RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296026.4

CXCL3-201, Transcript of C-X-C motif chemokine ligand 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CXCL3, Length 1,075 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL3-201ENST00000296026 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
CXCL3-201ENST00000296026 PHF20Q9BVI0 1012 aa22.03■■□□□ 1.12
CXCL3-201ENST00000296026 CHST12Q9NRB3 414 aa22.03■■□□□ 1.12
CXCL3-201ENST00000296026 SPG21Q9NZD8 308 aa22.03■■□□□ 1.12
CXCL3-201ENST00000296026 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa22.02■■□□□ 1.12
CXCL3-201ENST00000296026 LOC730098B7Z3J9 87 aa22.02■■□□□ 1.12
CXCL3-201ENST00000296026 MAFO75444 373 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
CXCL3-201ENST00000296026 CDKL5O76039 1030 aa22.02■■□□□ 1.12
CXCL3-201ENST00000296026 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
CXCL3-201ENST00000296026 PSMC5P62195 406 aa22.02■■□□□ 1.12
CXCL3-201ENST00000296026 SCRN1Q12765 414 aa22.02■■□□□ 1.12
CXCL3-201ENST00000296026 ANO5Q75V66 913 aa22.02■■□□□ 1.12
CXCL3-201ENST00000296026 RHPN2Q8IUC4 686 aa22.02■■□□□ 1.12
CXCL3-201ENST00000296026 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
CXCL3-201ENST00000296026 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
CXCL3-201ENST00000296026 C5orf42Q9H799 3197 aa22.01■■□□□ 1.11
CXCL3-201ENST00000296026 HIDE1A8MVS5 230 aa22.01■■□□□ 1.11
CXCL3-201ENST00000296026 EML1O00423 815 aa22.01■■□□□ 1.11
CXCL3-201ENST00000296026 SRGAP2BP0DMP2 458 aa22.01■■□□□ 1.11
CXCL3-201ENST00000296026 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP22.01■■□□□ 1.11
CXCL3-201ENST00000296026 KCNC3Q14003 757 aa22.01■■□□□ 1.11
CXCL3-201ENST00000296026 PLA2G4FQ68DD2 849 aa22.01■■□□□ 1.11
CXCL3-201ENST00000296026 TMEM184AQ6ZMB5 413 aa22.01■■□□□ 1.11
CXCL3-201ENST00000296026 HFE2Q6ZVN8 426 aa22.01■■□□□ 1.11
CXCL3-201ENST00000296026 TMC7Q7Z402 723 aa22.01■■□□□ 1.11
CXCL3-201ENST00000296026 ZNF410Q86VK4 478 aa22.01■■□□□ 1.11
CXCL3-201ENST00000296026 SLC39A11Q8N1S5 342 aa22.01■■□□□ 1.11
CXCL3-201ENST00000296026 PHF7Q9BWX1 381 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
CXCL3-201ENST00000296026 MRPL9Q9BYD2 267 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
CXCL3-201ENST00000296026 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
CXCL3-201ENST00000296026 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
CXCL3-201ENST00000296026 XBP1P17861 261 aa22■■□□□ 1.11
CXCL3-201ENST00000296026 TECP42680 631 aa22■■□□□ 1.11
CXCL3-201ENST00000296026 PHKA2P46019 1235 aa22■■□□□ 1.11
CXCL3-201ENST00000296026 PPP2R5CQ13362 524 aa22■■□□□ 1.11
CXCL3-201ENST00000296026 TWF2Q6IBS0 349 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
CXCL3-201ENST00000296026 LLGL2Q6P1M3 1020 aa22■■□□□ 1.11
CXCL3-201ENST00000296026 NEK8Q86SG6 692 aa22■■□□□ 1.11
CXCL3-201ENST00000296026 KSR1Q8IVT5 923 aa22■■□□□ 1.11
CXCL3-201ENST00000296026 SUSD6Q92537 303 aa22■■□□□ 1.11
CXCL3-201ENST00000296026 EDAQ92838 391 aa22■■□□□ 1.11
CXCL3-201ENST00000296026 FAM20AQ96MK3 541 aa22■■□□□ 1.11
CXCL3-201ENST00000296026 KCNMB3Q9NPA1 279 aa22■■□□□ 1.11
CXCL3-201ENST00000296026 GJB4Q9NTQ9 266 aa22■■□□□ 1.11
CXCL3-201ENST00000296026 VAV3Q9UKW4 847 aa22■■□□□ 1.11
CXCL3-201ENST00000296026 DTNBO60941 627 aa21.99■■□□□ 1.11
CXCL3-201ENST00000296026 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
CXCL3-201ENST00000296026 QARSP47897 775 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
CXCL3-201ENST00000296026 CBX2Q14781 532 aaPredicted RBP21.99■■□□□ 1.11
CXCL3-201ENST00000296026 PPP4R3AQ6IN85 833 aa21.99■■□□□ 1.11
CXCL3-201ENST00000296026 ANKRD54Q6NXT1 300 aa21.99■■□□□ 1.11
CXCL3-201ENST00000296026 RPGRIP1Q96KN7 1286 aa21.99■■□□□ 1.11
CXCL3-201ENST00000296026 NLRP4Q96MN2 994 aa21.99■■□□□ 1.11
CXCL3-201ENST00000296026 JPH2Q9BR39 696 aaPredicted RBP21.99■■□□□ 1.11
CXCL3-201ENST00000296026 TRAIPQ9BWF2 469 aa21.99■■□□□ 1.11
CXCL3-201ENST00000296026 S1PR5Q9H228 398 aa21.99■■□□□ 1.11
CXCL3-201ENST00000296026 CYP26B1Q9NR63 512 aa21.99■■□□□ 1.11
CXCL3-201ENST00000296026 TPCN1Q9ULQ1 816 aa21.99■■□□□ 1.11
CXCL3-201ENST00000296026 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
CXCL3-201ENST00000296026 STK36Q9NRP7 1315 aa21.99■■□□□ 1.11
CXCL3-201ENST00000296026 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa21.98■■□□□ 1.11
CXCL3-201ENST00000296026 CCNT1O60563 726 aaKnown RBP21.98■■□□□ 1.11
CXCL3-201ENST00000296026 PFKFB2O60825 505 aa21.98■■□□□ 1.11
CXCL3-201ENST00000296026 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP21.98■■□□□ 1.11
CXCL3-201ENST00000296026 ALDH7A1P49419 539 aaKnown RBP21.98■■□□□ 1.11
CXCL3-201ENST00000296026 NPEPPSP55786 919 aa21.98■■□□□ 1.11
CXCL3-201ENST00000296026 BCAR1P56945 870 aa21.98■■□□□ 1.11
CXCL3-201ENST00000296026 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP21.98■■□□□ 1.11
CXCL3-201ENST00000296026 LONRF3Q496Y0 759 aa21.98■■□□□ 1.11
CXCL3-201ENST00000296026 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa21.98■■□□□ 1.11
CXCL3-201ENST00000296026 CATSPER4Q7RTX7 472 aa21.98■■□□□ 1.11
CXCL3-201ENST00000296026 OXER1Q8TDS5 423 aa21.98■■□□□ 1.11
CXCL3-201ENST00000296026 LPPQ93052 612 aa21.98■■□□□ 1.11
CXCL3-201ENST00000296026 APOL5Q9BWW9 433 aa21.98■■□□□ 1.11
CXCL3-201ENST00000296026 P4HBP07237 508 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
CXCL3-201ENST00000296026 SKIP12755 728 aa21.97■■□□□ 1.11
CXCL3-201ENST00000296026 SYCE2Q6PIF2 218 aa21.97■■□□□ 1.11
CXCL3-201ENST00000296026 MRPL43Q8N983 215 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
CXCL3-201ENST00000296026 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
CXCL3-201ENST00000296026 SLC7A3Q8WY07 619 aa21.97■■□□□ 1.11
CXCL3-201ENST00000296026 CEP170P1Q96L14 293 aa21.97■■□□□ 1.11
CXCL3-201ENST00000296026 FAM105AQ9NUU6 356 aa21.97■■□□□ 1.11
CXCL3-201ENST00000296026 WRAP73Q9P2S5 460 aaPredicted RBP21.97■■□□□ 1.11
CXCL3-201ENST00000296026 C2orf71A6NGG8 1288 aa21.96■■□□□ 1.11
CXCL3-201ENST00000296026 TBX3O15119 743 aa21.96■■□□□ 1.11
CXCL3-201ENST00000296026 MARCH6O60337 910 aa21.96■■□□□ 1.11
CXCL3-201ENST00000296026 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP21.96■■□□□ 1.11
CXCL3-201ENST00000296026 HOXB8P17481 243 aaPredicted RBP21.96■■□□□ 1.11
CXCL3-201ENST00000296026 RSPH1Q8WYR4 309 aa21.96■■□□□ 1.11
CXCL3-201ENST00000296026 HAS1Q92839 578 aa21.96■■□□□ 1.11
CXCL3-201ENST00000296026 TMEM169Q96HH4 297 aa21.96■■□□□ 1.11
CXCL3-201ENST00000296026 MFSD14AQ96MC6 490 aa21.96■■□□□ 1.11
CXCL3-201ENST00000296026 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
CXCL3-201ENST00000296026 IFT122Q9HBG6 1241 aa21.96■■□□□ 1.11
CXCL3-201ENST00000296026 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa21.96■■□□□ 1.11
CXCL3-201ENST00000296026 MEIS3P2A8K0S8 358 aa21.95■■□□□ 1.1
CXCL3-201ENST00000296026 CTDNEP1O95476 244 aa21.95■■□□□ 1.1
CXCL3-201ENST00000296026 CA8P35219 290 aa21.95■■□□□ 1.1
CXCL3-201ENST00000296026 RAB27AP51159 221 aa21.95■■□□□ 1.1
CXCL3-201ENST00000296026 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP21.95■■□□□ 1.1
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