RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000225308.12

SLC25A39-201, Transcript of solute carrier family 25 member 39, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene SLC25A39, Length 1,607 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A39-201ENST00000225308 CSDE1O75534 798 aaKnown RBP24.13■■□□□ 1.45
SLC25A39-201ENST00000225308 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa24.13■■□□□ 1.45
SLC25A39-201ENST00000225308 PAK2Q13177 524 aa24.13■■□□□ 1.45
SLC25A39-201ENST00000225308 CAPSQ13938 189 aa24.13■■□□□ 1.45
SLC25A39-201ENST00000225308 MCM6Q14566 821 aa24.13■■□□□ 1.45
SLC25A39-201ENST00000225308 RRAGBQ5VZM2 374 aa24.13■■□□□ 1.45
SLC25A39-201ENST00000225308 DAW1Q8N136 415 aa24.13■■□□□ 1.45
SLC25A39-201ENST00000225308 PDILTQ8N807 584 aa24.13■■□□□ 1.45
SLC25A39-201ENST00000225308 PANK2Q9BZ23 570 aa24.13■■□□□ 1.45
SLC25A39-201ENST00000225308 ERVK-5Q9HDB9 667 aa24.13■■□□□ 1.45
SLC25A39-201ENST00000225308 GBF1Q92538 1859 aa24.13■■□□□ 1.45
SLC25A39-201ENST00000225308 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa24.12■■□□□ 1.45
SLC25A39-201ENST00000225308 IKBKEQ14164 716 aa24.12■■□□□ 1.45
SLC25A39-201ENST00000225308 ARSHQ5FYA8 562 aa24.12■■□□□ 1.45
SLC25A39-201ENST00000225308 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa24.12■■□□□ 1.45
SLC25A39-201ENST00000225308 BSNDQ8WZ55 320 aa24.12■■□□□ 1.45
SLC25A39-201ENST00000225308 GCOM2Q9BZD3 368 aaPredicted RBP24.12■■□□□ 1.45
SLC25A39-201ENST00000225308 KCND2Q9NZV8 630 aa24.12■■□□□ 1.45
SLC25A39-201ENST00000225308 ST3GAL5Q9UNP4 418 aa24.12■■□□□ 1.45
SLC25A39-201ENST00000225308 ZBBXA8MT70 800 aa24.11■■□□□ 1.45
SLC25A39-201ENST00000225308 GUCY2CP25092 1073 aa24.11■■□□□ 1.45
SLC25A39-201ENST00000225308 WDR5P61964 334 aaKnown RBP24.11■■□□□ 1.45
SLC25A39-201ENST00000225308 MAPK7Q13164 816 aa24.11■■□□□ 1.45
SLC25A39-201ENST00000225308 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP24.11■■□□□ 1.45
SLC25A39-201ENST00000225308 E2F4Q16254 413 aa24.11■■□□□ 1.45
SLC25A39-201ENST00000225308 ADALQ6DHV7 355 aa24.11■■□□□ 1.45
SLC25A39-201ENST00000225308 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP24.11■■□□□ 1.45
SLC25A39-201ENST00000225308 TMX1Q9H3N1 280 aa24.11■■□□□ 1.45
SLC25A39-201ENST00000225308 MINDY3Q9H8M7 445 aa24.11■■□□□ 1.45
SLC25A39-201ENST00000225308 STAT6P42226 847 aa24.1■■□□□ 1.45
SLC25A39-201ENST00000225308 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa24.1■■□□□ 1.45
SLC25A39-201ENST00000225308 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP24.1■■□□□ 1.45
SLC25A39-201ENST00000225308 KIFAP3Q92845 792 aa24.1■■□□□ 1.45
SLC25A39-201ENST00000225308 GPR182O15218 404 aa24.1■■□□□ 1.45
SLC25A39-201ENST00000225308 EFCAB14O75071 495 aa24.1■■□□□ 1.45
SLC25A39-201ENST00000225308 HIP1RO75146 1068 aa24.1■■□□□ 1.45
SLC25A39-201ENST00000225308 FGFR4P22455 802 aa24.1■■□□□ 1.45
SLC25A39-201ENST00000225308 PTENP60484 403 aa24.1■■□□□ 1.45
SLC25A39-201ENST00000225308 POU5F1BQ06416 359 aa24.1■■□□□ 1.45
SLC25A39-201ENST00000225308 TFDP1Q14186 410 aa24.1■■□□□ 1.45
SLC25A39-201ENST00000225308 FAM109BQ6ICB4 259 aaPredicted RBP24.1■■□□□ 1.45
SLC25A39-201ENST00000225308 GPBP1Q86WP2 473 aa24.1■■□□□ 1.45
SLC25A39-201ENST00000225308 LINC01599Q8WXQ3 324 aa24.1■■□□□ 1.45
SLC25A39-201ENST00000225308 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa24.1■■□□□ 1.45
SLC25A39-201ENST00000225308 CHD7Q9P2D1 2997 aa24.09■■□□□ 1.45
SLC25A39-201ENST00000225308 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa24.09■■□□□ 1.45
SLC25A39-201ENST00000225308 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP24.09■■□□□ 1.45
SLC25A39-201ENST00000225308 PHKA2P46019 1235 aa24.09■■□□□ 1.45
SLC25A39-201ENST00000225308 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP24.09■■□□□ 1.45
SLC25A39-201ENST00000225308 TIPINQ9BVW5 301 aa24.09■■□□□ 1.45
SLC25A39-201ENST00000225308 NFKBIZQ9BYH8 718 aa24.09■■□□□ 1.45
SLC25A39-201ENST00000225308 CMA1P23946 247 aa24.08■■□□□ 1.45
SLC25A39-201ENST00000225308 DEFB103AP81534 67 aa24.08■■□□□ 1.45
SLC25A39-201ENST00000225308 LRIT3Q3SXY7 679 aa24.08■■□□□ 1.45
SLC25A39-201ENST00000225308 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa24.08■■□□□ 1.45
SLC25A39-201ENST00000225308 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP24.08■■□□□ 1.45
SLC25A39-201ENST00000225308 DRC1Q96MC2 740 aa24.08■■□□□ 1.45
SLC25A39-201ENST00000225308 REEP2Q9BRK0 252 aa24.08■■□□□ 1.45
SLC25A39-201ENST00000225308 FTHL17Q9BXU8 183 aa24.08■■□□□ 1.45
SLC25A39-201ENST00000225308 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP24.08■■□□□ 1.45
SLC25A39-201ENST00000225308 FAM13BQ9NYF5 915 aa24.08■■□□□ 1.45
SLC25A39-201ENST00000225308 LRRIQ4A6NIV6 560 aa24.07■■□□□ 1.44
SLC25A39-201ENST00000225308 MGEA5O60502 916 aa24.07■■□□□ 1.44
SLC25A39-201ENST00000225308 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP24.07■■□□□ 1.44
SLC25A39-201ENST00000225308 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP24.07■■□□□ 1.44
SLC25A39-201ENST00000225308 ODR4Q5SWX8 454 aa24.07■■□□□ 1.44
SLC25A39-201ENST00000225308 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP24.07■■□□□ 1.449e-15■■□□□ 12.4
SLC25A39-201ENST00000225308 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP24.07■■□□□ 1.44
SLC25A39-201ENST00000225308 MYO9BQ13459 2157 aa24.06■■□□□ 1.44
SLC25A39-201ENST00000225308 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP24.06■■□□□ 1.44
SLC25A39-201ENST00000225308 NAMPTP43490 491 aa24.06■■□□□ 1.44
SLC25A39-201ENST00000225308 KCNJ6P48051 423 aa24.06■■□□□ 1.44
SLC25A39-201ENST00000225308 PPP2R5AQ15172 486 aa24.06■■□□□ 1.44
SLC25A39-201ENST00000225308 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP24.06■■□□□ 1.44
SLC25A39-201ENST00000225308 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP24.06■■□□□ 1.44
SLC25A39-201ENST00000225308 DHX58Q96C10 678 aa24.06■■□□□ 1.44
SLC25A39-201ENST00000225308 KCNH3Q9ULD8 1083 aa24.06■■□□□ 1.44
SLC25A39-201ENST00000225308 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa24.06■■□□□ 1.44
SLC25A39-201ENST00000225308 A0A1B0GVL5 298 aa24.06■■□□□ 1.44
SLC25A39-201ENST00000225308 A0A1W2PQ27 194 aa24.06■■□□□ 1.44
SLC25A39-201ENST00000225308 A0A1W2PQ64 194 aa24.06■■□□□ 1.44
SLC25A39-201ENST00000225308 A0A1W2PQD8 194 aa24.06■■□□□ 1.44
SLC25A39-201ENST00000225308 ENPP3O14638 875 aa24.06■■□□□ 1.44
SLC25A39-201ENST00000225308 PFKFB1P16118 471 aa24.06■■□□□ 1.44
SLC25A39-201ENST00000225308 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP24.06■■□□□ 1.44
SLC25A39-201ENST00000225308 MBTD1Q05BQ5 628 aa24.06■■□□□ 1.44
SLC25A39-201ENST00000225308 IQUBQ8NA54 791 aa24.06■■□□□ 1.44
SLC25A39-201ENST00000225308 IFT74Q96LB3 600 aa24.06■■□□□ 1.44
SLC25A39-201ENST00000225308 SLC9A7Q96T83 725 aa24.06■■□□□ 1.44
SLC25A39-201ENST00000225308 ODF2LQ9ULJ1 636 aa24.06■■□□□ 1.44
SLC25A39-201ENST00000225308 HPSEQ9Y251 543 aa24.06■■□□□ 1.44
SLC25A39-201ENST00000225308 SFI1A8K8P3 1242 aa24.05■■□□□ 1.44
SLC25A39-201ENST00000225308 GIT2Q14161 759 aa24.05■■□□□ 1.44
SLC25A39-201ENST00000225308 DSC3Q14574 896 aa24.05■■□□□ 1.44
SLC25A39-201ENST00000225308 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP24.05■■□□□ 1.44
SLC25A39-201ENST00000225308 SV2BQ7L1I2 683 aa24.05■■□□□ 1.44
SLC25A39-201ENST00000225308 CATSPER4Q7RTX7 472 aa24.05■■□□□ 1.44
SLC25A39-201ENST00000225308 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP24.05■■□□□ 1.44
SLC25A39-201ENST00000225308 KIFC3Q9BVG8 833 aa24.05■■□□□ 1.44
SLC25A39-201ENST00000225308 CUEDC2Q9H467 287 aa24.05■■□□□ 1.44
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