RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000379359.3

RGCC-201, Transcript of regulator of cell cycle, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RGCC, Length 960 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGCC-201ENST00000379359 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP22.37■■□□□ 1.17
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RGCC-201ENST00000379359 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa22.37■■□□□ 1.17
RGCC-201ENST00000379359 LAG3P18627 525 aa22.36■■□□□ 1.17
RGCC-201ENST00000379359 MCM7P33993 719 aa22.36■■□□□ 1.17
RGCC-201ENST00000379359 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
RGCC-201ENST00000379359 TWF2Q6IBS0 349 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
RGCC-201ENST00000379359 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP22.36■■□□□ 1.17
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RGCC-201ENST00000379359 TCP11Q8WWU5 503 aa22.36■■□□□ 1.17
RGCC-201ENST00000379359 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
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RGCC-201ENST00000379359 A0A0U1RQF3 1178 aa22.34■■□□□ 1.17
RGCC-201ENST00000379359 SLITRK3O94933 977 aa22.34■■□□□ 1.17
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RGCC-201ENST00000379359 HYAL1Q12794 435 aa22.34■■□□□ 1.17
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RGCC-201ENST00000379359 HELQQ8TDG4 1101 aa22.34■■□□□ 1.17
RGCC-201ENST00000379359 MTRQ99707 1265 aa22.34■■□□□ 1.17
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RGCC-201ENST00000379359 KIAA1671Q9BY89 1806 aa22.34■■□□□ 1.17
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RGCC-201ENST00000379359 CASD1Q96PB1 797 aa22.33■■□□□ 1.17
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RGCC-201ENST00000379359 ZBTB39O15060 712 aa22.32■■□□□ 1.16
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RGCC-201ENST00000379359 IRS1P35568 1242 aa22.32■■□□□ 1.16
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RGCC-201ENST00000379359 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa22.32■■□□□ 1.16
RGCC-201ENST00000379359 CAMK1Q14012 370 aa22.32■■□□□ 1.16
RGCC-201ENST00000379359 CLUL1Q15846 466 aa22.32■■□□□ 1.16
RGCC-201ENST00000379359 RBM23Q86U06 439 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
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RGCC-201ENST00000379359 CWH43Q9H720 699 aa22.32■■□□□ 1.16
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RGCC-201ENST00000379359 NCOR1O75376 2440 aa22.3■■□□□ 1.16
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RGCC-201ENST00000379359 LINC01565O15544 149 aa22.29■■□□□ 1.16
RGCC-201ENST00000379359 ERLIN2O94905 339 aa22.29■■□□□ 1.16
RGCC-201ENST00000379359 LYPLA2O95372 231 aa22.29■■□□□ 1.16
RGCC-201ENST00000379359 PBX3P40426 434 aa22.29■■□□□ 1.16
RGCC-201ENST00000379359 TFDP1Q14186 410 aa22.29■■□□□ 1.16
RGCC-201ENST00000379359 TTC38Q5R3I4 469 aa22.29■■□□□ 1.16
RGCC-201ENST00000379359 LRRC55Q6ZSA7 311 aa22.29■■□□□ 1.16
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