RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000249700.8

TMOD2-201, Transcript of tropomodulin 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TMOD2, Length 9,191 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD2-201ENST00000249700 CIITAP33076 1130 aa6.56□□□□□ -1.36
TMOD2-201ENST00000249700 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
TMOD2-201ENST00000249700 IGBP1P78318 339 aa6.56□□□□□ -1.36
TMOD2-201ENST00000249700 PEX26Q7Z412 305 aa6.56□□□□□ -1.36
TMOD2-201ENST00000249700 ELMOD1Q8N336 334 aa6.56□□□□□ -1.36
TMOD2-201ENST00000249700 TRPM4Q8TD43 1214 aa6.56□□□□□ -1.36
TMOD2-201ENST00000249700 WRAP73Q9P2S5 460 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
TMOD2-201ENST00000249700 GOLGA6L7A0A1B0GV03 622 aa6.56□□□□□ -1.36
TMOD2-201ENST00000249700 RASSF10A6NK89 507 aa6.56□□□□□ -1.36
TMOD2-201ENST00000249700 MXI1P50539 228 aa6.56□□□□□ -1.36
TMOD2-201ENST00000249700 KLHDC7AQ5VTJ3 777 aa6.56□□□□□ -1.36
TMOD2-201ENST00000249700 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
TMOD2-201ENST00000249700 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
TMOD2-201ENST00000249700 DRAP1Q14919 205 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
TMOD2-201ENST00000249700 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa6.56□□□□□ -1.36
TMOD2-201ENST00000249700 ZNF541Q9H0D2 1346 aa6.56□□□□□ -1.36
TMOD2-201ENST00000249700 SHANK3Q9BYB0 1731 aa6.56□□□□□ -1.36
TMOD2-201ENST00000249700 NWD2Q9ULI1 1742 aa6.56□□□□□ -1.36
TMOD2-201ENST00000249700 DENND3A2RUS2 1198 aa6.56□□□□□ -1.36
TMOD2-201ENST00000249700 WDR64B1ANS9 1081 aa6.56□□□□□ -1.36
TMOD2-201ENST00000249700 H2AFXP16104 143 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
TMOD2-201ENST00000249700 SCYL3Q8IZE3 742 aa6.56□□□□□ -1.36
TMOD2-201ENST00000249700 NSUN6Q8TEA1 469 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
TMOD2-201ENST00000249700 PPP2R3CQ969Q6 453 aa6.56□□□□□ -1.36
TMOD2-201ENST00000249700 AP1M1Q9BXS5 423 aa6.56□□□□□ -1.36
TMOD2-201ENST00000249700 TSGA10Q9BZW7 698 aa6.56□□□□□ -1.36
TMOD2-201ENST00000249700 MFSD1Q9H3U5 465 aa6.56□□□□□ -1.36
TMOD2-201ENST00000249700 ACP6Q9NPH0 428 aa6.56□□□□□ -1.36
TMOD2-201ENST00000249700 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
TMOD2-201ENST00000249700 GRIN3BO60391 1043 aa6.56□□□□□ -1.36
TMOD2-201ENST00000249700 UGCGQ16739 394 aa6.56□□□□□ -1.36
TMOD2-201ENST00000249700 ZCWPW2Q504Y3 356 aa6.56□□□□□ -1.36
TMOD2-201ENST00000249700 MAATS1Q7Z4T9 603 aa6.56□□□□□ -1.36
TMOD2-201ENST00000249700 CBWD2Q8IUF1 395 aa6.56□□□□□ -1.36
TMOD2-201ENST00000249700 PGBD3Q8N328 593 aa6.56□□□□□ -1.36
TMOD2-201ENST00000249700 ASTN1O14525 1302 aa6.56□□□□□ -1.36
TMOD2-201ENST00000249700 NPM3O75607 178 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
TMOD2-201ENST00000249700 DDNO94850 711 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
TMOD2-201ENST00000249700 CCNE2O96020 404 aa6.56□□□□□ -1.36
TMOD2-201ENST00000249700 IREB2P48200 963 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
TMOD2-201ENST00000249700 KCNMA1Q12791 1236 aa6.56□□□□□ -1.36
TMOD2-201ENST00000249700 MOB2Q70IA6 237 aa6.56□□□□□ -1.36
TMOD2-201ENST00000249700 RYBPQ8N488 228 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
TMOD2-201ENST00000249700 BAP1Q92560 729 aa6.56□□□□□ -1.36
TMOD2-201ENST00000249700 N4BP2L2Q92802 583 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
TMOD2-201ENST00000249700 ANKZF1Q9H8Y5 726 aa6.56□□□□□ -1.36
TMOD2-201ENST00000249700 KMT5AQ9NQR1 393 aa6.56□□□□□ -1.36
TMOD2-201ENST00000249700 EMSYQ7Z589 1322 aa6.56□□□□□ -1.36
TMOD2-201ENST00000249700 TBC1D8O95759 1140 aa6.55□□□□□ -1.36
TMOD2-201ENST00000249700 SETSIPP0DME0 302 aa6.55□□□□□ -1.36
TMOD2-201ENST00000249700 TNNI1P19237 187 aa6.55□□□□□ -1.36
TMOD2-201ENST00000249700 XPAP23025 273 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
TMOD2-201ENST00000249700 YAF2Q8IY57 180 aa6.55□□□□□ -1.36
TMOD2-201ENST00000249700 TMEM143Q96AN5 459 aa6.55□□□□□ -1.36
TMOD2-201ENST00000249700 KRT12Q99456 494 aa6.55□□□□□ -1.36
TMOD2-201ENST00000249700 DMGDHQ9UI17 866 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
TMOD2-201ENST00000249700 VWA5AO00534 786 aa6.55□□□□□ -1.36
TMOD2-201ENST00000249700 ATMINO43313 823 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
TMOD2-201ENST00000249700 SERPING1P05155 500 aa6.55□□□□□ -1.36
TMOD2-201ENST00000249700 MEA1Q16626 185 aa6.55□□□□□ -1.36
TMOD2-201ENST00000249700 ATP6V0A1Q93050 837 aa6.55□□□□□ -1.36
TMOD2-201ENST00000249700 IQCDQ96DY2 449 aa6.55□□□□□ -1.36
TMOD2-201ENST00000249700 MS4A14Q96JA4 679 aa6.55□□□□□ -1.36
TMOD2-201ENST00000249700 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
TMOD2-201ENST00000249700 AGPAT3Q9NRZ7 376 aa6.55□□□□□ -1.36
TMOD2-201ENST00000249700 SASH3O75995 380 aa6.55□□□□□ -1.36
TMOD2-201ENST00000249700 MARK3P27448 753 aa6.55□□□□□ -1.36
TMOD2-201ENST00000249700 PSMC5P62195 406 aa6.55□□□□□ -1.36
TMOD2-201ENST00000249700 BRD3Q15059 726 aa6.55□□□□□ -1.36
TMOD2-201ENST00000249700 FASTKD5Q7L8L6 764 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
TMOD2-201ENST00000249700 HDXQ7Z353 690 aa6.55□□□□□ -1.36
TMOD2-201ENST00000249700 SLC5A5Q92911 643 aa6.55□□□□□ -1.36
TMOD2-201ENST00000249700 KAT5Q92993 513 aa6.55□□□□□ -1.36
TMOD2-201ENST00000249700 ACCSQ96QU6 501 aa6.55□□□□□ -1.36
TMOD2-201ENST00000249700 FAM107BQ9H098 131 aa6.55□□□□□ -1.36
TMOD2-201ENST00000249700 KCTD10Q9H3F6 313 aa6.55□□□□□ -1.36
TMOD2-201ENST00000249700 KCND1Q9NSA2 647 aa6.55□□□□□ -1.36
TMOD2-201ENST00000249700 CYP3A4P08684 503 aa6.55□□□□□ -1.36
TMOD2-201ENST00000249700 PTPRAP18433 802 aa6.55□□□□□ -1.36
TMOD2-201ENST00000249700 YWHABP31946 246 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
TMOD2-201ENST00000249700 FBXW4P57775 412 aa6.55□□□□□ -1.36
TMOD2-201ENST00000249700 CCNA1P78396 465 aa6.55□□□□□ -1.36
TMOD2-201ENST00000249700 GUCY2DQ02846 1103 aa6.55□□□□□ -1.36
TMOD2-201ENST00000249700 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa6.55□□□□□ -1.36
TMOD2-201ENST00000249700 ZNF571Q7Z3V5 609 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
TMOD2-201ENST00000249700 ZNF280CQ8ND82 737 aa6.55□□□□□ -1.36
TMOD2-201ENST00000249700 CCDC114Q96M63 670 aa6.55□□□□□ -1.36
TMOD2-201ENST00000249700 RIT2Q99578 217 aa6.55□□□□□ -1.36
TMOD2-201ENST00000249700 CYP3A7-CYP3A51PA0A087WV96 503 aa6.55□□□□□ -1.36
TMOD2-201ENST00000249700 HEXIM1O94992 359 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
TMOD2-201ENST00000249700 CYP3A7P24462 503 aa6.55□□□□□ -1.36
TMOD2-201ENST00000249700 CNTN2Q02246 1040 aa6.55□□□□□ -1.36
TMOD2-201ENST00000249700 ZNF211Q13398 564 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
TMOD2-201ENST00000249700 USP37Q86T82 979 aa6.55□□□□□ -1.36
TMOD2-201ENST00000249700 FAM83AQ86UY5 434 aa6.55□□□□□ -1.36
TMOD2-201ENST00000249700 CDR2LQ86X02 465 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
TMOD2-201ENST00000249700 LPAR1Q92633 364 aa6.55□□□□□ -1.36
TMOD2-201ENST00000249700 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
TMOD2-201ENST00000249700 CCDC151A5D8V7 595 aa6.55□□□□□ -1.36
TMOD2-201ENST00000249700 ADM5C9JUS6 153 aa6.55□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.9 ms