RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000297265.4

CHMP4C-201, Transcript of charged multivesicular body protein 4C, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CHMP4C, Length 1,866 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP4C-201ENST00000297265 PCIF1Q9H4Z3 704 aa14.86□□□□□ -0.03
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CHMP4C-201ENST00000297265 TBX20Q9UMR3 447 aa14.86□□□□□ -0.03
CHMP4C-201ENST00000297265 GUCA1BQ9UMX6 200 aa14.86□□□□□ -0.03
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CHMP4C-201ENST00000297265 ANKRD63C9JTQ0 380 aa14.86□□□□□ -0.03
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CHMP4C-201ENST00000297265 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa14.86□□□□□ -0.03
CHMP4C-201ENST00000297265 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa14.85□□□□□ -0.03
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CHMP4C-201ENST00000297265 TRIM49CP0CI26 452 aa14.85□□□□□ -0.03
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CHMP4C-201ENST00000297265 HSPBP1Q9NZL4 362 aa14.85□□□□□ -0.03
CHMP4C-201ENST00000297265 GCNT4Q9P109 453 aa14.85□□□□□ -0.03
CHMP4C-201ENST00000297265 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
CHMP4C-201ENST00000297265 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP14.85□□□□□ -0.03
CHMP4C-201ENST00000297265 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
CHMP4C-201ENST00000297265 CLEC11AQ9Y240 323 aa14.85□□□□□ -0.03
CHMP4C-201ENST00000297265 PCDHA13Q9Y5I0 950 aa14.85□□□□□ -0.03
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CHMP4C-201ENST00000297265 SERPING1P05155 500 aa14.84□□□□□ -0.03
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CHMP4C-201ENST00000297265 TMEM63BQ5T3F8 832 aa14.84□□□□□ -0.03
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CHMP4C-201ENST00000297265 JAKMIP2Q96AA8 810 aa14.84□□□□□ -0.03
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CHMP4C-201ENST00000297265 MMP19Q99542 508 aa14.84□□□□□ -0.03
CHMP4C-201ENST00000297265 CARD6Q9BX69 1037 aa14.84□□□□□ -0.03
CHMP4C-201ENST00000297265 MROH8Q9H579 483 aa14.84□□□□□ -0.03
CHMP4C-201ENST00000297265 ZNF408Q9H9D4 720 aa14.84□□□□□ -0.03
CHMP4C-201ENST00000297265 KMT5AQ9NQR1 393 aa14.84□□□□□ -0.03
CHMP4C-201ENST00000297265 ARHGAP28Q9P2N2 729 aa14.84□□□□□ -0.03
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CHMP4C-201ENST00000297265 RAPGEF1Q13905 1077 aa14.83□□□□□ -0.04
CHMP4C-201ENST00000297265 KCTD2Q14681 263 aa14.83□□□□□ -0.04
CHMP4C-201ENST00000297265 ERCC6LQ2NKX8 1250 aa14.83□□□□□ -0.04
CHMP4C-201ENST00000297265 HSDL1Q3SXM5 330 aa14.83□□□□□ -0.04
CHMP4C-201ENST00000297265 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa14.83□□□□□ -0.04
CHMP4C-201ENST00000297265 IQCEQ6IPM2 695 aa14.83□□□□□ -0.04
CHMP4C-201ENST00000297265 METTL7BQ6UX53 244 aa14.83□□□□□ -0.04
CHMP4C-201ENST00000297265 XXYLT1Q8NBI6 393 aa14.83□□□□□ -0.04
CHMP4C-201ENST00000297265 SHCBP1Q8NEM2 672 aa14.83□□□□□ -0.04
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CHMP4C-201ENST00000297265 SALL4Q9UJQ4 1053 aa14.83□□□□□ -0.04
CHMP4C-201ENST00000297265 MYO6Q9UM54 1294 aa14.83□□□□□ -0.04
CHMP4C-201ENST00000297265 BTBD19C9JJ37 291 aa14.82□□□□□ -0.04
CHMP4C-201ENST00000297265 PJA2O43164 708 aa14.82□□□□□ -0.04
CHMP4C-201ENST00000297265 KRT86O43790 486 aa14.82□□□□□ -0.04
CHMP4C-201ENST00000297265 AKR1B10O60218 316 aa14.82□□□□□ -0.04
CHMP4C-201ENST00000297265 TADA3O75528 432 aa14.82□□□□□ -0.04
CHMP4C-201ENST00000297265 ADRB2P07550 413 aa14.82□□□□□ -0.04
CHMP4C-201ENST00000297265 INTS8Q75QN2 995 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
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