RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000637849.1

EFHC1-235, Transcript of EF-hand domain containing 1, humanhuman

TSL 5

Gene EFHC1, Length 2,746 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFHC1-235ENST00000637849 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa22.85■■□□□ 1.25
EFHC1-235ENST00000637849 IQGAP3Q86VI3 1631 aa22.84■■□□□ 1.25
EFHC1-235ENST00000637849 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP22.84■■□□□ 1.25
EFHC1-235ENST00000637849 FAM135AQ9P2D6 1515 aa22.83■■□□□ 1.25
EFHC1-235ENST00000637849 BCORL1Q5H9F3 1711 aa22.82■■□□□ 1.24
EFHC1-235ENST00000637849 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa22.8■■□□□ 1.24
EFHC1-235ENST00000637849 YEATS2Q9ULM3 1422 aa22.79■■□□□ 1.24
EFHC1-235ENST00000637849 SIN3AQ96ST3 1273 aa22.78■■□□□ 1.24
EFHC1-235ENST00000637849 VWDEQ8N2E2 1590 aa22.78■■□□□ 1.24
EFHC1-235ENST00000637849 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP22.78■■□□□ 1.24
EFHC1-235ENST00000637849 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP22.77■■□□□ 1.24
EFHC1-235ENST00000637849 MROH1Q8NDA8 1641 aa22.77■■□□□ 1.24
EFHC1-235ENST00000637849 PKD2Q13563 968 aa22.77■■□□□ 1.24
EFHC1-235ENST00000637849 TRHP20396 242 aaPredicted RBP22.76■■□□□ 1.23
EFHC1-235ENST00000637849 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa22.76■■□□□ 1.23
EFHC1-235ENST00000637849 KIF3BO15066 747 aa22.75■■□□□ 1.23
EFHC1-235ENST00000637849 REREQ9P2R6 1566 aa22.75■■□□□ 1.23
EFHC1-235ENST00000637849 FOXD1Q16676 465 aa22.74■■□□□ 1.23
EFHC1-235ENST00000637849 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP22.74■■□□□ 1.232e-6■■■■□ 23.3
EFHC1-235ENST00000637849 ATP10AO60312 1499 aa22.73■■□□□ 1.23
EFHC1-235ENST00000637849 KANK1Q14678 1352 aa22.7■■□□□ 1.23
EFHC1-235ENST00000637849 NEUROD1Q13562 356 aa22.7■■□□□ 1.22
EFHC1-235ENST00000637849 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa22.7■■□□□ 1.22
EFHC1-235ENST00000637849 TET3O43151 1660 aa22.68■■□□□ 1.22
EFHC1-235ENST00000637849 LMTK2Q8IWU2 1503 aa22.68■■□□□ 1.22
EFHC1-235ENST00000637849 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
EFHC1-235ENST00000637849 AGLP35573 1532 aa22.67■■□□□ 1.22
EFHC1-235ENST00000637849 E9PCH4 1651 aa22.64■■□□□ 1.21
EFHC1-235ENST00000637849 TONSLQ96HA7 1378 aa22.62■■□□□ 1.21
EFHC1-235ENST00000637849 PLA2R1Q13018 1463 aa22.62■■□□□ 1.21
EFHC1-235ENST00000637849 EFCAB6Q5THR3 1501 aa22.6■■□□□ 1.21
EFHC1-235ENST00000637849 CEP152O94986 1710 aa22.59■■□□□ 1.21
EFHC1-235ENST00000637849 ABCC3O15438 1527 aa22.59■■□□□ 1.21
EFHC1-235ENST00000637849 GGT6Q6P531 493 aa22.59■■□□□ 1.21
EFHC1-235ENST00000637849 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa22.58■■□□□ 1.21
EFHC1-235ENST00000637849 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
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EFHC1-235ENST00000637849 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP22.56■■□□□ 1.2
EFHC1-235ENST00000637849 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa22.54■■□□□ 1.2
EFHC1-235ENST00000637849 TRPM2O94759 1503 aa22.54■■□□□ 1.2
EFHC1-235ENST00000637849 PPP6R1Q9UPN7 881 aa22.53■■□□□ 1.2
EFHC1-235ENST00000637849 CCDC144AA2RUR9 1427 aa22.53■■□□□ 1.2
EFHC1-235ENST00000637849 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa22.53■■□□□ 1.2
EFHC1-235ENST00000637849 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa22.52■■□□□ 1.2
EFHC1-235ENST00000637849 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa22.51■■□□□ 1.19
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EFHC1-235ENST00000637849 CLTCL1P53675 1640 aa22.43■■□□□ 1.18
EFHC1-235ENST00000637849 NOS1P29475 1434 aa22.42■■□□□ 1.18
EFHC1-235ENST00000637849 CNTLNQ9NXG0 1405 aa22.42■■□□□ 1.18
EFHC1-235ENST00000637849 NEURL4Q96JN8 1562 aa22.42■■□□□ 1.18
EFHC1-235ENST00000637849 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa22.41■■□□□ 1.18
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EFHC1-235ENST00000637849 SYNMO15061 1565 aa22.35■■□□□ 1.17
EFHC1-235ENST00000637849 MLECQ14165 292 aa22.35■■□□□ 1.17
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EFHC1-235ENST00000637849 NBPF8Q3BBV2 869 aa22.33■■□□□ 1.16
EFHC1-235ENST00000637849 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
EFHC1-235ENST00000637849 ERVK-7P63135 1459 aa22.31■■□□□ 1.16
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EFHC1-235ENST00000637849 DCAF11Q8TEB1 546 aa22.3■■□□□ 1.16
EFHC1-235ENST00000637849 ADGRB3O60242 1522 aa22.29■■□□□ 1.16
EFHC1-235ENST00000637849 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa22.29■■□□□ 1.16
EFHC1-235ENST00000637849 RGL3Q3MIN7 710 aa22.29■■□□□ 1.16
EFHC1-235ENST00000637849 STAC3Q96MF2 364 aa22.28■■□□□ 1.16
EFHC1-235ENST00000637849 ZMYM3Q14202 1370 aa22.27■■□□□ 1.16
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EFHC1-235ENST00000637849 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
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EFHC1-235ENST00000637849 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa22.23■■□□□ 1.15
EFHC1-235ENST00000637849 IFT172Q9UG01 1749 aa22.23■■□□□ 1.15
EFHC1-235ENST00000637849 IDI1Q13907 227 aa22.22■■□□□ 1.15
EFHC1-235ENST00000637849 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa22.21■■□□□ 1.15
EFHC1-235ENST00000637849 MYOM2P54296 1465 aa22.2■■□□□ 1.14
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EFHC1-235ENST00000637849 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa22.18■■□□□ 1.14
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EFHC1-235ENST00000637849 NRXN1Q9ULB1 1477 aa22.15■■□□□ 1.14
EFHC1-235ENST00000637849 C3P01024 1663 aa22.15■■□□□ 1.14
EFHC1-235ENST00000637849 ADAMTSL3P82987 1691 aa22.14■■□□□ 1.13
EFHC1-235ENST00000637849 CHGAP10645 457 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
EFHC1-235ENST00000637849 GPRASP1Q5JY77 1395 aa22.14■■□□□ 1.13
EFHC1-235ENST00000637849 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP22.13■■□□□ 1.135e-7■□□□□ 9.7
EFHC1-235ENST00000637849 TNRQ92752 1358 aa22.12■■□□□ 1.13
EFHC1-235ENST00000637849 LAMC1P11047 1609 aa22.12■■□□□ 1.13
EFHC1-235ENST00000637849 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa22.12■■□□□ 1.13
EFHC1-235ENST00000637849 MYO5BQ9ULV0 1848 aa22.12■■□□□ 1.13
EFHC1-235ENST00000637849 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa22.11■■□□□ 1.13
EFHC1-235ENST00000637849 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
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