RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428962.2

THBS3-202, Transcript of thrombospondin 3, humanhuman

TSL 2

Gene THBS3, Length 1,833 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THBS3-202ENST00000428962 NOP2P46087 812 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
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THBS3-202ENST00000428962 AENQ8WTP8 325 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
THBS3-202ENST00000428962 PBKQ96KB5 322 aa14.89□□□□□ -0.03
THBS3-202ENST00000428962 TAAR1Q96RJ0 339 aa14.89□□□□□ -0.03
THBS3-202ENST00000428962 RMDN3Q96TC7 470 aa14.89□□□□□ -0.03
THBS3-202ENST00000428962 PDCD2LQ9BRP1 358 aa14.89□□□□□ -0.03
THBS3-202ENST00000428962 IKZF4Q9H2S9 585 aa14.89□□□□□ -0.03
THBS3-202ENST00000428962 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
THBS3-202ENST00000428962 PXMP2Q9NR77 195 aa14.89□□□□□ -0.03
THBS3-202ENST00000428962 ANKEF1Q9NU02 776 aa14.89□□□□□ -0.03
THBS3-202ENST00000428962 VPS18Q9P253 973 aa14.89□□□□□ -0.03
THBS3-202ENST00000428962 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
THBS3-202ENST00000428962 EVI5O60447 810 aa14.89□□□□□ -0.03
THBS3-202ENST00000428962 ZMYND10O75800 440 aa14.89□□□□□ -0.03
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THBS3-202ENST00000428962 TRIM49CP0CI26 452 aa14.89□□□□□ -0.03
THBS3-202ENST00000428962 EPHB4P54760 987 aa14.89□□□□□ -0.03
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THBS3-202ENST00000428962 CBWD6Q4V339 395 aa14.89□□□□□ -0.03
THBS3-202ENST00000428962 CBWD3Q5JTY5 395 aa14.89□□□□□ -0.03
THBS3-202ENST00000428962 CBWD5Q5RIA9 395 aa14.89□□□□□ -0.03
THBS3-202ENST00000428962 GJB7Q6PEY0 223 aa14.89□□□□□ -0.03
THBS3-202ENST00000428962 MICALL2Q8IY33 904 aa14.89□□□□□ -0.03
THBS3-202ENST00000428962 SCYL3Q8IZE3 742 aa14.89□□□□□ -0.03
THBS3-202ENST00000428962 HVCN1Q96D96 273 aa14.89□□□□□ -0.03
THBS3-202ENST00000428962 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
THBS3-202ENST00000428962 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
THBS3-202ENST00000428962 EXOC7Q9UPT5 735 aa14.89□□□□□ -0.03
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THBS3-202ENST00000428962 EMBQ6PCB8 327 aa14.88□□□□□ -0.03
THBS3-202ENST00000428962 NLRX1Q86UT6 975 aa14.88□□□□□ -0.03
THBS3-202ENST00000428962 IFT20Q8IY31 132 aa14.88□□□□□ -0.03
THBS3-202ENST00000428962 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
THBS3-202ENST00000428962 HACL1Q9UJ83 578 aa14.88□□□□□ -0.03
THBS3-202ENST00000428962 ADAM21Q9UKJ8 722 aa14.88□□□□□ -0.03
THBS3-202ENST00000428962 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
THBS3-202ENST00000428962 LTBP3Q9NS15 1303 aa14.88□□□□□ -0.03
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THBS3-202ENST00000428962 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP14.87□□□□□ -0.03
THBS3-202ENST00000428962 KIF4AO95239 1232 aa14.87□□□□□ -0.03
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THBS3-202ENST00000428962 SMARCAL1Q9NZC9 954 aa14.87□□□□□ -0.03
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THBS3-202ENST00000428962 PARP14Q460N5 1801 aa14.87□□□□□ -0.03
THBS3-202ENST00000428962 NCANO14594 1321 aa14.87□□□□□ -0.03
THBS3-202ENST00000428962 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
THBS3-202ENST00000428962 EGFRP00533 1210 aa14.87□□□□□ -0.03
THBS3-202ENST00000428962 NCKAP1LP55160 1127 aa14.87□□□□□ -0.03
THBS3-202ENST00000428962 NNTQ13423 1086 aa14.87□□□□□ -0.03
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THBS3-202ENST00000428962 ZNF280CQ8ND82 737 aa14.87□□□□□ -0.03
THBS3-202ENST00000428962 SLC30A5Q8TAD4 765 aa14.87□□□□□ -0.03
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THBS3-202ENST00000428962 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
THBS3-202ENST00000428962 USP38Q8NB14 1042 aa14.86□□□□□ -0.03
THBS3-202ENST00000428962 HDAC7Q8WUI4 952 aa14.86□□□□□ -0.03
THBS3-202ENST00000428962 CTNNBL1Q8WYA6 563 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
THBS3-202ENST00000428962 CAVIN3Q969G5 261 aa14.86□□□□□ -0.03
THBS3-202ENST00000428962 ATG4CQ96DT6 458 aa14.86□□□□□ -0.03
THBS3-202ENST00000428962 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
THBS3-202ENST00000428962 C12orf42Q96LP6 360 aa14.86□□□□□ -0.03
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