RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000639501.1

PMS1-222, Transcript of PMS1 homolog 1, mismatch repair system component, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PMS1, Length 2,506 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS1-222ENST00000639501 PKD2Q13563 968 aa27.27■■□□□ 1.96
PMS1-222ENST00000639501 USP35Q9P2H5 1018 aa27.27■■□□□ 1.96
PMS1-222ENST00000639501 PTPRGP23470 1445 aa27.26■■□□□ 1.95
PMS1-222ENST00000639501 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa27.25■■□□□ 1.95
PMS1-222ENST00000639501 E9PCH4 1651 aa27.25■■□□□ 1.95
PMS1-222ENST00000639501 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP27.25■■□□□ 1.95
PMS1-222ENST00000639501 CARD11Q9BXL7 1154 aa27.24■■□□□ 1.95
PMS1-222ENST00000639501 MS4A1P11836 297 aa27.24■■□□□ 1.95
PMS1-222ENST00000639501 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa27.23■■□□□ 1.95
PMS1-222ENST00000639501 CDCA7LQ96GN5 454 aa27.22■■□□□ 1.95
PMS1-222ENST00000639501 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa27.22■■□□□ 1.95
PMS1-222ENST00000639501 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa27.22■■□□□ 1.95
PMS1-222ENST00000639501 ADGBQ8N7X0 1667 aa27.21■■□□□ 1.95
PMS1-222ENST00000639501 PLIN1O60240 522 aa27.21■■□□□ 1.95
PMS1-222ENST00000639501 RALBP1Q15311 655 aa27.19■■□□□ 1.94
PMS1-222ENST00000639501 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP27.19■■□□□ 1.94
PMS1-222ENST00000639501 ABCA8O94911 1581 aa27.18■■□□□ 1.94
PMS1-222ENST00000639501 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP27.18■■□□□ 1.94
PMS1-222ENST00000639501 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP27.15■■□□□ 1.94
PMS1-222ENST00000639501 BRPF3Q9ULD4 1205 aa27.14■■□□□ 1.94
PMS1-222ENST00000639501 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa27.13■■□□□ 1.93
PMS1-222ENST00000639501 CROCC2H7BZ55 1655 aa27.13■■□□□ 1.93
PMS1-222ENST00000639501 ADGRL2O95490 1459 aa27.12■■□□□ 1.93
PMS1-222ENST00000639501 CRBNQ96SW2 442 aa27.12■■□□□ 1.93
PMS1-222ENST00000639501 NLRP13Q86W25 1043 aa27.11■■□□□ 1.93
PMS1-222ENST00000639501 PARD3Q8TEW0 1356 aa27.11■■□□□ 1.93
PMS1-222ENST00000639501 PDE3BQ13370 1112 aa27.1■■□□□ 1.93
PMS1-222ENST00000639501 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP27.1■■□□□ 1.93
PMS1-222ENST00000639501 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa27.1■■□□□ 1.93
PMS1-222ENST00000639501 SLC4A3P48751 1232 aa27.09■■□□□ 1.93
PMS1-222ENST00000639501 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP27.09■■□□□ 1.93
PMS1-222ENST00000639501 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa27.06■■□□□ 1.92
PMS1-222ENST00000639501 NFKBIBQ15653 356 aa27.06■■□□□ 1.92
PMS1-222ENST00000639501 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP27.05■■□□□ 1.92
PMS1-222ENST00000639501 DDRGK1Q96HY6 314 aa27.05■■□□□ 1.92
PMS1-222ENST00000639501 ITSN2Q9NZM3 1697 aa27.04■■□□□ 1.92
PMS1-222ENST00000639501 GSE1Q14687 1217 aa27.04■■□□□ 1.92
PMS1-222ENST00000639501 C20orf194Q5TEA3 1177 aa27.04■■□□□ 1.92
PMS1-222ENST00000639501 ATP10BO94823 1461 aa27.03■■□□□ 1.92
PMS1-222ENST00000639501 NUP155O75694 1391 aa27.03■■□□□ 1.92
PMS1-222ENST00000639501 DCAF11Q8TEB1 546 aa27.03■■□□□ 1.92
PMS1-222ENST00000639501 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP27.02■■□□□ 1.92
PMS1-222ENST00000639501 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa27.02■■□□□ 1.92
PMS1-222ENST00000639501 ABCC2Q92887 1545 aa26.99■■□□□ 1.91
PMS1-222ENST00000639501 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP26.99■■□□□ 1.91
PMS1-222ENST00000639501 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP26.99■■□□□ 1.91
PMS1-222ENST00000639501 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP26.98■■□□□ 1.91
PMS1-222ENST00000639501 KDM2BQ8NHM5 1336 aa26.97■■□□□ 1.91
PMS1-222ENST00000639501 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP26.95■■□□□ 1.91
PMS1-222ENST00000639501 KDM5DQ9BY66 1539 aa26.93■■□□□ 1.9
PMS1-222ENST00000639501 PLEKHD1A6NEE1 506 aa26.92■■□□□ 1.9
PMS1-222ENST00000639501 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa26.91■■□□□ 1.9
PMS1-222ENST00000639501 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa26.91■■□□□ 1.9
PMS1-222ENST00000639501 ADCY10Q96PN6 1610 aa26.91■■□□□ 1.9
PMS1-222ENST00000639501 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa26.9■■□□□ 1.9
PMS1-222ENST00000639501 C8orf34Q49A92 452 aa26.89■■□□□ 1.89
PMS1-222ENST00000639501 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa26.89■■□□□ 1.89
PMS1-222ENST00000639501 NBPF1Q3BBV0 1214 aa26.88■■□□□ 1.89
PMS1-222ENST00000639501 C9orf84Q5VXU9 1444 aa26.88■■□□□ 1.89
PMS1-222ENST00000639501 DISP3Q9P2K9 1392 aa26.87■■□□□ 1.89
PMS1-222ENST00000639501 PRAG1Q86YV5 1406 aa26.86■■□□□ 1.89
PMS1-222ENST00000639501 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP26.86■■□□□ 1.89
PMS1-222ENST00000639501 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP26.84■■□□□ 1.89
PMS1-222ENST00000639501 INSRP06213 1382 aa26.83■■□□□ 1.89
PMS1-222ENST00000639501 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP26.83■■□□□ 1.89
PMS1-222ENST00000639501 FAM161AQ3B820 660 aa26.82■■□□□ 1.88
PMS1-222ENST00000639501 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP26.82■■□□□ 1.88
PMS1-222ENST00000639501 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP26.82■■□□□ 1.88
PMS1-222ENST00000639501 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa26.82■■□□□ 1.88
PMS1-222ENST00000639501 SHANK2Q9UPX8 1470 aa26.81■■□□□ 1.88
PMS1-222ENST00000639501 PANK3Q9H999 370 aa26.81■■□□□ 1.88
PMS1-222ENST00000639501 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa26.8■■□□□ 1.88
PMS1-222ENST00000639501 TESK2Q96S53 571 aa26.79■■□□□ 1.88
PMS1-222ENST00000639501 ADAMTS8Q9UP79 889 aa26.79■■□□□ 1.88
PMS1-222ENST00000639501 RGL3Q3MIN7 710 aa26.77■■□□□ 1.88
PMS1-222ENST00000639501 DUSP27Q5VZP5 1158 aa26.77■■□□□ 1.88
PMS1-222ENST00000639501 RGS3P49796 1198 aa26.76■■□□□ 1.87
PMS1-222ENST00000639501 GPRASP1Q5JY77 1395 aa26.74■■□□□ 1.87
PMS1-222ENST00000639501 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP26.74■■□□□ 1.87
PMS1-222ENST00000639501 FAM135AQ9P2D6 1515 aa26.74■■□□□ 1.87
PMS1-222ENST00000639501 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa26.72■■□□□ 1.87
PMS1-222ENST00000639501 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa26.72■■□□□ 1.87
PMS1-222ENST00000639501 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa26.72■■□□□ 1.87
PMS1-222ENST00000639501 A2MP01023 1474 aa26.72■■□□□ 1.87
PMS1-222ENST00000639501 ERBINQ96RT1 1412 aa26.71■■□□□ 1.87
PMS1-222ENST00000639501 ABCC10Q5T3U5 1492 aa26.71■■□□□ 1.87
PMS1-222ENST00000639501 CCDC144AA2RUR9 1427 aa26.7■■□□□ 1.86
PMS1-222ENST00000639501 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP26.69■■□□□ 1.86
PMS1-222ENST00000639501 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP26.68■■□□□ 1.864e-6■■■■□ 23.6
PMS1-222ENST00000639501 ZNF521Q96K83 1311 aa26.68■■□□□ 1.86
PMS1-222ENST00000639501 LAMC1P11047 1609 aa26.67■■□□□ 1.86
PMS1-222ENST00000639501 TSPY4P0CV99 314 aa26.67■■□□□ 1.86
PMS1-222ENST00000639501 TSPY10P0CW01 314 aa26.67■■□□□ 1.86
PMS1-222ENST00000639501 CYB5RLQ6IPT4 315 aa26.67■■□□□ 1.86
PMS1-222ENST00000639501 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa26.66■■□□□ 1.86
PMS1-222ENST00000639501 PLA2R1Q13018 1463 aa26.66■■□□□ 1.86
PMS1-222ENST00000639501 MYO5CQ9NQX4 1742 aa26.64■■□□□ 1.86
PMS1-222ENST00000639501 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP26.64■■□□□ 1.85
PMS1-222ENST00000639501 TTC37Q6PGP7 1564 aa26.63■■□□□ 1.85
PMS1-222ENST00000639501 MAGI2Q86UL8 1455 aa26.63■■□□□ 1.85
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