RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000330298.6

CTNNA3-201, Transcript of catenin alpha 3, humanhuman

TSL 2

Gene CTNNA3, Length 696 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA3-201ENST00000330298 POTEDQ86YR6 584 aa14.78□□□□□ -0.04
CTNNA3-201ENST00000330298 RHPN2Q8IUC4 686 aa14.78□□□□□ -0.04
CTNNA3-201ENST00000330298 THNSL1Q8IYQ7 743 aa14.78□□□□□ -0.04
CTNNA3-201ENST00000330298 CEP170P1Q96L14 293 aa14.78□□□□□ -0.04
CTNNA3-201ENST00000330298 CDCA3Q99618 268 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
CTNNA3-201ENST00000330298 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
CTNNA3-201ENST00000330298 LXNQ9BS40 222 aa14.78□□□□□ -0.04
CTNNA3-201ENST00000330298 IGFLR1Q9H665 355 aa14.78□□□□□ -0.04
CTNNA3-201ENST00000330298 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa14.78□□□□□ -0.04
CTNNA3-201ENST00000330298 CD320Q9NPF0 282 aa14.78□□□□□ -0.04
CTNNA3-201ENST00000330298 TLR9Q9NR96 1032 aa14.78□□□□□ -0.04
CTNNA3-201ENST00000330298 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
CTNNA3-201ENST00000330298 C19orf67A6NJJ6 358 aa14.77□□□□□ -0.05
CTNNA3-201ENST00000330298 FSCN2O14926 492 aa14.77□□□□□ -0.05
CTNNA3-201ENST00000330298 ASAP2O43150 1006 aa14.77□□□□□ -0.05
CTNNA3-201ENST00000330298 EYA4O95677 639 aa14.77□□□□□ -0.05
CTNNA3-201ENST00000330298 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.05
CTNNA3-201ENST00000330298 COL9A1P20849 921 aa14.77□□□□□ -0.05
CTNNA3-201ENST00000330298 YWHABP31946 246 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
CTNNA3-201ENST00000330298 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP14.77□□□□□ -0.05
CTNNA3-201ENST00000330298 NPEPPSP55786 919 aa14.77□□□□□ -0.05
CTNNA3-201ENST00000330298 DLX2Q07687 328 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.05
CTNNA3-201ENST00000330298 COASYQ13057 564 aa14.77□□□□□ -0.05
CTNNA3-201ENST00000330298 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
CTNNA3-201ENST00000330298 PLA2G4FQ68DD2 849 aa14.77□□□□□ -0.05
CTNNA3-201ENST00000330298 ADHFE1Q8IWW8 467 aa14.77□□□□□ -0.05
CTNNA3-201ENST00000330298 TCP11Q8WWU5 503 aa14.77□□□□□ -0.05
CTNNA3-201ENST00000330298 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
CTNNA3-201ENST00000330298 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.05
CTNNA3-201ENST00000330298 MSLNLQ96KJ4 702 aa14.77□□□□□ -0.05
CTNNA3-201ENST00000330298 ZNF558Q96NG5 402 aa14.77□□□□□ -0.05
CTNNA3-201ENST00000330298 SH2D3AQ9BRG2 576 aa14.77□□□□□ -0.05
CTNNA3-201ENST00000330298 MRPL9Q9BYD2 267 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
CTNNA3-201ENST00000330298 EPHX3Q9H6B9 360 aa14.77□□□□□ -0.05
CTNNA3-201ENST00000330298 WRAP73Q9P2S5 460 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.05
CTNNA3-201ENST00000330298 CD207Q9UJ71 328 aa14.77□□□□□ -0.05
CTNNA3-201ENST00000330298 FAM205CA6NFA0 338 aa14.76□□□□□ -0.05
CTNNA3-201ENST00000330298 BTBD18B2RXH4 712 aa14.76□□□□□ -0.05
CTNNA3-201ENST00000330298 MBTPS2O43462 519 aa14.76□□□□□ -0.05
CTNNA3-201ENST00000330298 GPR37L1O60883 481 aa14.76□□□□□ -0.05
CTNNA3-201ENST00000330298 ZNF623O75123 536 aa14.76□□□□□ -0.05
CTNNA3-201ENST00000330298 TBX10O75333 385 aa14.76□□□□□ -0.05
CTNNA3-201ENST00000330298 SLITRK3O94933 977 aa14.76□□□□□ -0.05
CTNNA3-201ENST00000330298 LYPLA2O95372 231 aa14.76□□□□□ -0.05
CTNNA3-201ENST00000330298 SEC24BO95487 1268 aa14.76□□□□□ -0.05
CTNNA3-201ENST00000330298 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
CTNNA3-201ENST00000330298 FGFR4P22455 802 aa14.76□□□□□ -0.05
CTNNA3-201ENST00000330298 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
CTNNA3-201ENST00000330298 PHKA2P46019 1235 aa14.76□□□□□ -0.05
CTNNA3-201ENST00000330298 NRIP1P48552 1158 aa14.76□□□□□ -0.05
CTNNA3-201ENST00000330298 RAB27AP51159 221 aa14.76□□□□□ -0.05
CTNNA3-201ENST00000330298 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
CTNNA3-201ENST00000330298 KRT17Q04695 432 aa14.76□□□□□ -0.05
CTNNA3-201ENST00000330298 ZP2Q05996 745 aa14.76□□□□□ -0.05
CTNNA3-201ENST00000330298 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP14.76□□□□□ -0.05
CTNNA3-201ENST00000330298 CLLU1OSQ5K130 101 aa14.76□□□□□ -0.05
CTNNA3-201ENST00000330298 NCAPH2Q6IBW4 605 aa14.76□□□□□ -0.05
CTNNA3-201ENST00000330298 KCNT2Q6UVM3 1135 aa14.76□□□□□ -0.05
CTNNA3-201ENST00000330298 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa14.76□□□□□ -0.05
CTNNA3-201ENST00000330298 ADGRD2Q7Z7M1 963 aa14.76□□□□□ -0.05
CTNNA3-201ENST00000330298 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
CTNNA3-201ENST00000330298 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa14.76□□□□□ -0.05
CTNNA3-201ENST00000330298 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
CTNNA3-201ENST00000330298 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
CTNNA3-201ENST00000330298 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
CTNNA3-201ENST00000330298 HSD17B14Q9BPX1 270 aa14.76□□□□□ -0.05
CTNNA3-201ENST00000330298 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
CTNNA3-201ENST00000330298 TLE6Q9H808 572 aa14.76□□□□□ -0.05
CTNNA3-201ENST00000330298 IFT122Q9HBG6 1241 aa14.76□□□□□ -0.05
CTNNA3-201ENST00000330298 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
CTNNA3-201ENST00000330298 PCDHA12Q9UN75 941 aa14.76□□□□□ -0.05
CTNNA3-201ENST00000330298 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa14.76□□□□□ -0.05
CTNNA3-201ENST00000330298 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa14.76□□□□□ -0.05
CTNNA3-201ENST00000330298 LINC01565O15544 149 aa14.75□□□□□ -0.05
CTNNA3-201ENST00000330298 JAK2O60674 1132 aa14.75□□□□□ -0.05
CTNNA3-201ENST00000330298 CSDE1O75534 798 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
CTNNA3-201ENST00000330298 ALADP13716 330 aa14.75□□□□□ -0.05
CTNNA3-201ENST00000330298 NDUFV1P49821 464 aa14.75□□□□□ -0.05
CTNNA3-201ENST00000330298 ERVFC1P60507 584 aa14.75□□□□□ -0.05
CTNNA3-201ENST00000330298 CALCRLQ16602 461 aa14.75□□□□□ -0.05
CTNNA3-201ENST00000330298 TWF2Q6IBS0 349 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
CTNNA3-201ENST00000330298 CATSPER4Q7RTX7 472 aa14.75□□□□□ -0.05
CTNNA3-201ENST00000330298 KSR1Q8IVT5 923 aa14.75□□□□□ -0.05
CTNNA3-201ENST00000330298 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
CTNNA3-201ENST00000330298 RNF169Q8NCN4 708 aa14.75□□□□□ -0.05
CTNNA3-201ENST00000330298 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP14.75□□□□□ -0.05
CTNNA3-201ENST00000330298 DYDC2Q96IM9 177 aa14.75□□□□□ -0.05
CTNNA3-201ENST00000330298 NLRP4Q96MN2 994 aa14.75□□□□□ -0.05
CTNNA3-201ENST00000330298 MTMR9Q96QG7 549 aa14.75□□□□□ -0.05
CTNNA3-201ENST00000330298 SPG21Q9NZD8 308 aa14.75□□□□□ -0.05
CTNNA3-201ENST00000330298 RGL1Q9NZL6 768 aa14.75□□□□□ -0.05
CTNNA3-201ENST00000330298 CLEC1BQ9P126 229 aa14.75□□□□□ -0.05
CTNNA3-201ENST00000330298 HCSTQ9UBK5 93 aa14.75□□□□□ -0.05
CTNNA3-201ENST00000330298 PLXNA4Q9HCM2 1894 aa14.75□□□□□ -0.05
CTNNA3-201ENST00000330298 NEMFO60524 1076 aa14.74□□□□□ -0.05
CTNNA3-201ENST00000330298 DTNBO60941 627 aa14.74□□□□□ -0.05
CTNNA3-201ENST00000330298 CSPG5O95196 566 aa14.74□□□□□ -0.05
CTNNA3-201ENST00000330298 POU5F1BQ06416 359 aa14.74□□□□□ -0.05
CTNNA3-201ENST00000330298 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa14.74□□□□□ -0.05
CTNNA3-201ENST00000330298 ST3GAL1Q11201 340 aa14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.6 ms