RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000390938.1

RNU6-930P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 930, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-930P, Length 100 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-930P-201ENST00000390938 STIM2Q9P246 746 aa-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-930P-201ENST00000390938 GULP1Q9UBP9 304 aa-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-930P-201ENST00000390938 EIF2B4Q9UI10 523 aaKnown RBP-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-930P-201ENST00000390938 POU2F3Q9UKI9 436 aa-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-930P-201ENST00000390938 MUC12Q9UKN1 5478 aa-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-930P-201ENST00000390938 ZFHX2Q9C0A1 2572 aaPredicted RBP-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-930P-201ENST00000390938 TTC3P53804 2025 aa-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-930P-201ENST00000390938 A0A1B0GUV1 79 aa-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-930P-201ENST00000390938 ESYT3A0FGR9 886 aa-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-930P-201ENST00000390938 UPK3BL1B0FP48 263 aa-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-930P-201ENST00000390938 B4DGG1 531 aa-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-930P-201ENST00000390938 UPK3BL2E5RIL1 263 aa-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-930P-201ENST00000390938 TUBB4AP04350 444 aa-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-930P-201ENST00000390938 PSG1P11464 419 aa-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-930P-201ENST00000390938 PRF1P14222 555 aa-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-930P-201ENST00000390938 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-930P-201ENST00000390938 CEACAM8P31997 349 aaPredicted RBP-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-930P-201ENST00000390938 ARHGAP25P42331 645 aa-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-930P-201ENST00000390938 GLRBP48167 497 aa-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-930P-201ENST00000390938 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-930P-201ENST00000390938 POU5F1BQ06416 359 aa-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-930P-201ENST00000390938 SCAPQ12770 1279 aa-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-930P-201ENST00000390938 KRT72Q14CN4 511 aa-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-930P-201ENST00000390938 RASIP1Q5U651 963 aa-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-930P-201ENST00000390938 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-930P-201ENST00000390938 FAM111BQ6SJ93 734 aa-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-930P-201ENST00000390938 RAB11FIP1Q6WKZ4 1283 aaPredicted RBP-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-930P-201ENST00000390938 OAFQ86UD1 273 aa-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-930P-201ENST00000390938 SLITRK4Q8IW52 837 aa-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-930P-201ENST00000390938 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-930P-201ENST00000390938 GJD3Q8N144 294 aa-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-930P-201ENST00000390938 CBARPQ8N350 705 aaPredicted RBP-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-930P-201ENST00000390938 C16orf52Q8NHV5 167 aa-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-930P-201ENST00000390938 LMO3Q8TAP4 145 aa-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-930P-201ENST00000390938 FAM234AQ9H0X4 552 aa-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-930P-201ENST00000390938 OR10A2Q9H208 303 aa-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-930P-201ENST00000390938 ADAM21Q9UKJ8 722 aa-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-930P-201ENST00000390938 KLLNB2CW77 178 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-930P-201ENST00000390938 HOXA3O43365 443 aaPredicted RBP-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-930P-201ENST00000390938 ATP12AP54707 1039 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-930P-201ENST00000390938 SOX10P56693 466 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-930P-201ENST00000390938 ERVFC1-1P60608 527 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-930P-201ENST00000390938 DAZAP2Q15038 168 aaPredicted RBP-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-930P-201ENST00000390938 RBMS2Q15434 407 aaKnown RBP-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-930P-201ENST00000390938 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-930P-201ENST00000390938 TSTD2Q5T7W7 516 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-930P-201ENST00000390938 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-930P-201ENST00000390938 ADGRA1Q86SQ6 560 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-930P-201ENST00000390938 CNGA4Q8IV77 575 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-930P-201ENST00000390938 RGS22Q8NE09 1264 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-930P-201ENST00000390938 NTNG2Q96CW9 530 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-930P-201ENST00000390938 MED30Q96HR3 178 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-930P-201ENST00000390938 ATOH8Q96SQ7 321 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-930P-201ENST00000390938 SRRTQ9BXP5 876 aaKnown RBP-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-930P-201ENST00000390938 RMI1Q9H9A7 625 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-930P-201ENST00000390938 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-930P-201ENST00000390938 IGF2BP1Q9NZI8 577 aaKnown RBP eCLIP-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-930P-201ENST00000390938 TRPM5Q9NZQ8 1165 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-930P-201ENST00000390938 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-930P-201ENST00000390938 FAT4Q6V0I7 4981 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-930P-201ENST00000390938 USP17L3A6NCW0 530 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-930P-201ENST00000390938 USP17L4A6NCW7 530 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-930P-201ENST00000390938 USP17L10C9JJH3 530 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-930P-201ENST00000390938 MFAP3LO75121 409 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-930P-201ENST00000390938 IPO13O94829 963 aaKnown RBP-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-930P-201ENST00000390938 IL18BPO95998 194 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-930P-201ENST00000390938 EGFP01133 1207 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-930P-201ENST00000390938 RNF224P0DH78 156 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-930P-201ENST00000390938 SOX11P35716 441 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-930P-201ENST00000390938 USP5P45974 858 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-930P-201ENST00000390938 COASYQ13057 564 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-930P-201ENST00000390938 UBXN2BQ14CS0 331 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-930P-201ENST00000390938 DDB1Q16531 1140 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-930P-201ENST00000390938 SKIDA1Q1XH10 827 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-930P-201ENST00000390938 PMS2CLQ68D20 193 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-930P-201ENST00000390938 VASNQ6EMK4 673 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-930P-201ENST00000390938 USP17L2Q6R6M4 530 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-930P-201ENST00000390938 USP17L1Q7RTZ2 530 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-930P-201ENST00000390938 RETREG2Q8NC44 543 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-930P-201ENST00000390938 ARRDC4Q8NCT1 418 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-930P-201ENST00000390938 RABGGTAQ92696 567 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-930P-201ENST00000390938 COQ8BQ96D53 544 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-930P-201ENST00000390938 SDF2L1Q9HCN8 221 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-930P-201ENST00000390938 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-930P-201ENST00000390938 POT1Q9NUX5 634 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-930P-201ENST00000390938 HSPBP1Q9NZL4 362 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-930P-201ENST00000390938 RNF181Q9P0P0 153 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-930P-201ENST00000390938 ZNF282Q9UDV7 671 aaPredicted RBP-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-930P-201ENST00000390938 E5RJQ4 531 aa-0.8□□□□□ -2.54
RNU6-930P-201ENST00000390938 IFNL4K9M1U5 179 aa-0.8□□□□□ -2.54
RNU6-930P-201ENST00000390938 GFRA2O00451 464 aa-0.8□□□□□ -2.54
RNU6-930P-201ENST00000390938 KCNJ5P48544 419 aa-0.8□□□□□ -2.54
RNU6-930P-201ENST00000390938 MRE11P49959 708 aa-0.8□□□□□ -2.54
RNU6-930P-201ENST00000390938 KCNQ1P51787 676 aa-0.8□□□□□ -2.54
RNU6-930P-201ENST00000390938 RNF4P78317 190 aa-0.8□□□□□ -2.54
RNU6-930P-201ENST00000390938 LRRC14Q15048 493 aa-0.8□□□□□ -2.54
RNU6-930P-201ENST00000390938 SF1Q15637 639 aaKnown RBP-0.8□□□□□ -2.54
RNU6-930P-201ENST00000390938 IQSEC1Q6DN90 963 aa-0.8□□□□□ -2.54
RNU6-930P-201ENST00000390938 ZNF343Q6P1L6 599 aa-0.8□□□□□ -2.54
RNU6-930P-201ENST00000390938 GDF7Q7Z4P5 450 aa-0.8□□□□□ -2.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.2 ms