RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000298260.8

SKA3-201, Transcript of spindle and kinetochore associated complex subunit 3, humanhuman

TSL 2

Gene SKA3, Length 2,803 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKA3-201ENST00000298260 CYP4X1Q8N118 509 aa14.55□□□□□ -0.08
SKA3-201ENST00000298260 FBF1Q8TES7 1133 aa14.55□□□□□ -0.08
SKA3-201ENST00000298260 DDX50Q9BQ39 737 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
SKA3-201ENST00000298260 TAS2R14Q9NYV8 317 aa14.55□□□□□ -0.08
SKA3-201ENST00000298260 LMCD1Q9NZU5 365 aa14.55□□□□□ -0.08
SKA3-201ENST00000298260 E9PMD0 336 aa14.54□□□□□ -0.08
SKA3-201ENST00000298260 LIN7AO14910 233 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
SKA3-201ENST00000298260 DDX3YO15523 660 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
SKA3-201ENST00000298260 CALB2P22676 271 aa14.54□□□□□ -0.08
SKA3-201ENST00000298260 CASP5P51878 434 aa14.54□□□□□ -0.08
SKA3-201ENST00000298260 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP14.54□□□□□ -0.08
SKA3-201ENST00000298260 EXOC3L4Q17RC7 722 aa14.54□□□□□ -0.08
SKA3-201ENST00000298260 VSIG1Q86XK7 387 aa14.54□□□□□ -0.08
SKA3-201ENST00000298260 CCNJLQ8IV13 435 aa14.54□□□□□ -0.08
SKA3-201ENST00000298260 GALNT15Q8N3T1 639 aa14.54□□□□□ -0.08
SKA3-201ENST00000298260 PIGOQ8TEQ8 1089 aa14.54□□□□□ -0.08
SKA3-201ENST00000298260 KRT35Q92764 455 aa14.54□□□□□ -0.08
SKA3-201ENST00000298260 AK8Q96MA6 479 aa14.54□□□□□ -0.08
SKA3-201ENST00000298260 NUCKS1Q9H1E3 243 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
SKA3-201ENST00000298260 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
SKA3-201ENST00000298260 BARHL2Q9NY43 387 aa14.54□□□□□ -0.08
SKA3-201ENST00000298260 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
SKA3-201ENST00000298260 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa14.54□□□□□ -0.08
SKA3-201ENST00000298260 LRRC42Q9Y546 428 aa14.54□□□□□ -0.08
SKA3-201ENST00000298260 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa14.54□□□□□ -0.08
SKA3-201ENST00000298260 UNC5CO95185 931 aa14.54□□□□□ -0.08
SKA3-201ENST00000298260 PEX5P50542 639 aa14.54□□□□□ -0.08
SKA3-201ENST00000298260 DIXDC1Q155Q3 683 aa14.54□□□□□ -0.08
SKA3-201ENST00000298260 FAM26FQ5R3K3 315 aa14.54□□□□□ -0.08
SKA3-201ENST00000298260 NEK8Q86SG6 692 aa14.54□□□□□ -0.08
SKA3-201ENST00000298260 MFN1Q8IWA4 741 aa14.54□□□□□ -0.08
SKA3-201ENST00000298260 RAD54LQ92698 747 aa14.54□□□□□ -0.08
SKA3-201ENST00000298260 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa14.54□□□□□ -0.08
SKA3-201ENST00000298260 CCDC134Q9H6E4 229 aa14.54□□□□□ -0.08
SKA3-201ENST00000298260 GJB6O95452 261 aa14.53□□□□□ -0.08
SKA3-201ENST00000298260 AFPP02771 609 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
SKA3-201ENST00000298260 CHRNDQ07001 517 aa14.53□□□□□ -0.08
SKA3-201ENST00000298260 RFWD3Q6PCD5 774 aa14.53□□□□□ -0.08
SKA3-201ENST00000298260 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
SKA3-201ENST00000298260 LNX1Q8TBB1 728 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
SKA3-201ENST00000298260 STK32AQ8WU08 396 aa14.53□□□□□ -0.08
SKA3-201ENST00000298260 ITFG2Q969R8 447 aa14.53□□□□□ -0.08
SKA3-201ENST00000298260 SLC4A9Q96Q91 983 aa14.53□□□□□ -0.08
SKA3-201ENST00000298260 TRIM4Q9C037 500 aa14.53□□□□□ -0.08
SKA3-201ENST00000298260 UBE2OQ9C0C9 1292 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
SKA3-201ENST00000298260 MAGEF1Q9HAY2 307 aa14.53□□□□□ -0.08
SKA3-201ENST00000298260 WDR35Q9P2L0 1181 aa14.53□□□□□ -0.08
SKA3-201ENST00000298260 ARMCX3Q9UH62 379 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
SKA3-201ENST00000298260 HDAC9Q9UKV0 1011 aa14.53□□□□□ -0.08
SKA3-201ENST00000298260 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
SKA3-201ENST00000298260 PVALEFA0A1B0GWK0 134 aa14.53□□□□□ -0.08
SKA3-201ENST00000298260 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
SKA3-201ENST00000298260 PYGBP11216 843 aa14.53□□□□□ -0.08
SKA3-201ENST00000298260 ATP6V1C1P21283 382 aa14.53□□□□□ -0.08
SKA3-201ENST00000298260 PON1P27169 355 aa14.53□□□□□ -0.08
SKA3-201ENST00000298260 MAPK7Q13164 816 aa14.53□□□□□ -0.08
SKA3-201ENST00000298260 SEPT2Q15019 361 aa14.53□□□□□ -0.08
SKA3-201ENST00000298260 CALCRLQ16602 461 aa14.53□□□□□ -0.08
SKA3-201ENST00000298260 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
SKA3-201ENST00000298260 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
SKA3-201ENST00000298260 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa14.53□□□□□ -0.08
SKA3-201ENST00000298260 SLFN11Q7Z7L1 901 aa14.53□□□□□ -0.08
SKA3-201ENST00000298260 LMNTD2Q8IXW0 634 aa14.53□□□□□ -0.08
SKA3-201ENST00000298260 DRAXINQ8NBI3 349 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
SKA3-201ENST00000298260 DNAJC19Q96DA6 116 aa14.53□□□□□ -0.08
SKA3-201ENST00000298260 SLCO1B3Q9NPD5 702 aa14.53□□□□□ -0.08
SKA3-201ENST00000298260 MCM9Q9NXL9 1143 aa14.53□□□□□ -0.08
SKA3-201ENST00000298260 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP14.53□□□□□ -0.08
SKA3-201ENST00000298260 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa14.53□□□□□ -0.08
SKA3-201ENST00000298260 KCPQ6ZWJ8 1503 aa14.53□□□□□ -0.08
SKA3-201ENST00000298260 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa14.52□□□□□ -0.08
SKA3-201ENST00000298260 GOLGA6L10A0A0M3HER8 536 aa14.52□□□□□ -0.08
SKA3-201ENST00000298260 NR2F2P24468 414 aa14.52□□□□□ -0.08
SKA3-201ENST00000298260 KLRK1P26718 216 aa14.52□□□□□ -0.08
SKA3-201ENST00000298260 FOXN2P32314 431 aa14.52□□□□□ -0.08
SKA3-201ENST00000298260 GBP1P32455 592 aa14.52□□□□□ -0.08
SKA3-201ENST00000298260 PPP1R2P41236 205 aa14.52□□□□□ -0.08
SKA3-201ENST00000298260 SSR1P43307 286 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.08
SKA3-201ENST00000298260 TRIP13Q15645 432 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.08
SKA3-201ENST00000298260 USP17L2Q6R6M4 530 aa14.52□□□□□ -0.08
SKA3-201ENST00000298260 UBA5Q9GZZ9 404 aa14.52□□□□□ -0.08
SKA3-201ENST00000298260 DENND2DQ9H6A0 471 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.08
SKA3-201ENST00000298260 PICK1Q9NRD5 415 aa14.52□□□□□ -0.08
SKA3-201ENST00000298260 CYP39A1Q9NYL5 469 aa14.52□□□□□ -0.08
SKA3-201ENST00000298260 KLHL14Q9P2G3 628 aa14.52□□□□□ -0.08
SKA3-201ENST00000298260 PRKAG3Q9UGI9 489 aa14.52□□□□□ -0.08
SKA3-201ENST00000298260 ASB3Q9Y575 518 aa14.52□□□□□ -0.08
SKA3-201ENST00000298260 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.08
SKA3-201ENST00000298260 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.08
SKA3-201ENST00000298260 FLOT1O75955 427 aa14.52□□□□□ -0.09
SKA3-201ENST00000298260 CETPP11597 493 aa14.52□□□□□ -0.09
SKA3-201ENST00000298260 STX2P32856 288 aa14.52□□□□□ -0.09
SKA3-201ENST00000298260 CCNG1P51959 295 aa14.52□□□□□ -0.09
SKA3-201ENST00000298260 KLC1Q07866 573 aa14.52□□□□□ -0.09
SKA3-201ENST00000298260 CTTNQ14247 550 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
SKA3-201ENST00000298260 MUM1Q2TAK8 710 aa14.52□□□□□ -0.09
SKA3-201ENST00000298260 SRRM1Q8IYB3 904 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
SKA3-201ENST00000298260 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
SKA3-201ENST00000298260 PRELID2Q8N945 189 aa14.52□□□□□ -0.09
SKA3-201ENST00000298260 SCFD1Q8WVM8 642 aa14.52□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 84.7 ms