RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000111980.3

Hoxd4-202, Transcript of Homeobox protein Hox-D4, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Hoxd4, Length 1,494 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Gtf3c3Q3TMP1 882 aa21.79■■□□□ 1.08
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Mcm7Q61881 719 aaKnown RBP21.79■■□□□ 1.08
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 ScapQ6GQT6 1276 aa21.79■■□□□ 1.08
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Mbtd1Q6P5G3 631 aa21.79■■□□□ 1.08
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Nap1l3Q794H2 544 aa21.79■■□□□ 1.08
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 IqcgQ80W32 419 aa21.79■■□□□ 1.08
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Ipo9Q91YE6 1041 aa21.79■■□□□ 1.08
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Themis3Q9CU24 569 aa21.79■■□□□ 1.08
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Smyd3Q9CWR2 428 aa21.79■■□□□ 1.08
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Myh11O08638 1972 aa21.79■■□□□ 1.08
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 MtrA6H5Y3 1253 aa21.78■■□□□ 1.08
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 SarsP26638 512 aaKnown RBP21.78■■□□□ 1.08
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Grxcr1Q50H32 290 aa21.78■■□□□ 1.08
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Znf280dQ68FE8 974 aa21.78■■□□□ 1.08
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Git1Q68FF6 770 aa21.78■■□□□ 1.08
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Fut11Q8BHC9 489 aa21.78■■□□□ 1.08
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Smarcal1Q8BJL0 910 aa21.78■■□□□ 1.08
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Fam160b1Q8CDM8 764 aa21.78■■□□□ 1.08
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Malrd1A2AJX4 2123 aa21.78■■□□□ 1.08
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Map7d2A2AG50 781 aa21.77■■□□□ 1.08
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Vmn2r71L7N2D8 855 aa21.77■■□□□ 1.08
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Krt18P05784 423 aa21.77■■□□□ 1.08
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Xrcc6P23475 608 aa21.77■■□□□ 1.08
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Gbp1Q01514 589 aa21.77■■□□□ 1.08
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Sppl2bQ3TD49 578 aa21.77■■□□□ 1.08
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Cypt4Q6P925 153 aa21.77■■□□□ 1.08
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Npas4Q8BGD7 802 aa21.77■■□□□ 1.08
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 4931406P16RikQ8C5X1 1059 aa21.77■■□□□ 1.08
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Tdrd7Q8K1H1 1086 aaKnown RBP21.77■■□□□ 1.08
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Tcf25Q8R3L2 676 aaKnown RBP21.77■■□□□ 1.08
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 B3galt6Q91Z92 325 aa21.77■■□□□ 1.08
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Slc12a9Q99MR3 914 aa21.77■■□□□ 1.08
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Rnf186Q9D241 226 aa21.77■■□□□ 1.08
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Atp13a1Q9EPE9 1200 aaKnown RBP21.77■■□□□ 1.08
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Nr1h3Q9Z0Y9 445 aa21.77■■□□□ 1.08
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Gm4924A0A1B0GR71 966 aa21.77■■□□□ 1.07
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1700018F24RikB2RW27 314 aa21.77■■□□□ 1.07
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Rsph10bE9PYQ0 876 aa21.77■■□□□ 1.07
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Zfp882E9Q4R4 555 aa21.77■■□□□ 1.07
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Ifnar1P33896 590 aa21.77■■□□□ 1.07
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Klra7Q60654 280 aa21.77■■□□□ 1.07
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 RragbQ6NTA4 374 aa21.77■■□□□ 1.07
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Fhod1Q6P9Q4 1197 aa21.77■■□□□ 1.07
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Atp1a3Q6PIC6 1013 aa21.77■■□□□ 1.07
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Kcnv1Q8BZN2 503 aa21.77■■□□□ 1.07
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Cacnb1Q8R3Z5 597 aa21.77■■□□□ 1.07
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Olfr390Q8VEZ7 311 aa21.77■■□□□ 1.07
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Krt17Q9QWL7 433 aa21.77■■□□□ 1.07
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Kng1O08677 661 aa21.76■■□□□ 1.07
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Rasa2P58069 847 aa21.76■■□□□ 1.07
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Asprv1Q09PK2 339 aa21.76■■□□□ 1.07
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Xpnpep1Q6P1B1 623 aa21.76■■□□□ 1.07
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Ppp2r5aQ6PD03 486 aa21.76■■□□□ 1.07
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Tmem220Q8BP07 167 aa21.76■■□□□ 1.07
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Unc93b1Q8VCW4 598 aa21.76■■□□□ 1.07
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Tnpo2Q99LG2 887 aaKnown RBP21.76■■□□□ 1.07
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Kcnq4Q9JK97 696 aa21.76■■□□□ 1.07
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Taf1Q80UV9 1891 aa21.75■■□□□ 1.07
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Vmn2r17E9PYF5 849 aa21.75■■□□□ 1.07
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 DeptorQ570Y9 409 aa21.75■■□□□ 1.07
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Pex1Q5BL07 1284 aa21.75■■□□□ 1.07
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Kiaa1841Q68FF0 718 aa21.75■■□□□ 1.07
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Ctdspl2Q8BG15 465 aa21.75■■□□□ 1.07
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Zmym6Q8BS54 1249 aa21.75■■□□□ 1.07
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Hps3Q91VB4 1002 aa21.75■■□□□ 1.07
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Adam33Q923W9 797 aa21.75■■□□□ 1.07
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 B4galt5Q9JMK0 388 aa21.75■■□□□ 1.07
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Hebp1Q9R257 190 aa21.75■■□□□ 1.07
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Igkv18-36A0A075B5M9 114 aa21.74■■□□□ 1.07
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 DohhA0A1Y7VJ29 135 aa21.74■■□□□ 1.07
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Gm4907B1AXB9 411 aa21.74■■□□□ 1.07
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Apol7aB2RT54 418 aa21.74■■□□□ 1.07
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Ccdc152E9PX14 254 aa21.74■■□□□ 1.07
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Mdm4O35618 489 aa21.74■■□□□ 1.07
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 AurkbO70126 345 aa21.74■■□□□ 1.07
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Msh3P13705 1091 aa21.74■■□□□ 1.07
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Fgfr4Q03142 799 aa21.74■■□□□ 1.07
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Cacna2d4Q5RJF7 1116 aa21.74■■□□□ 1.07
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Prpf4bQ61136 1007 aaKnown RBP21.74■■□□□ 1.07
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Msantd2Q6NZR2 559 aa21.74■■□□□ 1.07
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Znf689Q8BKK5 500 aa21.74■■□□□ 1.07
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Fbxo17Q9QZM8 286 aa21.74■■□□□ 1.07
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Col4a6B1AVK5 1691 aa21.74■■□□□ 1.07
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Pcbp1P60335 356 aaKnown RBP21.73■■□□□ 1.07
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Arf4P61750 180 aa21.73■■□□□ 1.07
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Arhgef16Q3U5C8 713 aa21.73■■□□□ 1.07
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Colgalt2Q6NVG7 625 aa21.73■■□□□ 1.07
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Smarca1Q6PGB8 1046 aa21.73■■□□□ 1.07
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Olfr119Q7TRJ5 321 aa21.73■■□□□ 1.07
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Cyth4Q80YW0 393 aa21.73■■□□□ 1.07
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 FtoQ8BGW1 502 aa21.73■■□□□ 1.07
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Kiaa0391Q8JZY4 584 aaKnown RBP21.73■■□□□ 1.07
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Ino80bQ99PT3 375 aaKnown RBP21.73■■□□□ 1.07
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Baz2aQ91YE5 1889 aaKnown RBP21.73■■□□□ 1.07
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Ccdc112A0AUP1 442 aa21.72■■□□□ 1.07
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Pex10B1AUE5 324 aa21.72■■□□□ 1.07
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Serpina16D3Z660 418 aa21.72■■□□□ 1.07
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 DsppP97399 934 aa21.72■■□□□ 1.07
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Zbtb8osQ505B7 168 aa21.72■■□□□ 1.07
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Cd180Q62192 661 aa21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 36.6 ms