RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000318066.6

UBE2N-201, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 N, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UBE2N, Length 5,186 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2N-201ENST00000318066 PTPN21Q16825 1174 aa20.25■□□□□ 0.83
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UBE2N-201ENST00000318066 WWP1Q9H0M0 922 aa20.25■□□□□ 0.83
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UBE2N-201ENST00000318066 NLRP1Q9C000 1473 aa20.25■□□□□ 0.83
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UBE2N-201ENST00000318066 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa20.25■□□□□ 0.83
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UBE2N-201ENST00000318066 SLC12A1Q13621 1099 aa20.25■□□□□ 0.83
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UBE2N-201ENST00000318066 FAM47EQ6ZV65 393 aa20.24■□□□□ 0.83
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UBE2N-201ENST00000318066 BCS1LQ9Y276 419 aa20.23■□□□□ 0.83
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UBE2N-201ENST00000318066 USP17L1Q7RTZ2 530 aa20.23■□□□□ 0.83
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UBE2N-201ENST00000318066 HSPH1Q92598 858 aa20.23■□□□□ 0.83
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UBE2N-201ENST00000318066 WDR70Q9NW82 654 aa20.23■□□□□ 0.83
UBE2N-201ENST00000318066 ZNF18P17022 549 aa20.23■□□□□ 0.83
UBE2N-201ENST00000318066 HSPA9P38646 679 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
UBE2N-201ENST00000318066 USP11P51784 963 aa20.23■□□□□ 0.83
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UBE2N-201ENST00000318066 ICA1LQ8NDH6 482 aa20.23■□□□□ 0.83
UBE2N-201ENST00000318066 ACAP3Q96P50 834 aa20.23■□□□□ 0.83
UBE2N-201ENST00000318066 INTUQ9ULD6 942 aa20.23■□□□□ 0.83
UBE2N-201ENST00000318066 ZHX2Q9Y6X8 837 aa20.23■□□□□ 0.83
UBE2N-201ENST00000318066 SNX2O60749 519 aa20.22■□□□□ 0.83
UBE2N-201ENST00000318066 ELMSAN1Q6PJG2 1045 aa20.22■□□□□ 0.83
UBE2N-201ENST00000318066 TRIM45Q9H8W5 580 aaPredicted RBP20.22■□□□□ 0.83
UBE2N-201ENST00000318066 MYO3BQ8WXR4 1341 aa20.22■□□□□ 0.83
UBE2N-201ENST00000318066 PPP1R37O75864 691 aa20.22■□□□□ 0.83
UBE2N-201ENST00000318066 P4HBP07237 508 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
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UBE2N-201ENST00000318066 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP20.22■□□□□ 0.839e-9■■□□□ 13
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UBE2N-201ENST00000318066 SPATA4Q8NEY3 305 aa20.22■□□□□ 0.83
UBE2N-201ENST00000318066 ASPSCR1Q9BZE9 553 aa20.22■□□□□ 0.83
UBE2N-201ENST00000318066 GOLPH3LQ9H4A5 285 aa20.22■□□□□ 0.83
UBE2N-201ENST00000318066 G3BP2Q9UN86 482 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
UBE2N-201ENST00000318066 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
UBE2N-201ENST00000318066 KRT4P19013 534 aa20.22■□□□□ 0.83
UBE2N-201ENST00000318066 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP20.22■□□□□ 0.83
UBE2N-201ENST00000318066 NUP85Q9BW27 656 aa20.22■□□□□ 0.83
UBE2N-201ENST00000318066 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP20.22■□□□□ 0.832e-6■■□□□ 12.3
UBE2N-201ENST00000318066 SMAPO00193 183 aa20.22■□□□□ 0.83
UBE2N-201ENST00000318066 PHKA2P46019 1235 aa20.22■□□□□ 0.83
UBE2N-201ENST00000318066 ZNF699Q32M78 642 aa20.22■□□□□ 0.83
UBE2N-201ENST00000318066 DSTYKQ6XUX3 929 aa20.22■□□□□ 0.83
UBE2N-201ENST00000318066 LCA5Q86VQ0 697 aa20.22■□□□□ 0.83
UBE2N-201ENST00000318066 NUDCD3Q8IVD9 361 aa20.22■□□□□ 0.83
UBE2N-201ENST00000318066 OR6B3Q8NGW1 331 aa20.22■□□□□ 0.83
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