RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636566.1

EFHC1-222, Transcript of EF-hand domain containing 1, human

TSL 4

Gene EFHC1, Length 552 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
EFHC1-222	ENST00000636566	PTPRG	P23470	1445 aa		7.63	□□□□□ -1.19
EFHC1-222	ENST00000636566	PAXIP1	Q6ZW49	1069 aa	Predicted RBP	7.63	□□□□□ -1.19
EFHC1-222	ENST00000636566	RRP7BP	Q9NSQ0	103 aa		7.63	□□□□□ -1.19
EFHC1-222	ENST00000636566	FBXO3	Q9UK99	471 aa		7.63	□□□□□ -1.19
EFHC1-222	ENST00000636566	TAOK2	Q9UL54	1235 aa		7.63	□□□□□ -1.19
EFHC1-222	ENST00000636566	PTPN23	Q9H3S7	1636 aa		7.63	□□□□□ -1.19
EFHC1-222	ENST00000636566	CHD1	O14646	1710 aa		7.62	□□□□□ -1.19
EFHC1-222	ENST00000636566	C11orf95	C9JLR9	678 aa	Predicted RBP	7.62	□□□□□ -1.19
EFHC1-222	ENST00000636566	C14orf37	Q86TY3	774 aa		7.62	□□□□□ -1.19
EFHC1-222	ENST00000636566	CFDP1	Q9UEE9	299 aa	Predicted RBP	7.62	□□□□□ -1.19
EFHC1-222	ENST00000636566	ZRANB1	Q9UGI0	708 aa		7.62	□□□□□ -1.19
EFHC1-222	ENST00000636566	NUP153	P49790	1475 aa	Known RBP	7.62	□□□□□ -1.19
EFHC1-222	ENST00000636566	PLB1	Q6P1J6	1458 aa		7.62	□□□□□ -1.19
EFHC1-222	ENST00000636566	MIA2	Q96PC5	1412 aa		7.61	□□□□□ -1.19
EFHC1-222	ENST00000636566	PAK3	O75914	559 aa	Predicted RBP	7.61	□□□□□ -1.19
EFHC1-222	ENST00000636566	CREBZF	Q9NS37	354 aa		7.61	□□□□□ -1.19
EFHC1-222	ENST00000636566	MAGI3	Q5TCQ9	1506 aa		7.61	□□□□□ -1.19
EFHC1-222	ENST00000636566	TRO	Q12816	1431 aa	Predicted RBP	7.61	□□□□□ -1.19
EFHC1-222	ENST00000636566	YTHDC1	Q96MU7	727 aa	Known RBP	7.6	□□□□□ -1.19
EFHC1-222	ENST00000636566	PLSCR2	Q9NRY7	297 aa		7.6	□□□□□ -1.19
EFHC1-222	ENST00000636566	GALR2	O43603	387 aa	Predicted RBP	7.59	□□□□□ -1.19
EFHC1-222	ENST00000636566	HAP1	P54257	671 aa	Predicted RBP	7.59	□□□□□ -1.19
EFHC1-222	ENST00000636566	NAP1L5	Q96NT1	182 aa	Predicted RBP	7.59	□□□□□ -1.19
EFHC1-222	ENST00000636566	TCOF1	Q13428	1488 aa	Known RBP	7.58	□□□□□ -1.2
EFHC1-222	ENST00000636566	MIER1	Q8N108	512 aa		7.58	□□□□□ -1.2
EFHC1-222	ENST00000636566	OTUD5	Q96G74	571 aa		7.58	□□□□□ -1.2
EFHC1-222	ENST00000636566	SIN3A	Q96ST3	1273 aa		7.58	□□□□□ -1.2
EFHC1-222	ENST00000636566	NAP1L2	Q9ULW6	460 aa	Predicted RBP	7.58	□□□□□ -1.2
EFHC1-222	ENST00000636566	ARHGEF11	O15085	1522 aa		7.57	□□□□□ -1.2
EFHC1-222	ENST00000636566	HFM1	A2PYH4	1435 aa		7.57	□□□□□ -1.2
EFHC1-222	ENST00000636566	ABCA8	O94911	1581 aa		7.57	□□□□□ -1.2
EFHC1-222	ENST00000636566	PTPRK	Q15262	1439 aa		7.56	□□□□□ -1.2
EFHC1-222	ENST00000636566	UACA	Q9BZF9	1416 aa		7.56	□□□□□ -1.2
EFHC1-222	ENST00000636566	SPDYE4	A6NLX3	237 aa		7.56	□□□□□ -1.2
EFHC1-222	ENST00000636566	NPM1	P06748	294 aa	Known RBP eCLIP	7.56	□□□□□ -1.2
EFHC1-222	ENST00000636566	TSPY4	P0CV99	314 aa		7.56	□□□□□ -1.2
EFHC1-222	ENST00000636566	TSPY10	P0CW01	314 aa		7.56	□□□□□ -1.2
EFHC1-222	ENST00000636566	BCCIP	Q9P287	314 aa	Known RBP eCLIP	7.56	□□□□□ -1.2
EFHC1-222	ENST00000636566	ITSN2	Q9NZM3	1697 aa		7.56	□□□□□ -1.2
EFHC1-222	ENST00000636566	TONSL	Q96HA7	1378 aa		7.56	□□□□□ -1.2
EFHC1-222	ENST00000636566	ATP10B	O94823	1461 aa		7.55	□□□□□ -1.2
EFHC1-222	ENST00000636566	ZNF644	Q9H582	1327 aa	Predicted RBP	7.55	□□□□□ -1.2
EFHC1-222	ENST00000636566	NAIP	Q13075	1403 aa		7.55	□□□□□ -1.2
EFHC1-222	ENST00000636566	POTEB2	H3BUK9	544 aa		7.55	□□□□□ -1.2
EFHC1-222	ENST00000636566	HSP90B1	P14625	803 aa	Known RBP	7.55	□□□□□ -1.2
EFHC1-222	ENST00000636566	IPO4	Q8TEX9	1081 aa	Known RBP	7.55	□□□□□ -1.2
EFHC1-222	ENST00000636566	KCNH8	Q96L42	1107 aa		7.55	□□□□□ -1.2
EFHC1-222	ENST00000636566	DAPK1	P53355	1430 aa		7.54	□□□□□ -1.2
EFHC1-222	ENST00000636566	KIF14	Q15058	1648 aa		7.54	□□□□□ -1.2
EFHC1-222	ENST00000636566	CAMSAP2	Q08AD1	1489 aa		7.53	□□□□□ -1.2
EFHC1-222	ENST00000636566	MAPKBP1	O60336	1514 aa		7.52	□□□□□ -1.2
EFHC1-222	ENST00000636566	GPATCH8	Q9UKJ3	1502 aa	Known RBP	7.52	□□□□□ -1.2
EFHC1-222	ENST00000636566	ANKRD30A	Q9BXX3	1397 aa		7.52	□□□□□ -1.21
EFHC1-222	ENST00000636566	ADCY10	Q96PN6	1610 aa		7.52	□□□□□ -1.21
EFHC1-222	ENST00000636566	ABCC5	O15440	1437 aa		7.52	□□□□□ -1.21
EFHC1-222	ENST00000636566	AKNA	Q7Z591	1439 aa		7.52	□□□□□ -1.21
EFHC1-222	ENST00000636566	GCC2	Q8IWJ2	1684 aa		7.51	□□□□□ -1.21
EFHC1-222	ENST00000636566	ROCK1	Q13464	1354 aa		7.51	□□□□□ -1.21
EFHC1-222	ENST00000636566	RRP9	O43818	475 aa	Known RBP	7.51	□□□□□ -1.21
EFHC1-222	ENST00000636566	CDK11B	P21127	795 aa	Known RBP	7.51	□□□□□ -1.21
EFHC1-222	ENST00000636566	HNRNPM	P52272	730 aa	Known RBP eCLIP	7.51	□□□□□ -1.21
EFHC1-222	ENST00000636566	ILDR1	Q86SU0	546 aa	Predicted RBP	7.51	□□□□□ -1.21
EFHC1-222	ENST00000636566	MPHOSPH9	Q99550	1183 aa		7.51	□□□□□ -1.21
EFHC1-222	ENST00000636566	DNMT1	P26358	1616 aa	Known RBP	7.51	□□□□□ -1.21
EFHC1-222	ENST00000636566	SHROOM2	Q13796	1616 aa		7.51	□□□□□ -1.21
EFHC1-222	ENST00000636566	CHRM1	P11229	460 aa	Predicted RBP	7.5	□□□□□ -1.21
EFHC1-222	ENST00000636566	WASHC2C	Q9Y4E1	1318 aa		7.5	□□□□□ -1.21
EFHC1-222	ENST00000636566	ABCC2	Q92887	1545 aa		7.49	□□□□□ -1.21
EFHC1-222	ENST00000636566	PPP1R15A	O75807	674 aa	Predicted RBP	7.49	□□□□□ -1.21
EFHC1-222	ENST00000636566	TEX2	Q8IWB9	1127 aa		7.49	□□□□□ -1.21
EFHC1-222	ENST00000636566	ERCC6L2	Q5T890	1561 aa		7.49	□□□□□ -1.21
EFHC1-222	ENST00000636566	CLASP1	Q7Z460	1538 aa		7.48	□□□□□ -1.21
EFHC1-222	ENST00000636566	POTEM	A6NI47	508 aa		7.48	□□□□□ -1.21
EFHC1-222	ENST00000636566	TPRN	Q4KMQ1	711 aa		7.48	□□□□□ -1.21
EFHC1-222	ENST00000636566	PHF12	Q96QT6	1004 aa		7.48	□□□□□ -1.21
EFHC1-222	ENST00000636566	ABCC10	Q5T3U5	1492 aa		7.48	□□□□□ -1.21
EFHC1-222	ENST00000636566	ADGB	Q8N7X0	1667 aa		7.47	□□□□□ -1.21
EFHC1-222	ENST00000636566	ARHGAP5	Q13017	1502 aa		7.47	□□□□□ -1.21
EFHC1-222	ENST00000636566	GTF2E1	P29083	439 aa	Predicted RBP	7.47	□□□□□ -1.21
EFHC1-222	ENST00000636566	EFCAB2	Q5VUJ9	269 aa		7.47	□□□□□ -1.21
EFHC1-222	ENST00000636566	BBX	Q8WY36	941 aa	Predicted RBP	7.47	□□□□□ -1.21
EFHC1-222	ENST00000636566	PRDM4	Q9UKN5	801 aa		7.47	□□□□□ -1.21
EFHC1-222	ENST00000636566	WASHC2A	Q641Q2	1341 aa		7.47	□□□□□ -1.21
EFHC1-222	ENST00000636566	CDC42BPA	Q5VT25	1732 aa		7.47	□□□□□ -1.21
EFHC1-222	ENST00000636566	C9orf84	Q5VXU9	1444 aa		7.46	□□□□□ -1.21
EFHC1-222	ENST00000636566	MNX1	P50219	401 aa	Predicted RBP	7.46	□□□□□ -1.22
EFHC1-222	ENST00000636566	ZFP91	Q96JP5	570 aa	Predicted RBP	7.46	□□□□□ -1.22
EFHC1-222	ENST00000636566	UHRF1BP1L	A0JNW5	1464 aa		7.45	□□□□□ -1.22
EFHC1-222	ENST00000636566	CALD1	Q05682	793 aa	Known RBP	7.45	□□□□□ -1.22
EFHC1-222	ENST00000636566	RTL5	Q5HYW3	569 aa	Predicted RBP	7.45	□□□□□ -1.22
EFHC1-222	ENST00000636566	CHMP4B	Q9H444	224 aa	Known RBP	7.45	□□□□□ -1.22
EFHC1-222	ENST00000636566	KDM6B	O15054	1643 aa		7.45	□□□□□ -1.22
EFHC1-222	ENST00000636566	NCOA1	Q15788	1441 aa		7.44	□□□□□ -1.22
EFHC1-222	ENST00000636566	PLEKHH2	Q8IVE3	1493 aa		7.44	□□□□□ -1.22
EFHC1-222	ENST00000636566	PKD2	Q13563	968 aa		7.44	□□□□□ -1.22
EFHC1-222	ENST00000636566	HSP90AA2P	Q14568	343 aa	Predicted RBP	7.44	□□□□□ -1.22
EFHC1-222	ENST00000636566	POTEG	Q6S5H5	508 aa		7.44	□□□□□ -1.22
EFHC1-222	ENST00000636566	DHX30	Q7L2E3	1194 aa	Known RBP eCLIP	7.44	□□□□□ -1.22
EFHC1-222	ENST00000636566	FAM43A	Q8N2R8	423 aa		7.44	□□□□□ -1.22
EFHC1-222	ENST00000636566	ZCCHC11	Q5TAX3	1644 aa	Known RBP	7.44	□□□□□ -1.22

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