RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000207178.1

Lmo1-202, Transcript of Rhombotin-1, mousemouse

APPRIS ALT1 TSL 2 BASIC

Gene Lmo1, Length 912 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmo1-202ENSMUST00000207178 Hip1rQ9JKY5 1068 aa21.59■■□□□ 1.05
Lmo1-202ENSMUST00000207178 NcdnQ9Z0E0 729 aa21.59■■□□□ 1.05
Lmo1-202ENSMUST00000207178 SpegQ62407 3262 aa21.59■■□□□ 1.05
Lmo1-202ENSMUST00000207178 Brca2P97929 3329 aa21.58■■□□□ 1.05
Lmo1-202ENSMUST00000207178 Chrna1P04756 457 aa21.58■■□□□ 1.05
Lmo1-202ENSMUST00000207178 ArvcfP98203 962 aa21.58■■□□□ 1.05
Lmo1-202ENSMUST00000207178 Hexim2Q3TVI4 313 aa21.58■■□□□ 1.05
Lmo1-202ENSMUST00000207178 Slc9a2Q3ZAS0 814 aa21.58■■□□□ 1.05
Lmo1-202ENSMUST00000207178 Zbtb5Q7TQG0 670 aa21.58■■□□□ 1.05
Lmo1-202ENSMUST00000207178 Tada3Q8R0L9 432 aa21.58■■□□□ 1.05
Lmo1-202ENSMUST00000207178 Atp6v0a4Q920R6 833 aa21.58■■□□□ 1.05
Lmo1-202ENSMUST00000207178 Mtif3Q9CZD5 276 aa21.58■■□□□ 1.05
Lmo1-202ENSMUST00000207178 Ccdc105Q9D4K7 499 aa21.58■■□□□ 1.05
Lmo1-202ENSMUST00000207178 Slx4ipQ9D7Y9 413 aa21.58■■□□□ 1.05
Lmo1-202ENSMUST00000207178 IydQ9DCX8 285 aa21.58■■□□□ 1.05
Lmo1-202ENSMUST00000207178 Tfcp2Q9ERA0 502 aa21.58■■□□□ 1.05
Lmo1-202ENSMUST00000207178 Gde1Q9JL56 331 aa21.58■■□□□ 1.05
Lmo1-202ENSMUST00000207178 Gvin1Q80SU7 2427 aa21.57■■□□□ 1.04
Lmo1-202ENSMUST00000207178 Rit2P70425 217 aa21.57■■□□□ 1.04
Lmo1-202ENSMUST00000207178 Lrrfip1Q3UZ39 729 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
Lmo1-202ENSMUST00000207178 Znf827Q505G8 1078 aa21.57■■□□□ 1.04
Lmo1-202ENSMUST00000207178 Bcar1Q61140 874 aa21.57■■□□□ 1.04
Lmo1-202ENSMUST00000207178 Suz12Q80U70 741 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
Lmo1-202ENSMUST00000207178 Lrrc66Q8K0B3 872 aa21.57■■□□□ 1.04
Lmo1-202ENSMUST00000207178 Saal1Q9D2C2 474 aa21.57■■□□□ 1.04
Lmo1-202ENSMUST00000207178 Arpp21Q9DCB4 807 aa21.57■■□□□ 1.04
Lmo1-202ENSMUST00000207178 Wdfy3Q6VNB8 3508 aa21.57■■□□□ 1.04
Lmo1-202ENSMUST00000207178 Fam170bE9PXT9 378 aa21.56■■□□□ 1.04
Lmo1-202ENSMUST00000207178 Cplx2P84086 134 aa21.56■■□□□ 1.04
Lmo1-202ENSMUST00000207178 Lrrc36Q3V0M2 755 aa21.56■■□□□ 1.04
Lmo1-202ENSMUST00000207178 Prmt8Q6PAK3 394 aa21.56■■□□□ 1.04
Lmo1-202ENSMUST00000207178 Nsun6Q7TS68 476 aa21.56■■□□□ 1.04
Lmo1-202ENSMUST00000207178 Rd3Q8BRE0 195 aa21.56■■□□□ 1.04
Lmo1-202ENSMUST00000207178 Amz1Q8BVF9 502 aa21.56■■□□□ 1.04
Lmo1-202ENSMUST00000207178 Znf445Q8R2V3 986 aa21.56■■□□□ 1.04
Lmo1-202ENSMUST00000207178 Unc93b1Q8VCW4 598 aa21.56■■□□□ 1.04
Lmo1-202ENSMUST00000207178 Ephx1Q9D379 455 aa21.56■■□□□ 1.04
Lmo1-202ENSMUST00000207178 Nmnat1Q9EPA7 285 aa21.56■■□□□ 1.04
Lmo1-202ENSMUST00000207178 Nr2e3Q9QXZ7 395 aa21.56■■□□□ 1.04
Lmo1-202ENSMUST00000207178 Zfp882E9Q4R4 555 aa21.55■■□□□ 1.04
Lmo1-202ENSMUST00000207178 Lrrc4bP0C192 709 aa21.55■■□□□ 1.04
Lmo1-202ENSMUST00000207178 Rin3P59729 980 aa21.55■■□□□ 1.04
Lmo1-202ENSMUST00000207178 Cd163Q2VLH6 1121 aa21.55■■□□□ 1.04
Lmo1-202ENSMUST00000207178 Nt5c2Q3V1L4 560 aa21.55■■□□□ 1.04
Lmo1-202ENSMUST00000207178 Mpzl3Q3V3F6 237 aa21.55■■□□□ 1.04
Lmo1-202ENSMUST00000207178 Pla2g4eQ50L42 875 aa21.55■■□□□ 1.04
Lmo1-202ENSMUST00000207178 Gas7Q60780 421 aa21.55■■□□□ 1.04
Lmo1-202ENSMUST00000207178 Rspry1Q8BVR6 576 aa21.55■■□□□ 1.04
Lmo1-202ENSMUST00000207178 Rsl1d1Q8BVY0 452 aaKnown RBP21.55■■□□□ 1.04
Lmo1-202ENSMUST00000207178 Trim47Q8C0E3 641 aa21.55■■□□□ 1.04
Lmo1-202ENSMUST00000207178 Sbk1Q8QZX0 417 aa21.55■■□□□ 1.04
Lmo1-202ENSMUST00000207178 Ophn1Q99J31 802 aa21.55■■□□□ 1.04
Lmo1-202ENSMUST00000207178 Bcl11aQ9QYE3 773 aa21.55■■□□□ 1.04
Lmo1-202ENSMUST00000207178 Zkscan16A2ALW2 728 aa21.54■■□□□ 1.04
Lmo1-202ENSMUST00000207178 PotegA5H0M4 473 aa21.54■■□□□ 1.04
Lmo1-202ENSMUST00000207178 Cyp3a25O09158 503 aa21.54■■□□□ 1.04
Lmo1-202ENSMUST00000207178 Fcgr2P08101 330 aa21.54■■□□□ 1.04
Lmo1-202ENSMUST00000207178 GaltQ03249 379 aa21.54■■□□□ 1.04
Lmo1-202ENSMUST00000207178 Gtf2f1Q3THK3 508 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
Lmo1-202ENSMUST00000207178 Slc27a1Q60714 646 aa21.54■■□□□ 1.04
Lmo1-202ENSMUST00000207178 Fhod1Q6P9Q4 1197 aa21.54■■□□□ 1.04
Lmo1-202ENSMUST00000207178 Kdm4aQ8BW72 1064 aa21.54■■□□□ 1.04
Lmo1-202ENSMUST00000207178 Rufy2Q8R4C2 606 aa21.54■■□□□ 1.04
Lmo1-202ENSMUST00000207178 MiosQ8VE19 875 aa21.54■■□□□ 1.04
Lmo1-202ENSMUST00000207178 Dnajb4Q9D832 337 aa21.54■■□□□ 1.04
Lmo1-202ENSMUST00000207178 Ccnt1Q9QWV9 724 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
Lmo1-202ENSMUST00000207178 Klhdc7bA0A286YD60 1263 aa21.53■■□□□ 1.04
Lmo1-202ENSMUST00000207178 GclmO09172 274 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
Lmo1-202ENSMUST00000207178 Xrcc6P23475 608 aa21.53■■□□□ 1.04
Lmo1-202ENSMUST00000207178 Sash1P59808 1230 aa21.53■■□□□ 1.04
Lmo1-202ENSMUST00000207178 EnahQ03173 802 aa21.53■■□□□ 1.04
Lmo1-202ENSMUST00000207178 Perm1Q149B8 807 aa21.53■■□□□ 1.04
Lmo1-202ENSMUST00000207178 Xkr4Q5GH67 647 aa21.53■■□□□ 1.04
Lmo1-202ENSMUST00000207178 Ccdc172Q810N9 267 aa21.53■■□□□ 1.04
Lmo1-202ENSMUST00000207178 Inpp5fQ8CDA1 1132 aa21.53■■□□□ 1.04
Lmo1-202ENSMUST00000207178 RabepkQ8VCH5 380 aa21.53■■□□□ 1.04
Lmo1-202ENSMUST00000207178 Cabp7Q91ZM8 215 aa21.53■■□□□ 1.04
Lmo1-202ENSMUST00000207178 Etnk1Q9D4V0 363 aa21.53■■□□□ 1.04
Lmo1-202ENSMUST00000207178 Clcn5Q9WVD4 746 aa21.53■■□□□ 1.04
Lmo1-202ENSMUST00000207178 PrnpP04925 254 aa21.52■■□□□ 1.04
Lmo1-202ENSMUST00000207178 Hk1P17710 974 aa21.52■■□□□ 1.04
Lmo1-202ENSMUST00000207178 Asap3Q5U464 904 aa21.52■■□□□ 1.04
Lmo1-202ENSMUST00000207178 Kcna4Q61423 654 aa21.52■■□□□ 1.04
Lmo1-202ENSMUST00000207178 Armcx2Q6A058 784 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
Lmo1-202ENSMUST00000207178 Frmd5Q6P5H6 517 aa21.52■■□□□ 1.04
Lmo1-202ENSMUST00000207178 Plppr4Q7TME0 766 aa21.52■■□□□ 1.04
Lmo1-202ENSMUST00000207178 Nod1Q8BHB0 953 aa21.52■■□□□ 1.04
Lmo1-202ENSMUST00000207178 Kcnj14Q8JZN3 434 aa21.52■■□□□ 1.04
Lmo1-202ENSMUST00000207178 Slc25a38Q91XD8 326 aa21.52■■□□□ 1.04
Lmo1-202ENSMUST00000207178 Pebp4Q9D9G2 242 aa21.52■■□□□ 1.04
Lmo1-202ENSMUST00000207178 Cntn6Q9JMB8 1028 aa21.52■■□□□ 1.04
Lmo1-202ENSMUST00000207178 Zfp40B1B1D3 796 aa21.51■■□□□ 1.03
Lmo1-202ENSMUST00000207178 Mpp3O88910 568 aa21.51■■□□□ 1.03
Lmo1-202ENSMUST00000207178 Vti1aO89116 217 aa21.51■■□□□ 1.03
Lmo1-202ENSMUST00000207178 Hoxc13P50207 328 aa21.51■■□□□ 1.03
Lmo1-202ENSMUST00000207178 Kcnma1Q08460 1209 aa21.51■■□□□ 1.03
Lmo1-202ENSMUST00000207178 H2-Q2Q4KN81 360 aa21.51■■□□□ 1.03
Lmo1-202ENSMUST00000207178 Slc9a1Q61165 820 aa21.51■■□□□ 1.03
Lmo1-202ENSMUST00000207178 LbpQ61805 481 aa21.51■■□□□ 1.03
Lmo1-202ENSMUST00000207178 Fbxl5Q8C2S5 690 aa21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 79.6 ms