RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000353468.4

SIGMAR1-202, Transcript of sigma non-opioid intracellular receptor 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SIGMAR1, Length 1,582 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIGMAR1-202ENST00000353468 LINC01465Q8N7H1 131 aa22.18■■□□□ 1.14
SIGMAR1-202ENST00000353468 ENOX1Q8TC92 643 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
SIGMAR1-202ENST00000353468 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
SIGMAR1-202ENST00000353468 DEFB118Q96PH6 123 aa22.18■■□□□ 1.14
SIGMAR1-202ENST00000353468 MED15Q96RN5 788 aa22.18■■□□□ 1.14
SIGMAR1-202ENST00000353468 STRA6Q9BX79 667 aa22.18■■□□□ 1.14
SIGMAR1-202ENST00000353468 C17orf102A2RUQ5 167 aa22.17■■□□□ 1.14
SIGMAR1-202ENST00000353468 IKBKBO14920 756 aa22.17■■□□□ 1.14
SIGMAR1-202ENST00000353468 SLC16A4O15374 487 aa22.17■■□□□ 1.14
SIGMAR1-202ENST00000353468 GNAT1P11488 350 aa22.17■■□□□ 1.14
SIGMAR1-202ENST00000353468 CCNE1P24864 410 aa22.17■■□□□ 1.14
SIGMAR1-202ENST00000353468 NAMPTP43490 491 aa22.17■■□□□ 1.14
SIGMAR1-202ENST00000353468 ACLYP53396 1101 aa22.17■■□□□ 1.14
SIGMAR1-202ENST00000353468 ADAM17P78536 824 aa22.17■■□□□ 1.14
SIGMAR1-202ENST00000353468 ALCAMQ13740 583 aa22.17■■□□□ 1.14
SIGMAR1-202ENST00000353468 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
SIGMAR1-202ENST00000353468 NFRKBQ6P4R8 1299 aa22.17■■□□□ 1.14
SIGMAR1-202ENST00000353468 HAUS6Q7Z4H7 955 aa22.17■■□□□ 1.14
SIGMAR1-202ENST00000353468 P2RX5Q93086 422 aa22.17■■□□□ 1.14
SIGMAR1-202ENST00000353468 ST6GALNAC4Q9H4F1 302 aa22.17■■□□□ 1.14
SIGMAR1-202ENST00000353468 FRMPD3Q5JV73 1810 aa22.17■■□□□ 1.14
SIGMAR1-202ENST00000353468 MBLAC1A4D2B0 266 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
SIGMAR1-202ENST00000353468 PPP1R37O75864 691 aa22.16■■□□□ 1.14
SIGMAR1-202ENST00000353468 HOXC8P31273 242 aa22.16■■□□□ 1.14
SIGMAR1-202ENST00000353468 MYL5Q02045 173 aa22.16■■□□□ 1.14
SIGMAR1-202ENST00000353468 HIC1Q14526 733 aa22.16■■□□□ 1.14
SIGMAR1-202ENST00000353468 NCAPHQ15003 741 aa22.16■■□□□ 1.14
SIGMAR1-202ENST00000353468 BMT2Q1RMZ1 405 aa22.16■■□□□ 1.14
SIGMAR1-202ENST00000353468 CENPPQ6IPU0 288 aa22.16■■□□□ 1.14
SIGMAR1-202ENST00000353468 NELFCDQ8IXH7 590 aa22.16■■□□□ 1.14
SIGMAR1-202ENST00000353468 TMEM161BQ8NDZ6 487 aa22.16■■□□□ 1.14
SIGMAR1-202ENST00000353468 SEMA6BQ9H3T3 888 aa22.16■■□□□ 1.14
SIGMAR1-202ENST00000353468 BICDL2A1A5D9 508 aa22.16■■□□□ 1.14
SIGMAR1-202ENST00000353468 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa22.16■■□□□ 1.14
SIGMAR1-202ENST00000353468 ASAP2O43150 1006 aa22.16■■□□□ 1.14
SIGMAR1-202ENST00000353468 HOXD13P35453 343 aa22.16■■□□□ 1.14
SIGMAR1-202ENST00000353468 PMS1P54277 932 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
SIGMAR1-202ENST00000353468 GTF2BQ00403 316 aa22.16■■□□□ 1.14
SIGMAR1-202ENST00000353468 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa22.16■■□□□ 1.14
SIGMAR1-202ENST00000353468 VTI1AQ96AJ9 217 aa22.16■■□□□ 1.14
SIGMAR1-202ENST00000353468 ZNF333Q96JL9 665 aa22.16■■□□□ 1.14
SIGMAR1-202ENST00000353468 KIFC3Q9BVG8 833 aa22.16■■□□□ 1.14
SIGMAR1-202ENST00000353468 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa22.16■■□□□ 1.14
SIGMAR1-202ENST00000353468 UBE4BO95155 1302 aa22.15■■□□□ 1.14
SIGMAR1-202ENST00000353468 TRIM49BA6NDI0 452 aa22.15■■□□□ 1.14
SIGMAR1-202ENST00000353468 LRRIQ4A6NIV6 560 aa22.15■■□□□ 1.14
SIGMAR1-202ENST00000353468 CAPSQ13938 189 aa22.15■■□□□ 1.14
SIGMAR1-202ENST00000353468 KNOP1Q1ED39 458 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
SIGMAR1-202ENST00000353468 SPATA1Q5VX52 437 aa22.15■■□□□ 1.14
SIGMAR1-202ENST00000353468 RHPN2Q8IUC4 686 aa22.15■■□□□ 1.14
SIGMAR1-202ENST00000353468 KSR1Q8IVT5 923 aa22.15■■□□□ 1.14
SIGMAR1-202ENST00000353468 DEPTORQ8TB45 409 aa22.15■■□□□ 1.14
SIGMAR1-202ENST00000353468 ARMC5Q96C12 935 aa22.15■■□□□ 1.14
SIGMAR1-202ENST00000353468 GLT1D1Q96MS3 346 aa22.15■■□□□ 1.14
SIGMAR1-202ENST00000353468 KCTD10Q9H3F6 313 aa22.15■■□□□ 1.14
SIGMAR1-202ENST00000353468 GRPEL1Q9HAV7 217 aa22.15■■□□□ 1.14
SIGMAR1-202ENST00000353468 ARHGAP28Q9P2N2 729 aa22.15■■□□□ 1.14
SIGMAR1-202ENST00000353468 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa22.15■■□□□ 1.14
SIGMAR1-202ENST00000353468 KBTBD13C9JR72 458 aa22.14■■□□□ 1.13
SIGMAR1-202ENST00000353468 H0YCG3 227 aa22.14■■□□□ 1.13
SIGMAR1-202ENST00000353468 TREHO43280 583 aa22.14■■□□□ 1.13
SIGMAR1-202ENST00000353468 GJB1P08034 283 aa22.14■■□□□ 1.13
SIGMAR1-202ENST00000353468 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
SIGMAR1-202ENST00000353468 KCNA1Q09470 495 aa22.14■■□□□ 1.13
SIGMAR1-202ENST00000353468 UVSSAQ2YD98 709 aa22.14■■□□□ 1.13
SIGMAR1-202ENST00000353468 FAM47CQ5HY64 1035 aa22.14■■□□□ 1.13
SIGMAR1-202ENST00000353468 ANKRD40Q6AI12 368 aa22.14■■□□□ 1.13
SIGMAR1-202ENST00000353468 TTI2Q6NXR4 508 aa22.14■■□□□ 1.13
SIGMAR1-202ENST00000353468 SESTD1Q86VW0 696 aa22.14■■□□□ 1.13
SIGMAR1-202ENST00000353468 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa22.14■■□□□ 1.13
SIGMAR1-202ENST00000353468 MAP7D2Q96T17 732 aa22.14■■□□□ 1.13
SIGMAR1-202ENST00000353468 OGDHLQ9ULD0 1010 aa22.14■■□□□ 1.13
SIGMAR1-202ENST00000353468 AKT3Q9Y243 479 aa22.14■■□□□ 1.13
SIGMAR1-202ENST00000353468 GRIN2DO15399 1336 aa22.14■■□□□ 1.13
SIGMAR1-202ENST00000353468 SMIM35A0A1B0GVV1 85 aa22.13■■□□□ 1.13
SIGMAR1-202ENST00000353468 DENND3A2RUS2 1198 aa22.13■■□□□ 1.13
SIGMAR1-202ENST00000353468 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa22.13■■□□□ 1.13
SIGMAR1-202ENST00000353468 CYP2C9P11712 490 aa22.13■■□□□ 1.13
SIGMAR1-202ENST00000353468 ITGA7Q13683 1181 aa22.13■■□□□ 1.13
SIGMAR1-202ENST00000353468 TFDP1Q14186 410 aa22.13■■□□□ 1.13
SIGMAR1-202ENST00000353468 RNF149Q8NC42 400 aa22.13■■□□□ 1.13
SIGMAR1-202ENST00000353468 HVCN1Q96D96 273 aa22.13■■□□□ 1.13
SIGMAR1-202ENST00000353468 TSG101Q99816 390 aa22.13■■□□□ 1.13
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SIGMAR1-202ENST00000353468 DNM1LO00429 736 aa22.12■■□□□ 1.13
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SIGMAR1-202ENST00000353468 SCP2P22307 547 aa22.12■■□□□ 1.13
SIGMAR1-202ENST00000353468 ABCD1P33897 745 aa22.12■■□□□ 1.13
SIGMAR1-202ENST00000353468 LRRC63Q05C16 580 aa22.12■■□□□ 1.13
SIGMAR1-202ENST00000353468 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
SIGMAR1-202ENST00000353468 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
SIGMAR1-202ENST00000353468 FOXR2Q6PJQ5 311 aa22.12■■□□□ 1.13
SIGMAR1-202ENST00000353468 KCNN1Q92952 543 aa22.12■■□□□ 1.13
SIGMAR1-202ENST00000353468 ACCSQ96QU6 501 aa22.12■■□□□ 1.13
SIGMAR1-202ENST00000353468 TMEM206Q9H813 350 aa22.12■■□□□ 1.13
SIGMAR1-202ENST00000353468 FANCLQ9NW38 375 aa22.12■■□□□ 1.13
SIGMAR1-202ENST00000353468 TBX20Q9UMR3 447 aa22.12■■□□□ 1.13
SIGMAR1-202ENST00000353468 PHF24Q9UPV7 400 aa22.12■■□□□ 1.13
SIGMAR1-202ENST00000353468 A0A1W2PQ45 241 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
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