RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361543.3

SGMS1-201, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SGMS1, Length 1,096 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-201ENST00000361543 TMEM161AQ9NX61 479 aa8.57□□□□□ -1.04
SGMS1-201ENST00000361543 RGL1Q9NZL6 768 aa8.57□□□□□ -1.04
SGMS1-201ENST00000361543 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP8.57□□□□□ -1.04
SGMS1-201ENST00000361543 RAPGEFL1Q9UHV5 662 aa8.57□□□□□ -1.04
SGMS1-201ENST00000361543 PCDHA12Q9UN75 941 aa8.57□□□□□ -1.04
SGMS1-201ENST00000361543 PPME1Q9Y570 386 aa8.57□□□□□ -1.04
SGMS1-201ENST00000361543 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa8.57□□□□□ -1.04
SGMS1-201ENST00000361543 A0A087WZ62 844 aa8.56□□□□□ -1.04
SGMS1-201ENST00000361543 TBKBP1A7MCY6 615 aa8.56□□□□□ -1.04
SGMS1-201ENST00000361543 GRM6O15303 877 aa8.56□□□□□ -1.04
SGMS1-201ENST00000361543 CSDE1O75534 798 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
SGMS1-201ENST00000361543 FGFR1P11362 822 aa8.56□□□□□ -1.04
SGMS1-201ENST00000361543 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
SGMS1-201ENST00000361543 ATP2B1P20020 1258 aa8.56□□□□□ -1.04
SGMS1-201ENST00000361543 FGFR4P22455 802 aa8.56□□□□□ -1.04
SGMS1-201ENST00000361543 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP8.56□□□□□ -1.04
SGMS1-201ENST00000361543 MCM7P33993 719 aa8.56□□□□□ -1.04
SGMS1-201ENST00000361543 RFC5P40937 340 aa8.56□□□□□ -1.04
SGMS1-201ENST00000361543 TXKP42681 527 aa8.56□□□□□ -1.04
SGMS1-201ENST00000361543 KCNQ1P51787 676 aa8.56□□□□□ -1.04
SGMS1-201ENST00000361543 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
SGMS1-201ENST00000361543 CTTNQ14247 550 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
SGMS1-201ENST00000361543 EMC2Q15006 297 aa8.56□□□□□ -1.04
SGMS1-201ENST00000361543 OTUD6AQ7L8S5 288 aa8.56□□□□□ -1.04
SGMS1-201ENST00000361543 NOSTRINQ8IVI9 506 aa8.56□□□□□ -1.04
SGMS1-201ENST00000361543 KSR1Q8IVT5 923 aa8.56□□□□□ -1.04
SGMS1-201ENST00000361543 TPH2Q8IWU9 490 aa8.56□□□□□ -1.04
SGMS1-201ENST00000361543 EXOC8Q8IYI6 725 aa8.56□□□□□ -1.04
SGMS1-201ENST00000361543 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
SGMS1-201ENST00000361543 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa8.56□□□□□ -1.04
SGMS1-201ENST00000361543 NEK9Q8TD19 979 aa8.56□□□□□ -1.04
SGMS1-201ENST00000361543 P2RX5Q93086 422 aa8.56□□□□□ -1.04
SGMS1-201ENST00000361543 NLRP4Q96MN2 994 aa8.56□□□□□ -1.04
SGMS1-201ENST00000361543 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
SGMS1-201ENST00000361543 MTMR9Q96QG7 549 aa8.56□□□□□ -1.04
SGMS1-201ENST00000361543 EIF2AK1Q9BQI3 630 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
SGMS1-201ENST00000361543 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
SGMS1-201ENST00000361543 PLVAPQ9BX97 442 aa8.56□□□□□ -1.04
SGMS1-201ENST00000361543 GCOM2Q9BZD3 368 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
SGMS1-201ENST00000361543 LMAN2LQ9H0V9 348 aa8.56□□□□□ -1.04
SGMS1-201ENST00000361543 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
SGMS1-201ENST00000361543 NSUN3Q9H649 340 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
SGMS1-201ENST00000361543 DHX33Q9H6R0 707 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
SGMS1-201ENST00000361543 ELAC1Q9H777 363 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
SGMS1-201ENST00000361543 UBE2ZQ9H832 354 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
SGMS1-201ENST00000361543 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa8.56□□□□□ -1.04
SGMS1-201ENST00000361543 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
SGMS1-201ENST00000361543 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
SGMS1-201ENST00000361543 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa8.56□□□□□ -1.04
SGMS1-201ENST00000361543 WDFY4Q6ZS81 3184 aa8.56□□□□□ -1.04
SGMS1-201ENST00000361543 TDRD15B5MCY1 1934 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
SGMS1-201ENST00000361543 POTEMA6NI47 508 aa8.55□□□□□ -1.04
SGMS1-201ENST00000361543 ZBTB39O15060 712 aa8.55□□□□□ -1.04
SGMS1-201ENST00000361543 HOXA2O43364 376 aa8.55□□□□□ -1.04
SGMS1-201ENST00000361543 GAS2O43903 313 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
SGMS1-201ENST00000361543 CSPG5O95196 566 aa8.55□□□□□ -1.04
SGMS1-201ENST00000361543 PSEN1P49768 467 aa8.55□□□□□ -1.04
SGMS1-201ENST00000361543 FAM189BP81408 668 aa8.55□□□□□ -1.04
SGMS1-201ENST00000361543 XKR9Q5GH70 373 aa8.55□□□□□ -1.04
SGMS1-201ENST00000361543 TCEAL5Q5H9L2 206 aa8.55□□□□□ -1.04
SGMS1-201ENST00000361543 SPOUT1Q5T280 376 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
SGMS1-201ENST00000361543 FAM102BQ5T8I3 360 aa8.55□□□□□ -1.04
SGMS1-201ENST00000361543 CATSPER4Q7RTX7 472 aa8.55□□□□□ -1.04
SGMS1-201ENST00000361543 ECHDC2Q86YB7 292 aa8.55□□□□□ -1.04
SGMS1-201ENST00000361543 RNF169Q8NCN4 708 aa8.55□□□□□ -1.04
SGMS1-201ENST00000361543 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
SGMS1-201ENST00000361543 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
SGMS1-201ENST00000361543 TMEM143Q96AN5 459 aa8.55□□□□□ -1.04
SGMS1-201ENST00000361543 UHRF1Q96T88 793 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
SGMS1-201ENST00000361543 HSD17B14Q9BPX1 270 aa8.55□□□□□ -1.04
SGMS1-201ENST00000361543 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
SGMS1-201ENST00000361543 TMEM60Q9H2L4 133 aa8.55□□□□□ -1.04
SGMS1-201ENST00000361543 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
SGMS1-201ENST00000361543 DACT1Q9NYF0 836 aa8.55□□□□□ -1.04
SGMS1-201ENST00000361543 HCSTQ9UBK5 93 aa8.55□□□□□ -1.04
SGMS1-201ENST00000361543 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
SGMS1-201ENST00000361543 A0A0U1RQF3 1178 aa8.54□□□□□ -1.04
SGMS1-201ENST00000361543 SLITRK3O94933 977 aa8.54□□□□□ -1.04
SGMS1-201ENST00000361543 LYPLA2O95372 231 aa8.54□□□□□ -1.04
SGMS1-201ENST00000361543 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
SGMS1-201ENST00000361543 ITGB1P05556 798 aa8.54□□□□□ -1.04
SGMS1-201ENST00000361543 OR52Z1P0C646 297 aa8.54□□□□□ -1.04
SGMS1-201ENST00000361543 BMP1P13497 986 aa8.54□□□□□ -1.04
SGMS1-201ENST00000361543 KCNA5P22460 613 aa8.54□□□□□ -1.04
SGMS1-201ENST00000361543 TRAPPC10P48553 1259 aa8.54□□□□□ -1.04
SGMS1-201ENST00000361543 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa8.54□□□□□ -1.04
SGMS1-201ENST00000361543 NAALADL2Q58DX5 795 aa8.54□□□□□ -1.04
SGMS1-201ENST00000361543 CLLU1OSQ5K130 101 aa8.54□□□□□ -1.04
SGMS1-201ENST00000361543 TTC38Q5R3I4 469 aa8.54□□□□□ -1.04
SGMS1-201ENST00000361543 TWF2Q6IBS0 349 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
SGMS1-201ENST00000361543 ABI1Q8IZP0 508 aa8.54□□□□□ -1.04
SGMS1-201ENST00000361543 LRRC43Q8N309 656 aa8.54□□□□□ -1.04
SGMS1-201ENST00000361543 KLHL23Q8NBE8 558 aa8.54□□□□□ -1.04
SGMS1-201ENST00000361543 TCP11Q8WWU5 503 aa8.54□□□□□ -1.04
SGMS1-201ENST00000361543 TMX3Q96JJ7 454 aa8.54□□□□□ -1.04
SGMS1-201ENST00000361543 MTRQ99707 1265 aa8.54□□□□□ -1.04
SGMS1-201ENST00000361543 TMEM117Q9H0C3 514 aa8.54□□□□□ -1.04
SGMS1-201ENST00000361543 IFT122Q9HBG6 1241 aa8.54□□□□□ -1.04
SGMS1-201ENST00000361543 CHST12Q9NRB3 414 aa8.54□□□□□ -1.04
SGMS1-201ENST00000361543 AAASQ9NRG9 546 aa8.54□□□□□ -1.04
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