RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000258083.2

PRADC1-201, Transcript of protease associated domain containing 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PRADC1, Length 1,083 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRADC1-201ENST00000258083 FNDC1Q4ZHG4 1894 aaPredicted RBP24.83■■□□□ 1.57
PRADC1-201ENST00000258083 POTEMA6NI47 508 aa24.83■■□□□ 1.57
PRADC1-201ENST00000258083 FGFR1P11362 822 aa24.83■■□□□ 1.57
PRADC1-201ENST00000258083 ATP2B1P20020 1258 aa24.83■■□□□ 1.57
PRADC1-201ENST00000258083 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP24.83■■□□□ 1.57
PRADC1-201ENST00000258083 EMC2Q15006 297 aa24.83■■□□□ 1.57
PRADC1-201ENST00000258083 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP24.83■■□□□ 1.57
PRADC1-201ENST00000258083 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP24.83■■□□□ 1.57
PRADC1-201ENST00000258083 TMEM143Q96AN5 459 aa24.83■■□□□ 1.57
PRADC1-201ENST00000258083 TMEM117Q9H0C3 514 aa24.83■■□□□ 1.57
PRADC1-201ENST00000258083 UBE2ZQ9H832 354 aaPredicted RBP24.83■■□□□ 1.57
PRADC1-201ENST00000258083 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa24.83■■□□□ 1.57
PRADC1-201ENST00000258083 DACT1Q9NYF0 836 aa24.83■■□□□ 1.57
PRADC1-201ENST00000258083 BDP1A6H8Y1 2624 aa24.83■■□□□ 1.57
PRADC1-201ENST00000258083 TBKBP1A7MCY6 615 aa24.82■■□□□ 1.56
PRADC1-201ENST00000258083 HOXA2O43364 376 aa24.82■■□□□ 1.56
PRADC1-201ENST00000258083 EOMESO95936 686 aa24.82■■□□□ 1.56
PRADC1-201ENST00000258083 ITGB1P05556 798 aa24.82■■□□□ 1.56
PRADC1-201ENST00000258083 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa24.82■■□□□ 1.56
PRADC1-201ENST00000258083 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP24.82■■□□□ 1.56
PRADC1-201ENST00000258083 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP24.82■■□□□ 1.56
PRADC1-201ENST00000258083 KCNQ1P51787 676 aa24.82■■□□□ 1.56
PRADC1-201ENST00000258083 TCEAL5Q5H9L2 206 aa24.82■■□□□ 1.56
PRADC1-201ENST00000258083 KLHL23Q8NBE8 558 aa24.82■■□□□ 1.56
PRADC1-201ENST00000258083 SPPL3Q8TCT6 385 aa24.82■■□□□ 1.56
PRADC1-201ENST00000258083 ADAMTS19Q8TE59 1207 aa24.82■■□□□ 1.56
PRADC1-201ENST00000258083 TCP11Q8WWU5 503 aa24.82■■□□□ 1.56
PRADC1-201ENST00000258083 NLRP4Q96MN2 994 aa24.82■■□□□ 1.56
PRADC1-201ENST00000258083 CASD1Q96PB1 797 aa24.82■■□□□ 1.56
PRADC1-201ENST00000258083 ASAP2O43150 1006 aa24.81■■□□□ 1.56
PRADC1-201ENST00000258083 OR52Z1P0C646 297 aa24.81■■□□□ 1.56
PRADC1-201ENST00000258083 IBSPP21815 317 aaPredicted RBP24.81■■□□□ 1.56
PRADC1-201ENST00000258083 RARRES1P49788 294 aa24.81■■□□□ 1.56
PRADC1-201ENST00000258083 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa24.81■■□□□ 1.56
PRADC1-201ENST00000258083 ZNF174Q15697 407 aa24.81■■□□□ 1.56
PRADC1-201ENST00000258083 TTC38Q5R3I4 469 aa24.81■■□□□ 1.56
PRADC1-201ENST00000258083 FERMT3Q86UX7 667 aa24.81■■□□□ 1.56
PRADC1-201ENST00000258083 C4orf32Q8N8J7 132 aa24.81■■□□□ 1.56
PRADC1-201ENST00000258083 CWH43Q9H720 699 aa24.81■■□□□ 1.56
PRADC1-201ENST00000258083 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP24.81■■□□□ 1.56
PRADC1-201ENST00000258083 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP24.81■■□□□ 1.56
PRADC1-201ENST00000258083 KIAA1671Q9BY89 1806 aa24.81■■□□□ 1.56
PRADC1-201ENST00000258083 DGAT1O75907 488 aa24.8■■□□□ 1.56
PRADC1-201ENST00000258083 DNAJB1P25685 340 aa24.8■■□□□ 1.56
PRADC1-201ENST00000258083 MCM2P49736 904 aa24.8■■□□□ 1.56
PRADC1-201ENST00000258083 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa24.8■■□□□ 1.56
PRADC1-201ENST00000258083 MTRQ99707 1265 aa24.8■■□□□ 1.56
PRADC1-201ENST00000258083 TUFT1Q9NNX1 390 aa24.8■■□□□ 1.56
PRADC1-201ENST00000258083 HCSTQ9UBK5 93 aa24.8■■□□□ 1.56
PRADC1-201ENST00000258083 PHKA2P46019 1235 aa24.79■■□□□ 1.56
PRADC1-201ENST00000258083 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP24.79■■□□□ 1.56
PRADC1-201ENST00000258083 CLLU1OSQ5K130 101 aa24.79■■□□□ 1.56
PRADC1-201ENST00000258083 LRRC55Q6ZSA7 311 aa24.79■■□□□ 1.56
PRADC1-201ENST00000258083 CATSPER3Q86XQ3 398 aa24.79■■□□□ 1.56
PRADC1-201ENST00000258083 PABPC5Q96DU9 382 aaKnown RBP24.79■■□□□ 1.56
PRADC1-201ENST00000258083 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP24.79■■□□□ 1.56
PRADC1-201ENST00000258083 MINDY3Q9H8M7 445 aa24.79■■□□□ 1.56
PRADC1-201ENST00000258083 AAASQ9NRG9 546 aa24.79■■□□□ 1.56
PRADC1-201ENST00000258083 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP24.79■■□□□ 1.56
PRADC1-201ENST00000258083 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa24.79■■□□□ 1.56
PRADC1-201ENST00000258083 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP24.79■■□□□ 1.56
PRADC1-201ENST00000258083 KIF3AQ9Y496 699 aa24.79■■□□□ 1.56
PRADC1-201ENST00000258083 ARID2Q68CP9 1835 aa24.79■■□□□ 1.56
PRADC1-201ENST00000258083 ATG2AQ2TAZ0 1938 aa24.78■■□□□ 1.56
PRADC1-201ENST00000258083 ZNF623O75123 536 aa24.78■■□□□ 1.56
PRADC1-201ENST00000258083 TECP42680 631 aa24.78■■□□□ 1.56
PRADC1-201ENST00000258083 UBE3AQ05086 875 aa24.78■■□□□ 1.56
PRADC1-201ENST00000258083 POU5F1BQ06416 359 aa24.78■■□□□ 1.56
PRADC1-201ENST00000258083 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP24.78■■□□□ 1.56
PRADC1-201ENST00000258083 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP24.78■■□□□ 1.56
PRADC1-201ENST00000258083 LEXMQ3ZCV2 418 aa24.78■■□□□ 1.56
PRADC1-201ENST00000258083 CATSPER4Q7RTX7 472 aa24.78■■□□□ 1.56
PRADC1-201ENST00000258083 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP24.78■■□□□ 1.56
PRADC1-201ENST00000258083 PIGOQ8TEQ8 1089 aa24.78■■□□□ 1.56
PRADC1-201ENST00000258083 RSPH1Q8WYR4 309 aa24.78■■□□□ 1.56
PRADC1-201ENST00000258083 UHRF1Q96T88 793 aaPredicted RBP24.78■■□□□ 1.56
PRADC1-201ENST00000258083 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP24.78■■□□□ 1.56
PRADC1-201ENST00000258083 PCDHB12Q9Y5F1 795 aa24.78■■□□□ 1.56
PRADC1-201ENST00000258083 NCK2O43639 380 aa24.77■■□□□ 1.56
PRADC1-201ENST00000258083 MED24O75448 989 aa24.77■■□□□ 1.56
PRADC1-201ENST00000258083 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa24.77■■□□□ 1.56
PRADC1-201ENST00000258083 RPA1P27694 616 aa24.77■■□□□ 1.56
PRADC1-201ENST00000258083 ARL2P36404 184 aa24.77■■□□□ 1.56
PRADC1-201ENST00000258083 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP24.77■■□□□ 1.56
PRADC1-201ENST00000258083 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa24.77■■□□□ 1.56
PRADC1-201ENST00000258083 CTC1Q2NKJ3 1217 aa24.77■■□□□ 1.56
PRADC1-201ENST00000258083 LRRC43Q8N309 656 aa24.77■■□□□ 1.56
PRADC1-201ENST00000258083 COLGALT1Q8NBJ5 622 aa24.77■■□□□ 1.56
PRADC1-201ENST00000258083 RNF149Q8NC42 400 aa24.77■■□□□ 1.56
PRADC1-201ENST00000258083 POF1BQ8WVV4 589 aa24.77■■□□□ 1.56
PRADC1-201ENST00000258083 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP24.77■■□□□ 1.56
PRADC1-201ENST00000258083 SKIP12755 728 aa24.76■■□□□ 1.55
PRADC1-201ENST00000258083 LAG3P18627 525 aa24.76■■□□□ 1.55
PRADC1-201ENST00000258083 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP24.76■■□□□ 1.55
PRADC1-201ENST00000258083 PTENP60484 403 aa24.76■■□□□ 1.55
PRADC1-201ENST00000258083 NBR1Q14596 966 aa24.76■■□□□ 1.55
PRADC1-201ENST00000258083 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP24.76■■□□□ 1.55
PRADC1-201ENST00000258083 TWF2Q6IBS0 349 aaKnown RBP24.76■■□□□ 1.55
PRADC1-201ENST00000258083 FAM105AQ9NUU6 356 aa24.76■■□□□ 1.55
PRADC1-201ENST00000258083 TNFRSF10AO00220 468 aa24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.4 ms