RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000417171.5

PDZK1-202, Transcript of PDZ domain containing 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PDZK1, Length 2,230 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZK1-202ENST00000417171 TARSP26639 723 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
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PDZK1-202ENST00000417171 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
PDZK1-202ENST00000417171 TCIRG1Q13488 830 aa9.48□□□□□ -0.89
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PDZK1-202ENST00000417171 WDR72Q3MJ13 1102 aa9.48□□□□□ -0.89
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PDZK1-202ENST00000417171 SLF2Q8IX21 1173 aa9.48□□□□□ -0.89
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PDZK1-202ENST00000417171 HAUS1Q96CS2 278 aa9.48□□□□□ -0.89
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PDZK1-202ENST00000417171 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa9.46□□□□□ -0.89
PDZK1-202ENST00000417171 PPAN-P2RY11A0A0B4J1V8 794 aaPredicted RBP9.46□□□□□ -0.89
PDZK1-202ENST00000417171 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa9.46□□□□□ -0.89
PDZK1-202ENST00000417171 SMIM23A6NLE4 172 aa9.46□□□□□ -0.89
PDZK1-202ENST00000417171 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP9.46□□□□□ -0.89
PDZK1-202ENST00000417171 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP9.46□□□□□ -0.89
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