RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428007.1

PAICSP3-201, Transcript of phosphoribosylaminoimidazole carboxylase, phosphoribosylaminoimidazole succinocarboxamide synthetase pseudogene 3, humanhuman

BASIC

Gene PAICSP3, Length 1,168 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAICSP3-201ENST00000428007 H0YCG3 227 aa9.9□□□□□ -0.82
PAICSP3-201ENST00000428007 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.82
PAICSP3-201ENST00000428007 PPP6R2O75170 966 aa9.9□□□□□ -0.82
PAICSP3-201ENST00000428007 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.82
PAICSP3-201ENST00000428007 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.82
PAICSP3-201ENST00000428007 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP9.9□□□□□ -0.82
PAICSP3-201ENST00000428007 EIF4BP23588 611 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
PAICSP3-201ENST00000428007 AXLP30530 894 aa9.9□□□□□ -0.82
PAICSP3-201ENST00000428007 CCT6AP40227 531 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
PAICSP3-201ENST00000428007 MGAT3Q09327 533 aa9.9□□□□□ -0.82
PAICSP3-201ENST00000428007 PAK2Q13177 524 aa9.9□□□□□ -0.82
PAICSP3-201ENST00000428007 SHHQ15465 462 aa9.9□□□□□ -0.82
PAICSP3-201ENST00000428007 XKR9Q5GH70 373 aa9.9□□□□□ -0.82
PAICSP3-201ENST00000428007 FBXO47Q5MNV8 452 aa9.9□□□□□ -0.82
PAICSP3-201ENST00000428007 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.82
PAICSP3-201ENST00000428007 CATSPER3Q86XQ3 398 aa9.9□□□□□ -0.82
PAICSP3-201ENST00000428007 LINC01465Q8N7H1 131 aa9.9□□□□□ -0.82
PAICSP3-201ENST00000428007 KCNG4Q8TDN1 519 aa9.9□□□□□ -0.82
PAICSP3-201ENST00000428007 KIFAP3Q92845 792 aa9.9□□□□□ -0.82
PAICSP3-201ENST00000428007 DYDC2Q96IM9 177 aa9.9□□□□□ -0.82
PAICSP3-201ENST00000428007 MTRQ99707 1265 aa9.9□□□□□ -0.82
PAICSP3-201ENST00000428007 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP9.9□□□□□ -0.82
PAICSP3-201ENST00000428007 TRAIPQ9BWF2 469 aa9.9□□□□□ -0.82
PAICSP3-201ENST00000428007 TMEM60Q9H2L4 133 aa9.9□□□□□ -0.82
PAICSP3-201ENST00000428007 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa9.9□□□□□ -0.82
PAICSP3-201ENST00000428007 CCDC39Q9UFE4 941 aa9.9□□□□□ -0.82
PAICSP3-201ENST00000428007 AKT3Q9Y243 479 aa9.9□□□□□ -0.82
PAICSP3-201ENST00000428007 RWDD3Q9Y3V2 267 aa9.9□□□□□ -0.82
PAICSP3-201ENST00000428007 INSL6Q9Y581 213 aa9.9□□□□□ -0.82
PAICSP3-201ENST00000428007 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa9.9□□□□□ -0.82
PAICSP3-201ENST00000428007 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
PAICSP3-201ENST00000428007 CDY2AQ9Y6F7 541 aa9.9□□□□□ -0.82
PAICSP3-201ENST00000428007 ARHGEF35A5YM69 484 aa9.89□□□□□ -0.83
PAICSP3-201ENST00000428007 NBNO60934 754 aa9.89□□□□□ -0.83
PAICSP3-201ENST00000428007 RPS6KA5O75582 802 aa9.89□□□□□ -0.83
PAICSP3-201ENST00000428007 STBD1O95210 358 aa9.89□□□□□ -0.83
PAICSP3-201ENST00000428007 CHRNA1P02708 482 aa9.89□□□□□ -0.83
PAICSP3-201ENST00000428007 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa9.89□□□□□ -0.83
PAICSP3-201ENST00000428007 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
PAICSP3-201ENST00000428007 NASPP49321 788 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
PAICSP3-201ENST00000428007 RARRES1P49788 294 aa9.89□□□□□ -0.83
PAICSP3-201ENST00000428007 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
PAICSP3-201ENST00000428007 SLC39A14Q15043 492 aa9.89□□□□□ -0.83
PAICSP3-201ENST00000428007 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
PAICSP3-201ENST00000428007 MTERF2Q49AM1 385 aa9.89□□□□□ -0.83
PAICSP3-201ENST00000428007 TRAF7Q6Q0C0 670 aa9.89□□□□□ -0.83
PAICSP3-201ENST00000428007 DEFB128Q7Z7B8 93 aa9.89□□□□□ -0.83
PAICSP3-201ENST00000428007 CNNM3Q8NE01 707 aa9.89□□□□□ -0.83
PAICSP3-201ENST00000428007 EPS8L1Q8TE68 723 aa9.89□□□□□ -0.83
PAICSP3-201ENST00000428007 SNX29Q8TEQ0 813 aa9.89□□□□□ -0.83
PAICSP3-201ENST00000428007 CCDC51Q96ER9 411 aa9.89□□□□□ -0.83
PAICSP3-201ENST00000428007 CCDC34Q96HJ3 373 aa9.89□□□□□ -0.83
PAICSP3-201ENST00000428007 SCLYQ96I15 445 aa9.89□□□□□ -0.83
PAICSP3-201ENST00000428007 DRC1Q96MC2 740 aa9.89□□□□□ -0.83
PAICSP3-201ENST00000428007 SCLT1Q96NL6 688 aa9.89□□□□□ -0.83
PAICSP3-201ENST00000428007 SAMD11Q96NU1 681 aa9.89□□□□□ -0.83
PAICSP3-201ENST00000428007 CCSER1Q9C0I3 900 aa9.89□□□□□ -0.83
PAICSP3-201ENST00000428007 C2orf40Q9H1Z8 148 aa9.89□□□□□ -0.83
PAICSP3-201ENST00000428007 ELAC1Q9H777 363 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
PAICSP3-201ENST00000428007 SUGCTQ9HAC7 445 aa9.89□□□□□ -0.83
PAICSP3-201ENST00000428007 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
PAICSP3-201ENST00000428007 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
PAICSP3-201ENST00000428007 CEP290O15078 2479 aa9.89□□□□□ -0.83
PAICSP3-201ENST00000428007 DNAH12Q6ZR08 3092 aa9.88□□□□□ -0.83
PAICSP3-201ENST00000428007 ALPK3Q96L96 1907 aa9.88□□□□□ -0.83
PAICSP3-201ENST00000428007 ZBBXA8MT70 800 aa9.88□□□□□ -0.83
PAICSP3-201ENST00000428007 GPR37L1O60883 481 aa9.88□□□□□ -0.83
PAICSP3-201ENST00000428007 EYA4O95677 639 aa9.88□□□□□ -0.83
PAICSP3-201ENST00000428007 EOMESO95936 686 aa9.88□□□□□ -0.83
PAICSP3-201ENST00000428007 CYP11B2P19099 503 aa9.88□□□□□ -0.83
PAICSP3-201ENST00000428007 PHKA2P46019 1235 aa9.88□□□□□ -0.83
PAICSP3-201ENST00000428007 RAB27AP51159 221 aa9.88□□□□□ -0.83
PAICSP3-201ENST00000428007 EFNA5P52803 228 aa9.88□□□□□ -0.83
PAICSP3-201ENST00000428007 RESTQ13127 1097 aa9.88□□□□□ -0.83
PAICSP3-201ENST00000428007 CTTNQ14247 550 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
PAICSP3-201ENST00000428007 EMC2Q15006 297 aa9.88□□□□□ -0.83
PAICSP3-201ENST00000428007 UGCGQ16739 394 aa9.88□□□□□ -0.83
PAICSP3-201ENST00000428007 SLC24A5Q71RS6 500 aa9.88□□□□□ -0.83
PAICSP3-201ENST00000428007 C16orf59Q7L2K0 433 aa9.88□□□□□ -0.83
PAICSP3-201ENST00000428007 OTOP2Q7RTS6 562 aa9.88□□□□□ -0.83
PAICSP3-201ENST00000428007 HACE1Q8IYU2 909 aa9.88□□□□□ -0.83
PAICSP3-201ENST00000428007 DBF4BQ8NFT6 615 aa9.88□□□□□ -0.83
PAICSP3-201ENST00000428007 IFT74Q96LB3 600 aa9.88□□□□□ -0.83
PAICSP3-201ENST00000428007 PRIMPOLQ96LW4 560 aa9.88□□□□□ -0.83
PAICSP3-201ENST00000428007 CEP89Q96ST8 783 aa9.88□□□□□ -0.83
PAICSP3-201ENST00000428007 RAD9AQ99638 391 aa9.88□□□□□ -0.83
PAICSP3-201ENST00000428007 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP9.88□□□□□ -0.83
PAICSP3-201ENST00000428007 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP9.88□□□□□ -0.83
PAICSP3-201ENST00000428007 CUEDC2Q9H467 287 aa9.88□□□□□ -0.83
PAICSP3-201ENST00000428007 UBN1Q9NPG3 1134 aa9.88□□□□□ -0.83
PAICSP3-201ENST00000428007 RGL1Q9NZL6 768 aa9.88□□□□□ -0.83
PAICSP3-201ENST00000428007 STK39Q9UEW8 545 aa9.88□□□□□ -0.83
PAICSP3-201ENST00000428007 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa9.88□□□□□ -0.83
PAICSP3-201ENST00000428007 GTF3C5Q9Y5Q8 519 aaPredicted RBP9.88□□□□□ -0.83
PAICSP3-201ENST00000428007 MYH9P35579 1960 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
PAICSP3-201ENST00000428007 VWA3AA6NCI4 1184 aa9.87□□□□□ -0.83
PAICSP3-201ENST00000428007 POTEMA6NI47 508 aa9.87□□□□□ -0.83
PAICSP3-201ENST00000428007 BHMG1C9JSJ3 638 aaPredicted RBP9.87□□□□□ -0.83
PAICSP3-201ENST00000428007 GPR32O75388 356 aa9.87□□□□□ -0.83
PAICSP3-201ENST00000428007 F13A1P00488 732 aa9.87□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.9 ms