RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426965.1

HOXD-AS2-201, HOXD cluster antisense RNA 2, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD-AS2, Length 927 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD-AS2-201ENST00000426965 KRT79Q5XKE5 535 aa27.79■■■□□ 2.04
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HOXD-AS2-201ENST00000426965 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP27.79■■■□□ 2.04
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CLIC4Q9Y696 253 aa27.79■■■□□ 2.04
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HOXD-AS2-201ENST00000426965 GLRA2P23416 452 aa27.78■■■□□ 2.04
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HOXD-AS2-201ENST00000426965 ARHGEF35A5YM69 484 aa27.77■■■□□ 2.04
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HOXD-AS2-201ENST00000426965 BMP15O95972 392 aa27.76■■■□□ 2.03
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HOXD-AS2-201ENST00000426965 FAM102BQ5T8I3 360 aa27.75■■■□□ 2.03
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CATSPER4Q7RTX7 472 aa27.75■■■□□ 2.03
HOXD-AS2-201ENST00000426965 FIBCD1Q8N539 461 aa27.75■■■□□ 2.03
HOXD-AS2-201ENST00000426965 MCPH1Q8NEM0 835 aa27.75■■■□□ 2.03
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CHST12Q9NRB3 414 aa27.75■■■□□ 2.03
HOXD-AS2-201ENST00000426965 TMEM161AQ9NX61 479 aa27.75■■■□□ 2.03
HOXD-AS2-201ENST00000426965 MYO9BQ13459 2157 aa27.75■■■□□ 2.03
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HOXD-AS2-201ENST00000426965 POU5F1BQ06416 359 aa27.74■■■□□ 2.03
HOXD-AS2-201ENST00000426965 GRB10Q13322 594 aa27.74■■■□□ 2.03
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HOXD-AS2-201ENST00000426965 EPC2Q52LR7 807 aa27.74■■■□□ 2.03
HOXD-AS2-201ENST00000426965 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP27.74■■■□□ 2.03
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HOXD-AS2-201ENST00000426965 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP27.74■■■□□ 2.03
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HOXD-AS2-201ENST00000426965 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP27.72■■■□□ 2.03
HOXD-AS2-201ENST00000426965 TMEM192Q8IY95 271 aa27.72■■■□□ 2.03
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HOXD-AS2-201ENST00000426965 POU3F3P20264 500 aaPredicted RBP27.71■■■□□ 2.03
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HOXD-AS2-201ENST00000426965 AMHR2Q16671 573 aa27.7■■■□□ 2.02
HOXD-AS2-201ENST00000426965 TMEM119Q4V9L6 283 aa27.7■■■□□ 2.02
HOXD-AS2-201ENST00000426965 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP27.7■■■□□ 2.02
HOXD-AS2-201ENST00000426965 FBXO22Q8NEZ5 403 aa27.7■■■□□ 2.02
HOXD-AS2-201ENST00000426965 LRRC15Q8TF66 581 aa27.7■■■□□ 2.02
HOXD-AS2-201ENST00000426965 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP27.7■■■□□ 2.02
HOXD-AS2-201ENST00000426965 RUSC1Q9BVN2 902 aa27.7■■■□□ 2.02
HOXD-AS2-201ENST00000426965 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP27.7■■■□□ 2.02
HOXD-AS2-201ENST00000426965 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP27.7■■■□□ 2.02
HOXD-AS2-201ENST00000426965 REV3LO60673 3130 aa27.69■■■□□ 2.02
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