RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428534.1

GLI3-202, Transcript of GLI family zinc finger 3, humanhuman

TSL 4

Gene GLI3, Length 583 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI3-202ENST00000428534 CDHR5Q9HBB8 845 aa26.01■■□□□ 1.75
GLI3-202ENST00000428534 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP26.01■■□□□ 1.75
GLI3-202ENST00000428534 A0A087WZ62 844 aa26■■□□□ 1.75
GLI3-202ENST00000428534 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP26■■□□□ 1.75
GLI3-202ENST00000428534 KARSQ15046 597 aaKnown RBP26■■□□□ 1.75
GLI3-202ENST00000428534 ZNF697Q5TEC3 545 aa26■■□□□ 1.75
GLI3-202ENST00000428534 RNF149Q8NC42 400 aa26■■□□□ 1.75
GLI3-202ENST00000428534 IFT74Q96LB3 600 aa26■■□□□ 1.75
GLI3-202ENST00000428534 DRC1Q96MC2 740 aa26■■□□□ 1.75
GLI3-202ENST00000428534 PLIN2Q99541 437 aa26■■□□□ 1.75
GLI3-202ENST00000428534 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP26■■□□□ 1.75
GLI3-202ENST00000428534 NFKBIZQ9BYH8 718 aa26■■□□□ 1.75
GLI3-202ENST00000428534 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP26■■□□□ 1.75
GLI3-202ENST00000428534 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP26■■□□□ 1.75
GLI3-202ENST00000428534 C17orf75Q9HAS0 396 aa26■■□□□ 1.75
GLI3-202ENST00000428534 ST3GAL5Q9UNP4 418 aa26■■□□□ 1.75
GLI3-202ENST00000428534 ARID2Q68CP9 1835 aa26■■□□□ 1.75
GLI3-202ENST00000428534 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP25.99■■□□□ 1.75
GLI3-202ENST00000428534 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa25.99■■□□□ 1.75
GLI3-202ENST00000428534 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP25.99■■□□□ 1.75
GLI3-202ENST00000428534 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP25.99■■□□□ 1.75
GLI3-202ENST00000428534 PLCG1P19174 1290 aa25.99■■□□□ 1.75
GLI3-202ENST00000428534 WDR5P61964 334 aaKnown RBP25.99■■□□□ 1.75
GLI3-202ENST00000428534 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP25.99■■□□□ 1.75
GLI3-202ENST00000428534 SPECC1Q5M775 1068 aa25.99■■□□□ 1.75
GLI3-202ENST00000428534 RINT1Q6NUQ1 792 aa25.99■■□□□ 1.75
GLI3-202ENST00000428534 TMEM40Q8WWA1 233 aa25.99■■□□□ 1.75
GLI3-202ENST00000428534 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP25.99■■□□□ 1.75
GLI3-202ENST00000428534 ERVK-5Q9HDB9 667 aa25.99■■□□□ 1.75
GLI3-202ENST00000428534 FAM13BQ9NYF5 915 aa25.99■■□□□ 1.75
GLI3-202ENST00000428534 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP25.99■■□□□ 1.75
GLI3-202ENST00000428534 GUCY2CP25092 1073 aa25.98■■□□□ 1.75
GLI3-202ENST00000428534 MAEAQ7L5Y9 396 aa25.98■■□□□ 1.75
GLI3-202ENST00000428534 KCNK18Q7Z418 384 aa25.98■■□□□ 1.75
GLI3-202ENST00000428534 FAM228AQ86W67 206 aa25.98■■□□□ 1.75
GLI3-202ENST00000428534 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP25.98■■□□□ 1.75
GLI3-202ENST00000428534 RAD54LQ92698 747 aa25.98■■□□□ 1.75
GLI3-202ENST00000428534 C2orf40Q9H1Z8 148 aa25.98■■□□□ 1.75
GLI3-202ENST00000428534 CHST12Q9NRB3 414 aa25.98■■□□□ 1.75
GLI3-202ENST00000428534 C1orf112Q9NSG2 853 aa25.98■■□□□ 1.75
GLI3-202ENST00000428534 PCDHA7Q9UN72 937 aa25.98■■□□□ 1.75
GLI3-202ENST00000428534 PHLPP2Q6ZVD8 1323 aa25.97■■□□□ 1.75
GLI3-202ENST00000428534 DENND3A2RUS2 1198 aa25.97■■□□□ 1.75
GLI3-202ENST00000428534 GLRA2P23416 452 aa25.97■■□□□ 1.75
GLI3-202ENST00000428534 SLC12A3P55017 1021 aa25.97■■□□□ 1.75
GLI3-202ENST00000428534 C1orf186Q6ZWK4 172 aa25.97■■□□□ 1.75
GLI3-202ENST00000428534 KSR1Q8IVT5 923 aa25.97■■□□□ 1.75
GLI3-202ENST00000428534 ZBTB8OSQ8IWT0 167 aa25.97■■□□□ 1.75
GLI3-202ENST00000428534 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP25.97■■□□□ 1.75
GLI3-202ENST00000428534 LRRC27Q9C0I9 530 aa25.97■■□□□ 1.75
GLI3-202ENST00000428534 CUEDC2Q9H467 287 aa25.97■■□□□ 1.75
GLI3-202ENST00000428534 IFT122Q9HBG6 1241 aa25.97■■□□□ 1.75
GLI3-202ENST00000428534 NAMPTP43490 491 aa25.96■■□□□ 1.75
GLI3-202ENST00000428534 PTENP60484 403 aa25.96■■□□□ 1.75
GLI3-202ENST00000428534 RAB30Q15771 203 aa25.96■■□□□ 1.75
GLI3-202ENST00000428534 ADALQ6DHV7 355 aa25.96■■□□□ 1.75
GLI3-202ENST00000428534 OSBPL7Q9BZF2 842 aa25.96■■□□□ 1.75
GLI3-202ENST00000428534 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP25.96■■□□□ 1.75
GLI3-202ENST00000428534 DACT1Q9NYF0 836 aa25.96■■□□□ 1.75
GLI3-202ENST00000428534 CHMP5Q9NZZ3 219 aa25.96■■□□□ 1.75
GLI3-202ENST00000428534 MSRAQ9UJ68 235 aa25.96■■□□□ 1.75
GLI3-202ENST00000428534 ENPP3O14638 875 aa25.95■■□□□ 1.74
GLI3-202ENST00000428534 STAT6P42226 847 aa25.95■■□□□ 1.74
GLI3-202ENST00000428534 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP25.95■■□□□ 1.74
GLI3-202ENST00000428534 USP49Q70CQ1 688 aa25.95■■□□□ 1.74
GLI3-202ENST00000428534 SV2BQ7L1I2 683 aa25.95■■□□□ 1.74
GLI3-202ENST00000428534 CATSPER4Q7RTX7 472 aa25.95■■□□□ 1.74
GLI3-202ENST00000428534 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP25.95■■□□□ 1.74
GLI3-202ENST00000428534 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa25.95■■□□□ 1.74
GLI3-202ENST00000428534 ODF2LQ9ULJ1 636 aa25.95■■□□□ 1.74
GLI3-202ENST00000428534 LRRIQ4A6NIV6 560 aa25.94■■□□□ 1.74
GLI3-202ENST00000428534 STAG3L1P0CL83 205 aa25.94■■□□□ 1.74
GLI3-202ENST00000428534 AXLP30530 894 aa25.94■■□□□ 1.74
GLI3-202ENST00000428534 CAPSQ13938 189 aa25.94■■□□□ 1.74
GLI3-202ENST00000428534 HERC6Q8IVU3 1022 aa25.94■■□□□ 1.74
GLI3-202ENST00000428534 IQUBQ8NA54 791 aa25.94■■□□□ 1.74
GLI3-202ENST00000428534 ASAP3Q8TDY4 903 aa25.94■■□□□ 1.74
GLI3-202ENST00000428534 ZBED2Q9BTP6 218 aa25.94■■□□□ 1.74
GLI3-202ENST00000428534 GPRC5CQ9NQ84 441 aa25.94■■□□□ 1.74
GLI3-202ENST00000428534 RGS18Q9NS28 235 aa25.94■■□□□ 1.74
GLI3-202ENST00000428534 SIP14410 1827 aa25.93■■□□□ 1.74
GLI3-202ENST00000428534 HIP1RO75146 1068 aa25.93■■□□□ 1.74
GLI3-202ENST00000428534 ERLIN2O94905 339 aa25.93■■□□□ 1.74
GLI3-202ENST00000428534 KRT18P05783 430 aaKnown RBP25.93■■□□□ 1.74
GLI3-202ENST00000428534 SKIP12755 728 aa25.93■■□□□ 1.74
GLI3-202ENST00000428534 SCP2P22307 547 aa25.93■■□□□ 1.74
GLI3-202ENST00000428534 EFNA5P52803 228 aa25.93■■□□□ 1.74
GLI3-202ENST00000428534 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP25.93■■□□□ 1.74
GLI3-202ENST00000428534 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa25.93■■□□□ 1.74
GLI3-202ENST00000428534 TCTN1Q2MV58 587 aa25.93■■□□□ 1.74
GLI3-202ENST00000428534 RESP18Q5W5W9 173 aa25.93■■□□□ 1.74
GLI3-202ENST00000428534 SHC4Q6S5L8 630 aa25.93■■□□□ 1.74
GLI3-202ENST00000428534 SLC24A5Q71RS6 500 aa25.93■■□□□ 1.74
GLI3-202ENST00000428534 GPBP1Q86WP2 473 aa25.93■■□□□ 1.74
GLI3-202ENST00000428534 MYOCDQ8IZQ8 938 aa25.93■■□□□ 1.74
GLI3-202ENST00000428534 DEPTORQ8TB45 409 aa25.93■■□□□ 1.74
GLI3-202ENST00000428534 TOP1MTQ969P6 601 aa25.93■■□□□ 1.74
GLI3-202ENST00000428534 CDX2Q99626 313 aaPredicted RBP25.93■■□□□ 1.74
GLI3-202ENST00000428534 RUSC1Q9BVN2 902 aa25.93■■□□□ 1.74
GLI3-202ENST00000428534 TTYH1Q9H313 450 aaPredicted RBP25.93■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.8 ms