RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000414253.5

FAAP20-206, Transcript of FA core complex associated protein 20, humanhuman

TSL 2

Gene FAAP20, Length 2,216 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP20-206ENST00000414253 MTMR3Q13615 1198 aa26.65■■□□□ 1.86
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FAAP20-206ENST00000414253 FLOT1O75955 427 aa26.65■■□□□ 1.86
FAAP20-206ENST00000414253 SLITRK3O94933 977 aa26.65■■□□□ 1.86
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FAAP20-206ENST00000414253 BMT2Q1RMZ1 405 aa26.63■■□□□ 1.85
FAAP20-206ENST00000414253 SLFN11Q7Z7L1 901 aa26.63■■□□□ 1.85
FAAP20-206ENST00000414253 LMBR1Q8WVP7 490 aa26.63■■□□□ 1.85
FAAP20-206ENST00000414253 SLITRK6Q9H5Y7 841 aa26.63■■□□□ 1.85
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FAAP20-206ENST00000414253 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP26.62■■□□□ 1.85
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FAAP20-206ENST00000414253 SYCE1Q8N0S2 351 aa26.61■■□□□ 1.85
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FAAP20-206ENST00000414253 SEC14L1Q92503 715 aa26.61■■□□□ 1.85
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FAAP20-206ENST00000414253 SFI1A8K8P3 1242 aa26.6■■□□□ 1.85
FAAP20-206ENST00000414253 GCNT3O95395 438 aa26.6■■□□□ 1.85
FAAP20-206ENST00000414253 H2AFZP0C0S5 128 aa26.6■■□□□ 1.85
FAAP20-206ENST00000414253 ARP10275 920 aa26.6■■□□□ 1.85
FAAP20-206ENST00000414253 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP26.6■■□□□ 1.85
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FAAP20-206ENST00000414253 POLD1P28340 1107 aa26.6■■□□□ 1.85
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FAAP20-206ENST00000414253 C1orf186Q6ZWK4 172 aa26.6■■□□□ 1.85
FAAP20-206ENST00000414253 H2AFVQ71UI9 128 aa26.6■■□□□ 1.85
FAAP20-206ENST00000414253 VPS36Q86VN1 386 aa26.6■■□□□ 1.85
FAAP20-206ENST00000414253 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP26.6■■□□□ 1.85
FAAP20-206ENST00000414253 OLFML3Q9NRN5 406 aa26.6■■□□□ 1.85
FAAP20-206ENST00000414253 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP26.6■■□□□ 1.85
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FAAP20-206ENST00000414253 ZBTB39O15060 712 aa26.59■■□□□ 1.85
FAAP20-206ENST00000414253 PAEPP09466 180 aa26.59■■□□□ 1.85
FAAP20-206ENST00000414253 ITGA4P13612 1032 aa26.59■■□□□ 1.85
FAAP20-206ENST00000414253 EPHA7Q15375 998 aa26.59■■□□□ 1.85
FAAP20-206ENST00000414253 CCDC121Q6ZUS5 278 aa26.59■■□□□ 1.85
FAAP20-206ENST00000414253 TMC3Q7Z5M5 1100 aa26.59■■□□□ 1.85
FAAP20-206ENST00000414253 ZNF577Q9BSK1 485 aa26.59■■□□□ 1.85
FAAP20-206ENST00000414253 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP26.59■■□□□ 1.85
FAAP20-206ENST00000414253 NPEPPSP55786 919 aa26.59■■□□□ 1.85
FAAP20-206ENST00000414253 ODF2Q5BJF6 829 aa26.59■■□□□ 1.85
FAAP20-206ENST00000414253 AGBL1Q96MI9 1066 aa26.59■■□□□ 1.85
FAAP20-206ENST00000414253 ZNF341Q9BYN7 854 aa26.59■■□□□ 1.85
FAAP20-206ENST00000414253 DEFB129Q9H1M3 183 aa26.59■■□□□ 1.85
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