RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000639850.1

ME2-216, Transcript of malic enzyme 2, human

TSL 5 BASIC

Gene ME2, Length 2,331 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ME2-216	ENST00000639850	PLA2R1	Q13018	1463 aa		28.72	■■■□□ 2.19
ME2-216	ENST00000639850	POLR1A	O95602	1720 aa	Predicted RBP	28.71	■■■□□ 2.19
ME2-216	ENST00000639850	DCAF11	Q8TEB1	546 aa		28.7	■■■□□ 2.19
ME2-216	ENST00000639850	CCER2	I3L3R5	266 aa		28.7	■■■□□ 2.18
ME2-216	ENST00000639850	CCDC7	Q96M83	1385 aa		28.69	■■■□□ 2.18
ME2-216	ENST00000639850	C11orf95	C9JLR9	678 aa	Predicted RBP	28.69	■■■□□ 2.18
ME2-216	ENST00000639850	MYT1L	Q9UL68	1186 aa		28.69	■■■□□ 2.18
ME2-216	ENST00000639850	KDM2A	Q9Y2K7	1162 aa		28.69	■■■□□ 2.18
ME2-216	ENST00000639850	RALGAPB	Q86X10	1494 aa		28.68	■■■□□ 2.18
ME2-216	ENST00000639850	CD109	Q6YHK3	1445 aa		28.66	■■■□□ 2.18
ME2-216	ENST00000639850	USP47	Q96K76	1375 aa		28.66	■■■□□ 2.18
ME2-216	ENST00000639850	ATP10A	O60312	1499 aa		28.66	■■■□□ 2.18
ME2-216	ENST00000639850	CFAP74	Q9C0B2	1584 aa		28.65	■■■□□ 2.18
ME2-216	ENST00000639850	DEPDC5	O75140	1603 aa		28.65	■■■□□ 2.18
ME2-216	ENST00000639850	KDM5C	P41229	1560 aa		28.64	■■■□□ 2.18
ME2-216	ENST00000639850	CNTLN	Q9NXG0	1405 aa		28.63	■■■□□ 2.17
ME2-216	ENST00000639850	ZNF518A	Q6AHZ1	1483 aa		28.61	■■■□□ 2.17
ME2-216	ENST00000639850		E9PCH4	1651 aa		28.6	■■■□□ 2.17
ME2-216	ENST00000639850	RGL3	Q3MIN7	710 aa		28.6	■■■□□ 2.17
ME2-216	ENST00000639850	KIF7	Q2M1P5	1343 aa		28.6	■■■□□ 2.17
ME2-216	ENST00000639850	KIDINS220	Q9ULH0	1771 aa		28.59	■■■□□ 2.17
ME2-216	ENST00000639850	CARD11	Q9BXL7	1154 aa		28.59	■■■□□ 2.17
ME2-216	ENST00000639850	DHX29	Q7Z478	1369 aa	Known RBP	28.59	■■■□□ 2.17
ME2-216	ENST00000639850	EIF2AK4	Q9P2K8	1649 aa	Known RBP	28.59	■■■□□ 2.17
ME2-216	ENST00000639850	KANK1	Q14678	1352 aa		28.56	■■■□□ 2.16
ME2-216	ENST00000639850	KIF3B	O15066	747 aa		28.56	■■■□□ 2.16
ME2-216	ENST00000639850	BCORL1	Q5H9F3	1711 aa		28.55	■■■□□ 2.16
ME2-216	ENST00000639850	A2M	P01023	1474 aa		28.55	■■■□□ 2.16
ME2-216	ENST00000639850	TET3	O43151	1660 aa		28.54	■■■□□ 2.16
ME2-216	ENST00000639850	PRAG1	Q86YV5	1406 aa		28.54	■■■□□ 2.16
ME2-216	ENST00000639850	TRPM1	Q7Z4N2	1603 aa		28.52	■■■□□ 2.16
ME2-216	ENST00000639850	VWDE	Q8N2E2	1590 aa		28.52	■■■□□ 2.16
ME2-216	ENST00000639850	POGZ	Q7Z3K3	1410 aa		28.51	■■■□□ 2.15
ME2-216	ENST00000639850	ROCK2	O75116	1388 aa	Known RBP	28.51	■■■□□ 2.15
ME2-216	ENST00000639850	SPHKAP	Q2M3C7	1700 aa		28.51	■■■□□ 2.15
ME2-216	ENST00000639850	PRDM15	P57071	1507 aa	Predicted RBP	28.5	■■■□□ 2.15
ME2-216	ENST00000639850	CYB5RL	Q6IPT4	315 aa		28.49	■■■□□ 2.15
ME2-216	ENST00000639850	TRPM2	O94759	1503 aa		28.48	■■■□□ 2.15
ME2-216	ENST00000639850	MROH1	Q8NDA8	1641 aa		28.47	■■■□□ 2.15
ME2-216	ENST00000639850	ARID4B	Q4LE39	1312 aa	Predicted RBP	28.46	■■■□□ 2.15
ME2-216	ENST00000639850	NEO1	Q92859	1461 aa		28.46	■■■□□ 2.15
ME2-216	ENST00000639850	PTPRT	O14522	1441 aa		28.45	■■■□□ 2.15
ME2-216	ENST00000639850	MLH3	Q9UHC1	1453 aa		28.45	■■■□□ 2.14
ME2-216	ENST00000639850	RIMBP3C	A6NJZ7	1639 aa		28.45	■■■□□ 2.14
ME2-216	ENST00000639850	RIMBP3B	A6NNM3	1639 aa		28.45	■■■□□ 2.14
ME2-216	ENST00000639850	RIMBP3	Q9UFD9	1639 aa		28.45	■■■□□ 2.14
ME2-216	ENST00000639850	HECW2	Q9P2P5	1572 aa		28.44	■■■□□ 2.14
ME2-216	ENST00000639850	CEP152	O94986	1710 aa		28.44	■■■□□ 2.14
ME2-216	ENST00000639850	ST20-MTHFS	A0A0A6YYL1	179 aa		28.42	■■■□□ 2.14
ME2-216	ENST00000639850	POLR3GL	Q9BT43	218 aa		28.41	■■■□□ 2.14
ME2-216	ENST00000639850	CLTCL1	P53675	1640 aa		28.4	■■■□□ 2.14
ME2-216	ENST00000639850	PRKRIP1	Q9H875	184 aa	Predicted RBP	28.39	■■■□□ 2.14
ME2-216	ENST00000639850	MAP3K4	Q9Y6R4	1608 aa		28.39	■■■□□ 2.13
ME2-216	ENST00000639850	NBPF1	Q3BBV0	1214 aa		28.38	■■■□□ 2.13
ME2-216	ENST00000639850	GPRASP1	Q5JY77	1395 aa		28.38	■■■□□ 2.13
ME2-216	ENST00000639850	LAMC1	P11047	1609 aa		28.38	■■■□□ 2.13
ME2-216	ENST00000639850	RNF17	Q9BXT8	1623 aa	Known RBP	28.38	■■■□□ 2.13
ME2-216	ENST00000639850	EFCAB6	Q5THR3	1501 aa		28.35	■■■□□ 2.13
ME2-216	ENST00000639850	ABCA6	Q8N139	1617 aa		28.34	■■■□□ 2.13
ME2-216	ENST00000639850	FRMPD1	Q5SYB0	1578 aa		28.34	■■■□□ 2.13
ME2-216	ENST00000639850	RAPGEF3	O95398	923 aa		28.34	■■■□□ 2.13
ME2-216	ENST00000639850	GLI2	P10070	1586 aa		28.33	■■■□□ 2.13
ME2-216	ENST00000639850	LMTK2	Q8IWU2	1503 aa		28.32	■■■□□ 2.12
ME2-216	ENST00000639850	PPRC1	Q5VV67	1664 aa	Known RBP	28.31	■■■□□ 2.12
ME2-216	ENST00000639850	RICTOR	Q6R327	1708 aa		28.29	■■■□□ 2.12
ME2-216	ENST00000639850	MADD	Q8WXG6	1647 aa		28.29	■■■□□ 2.12
ME2-216	ENST00000639850	STAC3	Q96MF2	364 aa		28.29	■■■□□ 2.12
ME2-216	ENST00000639850	KIF1B	O60333	1816 aa		28.26	■■■□□ 2.11
ME2-216	ENST00000639850	GGT6	Q6P531	493 aa		28.26	■■■□□ 2.11
ME2-216	ENST00000639850	NEURL4	Q96JN8	1562 aa		28.26	■■■□□ 2.11
ME2-216	ENST00000639850	UGGT1	Q9NYU2	1555 aa		28.23	■■■□□ 2.11
ME2-216	ENST00000639850	CCDC184	Q52MB2	194 aa		28.23	■■■□□ 2.11
ME2-216	ENST00000639850	DIP2C	Q9Y2E4	1556 aa		28.23	■■■□□ 2.11
ME2-216	ENST00000639850	FAM69C	Q0P6D2	419 aa		28.21	■■■□□ 2.11
ME2-216	ENST00000639850	CFAP65	Q6ZU64	1925 aa	Known RBP	28.21	■■■□□ 2.11
ME2-216	ENST00000639850	DIP2B	Q9P265	1576 aa		28.2	■■■□□ 2.11
ME2-216	ENST00000639850	MRS2	Q9HD23	443 aa		28.19	■■■□□ 2.1
ME2-216	ENST00000639850	WASHC2C	Q9Y4E1	1318 aa		28.17	■■■□□ 2.1
ME2-216	ENST00000639850	TESK2	Q96S53	571 aa		28.17	■■■□□ 2.1
ME2-216	ENST00000639850	NPAT	Q14207	1427 aa		28.16	■■■□□ 2.1
ME2-216	ENST00000639850	ABCC3	O15438	1527 aa		28.16	■■■□□ 2.1
ME2-216	ENST00000639850	HNRNPU	Q00839	825 aa	Known RBP eCLIP	28.15	■■■□□ 2.1
ME2-216	ENST00000639850	COL17A1	Q9UMD9	1497 aa	Predicted RBP	28.15	■■■□□ 2.1
ME2-216	ENST00000639850	IQGAP1	P46940	1657 aa		28.14	■■■□□ 2.1
ME2-216	ENST00000639850	TSPOAP1	O95153	1857 aa		28.14	■■■□□ 2.1
ME2-216	ENST00000639850	CNGB1	Q14028	1251 aa	Predicted RBP	28.14	■■■□□ 2.09
ME2-216	ENST00000639850	MROH2A	A6NES4	1674 aa		28.13	■■■□□ 2.09
ME2-216	ENST00000639850	KIAA1210	Q9ULL0	1709 aa		28.13	■■■□□ 2.09
ME2-216	ENST00000639850	CAMSAP1	Q5T5Y3	1602 aa		28.12	■■■□□ 2.09
ME2-216	ENST00000639850	IFT172	Q9UG01	1749 aa		28.12	■■■□□ 2.09
ME2-216	ENST00000639850	YEATS2	Q9ULM3	1422 aa		28.11	■■■□□ 2.09
ME2-216	ENST00000639850	MYOM2	P54296	1465 aa		28.11	■■■□□ 2.09
ME2-216	ENST00000639850	DISP3	Q9P2K9	1392 aa		28.11	■■■□□ 2.09
ME2-216	ENST00000639850	TMF1	P82094	1093 aa		28.1	■■■□□ 2.09
ME2-216	ENST00000639850	FAM9B	Q8IZU0	186 aa		28.1	■■■□□ 2.09
ME2-216	ENST00000639850	SCAF11	Q99590	1463 aa	Known RBP	28.08	■■■□□ 2.09
ME2-216	ENST00000639850	ADGRB3	O60242	1522 aa		28.07	■■■□□ 2.08
ME2-216	ENST00000639850	ZMYM4	Q5VZL5	1548 aa		28.06	■■■□□ 2.08
ME2-216	ENST00000639850	CHGA	P10645	457 aa	Known RBP	28.05	■■■□□ 2.08
ME2-216	ENST00000639850	ZC3H13	Q5T200	1668 aa	Known RBP	28.04	■■■□□ 2.08

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