RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000317991.9

GRAMD1A-201, Transcript of GRAM domain containing 1A, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene GRAMD1A, Length 2,695 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRAMD1A-201ENST00000317991 PDXKO00764 312 aa24.11■■□□□ 1.45
GRAMD1A-201ENST00000317991 CALUO43852 315 aaPredicted RBP24.11■■□□□ 1.45
GRAMD1A-201ENST00000317991 RARAP10276 462 aa24.11■■□□□ 1.45
GRAMD1A-201ENST00000317991 PTGIRP43119 386 aa24.11■■□□□ 1.45
GRAMD1A-201ENST00000317991 DRAP1Q14919 205 aaPredicted RBP24.11■■□□□ 1.45
GRAMD1A-201ENST00000317991 KIF2BQ8N4N8 673 aa24.11■■□□□ 1.45
GRAMD1A-201ENST00000317991 RSRC1Q96IZ7 334 aaKnown RBP24.11■■□□□ 1.45
GRAMD1A-201ENST00000317991 KCNMB3Q9NPA1 279 aa24.11■■□□□ 1.45
GRAMD1A-201ENST00000317991 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa24.11■■□□□ 1.45
GRAMD1A-201ENST00000317991 FOXO6A8MYZ6 492 aa24.11■■□□□ 1.45
GRAMD1A-201ENST00000317991 TMEM253P0C7T8 217 aa24.11■■□□□ 1.45
GRAMD1A-201ENST00000317991 CREB1P16220 341 aa24.11■■□□□ 1.45
GRAMD1A-201ENST00000317991 SOX5P35711 763 aa24.11■■□□□ 1.45
GRAMD1A-201ENST00000317991 DDB1Q16531 1140 aa24.11■■□□□ 1.45
GRAMD1A-201ENST00000317991 OTUD6AQ7L8S5 288 aa24.11■■□□□ 1.45
GRAMD1A-201ENST00000317991 KRT35Q92764 455 aa24.11■■□□□ 1.45
GRAMD1A-201ENST00000317991 MLXIPLQ9NP71 852 aa24.11■■□□□ 1.45
GRAMD1A-201ENST00000317991 VCAM1P19320 739 aa24.1■■□□□ 1.45
GRAMD1A-201ENST00000317991 NCALDP61601 193 aa24.1■■□□□ 1.45
GRAMD1A-201ENST00000317991 CNGA2Q16280 664 aa24.1■■□□□ 1.45
GRAMD1A-201ENST00000317991 C6orf118Q5T5N4 469 aa24.1■■□□□ 1.45
GRAMD1A-201ENST00000317991 TTC27Q6P3X3 843 aa24.1■■□□□ 1.45
GRAMD1A-201ENST00000317991 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP24.1■■□□□ 1.45
GRAMD1A-201ENST00000317991 DNAJC12Q9UKB3 198 aa24.1■■□□□ 1.45
GRAMD1A-201ENST00000317991 SNX3O60493 162 aa24.1■■□□□ 1.45
GRAMD1A-201ENST00000317991 GCNT3O95395 438 aa24.1■■□□□ 1.45
GRAMD1A-201ENST00000317991 AGTP01019 485 aa24.1■■□□□ 1.45
GRAMD1A-201ENST00000317991 ANXA13P27216 316 aa24.1■■□□□ 1.45
GRAMD1A-201ENST00000317991 ALDH5A1P51649 535 aaPredicted RBP24.1■■□□□ 1.45
GRAMD1A-201ENST00000317991 RHBDL3P58872 404 aa24.1■■□□□ 1.45
GRAMD1A-201ENST00000317991 AUHQ13825 339 aaKnown RBP24.1■■□□□ 1.45
GRAMD1A-201ENST00000317991 PRELID2Q8N945 189 aa24.1■■□□□ 1.45
GRAMD1A-201ENST00000317991 C8orf37Q96NL8 207 aa24.1■■□□□ 1.45
GRAMD1A-201ENST00000317991 C15orf41Q9Y2V0 281 aa24.1■■□□□ 1.45
GRAMD1A-201ENST00000317991 NCANO14594 1321 aa24.1■■□□□ 1.45
GRAMD1A-201ENST00000317991 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa24.1■■□□□ 1.45
GRAMD1A-201ENST00000317991 FAM187AA6NFU0 413 aa24.09■■□□□ 1.45
GRAMD1A-201ENST00000317991 ANKRD63C9JTQ0 380 aa24.09■■□□□ 1.45
GRAMD1A-201ENST00000317991 HGSO14964 777 aaPredicted RBP24.09■■□□□ 1.45
GRAMD1A-201ENST00000317991 SNHG28P0DPA3 235 aa24.09■■□□□ 1.45
GRAMD1A-201ENST00000317991 CYP4A11Q02928 519 aa24.09■■□□□ 1.45
GRAMD1A-201ENST00000317991 ZNF543Q08ER8 600 aa24.09■■□□□ 1.45
GRAMD1A-201ENST00000317991 BARGINQ6ZT62 677 aa24.09■■□□□ 1.45
GRAMD1A-201ENST00000317991 HOOK2Q96ED9 719 aa24.09■■□□□ 1.45
GRAMD1A-201ENST00000317991 SETDB2Q96T68 719 aa24.09■■□□□ 1.45
GRAMD1A-201ENST00000317991 ECT2Q9H8V3 914 aa24.09■■□□□ 1.45
GRAMD1A-201ENST00000317991 FGFR1OP2Q9NVK5 253 aa24.09■■□□□ 1.45
GRAMD1A-201ENST00000317991 KIF13BQ9NQT8 1826 aa24.09■■□□□ 1.45
GRAMD1A-201ENST00000317991 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa24.09■■□□□ 1.45
GRAMD1A-201ENST00000317991 TMEM110-MUSTN1A8MSY1 372 aa24.09■■□□□ 1.45
GRAMD1A-201ENST00000317991 NQO1P15559 274 aaKnown RBP24.09■■□□□ 1.45
GRAMD1A-201ENST00000317991 PICALMQ13492 652 aa24.09■■□□□ 1.45
GRAMD1A-201ENST00000317991 RIPK1Q13546 671 aa24.09■■□□□ 1.45
GRAMD1A-201ENST00000317991 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP24.09■■□□□ 1.45
GRAMD1A-201ENST00000317991 CRELD2Q6UXH1 353 aaPredicted RBP24.09■■□□□ 1.45
GRAMD1A-201ENST00000317991 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP24.09■■□□□ 1.45
GRAMD1A-201ENST00000317991 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP24.09■■□□□ 1.45
GRAMD1A-201ENST00000317991 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP24.09■■□□□ 1.45
GRAMD1A-201ENST00000317991 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP24.09■■□□□ 1.45
GRAMD1A-201ENST00000317991 ALG6Q9Y672 507 aa24.09■■□□□ 1.45
GRAMD1A-201ENST00000317991 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa24.08■■□□□ 1.45
GRAMD1A-201ENST00000317991 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP24.08■■□□□ 1.45
GRAMD1A-201ENST00000317991 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa24.08■■□□□ 1.45
GRAMD1A-201ENST00000317991 DHX34Q14147 1143 aaKnown RBP24.08■■□□□ 1.45
GRAMD1A-201ENST00000317991 CCDC25Q86WR0 208 aa24.08■■□□□ 1.45
GRAMD1A-201ENST00000317991 KSR1Q8IVT5 923 aa24.08■■□□□ 1.45
GRAMD1A-201ENST00000317991 SPICE1Q8N0Z3 855 aa24.08■■□□□ 1.45
GRAMD1A-201ENST00000317991 BCS1LQ9Y276 419 aa24.08■■□□□ 1.45
GRAMD1A-201ENST00000317991 PTPN22Q9Y2R2 807 aa24.08■■□□□ 1.45
GRAMD1A-201ENST00000317991 RASGRF2O14827 1237 aa24.08■■□□□ 1.45
GRAMD1A-201ENST00000317991 LMNB1P20700 586 aa24.08■■□□□ 1.45
GRAMD1A-201ENST00000317991 ARHGAP44Q17R89 818 aa24.08■■□□□ 1.45
GRAMD1A-201ENST00000317991 EXOC3L1Q86VI1 746 aa24.08■■□□□ 1.45
GRAMD1A-201ENST00000317991 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP24.08■■□□□ 1.45
GRAMD1A-201ENST00000317991 NAP1L3Q99457 506 aaPredicted RBP24.08■■□□□ 1.45
GRAMD1A-201ENST00000317991 GPR88Q9GZN0 384 aa24.08■■□□□ 1.45
GRAMD1A-201ENST00000317991 METTL14Q9HCE5 456 aaKnown RBP24.08■■□□□ 1.45
GRAMD1A-201ENST00000317991 DNM3Q9UQ16 869 aa24.08■■□□□ 1.45
GRAMD1A-201ENST00000317991 TCRBV7S2A1N4TA0A589 114 aa24.07■■□□□ 1.44
GRAMD1A-201ENST00000317991 RIPK2O43353 540 aa24.07■■□□□ 1.44
GRAMD1A-201ENST00000317991 SLURP2P0DP57 97 aa24.07■■□□□ 1.44
GRAMD1A-201ENST00000317991 ADCY2Q08462 1091 aa24.07■■□□□ 1.44
GRAMD1A-201ENST00000317991 LLGL1Q15334 1064 aa24.07■■□□□ 1.44
GRAMD1A-201ENST00000317991 RUSC1Q9BVN2 902 aa24.07■■□□□ 1.44
GRAMD1A-201ENST00000317991 CCDC134Q9H6E4 229 aa24.07■■□□□ 1.44
GRAMD1A-201ENST00000317991 PNMA3Q9UL41 463 aa24.07■■□□□ 1.44
GRAMD1A-201ENST00000317991 TRIM33Q9UPN9 1127 aa24.07■■□□□ 1.44
GRAMD1A-201ENST00000317991 CFAP73A6NFT4 308 aa24.07■■□□□ 1.44
GRAMD1A-201ENST00000317991 TCP11X1B4DZS4 312 aa24.07■■□□□ 1.44
GRAMD1A-201ENST00000317991 TGFB1I1O43294 461 aa24.07■■□□□ 1.44
GRAMD1A-201ENST00000317991 DIAPH2O60879 1101 aa24.07■■□□□ 1.44
GRAMD1A-201ENST00000317991 SPIRE1Q08AE8 756 aa24.07■■□□□ 1.44
GRAMD1A-201ENST00000317991 LONRF1Q17RB8 773 aa24.07■■□□□ 1.44
GRAMD1A-201ENST00000317991 PRR16Q569H4 304 aa24.07■■□□□ 1.44
GRAMD1A-201ENST00000317991 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP24.07■■□□□ 1.44
GRAMD1A-201ENST00000317991 SYT11Q9BT88 431 aa24.07■■□□□ 1.44
GRAMD1A-201ENST00000317991 ATP8B3O60423 1300 aa24.07■■□□□ 1.44
GRAMD1A-201ENST00000317991 DRG2P55039 364 aaKnown RBP24.07■■□□□ 1.44
GRAMD1A-201ENST00000317991 COG2Q14746 738 aa24.07■■□□□ 1.44
GRAMD1A-201ENST00000317991 MAB21L3Q8N8X9 362 aa24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.2 ms