0.89
RPS28P8-201ENST00000435020 CDCA3Q99618 268 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
RPS28P8-201ENST00000435020 PHF7Q9BWX1 381 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
RPS28P8-201ENST00000435020 ZBP1Q9H171 429 aa9.51□□□□□ -0.89
RPS28P8-201ENST00000435020 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
RPS28P8-201ENST00000435020 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
RPS28P8-201ENST00000435020 FAM50BQ9Y247 325 aa9.51□□□□□ -0.89
RPS28P8-201ENST00000435020 HCN4Q9Y3Q4 1203 aa9.51□□□□□ -0.89
RPS28P8-201ENST00000435020 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa9.5□□□□□ -0.89
RPS28P8-201ENST00000435020 INPPL1O15357 1258 aa9.5□□□□□ -0.89
RPS28P8-201ENST00000435020 LILRB3O75022 631 aa9.5□□□□□ -0.89
RPS28P8-201ENST00000435020 CLASP2O75122 1294 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
RPS28P8-201ENST00000435020 OFD1O75665 1012 aa9.5□□□□□ -0.89
RPS28P8-201ENST00000435020 TMOD1P28289 359 aa9.5□□□□□ -0.89
RPS28P8-201ENST00000435020 AK2P54819 239 aa9.5□□□□□ -0.89
RPS28P8-201ENST00000435020 BCAR1P56945 870 aa9.5□□□□□ -0.89
RPS28P8-201ENST00000435020 PSMC5P62195 406 aa9.5□□□□□ -0.89
RPS28P8-201ENST00000435020 ZXDAP98168 799 aa9.5□□□□□ -0.89
RPS28P8-201ENST00000435020 NR5A1Q13285 461 aa9.5□□□□□ -0.89
RPS28P8-201ENST00000435020 AMHR2Q16671 573 aa9.5□□□□□ -0.89
RPS28P8-201ENST00000435020 ME3Q16798 604 aa9.5□□□□□ -0.89
RPS28P8-201ENST00000435020 IER5LQ5T953 404 aa9.5□□□□□ -0.89
RPS28P8-201ENST00000435020 PDE12Q6L8Q7 609 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.9 ms