RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000393389.7

ANKRD42-202, Transcript of ankyrin repeat domain 42, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene ANKRD42, Length 4,066 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD42-202ENST00000393389 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP9.34□□□□□ -0.91
ANKRD42-202ENST00000393389 CYFIP1Q7L576 1253 aa9.34□□□□□ -0.91
ANKRD42-202ENST00000393389 DEPTORQ8TB45 409 aa9.34□□□□□ -0.91
ANKRD42-202ENST00000393389 SPIRE2Q8WWL2 714 aa9.34□□□□□ -0.91
ANKRD42-202ENST00000393389 HVCN1Q96D96 273 aa9.34□□□□□ -0.91
ANKRD42-202ENST00000393389 ACCSQ96QU6 501 aa9.34□□□□□ -0.91
ANKRD42-202ENST00000393389 NUP85Q9BW27 656 aa9.34□□□□□ -0.91
ANKRD42-202ENST00000393389 ACP6Q9NPH0 428 aa9.34□□□□□ -0.91
ANKRD42-202ENST00000393389 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP9.34□□□□□ -0.91
ANKRD42-202ENST00000393389 DYNC1LI1Q9Y6G9 523 aaKnown RBP9.34□□□□□ -0.91
ANKRD42-202ENST00000393389 CLDN3O15551 220 aa9.34□□□□□ -0.91
ANKRD42-202ENST00000393389 GUCY2CP25092 1073 aa9.34□□□□□ -0.91
ANKRD42-202ENST00000393389 ALDH3A1P30838 453 aa9.34□□□□□ -0.91
ANKRD42-202ENST00000393389 PIK3CAP42336 1068 aa9.34□□□□□ -0.91
ANKRD42-202ENST00000393389 ECE1P42892 770 aa9.34□□□□□ -0.91
ANKRD42-202ENST00000393389 ECM1Q16610 540 aa9.34□□□□□ -0.91
ANKRD42-202ENST00000393389 SCYL2Q6P3W7 929 aa9.34□□□□□ -0.91
ANKRD42-202ENST00000393389 ZBTB33Q86T24 672 aa9.34□□□□□ -0.91
ANKRD42-202ENST00000393389 C4orf32Q8N8J7 132 aa9.34□□□□□ -0.91
ANKRD42-202ENST00000393389 KCNV2Q8TDN2 545 aa9.34□□□□□ -0.91
ANKRD42-202ENST00000393389 RFFLQ8WZ73 363 aa9.34□□□□□ -0.91
ANKRD42-202ENST00000393389 N4BP2L2Q92802 583 aaPredicted RBP9.34□□□□□ -0.91
ANKRD42-202ENST00000393389 FAM213AQ9BRX8 229 aa9.34□□□□□ -0.91
ANKRD42-202ENST00000393389 PI4K2AQ9BTU6 479 aa9.34□□□□□ -0.91
ANKRD42-202ENST00000393389 EPN3Q9H201 632 aa9.34□□□□□ -0.91
ANKRD42-202ENST00000393389 CD248Q9HCU0 757 aa9.34□□□□□ -0.91
ANKRD42-202ENST00000393389 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP9.34□□□□□ -0.91
ANKRD42-202ENST00000393389 RGPD2P0DJD1 1756 aa9.34□□□□□ -0.91
ANKRD42-202ENST00000393389 FMN2Q9NZ56 1722 aa9.33□□□□□ -0.92
ANKRD42-202ENST00000393389 A0A1B0GUA9 196 aa9.33□□□□□ -0.92
ANKRD42-202ENST00000393389 FMO5P49326 533 aa9.33□□□□□ -0.92
ANKRD42-202ENST00000393389 NPEPPSP55786 919 aa9.33□□□□□ -0.92
ANKRD42-202ENST00000393389 MEA1Q16626 185 aa9.33□□□□□ -0.92
ANKRD42-202ENST00000393389 AADACL2Q6P093 401 aa9.33□□□□□ -0.92
ANKRD42-202ENST00000393389 FMNL3Q8IVF7 1028 aa9.33□□□□□ -0.92
ANKRD42-202ENST00000393389 KIRREL3Q8IZU9 778 aa9.33□□□□□ -0.92
ANKRD42-202ENST00000393389 CCDC89Q8N998 374 aa9.33□□□□□ -0.92
ANKRD42-202ENST00000393389 C9orf72Q96LT7 481 aa9.33□□□□□ -0.92
ANKRD42-202ENST00000393389 WDR11Q9BZH6 1224 aa9.33□□□□□ -0.92
ANKRD42-202ENST00000393389 TRIM7Q9C029 511 aa9.33□□□□□ -0.92
ANKRD42-202ENST00000393389 EFCC1Q9HA90 598 aa9.33□□□□□ -0.92
ANKRD42-202ENST00000393389 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP9.33□□□□□ -0.92
ANKRD42-202ENST00000393389 PARP2Q9UGN5 583 aa9.33□□□□□ -0.92
ANKRD42-202ENST00000393389 SIK3Q9Y2K2 1263 aa9.33□□□□□ -0.92
ANKRD42-202ENST00000393389 PPAN-P2RY11A0A0B4J1V8 794 aaPredicted RBP9.33□□□□□ -0.92
ANKRD42-202ENST00000393389 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa9.33□□□□□ -0.92
ANKRD42-202ENST00000393389 TMEM150BA6NC51 233 aa9.33□□□□□ -0.92
ANKRD42-202ENST00000393389 SGK1O00141 431 aa9.33□□□□□ -0.92
ANKRD42-202ENST00000393389 FOXN3O00409 490 aaPredicted RBP9.33□□□□□ -0.92
ANKRD42-202ENST00000393389 NEBLO76041 1014 aa9.33□□□□□ -0.92
ANKRD42-202ENST00000393389 ATP5DP30049 168 aa9.33□□□□□ -0.92
ANKRD42-202ENST00000393389 VAMP7P51809 220 aa9.33□□□□□ -0.92
ANKRD42-202ENST00000393389 ERVK-9P63128 1117 aa9.33□□□□□ -0.92
ANKRD42-202ENST00000393389 PWP2Q15269 919 aaKnown RBP9.33□□□□□ -0.92
ANKRD42-202ENST00000393389 ZC3H8Q8N5P1 291 aaKnown RBP eCLIP9.33□□□□□ -0.92
ANKRD42-202ENST00000393389 ZNF564Q8TBZ8 553 aaPredicted RBP9.33□□□□□ -0.92
ANKRD42-202ENST00000393389 FAM84AQ96KN4 292 aa9.33□□□□□ -0.92
ANKRD42-202ENST00000393389 PRMT1Q99873 361 aaKnown RBP9.33□□□□□ -0.92
ANKRD42-202ENST00000393389 GPRC5CQ9NQ84 441 aa9.33□□□□□ -0.92
ANKRD42-202ENST00000393389 USP20Q9Y2K6 914 aa9.33□□□□□ -0.92
ANKRD42-202ENST00000393389 LRRD1A4D1F6 860 aa9.33□□□□□ -0.92
ANKRD42-202ENST00000393389 TISP43B9A030 160 aa9.33□□□□□ -0.92
ANKRD42-202ENST00000393389 SPAG7O75391 227 aa9.33□□□□□ -0.92
ANKRD42-202ENST00000393389 USP11P51784 963 aa9.33□□□□□ -0.92
ANKRD42-202ENST00000393389 GPC5P78333 572 aa9.33□□□□□ -0.92
ANKRD42-202ENST00000393389 SLC29A2Q14542 456 aa9.33□□□□□ -0.92
ANKRD42-202ENST00000393389 PLA2G4FQ68DD2 849 aa9.33□□□□□ -0.92
ANKRD42-202ENST00000393389 FRMD5Q7Z6J6 570 aa9.33□□□□□ -0.92
ANKRD42-202ENST00000393389 PAF1Q8N7H5 531 aa9.33□□□□□ -0.92
ANKRD42-202ENST00000393389 XXYLT1Q8NBI6 393 aa9.33□□□□□ -0.92
ANKRD42-202ENST00000393389 DAGLBQ8NCG7 672 aa9.33□□□□□ -0.92
ANKRD42-202ENST00000393389 TPCN2Q8NHX9 752 aa9.33□□□□□ -0.92
ANKRD42-202ENST00000393389 ACER1Q8TDN7 264 aa9.33□□□□□ -0.92
ANKRD42-202ENST00000393389 FAM20AQ96MK3 541 aa9.33□□□□□ -0.92
ANKRD42-202ENST00000393389 MYCBPQ99417 103 aaPredicted RBP9.33□□□□□ -0.92
ANKRD42-202ENST00000393389 MAK16Q9BXY0 300 aaKnown RBP9.33□□□□□ -0.92
ANKRD42-202ENST00000393389 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP9.33□□□□□ -0.92
ANKRD42-202ENST00000393389 ALG6Q9Y672 507 aa9.33□□□□□ -0.92
ANKRD42-202ENST00000393389 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP9.32□□□□□ -0.92
ANKRD42-202ENST00000393389 PDXKO00764 312 aa9.32□□□□□ -0.92
ANKRD42-202ENST00000393389 MSH4O15457 936 aa9.32□□□□□ -0.92
ANKRD42-202ENST00000393389 ECE2O60344 883 aa9.32□□□□□ -0.92
ANKRD42-202ENST00000393389 ZBED4O75132 1171 aa9.32□□□□□ -0.92
ANKRD42-202ENST00000393389 CALCAP01258 141 aa9.32□□□□□ -0.92
ANKRD42-202ENST00000393389 CHN1P15882 459 aa9.32□□□□□ -0.92
ANKRD42-202ENST00000393389 PRELPP51888 382 aa9.32□□□□□ -0.92
ANKRD42-202ENST00000393389 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP9.32□□□□□ -0.92
ANKRD42-202ENST00000393389 RWDD2BP57060 319 aa9.32□□□□□ -0.92
ANKRD42-202ENST00000393389 PPP4CP60510 307 aa9.32□□□□□ -0.92
ANKRD42-202ENST00000393389 BFSP1Q12934 665 aa9.32□□□□□ -0.92
ANKRD42-202ENST00000393389 AP3B2Q13367 1082 aa9.32□□□□□ -0.92
ANKRD42-202ENST00000393389 PTGISQ16647 500 aa9.32□□□□□ -0.92
ANKRD42-202ENST00000393389 TTMPQ5BVD1 217 aa9.32□□□□□ -0.92
ANKRD42-202ENST00000393389 CASC4Q6P4E1 433 aa9.32□□□□□ -0.92
ANKRD42-202ENST00000393389 TRIM59Q8IWR1 403 aa9.32□□□□□ -0.92
ANKRD42-202ENST00000393389 NLGN1Q8N2Q7 840 aa9.32□□□□□ -0.92
ANKRD42-202ENST00000393389 KIF2BQ8N4N8 673 aa9.32□□□□□ -0.92
ANKRD42-202ENST00000393389 SLC20A1Q8WUM9 679 aa9.32□□□□□ -0.92
ANKRD42-202ENST00000393389 ATG4AQ8WYN0 398 aa9.32□□□□□ -0.92
ANKRD42-202ENST00000393389 C18orf8Q96DM3 657 aa9.32□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.4 ms