RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000363315.1

SNORD1C-201, Transcript of small nucleolar RNA, C/D box 1C, humanhuman

BASIC

Gene SNORD1C, Length 78 nt, Biotype snoRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNORD1C-201ENST00000363315 RUSC1Q9BVN2 902 aa6.51□□□□□ -1.37
SNORD1C-201ENST00000363315 STRA6Q9BX79 667 aa6.51□□□□□ -1.37
SNORD1C-201ENST00000363315 UNC45AQ9H3U1 944 aa6.51□□□□□ -1.37
SNORD1C-201ENST00000363315 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
SNORD1C-201ENST00000363315 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP6.51□□□□□ -1.37
SNORD1C-201ENST00000363315 RGL1Q9NZL6 768 aa6.51□□□□□ -1.37
SNORD1C-201ENST00000363315 VPS18Q9P253 973 aa6.51□□□□□ -1.37
SNORD1C-201ENST00000363315 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa6.51□□□□□ -1.37
SNORD1C-201ENST00000363315 UTP11Q9Y3A2 253 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
SNORD1C-201ENST00000363315 PCDHA10Q9Y5I2 948 aa6.51□□□□□ -1.37
SNORD1C-201ENST00000363315 CAPN6Q9Y6Q1 641 aa6.51□□□□□ -1.37
SNORD1C-201ENST00000363315 CNTNAP1P78357 1384 aa6.51□□□□□ -1.37
SNORD1C-201ENST00000363315 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
SNORD1C-201ENST00000363315 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa6.51□□□□□ -1.37
SNORD1C-201ENST00000363315 NCANO14594 1321 aa6.5□□□□□ -1.37
SNORD1C-201ENST00000363315 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa6.5□□□□□ -1.37
SNORD1C-201ENST00000363315 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa6.5□□□□□ -1.37
SNORD1C-201ENST00000363315 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa6.5□□□□□ -1.37
SNORD1C-201ENST00000363315 CLRN2A0PK11 232 aa6.5□□□□□ -1.37
SNORD1C-201ENST00000363315 GOLGA6CA6NDK9 693 aa6.5□□□□□ -1.37
SNORD1C-201ENST00000363315 RCCD1A6NED2 376 aa6.5□□□□□ -1.37
SNORD1C-201ENST00000363315 FAM187AA6NFU0 413 aa6.5□□□□□ -1.37
SNORD1C-201ENST00000363315 TMCO5BA8MYB1 307 aa6.5□□□□□ -1.37
SNORD1C-201ENST00000363315 F8VZ95 297 aa6.5□□□□□ -1.37
SNORD1C-201ENST00000363315 EML1O00423 815 aa6.5□□□□□ -1.37
SNORD1C-201ENST00000363315 PODXLO00592 558 aa6.5□□□□□ -1.37
SNORD1C-201ENST00000363315 EPHB6O15197 1021 aa6.5□□□□□ -1.37
SNORD1C-201ENST00000363315 CHMP2AO43633 222 aa6.5□□□□□ -1.37
SNORD1C-201ENST00000363315 GAS2O43903 313 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
SNORD1C-201ENST00000363315 EVI5O60447 810 aa6.5□□□□□ -1.37
SNORD1C-201ENST00000363315 TLR2O60603 784 aa6.5□□□□□ -1.37
SNORD1C-201ENST00000363315 HIP1RO75146 1068 aa6.5□□□□□ -1.37
SNORD1C-201ENST00000363315 RTN2O75298 545 aa6.5□□□□□ -1.37
SNORD1C-201ENST00000363315 PLEKP08567 350 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
SNORD1C-201ENST00000363315 GOLGA6DP0CG33 693 aa6.5□□□□□ -1.37
SNORD1C-201ENST00000363315 MYBL1P10243 752 aa6.5□□□□□ -1.37
SNORD1C-201ENST00000363315 ALAS1P13196 640 aa6.5□□□□□ -1.37
SNORD1C-201ENST00000363315 SLC9A1P19634 815 aa6.5□□□□□ -1.37
SNORD1C-201ENST00000363315 KLRC1P26715 233 aa6.5□□□□□ -1.37
SNORD1C-201ENST00000363315 YWHABP31946 246 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
SNORD1C-201ENST00000363315 MAN1A1P33908 653 aa6.5□□□□□ -1.37
SNORD1C-201ENST00000363315 RARRES1P49788 294 aa6.5□□□□□ -1.37
SNORD1C-201ENST00000363315 DRG2P55039 364 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
SNORD1C-201ENST00000363315 NCKAP1LP55160 1127 aa6.5□□□□□ -1.37
SNORD1C-201ENST00000363315 GPC5P78333 572 aa6.5□□□□□ -1.37
SNORD1C-201ENST00000363315 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa6.5□□□□□ -1.37
SNORD1C-201ENST00000363315 BIRC3Q13489 604 aa6.5□□□□□ -1.37
SNORD1C-201ENST00000363315 DHX34Q14147 1143 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
SNORD1C-201ENST00000363315 COG2Q14746 738 aa6.5□□□□□ -1.37
SNORD1C-201ENST00000363315 DRAP1Q14919 205 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
SNORD1C-201ENST00000363315 PWP2Q15269 919 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
SNORD1C-201ENST00000363315 KRT39Q6A163 491 aa6.5□□□□□ -1.37
SNORD1C-201ENST00000363315 C11orf63Q6NUN7 778 aa6.5□□□□□ -1.37
SNORD1C-201ENST00000363315 KCNV1Q6PIU1 500 aa6.5□□□□□ -1.37
SNORD1C-201ENST00000363315 RNF207Q6ZRF8 634 aa6.5□□□□□ -1.37
SNORD1C-201ENST00000363315 ARMC9Q7Z3E5 817 aa6.5□□□□□ -1.37
SNORD1C-201ENST00000363315 ZNF571Q7Z3V5 609 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
SNORD1C-201ENST00000363315 HAUS6Q7Z4H7 955 aa6.5□□□□□ -1.37
SNORD1C-201ENST00000363315 DAAM2Q86T65 1068 aa6.5□□□□□ -1.37
SNORD1C-201ENST00000363315 CDAN1Q8IWY9 1227 aa6.5□□□□□ -1.37
SNORD1C-201ENST00000363315 RASGEF1CQ8N431 466 aa6.5□□□□□ -1.37
SNORD1C-201ENST00000363315 CHST13Q8NET6 341 aa6.5□□□□□ -1.37
SNORD1C-201ENST00000363315 DNERQ8NFT8 737 aa6.5□□□□□ -1.37
SNORD1C-201ENST00000363315 TPCN2Q8NHX9 752 aa6.5□□□□□ -1.37
SNORD1C-201ENST00000363315 TRERF1Q96PN7 1200 aa6.5□□□□□ -1.37
SNORD1C-201ENST00000363315 RMDN3Q96TC7 470 aa6.5□□□□□ -1.37
SNORD1C-201ENST00000363315 JPH2Q9BR39 696 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
SNORD1C-201ENST00000363315 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
SNORD1C-201ENST00000363315 STMN4Q9H169 189 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
SNORD1C-201ENST00000363315 WNT8AQ9H1J5 351 aa6.5□□□□□ -1.37
SNORD1C-201ENST00000363315 ISCUQ9H1K1 167 aa6.5□□□□□ -1.37
SNORD1C-201ENST00000363315 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
SNORD1C-201ENST00000363315 MLXIPQ9HAP2 919 aa6.5□□□□□ -1.37
SNORD1C-201ENST00000363315 GDF3Q9NR23 364 aa6.5□□□□□ -1.37
SNORD1C-201ENST00000363315 HOMER3Q9NSC5 361 aa6.5□□□□□ -1.37
SNORD1C-201ENST00000363315 GOLGA6AQ9NYA3 693 aa6.5□□□□□ -1.37
SNORD1C-201ENST00000363315 TMOD4Q9NZQ9 345 aa6.5□□□□□ -1.37
SNORD1C-201ENST00000363315 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
SNORD1C-201ENST00000363315 UVRAGQ9P2Y5 699 aa6.5□□□□□ -1.37
SNORD1C-201ENST00000363315 HDAC6Q9UBN7 1215 aa6.5□□□□□ -1.37
SNORD1C-201ENST00000363315 TRIM10Q9UDY6 481 aa6.5□□□□□ -1.37
SNORD1C-201ENST00000363315 DNAJC12Q9UKB3 198 aa6.5□□□□□ -1.37
SNORD1C-201ENST00000363315 MTUS1Q9ULD2 1270 aa6.5□□□□□ -1.37
SNORD1C-201ENST00000363315 HPCAL4Q9UM19 191 aa6.5□□□□□ -1.37
SNORD1C-201ENST00000363315 DUSP10Q9Y6W6 482 aa6.5□□□□□ -1.37
SNORD1C-201ENST00000363315 ZHX2Q9Y6X8 837 aa6.5□□□□□ -1.37
SNORD1C-201ENST00000363315 A0A0U1RQJ8 604 aa6.49□□□□□ -1.37
SNORD1C-201ENST00000363315 HMGB1P1B2RPK0 211 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
SNORD1C-201ENST00000363315 KCNK3O14649 394 aa6.49□□□□□ -1.37
SNORD1C-201ENST00000363315 CLIC2O15247 247 aa6.49□□□□□ -1.37
SNORD1C-201ENST00000363315 BUB1O43683 1085 aa6.49□□□□□ -1.37
SNORD1C-201ENST00000363315 SRGAP2O75044 1071 aa6.49□□□□□ -1.37
SNORD1C-201ENST00000363315 RNF40O75150 1001 aa6.49□□□□□ -1.37
SNORD1C-201ENST00000363315 MTA2O94776 668 aa6.49□□□□□ -1.37
SNORD1C-201ENST00000363315 HEXIM1O94992 359 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
SNORD1C-201ENST00000363315 ABL1P00519 1130 aa6.49□□□□□ -1.37
SNORD1C-201ENST00000363315 ARP10275 920 aa6.49□□□□□ -1.37
SNORD1C-201ENST00000363315 CAPN2P17655 700 aa6.49□□□□□ -1.37
SNORD1C-201ENST00000363315 NMT1P30419 496 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
SNORD1C-201ENST00000363315 HOXD13P35453 343 aa6.49□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.4 ms