RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000392011.6

SH3BP4-202, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP4, Length 5,194 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-202ENST00000392011 MMEL1Q495T6 779 aa18.44■□□□□ 0.54
SH3BP4-202ENST00000392011 NUP85Q9BW27 656 aa18.44■□□□□ 0.54
SH3BP4-202ENST00000392011 MRFAP1Q9Y605 127 aa18.44■□□□□ 0.54
SH3BP4-202ENST00000392011 DSTYKQ6XUX3 929 aa18.44■□□□□ 0.54
SH3BP4-202ENST00000392011 CRAMP1Q96RY5 1269 aa18.44■□□□□ 0.54
SH3BP4-202ENST00000392011 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa18.44■□□□□ 0.54
SH3BP4-202ENST00000392011 IPO11Q9UI26 975 aaKnown RBP18.44■□□□□ 0.54
SH3BP4-202ENST00000392011 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP18.44■□□□□ 0.54
SH3BP4-202ENST00000392011 PFDN6O15212 129 aa18.44■□□□□ 0.54
SH3BP4-202ENST00000392011 MYCP01106 439 aaPredicted RBP18.44■□□□□ 0.54
SH3BP4-202ENST00000392011 SRGAP2BP0DMP2 458 aa18.44■□□□□ 0.54
SH3BP4-202ENST00000392011 SLC8A1P32418 973 aa18.44■□□□□ 0.54
SH3BP4-202ENST00000392011 SERPINB6P35237 376 aa18.44■□□□□ 0.54
SH3BP4-202ENST00000392011 HNRNPH2P55795 449 aaKnown RBP18.44■□□□□ 0.54
SH3BP4-202ENST00000392011 ADCY2Q08462 1091 aa18.44■□□□□ 0.54
SH3BP4-202ENST00000392011 RHPN2Q8IUC4 686 aa18.44■□□□□ 0.54
SH3BP4-202ENST00000392011 MTRQ99707 1265 aa18.44■□□□□ 0.54
SH3BP4-202ENST00000392011 UBE2Q2LH0YL09 131 aa18.44■□□□□ 0.54
SH3BP4-202ENST00000392011 TOM1L1O75674 476 aa18.44■□□□□ 0.54
SH3BP4-202ENST00000392011 PCSK1NQ9UHG2 260 aa18.44■□□□□ 0.54
SH3BP4-202ENST00000392011 TLK1Q9UKI8 766 aa18.44■□□□□ 0.54
SH3BP4-202ENST00000392011 PNMA3Q9UL41 463 aa18.44■□□□□ 0.54
SH3BP4-202ENST00000392011 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa18.44■□□□□ 0.54
SH3BP4-202ENST00000392011 PLS3P13797 630 aa18.43■□□□□ 0.54
SH3BP4-202ENST00000392011 BBS5Q8N3I7 341 aa18.43■□□□□ 0.54
SH3BP4-202ENST00000392011 THOC1Q96FV9 657 aaKnown RBP18.43■□□□□ 0.54
SH3BP4-202ENST00000392011 MYMKA6NI61 221 aa18.43■□□□□ 0.54
SH3BP4-202ENST00000392011 HMGCS2P54868 508 aa18.43■□□□□ 0.54
SH3BP4-202ENST00000392011 SEMA3FQ13275 785 aa18.43■□□□□ 0.54
SH3BP4-202ENST00000392011 PLCB4Q15147 1175 aa18.43■□□□□ 0.54
SH3BP4-202ENST00000392011 DBN1Q16643 649 aa18.43■□□□□ 0.54
SH3BP4-202ENST00000392011 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa18.43■□□□□ 0.54
SH3BP4-202ENST00000392011 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP18.43■□□□□ 0.54
SH3BP4-202ENST00000392011 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP18.43■□□□□ 0.54
SH3BP4-202ENST00000392011 PCDHA10Q9Y5I2 948 aa18.43■□□□□ 0.54
SH3BP4-202ENST00000392011 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP18.43■□□□□ 0.54
SH3BP4-202ENST00000392011 MIPOL1Q8TD10 442 aa18.43■□□□□ 0.54
SH3BP4-202ENST00000392011 ELAC2Q9BQ52 826 aaKnown RBP18.43■□□□□ 0.54
SH3BP4-202ENST00000392011 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP18.43■□□□□ 0.54
SH3BP4-202ENST00000392011 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa18.43■□□□□ 0.54
SH3BP4-202ENST00000392011 PDHBP11177 359 aa18.43■□□□□ 0.54
SH3BP4-202ENST00000392011 HIBCHQ6NVY1 386 aaPredicted RBP18.43■□□□□ 0.54
SH3BP4-202ENST00000392011 HEY1Q9Y5J3 304 aa18.43■□□□□ 0.54
SH3BP4-202ENST00000392011 A0A087WUV0 522 aaPredicted RBP18.42■□□□□ 0.54
SH3BP4-202ENST00000392011 MYLK4Q86YV6 388 aaPredicted RBP18.42■□□□□ 0.54
SH3BP4-202ENST00000392011 TRIM42Q8IWZ5 723 aa18.42■□□□□ 0.54
SH3BP4-202ENST00000392011 EFCAB13Q8IY85 973 aa18.42■□□□□ 0.54
SH3BP4-202ENST00000392011 OTUD5Q96G74 571 aa18.42■□□□□ 0.54
SH3BP4-202ENST00000392011 G3BP2Q9UN86 482 aaKnown RBP18.42■□□□□ 0.54
SH3BP4-202ENST00000392011 PXDNLA1KZ92 1463 aa18.42■□□□□ 0.54
SH3BP4-202ENST00000392011 PDXKO00764 312 aa18.42■□□□□ 0.54
SH3BP4-202ENST00000392011 STRIP1Q5VSL9 837 aa18.42■□□□□ 0.54
SH3BP4-202ENST00000392011 KIAA1841Q6NSI8 718 aa18.42■□□□□ 0.54
SH3BP4-202ENST00000392011 RBM41Q96IZ5 413 aaKnown RBP18.42■□□□□ 0.54
SH3BP4-202ENST00000392011 ACAD9Q9H845 621 aa18.42■□□□□ 0.54
SH3BP4-202ENST00000392011 DLC1Q96QB1 1528 aa18.42■□□□□ 0.54
SH3BP4-202ENST00000392011 GOLGA8MH3BSY2 632 aa18.42■□□□□ 0.54
SH3BP4-202ENST00000392011 RHOBTB3O94955 611 aa18.42■□□□□ 0.54
SH3BP4-202ENST00000392011 SPATA4Q8NEY3 305 aa18.42■□□□□ 0.54
SH3BP4-202ENST00000392011 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP18.42■□□□□ 0.54
SH3BP4-202ENST00000392011 CPSF3Q9UKF6 684 aaKnown RBP18.42■□□□□ 0.54
SH3BP4-202ENST00000392011 STXBP3O00186 592 aa18.42■□□□□ 0.54
SH3BP4-202ENST00000392011 CSPG5O95196 566 aa18.42■□□□□ 0.54
SH3BP4-202ENST00000392011 JADE1Q6IE81 842 aa18.42■□□□□ 0.54
SH3BP4-202ENST00000392011 FRMD5Q7Z6J6 570 aa18.42■□□□□ 0.54
SH3BP4-202ENST00000392011 RNF139Q8WU17 664 aa18.41■□□□□ 0.54
SH3BP4-202ENST00000392011 FAF2Q96CS3 445 aa18.41■□□□□ 0.54
SH3BP4-202ENST00000392011 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP18.41■□□□□ 0.542e-6■■■□□ 14.6
SH3BP4-202ENST00000392011 EDEM3Q9BZQ6 932 aa18.41■□□□□ 0.54
SH3BP4-202ENST00000392011 FIS1Q9Y3D6 152 aa18.41■□□□□ 0.54
SH3BP4-202ENST00000392011 PHKA2P46019 1235 aa18.41■□□□□ 0.54
SH3BP4-202ENST00000392011 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP18.41■□□□□ 0.54
SH3BP4-202ENST00000392011 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP18.41■□□□□ 0.54
SH3BP4-202ENST00000392011 NR1I3Q14994 352 aa18.41■□□□□ 0.54
SH3BP4-202ENST00000392011 PDCD7Q8N8D1 485 aaKnown RBP18.41■□□□□ 0.54
SH3BP4-202ENST00000392011 C7orf25Q9BPX7 421 aa18.41■□□□□ 0.54
SH3BP4-202ENST00000392011 ABCA9Q8IUA7 1624 aa18.41■□□□□ 0.54
SH3BP4-202ENST00000392011 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa18.41■□□□□ 0.54
SH3BP4-202ENST00000392011 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa18.41■□□□□ 0.54
SH3BP4-202ENST00000392011 RPSAP08865 295 aaKnown RBP18.41■□□□□ 0.54
SH3BP4-202ENST00000392011 KLRK1P26718 216 aa18.41■□□□□ 0.54
SH3BP4-202ENST00000392011 GNA15P30679 374 aa18.41■□□□□ 0.54
SH3BP4-202ENST00000392011 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP18.41■□□□□ 0.54
SH3BP4-202ENST00000392011 SOX5P35711 763 aa18.41■□□□□ 0.54
SH3BP4-202ENST00000392011 SEPT6Q14141 434 aa18.41■□□□□ 0.54
SH3BP4-202ENST00000392011 C16orf86Q6ZW13 317 aa18.41■□□□□ 0.54
SH3BP4-202ENST00000392011 FBXL13Q8NEE6 735 aa18.41■□□□□ 0.54
SH3BP4-202ENST00000392011 RBAKQ9NYW8 714 aaPredicted RBP18.41■□□□□ 0.54
SH3BP4-202ENST00000392011 IQSEC2Q5JU85 1478 aa18.4■□□□□ 0.54
SH3BP4-202ENST00000392011 UBE4BO95155 1302 aa18.4■□□□□ 0.54
SH3BP4-202ENST00000392011 EVI5O60447 810 aa18.4■□□□□ 0.54
SH3BP4-202ENST00000392011 TROAPQ12815 778 aa18.4■□□□□ 0.54
SH3BP4-202ENST00000392011 TSTA3Q13630 321 aaPredicted RBP18.4■□□□□ 0.54
SH3BP4-202ENST00000392011 ZNF449Q6P9G9 518 aa18.4■□□□□ 0.54
SH3BP4-202ENST00000392011 GBP5Q96PP8 586 aa18.4■□□□□ 0.54
SH3BP4-202ENST00000392011 MLXIPLQ9NP71 852 aa18.4■□□□□ 0.54
SH3BP4-202ENST00000392011 SLC12A6Q9UHW9 1150 aa18.4■□□□□ 0.54
SH3BP4-202ENST00000392011 LRFN2Q9ULH4 789 aa18.4■□□□□ 0.54
SH3BP4-202ENST00000392011 ZNF185O15231 689 aa18.4■□□□□ 0.54
SH3BP4-202ENST00000392011 OPHN1O60890 802 aa18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.7 ms