RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000330687.8

CMTM4-201, Transcript of CKLF like MARVEL transmembrane domain containing 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CMTM4, Length 3,414 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM4-201ENST00000330687 CYP39A1Q9NYL5 469 aa22.16■■□□□ 1.14
CMTM4-201ENST00000330687 LMCD1Q9NZU5 365 aa22.16■■□□□ 1.14
CMTM4-201ENST00000330687 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
CMTM4-201ENST00000330687 MYH7P12883 1935 aa22.16■■□□□ 1.14
CMTM4-201ENST00000330687 TOM1O60784 492 aa22.15■■□□□ 1.14
CMTM4-201ENST00000330687 ATP9AO75110 1047 aa22.15■■□□□ 1.14
CMTM4-201ENST00000330687 ZDHHC24Q6UX98 284 aa22.15■■□□□ 1.14
CMTM4-201ENST00000330687 SCYL3Q8IZE3 742 aa22.15■■□□□ 1.14
CMTM4-201ENST00000330687 EIF1ADQ8N9N8 165 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
CMTM4-201ENST00000330687 KIFAP3Q92845 792 aa22.15■■□□□ 1.14
CMTM4-201ENST00000330687 RIC8AQ9NPQ8 531 aa22.15■■□□□ 1.14
CMTM4-201ENST00000330687 RHBDL2Q9NX52 303 aa22.15■■□□□ 1.14
CMTM4-201ENST00000330687 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
CMTM4-201ENST00000330687 PFASO15067 1338 aa22.15■■□□□ 1.14
CMTM4-201ENST00000330687 NUDT17P0C025 328 aa22.15■■□□□ 1.14
CMTM4-201ENST00000330687 RCN1Q15293 331 aa22.15■■□□□ 1.14
CMTM4-201ENST00000330687 TMED2Q15363 201 aa22.15■■□□□ 1.14
CMTM4-201ENST00000330687 DCAF12L1Q5VU92 463 aa22.15■■□□□ 1.14
CMTM4-201ENST00000330687 DRAXINQ8NBI3 349 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
CMTM4-201ENST00000330687 UBE2OQ9C0C9 1292 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
CMTM4-201ENST00000330687 C6orf50Q9HD87 102 aa22.15■■□□□ 1.14
CMTM4-201ENST00000330687 PCMTD2Q9NV79 361 aa22.15■■□□□ 1.14
CMTM4-201ENST00000330687 GCNT4Q9P109 453 aa22.15■■□□□ 1.14
CMTM4-201ENST00000330687 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP22.15■■□□□ 1.14
CMTM4-201ENST00000330687 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP22.15■■□□□ 1.147e-22■■■■■ 46.8
CMTM4-201ENST00000330687 THAP12O43422 761 aa22.15■■□□□ 1.14
CMTM4-201ENST00000330687 PLS1Q14651 629 aa22.15■■□□□ 1.14
CMTM4-201ENST00000330687 GALNTL6Q49A17 601 aa22.15■■□□□ 1.14
CMTM4-201ENST00000330687 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
CMTM4-201ENST00000330687 PRUNE1Q86TP1 453 aa22.15■■□□□ 1.14
CMTM4-201ENST00000330687 MROH5Q6ZUA9 1318 aa22.14■■□□□ 1.14
CMTM4-201ENST00000330687 SLC37A4O43826 429 aa22.14■■□□□ 1.14
CMTM4-201ENST00000330687 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.14
CMTM4-201ENST00000330687 CACNA2D1P54289 1103 aa22.14■■□□□ 1.14
CMTM4-201ENST00000330687 CTTNQ14247 550 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.14
CMTM4-201ENST00000330687 ZC2HC1CQ53FD0 456 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.14
CMTM4-201ENST00000330687 GPBP1Q86WP2 473 aa22.14■■□□□ 1.14
CMTM4-201ENST00000330687 TBC1D16Q8TBP0 767 aa22.14■■□□□ 1.14
CMTM4-201ENST00000330687 KRT35Q92764 455 aa22.14■■□□□ 1.14
CMTM4-201ENST00000330687 CDC42EP4Q9H3Q1 356 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.14
CMTM4-201ENST00000330687 EMILIN3Q9NT22 766 aa22.14■■□□□ 1.14
CMTM4-201ENST00000330687 NMRK1Q9NWW6 199 aa22.14■■□□□ 1.14
CMTM4-201ENST00000330687 AIPL1Q9NZN9 384 aa22.14■■□□□ 1.14
CMTM4-201ENST00000330687 AJAP1Q9UKB5 411 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.14
CMTM4-201ENST00000330687 KIAA1024Q9UPX6 916 aa22.14■■□□□ 1.14
CMTM4-201ENST00000330687 LMO7Q8WWI1 1683 aa22.14■■□□□ 1.14
CMTM4-201ENST00000330687 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa22.14■■□□□ 1.14
CMTM4-201ENST00000330687 LIN7AO14910 233 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
CMTM4-201ENST00000330687 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
CMTM4-201ENST00000330687 MAIP1Q8WWC4 291 aa22.14■■□□□ 1.13
CMTM4-201ENST00000330687 COA7Q96BR5 231 aa22.14■■□□□ 1.13
CMTM4-201ENST00000330687 FAM118BQ9BPY3 351 aa22.14■■□□□ 1.13
CMTM4-201ENST00000330687 MTA3Q9BTC8 594 aa22.14■■□□□ 1.13
CMTM4-201ENST00000330687 USP40Q9NVE5 1235 aa22.14■■□□□ 1.13
CMTM4-201ENST00000330687 TMOD3Q9NYL9 352 aa22.14■■□□□ 1.13
CMTM4-201ENST00000330687 WDR35Q9P2L0 1181 aa22.14■■□□□ 1.13
CMTM4-201ENST00000330687 HHATQ5VTY9 493 aa22.13■■□□□ 1.13
CMTM4-201ENST00000330687 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
CMTM4-201ENST00000330687 RAD54LQ92698 747 aa22.13■■□□□ 1.13
CMTM4-201ENST00000330687 DENND2DQ9H6A0 471 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
CMTM4-201ENST00000330687 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP22.13■■□□□ 1.13
CMTM4-201ENST00000330687 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
CMTM4-201ENST00000330687 FAM196BA6NMK8 535 aa22.13■■□□□ 1.13
CMTM4-201ENST00000330687 STAT1P42224 750 aa22.13■■□□□ 1.13
CMTM4-201ENST00000330687 DIXDC1Q155Q3 683 aa22.13■■□□□ 1.13
CMTM4-201ENST00000330687 ISLR2Q6UXK2 745 aa22.13■■□□□ 1.13
CMTM4-201ENST00000330687 C1orf54Q8WWF1 131 aa22.13■■□□□ 1.13
CMTM4-201ENST00000330687 ARHGEF26Q96DR7 871 aa22.13■■□□□ 1.13
CMTM4-201ENST00000330687 PVALEFA0A1B0GWK0 134 aa22.13■■□□□ 1.13
CMTM4-201ENST00000330687 TCRBV7S2A1N4TA0A589 114 aa22.13■■□□□ 1.13
CMTM4-201ENST00000330687 KRT25Q7Z3Z0 450 aa22.13■■□□□ 1.13
CMTM4-201ENST00000330687 TRIM59Q8IWR1 403 aa22.13■■□□□ 1.13
CMTM4-201ENST00000330687 SYN2Q92777 582 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
CMTM4-201ENST00000330687 CYTH2Q99418 400 aa22.13■■□□□ 1.13
CMTM4-201ENST00000330687 STARD3NLO95772 234 aa22.12■■□□□ 1.13
CMTM4-201ENST00000330687 RFWD3Q6PCD5 774 aa22.12■■□□□ 1.13
CMTM4-201ENST00000330687 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
CMTM4-201ENST00000330687 RDH13Q8NBN7 331 aa22.12■■□□□ 1.13
CMTM4-201ENST00000330687 C9orf72Q96LT7 481 aa22.12■■□□□ 1.13
CMTM4-201ENST00000330687 RAB34Q9BZG1 259 aa22.12■■□□□ 1.13
CMTM4-201ENST00000330687 GANQ9H2C0 597 aa22.12■■□□□ 1.13
CMTM4-201ENST00000330687 AFPP02771 609 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
CMTM4-201ENST00000330687 CHRNDQ07001 517 aa22.12■■□□□ 1.13
CMTM4-201ENST00000330687 SLC5A9Q2M3M2 681 aa22.12■■□□□ 1.13
CMTM4-201ENST00000330687 SNX30Q5VWJ9 437 aa22.12■■□□□ 1.13
CMTM4-201ENST00000330687 FAM81AQ8TBF8 368 aa22.12■■□□□ 1.13
CMTM4-201ENST00000330687 BORCS6Q96GS4 357 aa22.12■■□□□ 1.13
CMTM4-201ENST00000330687 RBM41Q96IZ5 413 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
CMTM4-201ENST00000330687 THAP2Q9H0W7 228 aa22.12■■□□□ 1.13
CMTM4-201ENST00000330687 OCEL1Q9H607 264 aa22.12■■□□□ 1.13
CMTM4-201ENST00000330687 BARHL2Q9NY43 387 aa22.12■■□□□ 1.13
CMTM4-201ENST00000330687 TAS2R14Q9NYV8 317 aa22.12■■□□□ 1.13
CMTM4-201ENST00000330687 MEIS1O00470 390 aa22.12■■□□□ 1.13
CMTM4-201ENST00000330687 ATMINO43313 823 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
CMTM4-201ENST00000330687 FGFR2P21802 821 aa22.12■■□□□ 1.13
CMTM4-201ENST00000330687 YY1P25490 414 aa22.12■■□□□ 1.13
CMTM4-201ENST00000330687 CRAMP1Q96RY5 1269 aa22.12■■□□□ 1.13
CMTM4-201ENST00000330687 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
CMTM4-201ENST00000330687 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
CMTM4-201ENST00000330687 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa22.12■■□□□ 1.13
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