RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000301886.3

ARL2-SNX15-201, Transcript of ARL2-SNX15 readthrough (NMD candidate), humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene ARL2-SNX15, Length 2,392 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 WDR35Q9P2L0 1181 aa24.49■■□□□ 1.51
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP24.49■■□□□ 1.51
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP24.49■■□□□ 1.51
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 SLIT2O94813 1529 aa24.49■■□□□ 1.51
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa24.49■■□□□ 1.51
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 TMEM120BA0PK00 339 aa24.49■■□□□ 1.51
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 EIF4E1BA6NMX2 242 aaKnown RBP24.49■■□□□ 1.51
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 FGFR4P22455 802 aa24.49■■□□□ 1.51
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 RPL21P46778 160 aaKnown RBP24.49■■□□□ 1.51
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ARL2-SNX15-201ENST00000301886 VSTM1Q6UX27 236 aa24.49■■□□□ 1.51
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 FRMD5Q7Z6J6 570 aa24.49■■□□□ 1.51
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 SLC35G2Q8TBE7 412 aa24.49■■□□□ 1.51
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ARL2-SNX15-201ENST00000301886 RFFLQ8WZ73 363 aa24.49■■□□□ 1.51
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 KLHL14Q9P2G3 628 aa24.49■■□□□ 1.51
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP24.49■■□□□ 1.51
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 SHANK3Q9BYB0 1731 aa24.48■■□□□ 1.51
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 MAP3K13O43283 966 aa24.48■■□□□ 1.51
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 PHF2O75151 1096 aa24.48■■□□□ 1.51
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ARL2-SNX15-201ENST00000301886 RAD23BP54727 409 aa24.48■■□□□ 1.51
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 JAM2P57087 298 aa24.48■■□□□ 1.51
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 SCFD1Q8WVM8 642 aa24.48■■□□□ 1.51
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 OSGEPQ9NPF4 335 aa24.48■■□□□ 1.51
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 C2CD2Q9Y426 696 aa24.48■■□□□ 1.51
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ATP5HO75947 161 aa24.47■■□□□ 1.51
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ARL2-SNX15-201ENST00000301886 KLC1Q07866 573 aa24.47■■□□□ 1.51
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 SUPV3L1Q8IYB8 786 aaKnown RBP eCLIP24.47■■□□□ 1.51
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 AGGF1Q8N302 714 aaeCLIP24.47■■□□□ 1.51
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ASAP3Q8TDY4 903 aa24.47■■□□□ 1.51
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 PIGBQ92521 554 aa24.47■■□□□ 1.51
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP24.47■■□□□ 1.51
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP24.47■■□□□ 1.51
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 EMILIN3Q9NT22 766 aa24.47■■□□□ 1.51
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 RGL1Q9NZL6 768 aa24.47■■□□□ 1.51
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 MTMR7Q9Y216 660 aa24.47■■□□□ 1.51
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa24.47■■□□□ 1.51
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 SLC37A4O43826 429 aa24.47■■□□□ 1.51
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 TMEM253P0C7T8 217 aa24.47■■□□□ 1.51
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 KRT13P13646 458 aa24.47■■□□□ 1.51
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 CAVIN4Q5BKX8 364 aa24.47■■□□□ 1.51
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 CGB2Q6NT52 195 aa24.47■■□□□ 1.51
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 SH3TC2Q8TF17 1288 aa24.47■■□□□ 1.51
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ARHGEF2Q92974 986 aaKnown RBP24.47■■□□□ 1.51
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 IRAK4Q9NWZ3 460 aa24.47■■□□□ 1.51
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ARMCX3Q9UH62 379 aaPredicted RBP24.47■■□□□ 1.51
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 PCDHA3Q9Y5H8 950 aa24.47■■□□□ 1.51
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ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ECM1Q16610 540 aa24.46■■□□□ 1.51
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 TBC1D25Q3MII6 688 aa24.46■■□□□ 1.51
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 PPP1R15BQ5SWA1 713 aa24.46■■□□□ 1.51
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ARL2-SNX15-201ENST00000301886 TMEM237Q96Q45 408 aa24.46■■□□□ 1.51
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 PIDD1Q9HB75 910 aa24.46■■□□□ 1.51
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 MCM9Q9NXL9 1143 aa24.46■■□□□ 1.51
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 PCYOX1Q9UHG3 505 aa24.46■■□□□ 1.51
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 GOLGA8HP0CJ92 632 aa24.46■■□□□ 1.51
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 SP100P23497 879 aaPredicted RBP24.46■■□□□ 1.51
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ZNF568Q3ZCX4 644 aa24.46■■□□□ 1.51
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 SLC30A5Q8TAD4 765 aa24.46■■□□□ 1.51
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 TAOK3Q9H2K8 898 aa24.46■■□□□ 1.51
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ESYT2A0FGR8 921 aa24.45■■□□□ 1.51
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 USP17L3A6NCW0 530 aa24.45■■□□□ 1.51
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 USP17L4A6NCW7 530 aa24.45■■□□□ 1.51
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 NR2F2P24468 414 aa24.45■■□□□ 1.51
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 UBE4AQ14139 1066 aa24.45■■□□□ 1.51
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 USP17L1Q7RTZ2 530 aa24.45■■□□□ 1.51
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP24.45■■□□□ 1.51
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ECHDC2Q86YB7 292 aa24.45■■□□□ 1.51
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 GRAMD1AQ96CP6 724 aa24.45■■□□□ 1.51
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 C18orf8Q96DM3 657 aa24.45■■□□□ 1.51
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 SERPINB12Q96P63 405 aa24.45■■□□□ 1.51
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 TMEM260Q9NX78 707 aa24.45■■□□□ 1.51
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 VCAM1P19320 739 aa24.45■■□□□ 1.5
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ZNF211Q13398 564 aaPredicted RBP24.45■■□□□ 1.5
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 EPHA7Q15375 998 aa24.45■■□□□ 1.5
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP24.45■■□□□ 1.5
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 TRMT10CQ7L0Y3 403 aaKnown RBP24.45■■□□□ 1.5
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 IFT43Q96FT9 208 aa24.45■■□□□ 1.5
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 TMEM47Q9BQJ4 181 aa24.45■■□□□ 1.5
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 USP40Q9NVE5 1235 aa24.45■■□□□ 1.5
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 RNF8O76064 485 aa24.44■■□□□ 1.5
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 TDP2O95551 362 aa24.44■■□□□ 1.5
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 LMNB1P20700 586 aa24.44■■□□□ 1.5
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 LAMB3Q13751 1172 aa24.44■■□□□ 1.5
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 MTFR1Q15390 333 aa24.44■■□□□ 1.5
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 TSNAXIP1Q2TAA8 658 aa24.44■■□□□ 1.5
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ZC3H12AQ5D1E8 599 aaKnown RBP24.44■■□□□ 1.5
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 TMEM154Q6P9G4 183 aa24.44■■□□□ 1.5
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 LNX1Q8TBB1 728 aaPredicted RBP24.44■■□□□ 1.5
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 SIX2Q9NPC8 291 aa24.44■■□□□ 1.5
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 EYA4O95677 639 aa24.44■■□□□ 1.5
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 PDHA1P08559 390 aa24.44■■□□□ 1.5
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 USP17L8P0C7I0 530 aa24.44■■□□□ 1.5
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ALAS1P13196 640 aa24.44■■□□□ 1.5
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 RXRBP28702 533 aa24.44■■□□□ 1.5
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