RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000285679.10

USP25-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 25, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP25, Length 3,973 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP25-201ENST00000285679 KYNUQ16719 465 aa16.48■□□□□ 0.23
USP25-201ENST00000285679 CD302Q8IX05 232 aa16.48■□□□□ 0.23
USP25-201ENST00000285679 MREGQ8N565 214 aa16.48■□□□□ 0.23
USP25-201ENST00000285679 C9orf72Q96LT7 481 aa16.48■□□□□ 0.23
USP25-201ENST00000285679 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP16.48■□□□□ 0.23
USP25-201ENST00000285679 OSBPL1AQ9BXW6 950 aa16.48■□□□□ 0.23
USP25-201ENST00000285679 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP16.47■□□□□ 0.23
USP25-201ENST00000285679 HLA-DOAP06340 250 aa16.47■□□□□ 0.23
USP25-201ENST00000285679 ECM1Q16610 540 aa16.47■□□□□ 0.23
USP25-201ENST00000285679 LONP2Q86WA8 852 aa16.47■□□□□ 0.23
USP25-201ENST00000285679 ACTRT1Q8TDG2 376 aa16.47■□□□□ 0.23
USP25-201ENST00000285679 MCUR1Q96AQ8 359 aa16.47■□□□□ 0.23
USP25-201ENST00000285679 ELMO3Q96BJ8 720 aa16.47■□□□□ 0.23
USP25-201ENST00000285679 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP16.47■□□□□ 0.23
USP25-201ENST00000285679 REEP2Q9BRK0 252 aa16.47■□□□□ 0.23
USP25-201ENST00000285679 LRRD1A4D1F6 860 aa16.47■□□□□ 0.23
USP25-201ENST00000285679 AKAP3O75969 853 aa16.47■□□□□ 0.23
USP25-201ENST00000285679 NTSR2O95665 410 aa16.47■□□□□ 0.23
USP25-201ENST00000285679 TNFRSF8P28908 595 aa16.47■□□□□ 0.23
USP25-201ENST00000285679 PSMC2P35998 433 aaKnown RBP16.47■□□□□ 0.23
USP25-201ENST00000285679 MSH2P43246 934 aa16.47■□□□□ 0.23
USP25-201ENST00000285679 KCNA1Q09470 495 aa16.47■□□□□ 0.23
USP25-201ENST00000285679 ZRSR2Q15696 482 aaKnown RBP16.47■□□□□ 0.23
USP25-201ENST00000285679 TSNAXIP1Q2TAA8 658 aa16.47■□□□□ 0.23
USP25-201ENST00000285679 CHADLQ6NUI6 762 aa16.47■□□□□ 0.23
USP25-201ENST00000285679 SUPT20HQ8NEM7 779 aa16.47■□□□□ 0.23
USP25-201ENST00000285679 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP16.47■□□□□ 0.23
USP25-201ENST00000285679 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP16.47■□□□□ 0.23
USP25-201ENST00000285679 YY1P25490 414 aa16.47■□□□□ 0.23
USP25-201ENST00000285679 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP16.47■□□□□ 0.23
USP25-201ENST00000285679 SPATA21Q7Z572 469 aa16.47■□□□□ 0.23
USP25-201ENST00000285679 KIAA0825Q8IV33 1275 aa16.47■□□□□ 0.23
USP25-201ENST00000285679 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP16.47■□□□□ 0.23
USP25-201ENST00000285679 ALG6Q9Y672 507 aa16.47■□□□□ 0.23
USP25-201ENST00000285679 NQO1P15559 274 aaKnown RBP16.46■□□□□ 0.23
USP25-201ENST00000285679 PSMC6P62333 389 aa16.46■□□□□ 0.23
USP25-201ENST00000285679 ADGRF4Q8IZF3 695 aa16.46■□□□□ 0.23
USP25-201ENST00000285679 SPZ1Q9BXG8 430 aa16.46■□□□□ 0.23
USP25-201ENST00000285679 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa16.46■□□□□ 0.23
USP25-201ENST00000285679 DCTN4Q9UJW0 460 aa16.46■□□□□ 0.23
USP25-201ENST00000285679 PNMA3Q9UL41 463 aa16.46■□□□□ 0.23
USP25-201ENST00000285679 GAS8O95995 478 aa16.46■□□□□ 0.23
USP25-201ENST00000285679 PPP2R5EQ16537 467 aa16.46■□□□□ 0.23
USP25-201ENST00000285679 ZNF384Q8TF68 577 aa16.46■□□□□ 0.23
USP25-201ENST00000285679 STMN2Q93045 179 aa16.46■□□□□ 0.23
USP25-201ENST00000285679 RUNDC3BQ96NL0 473 aa16.46■□□□□ 0.23
USP25-201ENST00000285679 CTNNAL1Q9UBT7 734 aa16.46■□□□□ 0.23
USP25-201ENST00000285679 NWD2Q9ULI1 1742 aa16.46■□□□□ 0.23
USP25-201ENST00000285679 GOLGA8IPA6NC78 632 aa16.46■□□□□ 0.23
USP25-201ENST00000285679 GOLGA8JA6NMD2 632 aa16.46■□□□□ 0.23
USP25-201ENST00000285679 GCLMP48507 274 aa16.46■□□□□ 0.23
USP25-201ENST00000285679 CCDC174Q6PII3 467 aa16.46■□□□□ 0.23
USP25-201ENST00000285679 SCYL3Q8IZE3 742 aa16.46■□□□□ 0.23
USP25-201ENST00000285679 VPS52Q8N1B4 723 aa16.46■□□□□ 0.23
USP25-201ENST00000285679 P3H4Q92791 437 aa16.46■□□□□ 0.23
USP25-201ENST00000285679 KDM4CQ9H3R0 1056 aa16.46■□□□□ 0.23
USP25-201ENST00000285679 SLC12A6Q9UHW9 1150 aa16.46■□□□□ 0.23
USP25-201ENST00000285679 TTC7AQ9ULT0 858 aaPredicted RBP16.46■□□□□ 0.23
USP25-201ENST00000285679 CCDC160A6NGH7 325 aa16.45■□□□□ 0.22
USP25-201ENST00000285679 RASA4BC9J798 803 aa16.45■□□□□ 0.22
USP25-201ENST00000285679 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP16.45■□□□□ 0.228e-7■■■□□ 16
USP25-201ENST00000285679 RASA4O43374 803 aa16.45■□□□□ 0.22
USP25-201ENST00000285679 HARSP12081 509 aaKnown RBP16.45■□□□□ 0.22
USP25-201ENST00000285679 ATF2P15336 505 aa16.45■□□□□ 0.22
USP25-201ENST00000285679 SLMAPQ14BN4 828 aa16.45■□□□□ 0.22
USP25-201ENST00000285679 SLF2Q8IX21 1173 aa16.45■□□□□ 0.22
USP25-201ENST00000285679 AKR1B1P15121 316 aa16.45■□□□□ 0.22
USP25-201ENST00000285679 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP16.45■□□□□ 0.22
USP25-201ENST00000285679 CYP11B2P19099 503 aa16.45■□□□□ 0.22
USP25-201ENST00000285679 RFC4P35249 363 aa16.45■□□□□ 0.22
USP25-201ENST00000285679 CROCCP2Q86T23 111 aa16.45■□□□□ 0.22
USP25-201ENST00000285679 ERP27Q96DN0 273 aa16.45■□□□□ 0.22
USP25-201ENST00000285679 RAB3IPQ96QF0 476 aaPredicted RBP16.45■□□□□ 0.22
USP25-201ENST00000285679 ANO3Q9BYT9 981 aa16.45■□□□□ 0.22
USP25-201ENST00000285679 TRPC6Q9Y210 931 aa16.45■□□□□ 0.22
USP25-201ENST00000285679 CFAP73A6NFT4 308 aa16.45■□□□□ 0.22
USP25-201ENST00000285679 ERMARDQ5T6L9 678 aa16.45■□□□□ 0.22
USP25-201ENST00000285679 DPH6Q7L8W6 267 aa16.45■□□□□ 0.22
USP25-201ENST00000285679 ERICH1Q86X53 443 aa16.45■□□□□ 0.22
USP25-201ENST00000285679 SPIRE2Q8WWL2 714 aa16.45■□□□□ 0.22
USP25-201ENST00000285679 DGCR8Q8WYQ5 773 aaKnown RBP eCLIP16.45■□□□□ 0.22
USP25-201ENST00000285679 LRRC4CQ9HCJ2 640 aa16.45■□□□□ 0.22
USP25-201ENST00000285679 USP40Q9NVE5 1235 aa16.45■□□□□ 0.22
USP25-201ENST00000285679 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP16.45■□□□□ 0.22
USP25-201ENST00000285679 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP16.45■□□□□ 0.22
USP25-201ENST00000285679 CLDN3O15551 220 aa16.45■□□□□ 0.22
USP25-201ENST00000285679 CAMTA2O94983 1202 aa16.45■□□□□ 0.22
USP25-201ENST00000285679 TARSP26639 723 aaKnown RBP16.45■□□□□ 0.22
USP25-201ENST00000285679 SOX5P35711 763 aa16.45■□□□□ 0.22
USP25-201ENST00000285679 CETN2P41208 172 aa16.45■□□□□ 0.22
USP25-201ENST00000285679 CACNB3P54284 484 aa16.45■□□□□ 0.22
USP25-201ENST00000285679 NT5DC3Q86UY8 548 aa16.45■□□□□ 0.22
USP25-201ENST00000285679 SYN2Q92777 582 aaPredicted RBP16.45■□□□□ 0.22
USP25-201ENST00000285679 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP16.45■□□□□ 0.22
USP25-201ENST00000285679 ERVK-5Q9HDB9 667 aa16.45■□□□□ 0.22
USP25-201ENST00000285679 ANAPC5Q9UJX4 755 aa16.45■□□□□ 0.22
USP25-201ENST00000285679 C15orf41Q9Y2V0 281 aa16.45■□□□□ 0.22
USP25-201ENST00000285679 DYNC1LI1Q9Y6G9 523 aaKnown RBP16.45■□□□□ 0.22
USP25-201ENST00000285679 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa16.44■□□□□ 0.22
USP25-201ENST00000285679 ARHGEF35A5YM69 484 aa16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.9 ms