RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000629113.1

LEMD1-210, Transcript of LEM domain containing 1, humanhuman

TSL 4

Gene LEMD1, Length 314 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LEMD1-210ENST00000629113 MYOM3Q5VTT5 1437 aa44.27■■■■■ 4.68
LEMD1-210ENST00000629113 LTBP4Q8N2S1 1624 aa44.24■■■■■ 4.67
LEMD1-210ENST00000629113 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa44.24■■■■■ 4.67
LEMD1-210ENST00000629113 KDM5DQ9BY66 1539 aa44.23■■■■■ 4.67
LEMD1-210ENST00000629113 MIA2Q96PC5 1412 aa44.21■■■■■ 4.67
LEMD1-210ENST00000629113 MAST1Q9Y2H9 1570 aa44.2■■■■■ 4.67
LEMD1-210ENST00000629113 PLA2R1Q13018 1463 aa44.17■■■■■ 4.66
LEMD1-210ENST00000629113 A2ML1A8K2U0 1454 aa44.16■■■■■ 4.66
LEMD1-210ENST00000629113 TNRQ92752 1358 aa44.16■■■■■ 4.66
LEMD1-210ENST00000629113 PZPP20742 1482 aa44.15■■■■■ 4.66
LEMD1-210ENST00000629113 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP44.14■■■■■ 4.66
LEMD1-210ENST00000629113 PKD2Q13563 968 aa44.14■■■■■ 4.66
LEMD1-210ENST00000629113 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP44.14■■■■■ 4.66
LEMD1-210ENST00000629113 FAM135AQ9P2D6 1515 aa44.13■■■■■ 4.65
LEMD1-210ENST00000629113 APLP2Q06481 763 aa44.11■■■■■ 4.65
LEMD1-210ENST00000629113 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP44.1■■■■■ 4.65
LEMD1-210ENST00000629113 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP44.06■■■■■ 4.64
LEMD1-210ENST00000629113 PTPN23Q9H3S7 1636 aa44.01■■■■■ 4.64
LEMD1-210ENST00000629113 ABCC3O15438 1527 aa44■■■■■ 4.63
LEMD1-210ENST00000629113 ABCC5O15440 1437 aa43.99■■■■■ 4.63
LEMD1-210ENST00000629113 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP43.99■■■■■ 4.63
LEMD1-210ENST00000629113 MROH1Q8NDA8 1641 aa43.98■■■■■ 4.63
LEMD1-210ENST00000629113 DUOX2Q9NRD8 1548 aa43.94■■■■■ 4.63
LEMD1-210ENST00000629113 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa43.94■■■■■ 4.62
LEMD1-210ENST00000629113 CROCC2H7BZ55 1655 aa43.93■■■■■ 4.62
LEMD1-210ENST00000629113 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP43.92■■■■■ 4.62
LEMD1-210ENST00000629113 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP43.91■■■■■ 4.62
LEMD1-210ENST00000629113 IQSEC2Q5JU85 1478 aa43.91■■■■■ 4.62
LEMD1-210ENST00000629113 CEP152O94986 1710 aa43.91■■■■■ 4.62
LEMD1-210ENST00000629113 KIF15Q9NS87 1388 aa43.91■■■■■ 4.62
LEMD1-210ENST00000629113 FGD6Q6ZV73 1430 aa43.9■■■■■ 4.62
LEMD1-210ENST00000629113 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP43.9■■■■■ 4.62
LEMD1-210ENST00000629113 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP43.9■■■■■ 4.62
LEMD1-210ENST00000629113 NEURL4Q96JN8 1562 aa43.89■■■■■ 4.62
LEMD1-210ENST00000629113 NLRP1Q9C000 1473 aa43.89■■■■■ 4.62
LEMD1-210ENST00000629113 DAPK1P53355 1430 aa43.88■■■■■ 4.61
LEMD1-210ENST00000629113 SHANK2Q9UPX8 1470 aa43.87■■■■■ 4.61
LEMD1-210ENST00000629113 UGGT1Q9NYU2 1555 aa43.85■■■■■ 4.61
LEMD1-210ENST00000629113 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP43.85■■■■■ 4.61
LEMD1-210ENST00000629113 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa43.84■■■■■ 4.61
LEMD1-210ENST00000629113 ERVK-7P63135 1459 aa43.83■■■■■ 4.61
LEMD1-210ENST00000629113 ANKLE2Q86XL3 938 aa43.82■■■■■ 4.61
LEMD1-210ENST00000629113 CHIC2Q9UKJ5 165 aa43.82■■■■■ 4.61
LEMD1-210ENST00000629113 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP43.77■■■■■ 4.6
LEMD1-210ENST00000629113 ERBINQ96RT1 1412 aa43.76■■■■■ 4.6
LEMD1-210ENST00000629113 UBAP1LF5GYI3 381 aa43.74■■■■■ 4.59
LEMD1-210ENST00000629113 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP43.73■■■■■ 4.59
LEMD1-210ENST00000629113 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP43.68■■■■■ 4.58
LEMD1-210ENST00000629113 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa43.67■■■■■ 4.58
LEMD1-210ENST00000629113 DEPDC5O75140 1603 aa43.66■■■■■ 4.58
LEMD1-210ENST00000629113 MED14O60244 1454 aa43.65■■■■■ 4.58
LEMD1-210ENST00000629113 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP43.63■■■■■ 4.57
LEMD1-210ENST00000629113 VWDEQ8N2E2 1590 aa43.63■■■■■ 4.57
LEMD1-210ENST00000629113 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa43.62■■■■■ 4.57
LEMD1-210ENST00000629113 UBR1Q8IWV7 1749 aa43.61■■■■■ 4.57
LEMD1-210ENST00000629113 IQGAP1P46940 1657 aa43.59■■■■■ 4.57
LEMD1-210ENST00000629113 DISP3Q9P2K9 1392 aa43.58■■■■■ 4.57
LEMD1-210ENST00000629113 CPS1P31327 1500 aa43.57■■■■■ 4.56
LEMD1-210ENST00000629113 KANK1Q14678 1352 aa43.55■■■■■ 4.56
LEMD1-210ENST00000629113 ADGRL2O95490 1459 aa43.5■■■■■ 4.55
LEMD1-210ENST00000629113 LTKP29376 864 aa43.49■■■■■ 4.55
LEMD1-210ENST00000629113 STRCP1A6NGW2 1772 aa43.46■■■■■ 4.55
LEMD1-210ENST00000629113 LMTK2Q8IWU2 1503 aa43.46■■■■■ 4.55
LEMD1-210ENST00000629113 PIK3C2BO00750 1634 aa43.45■■■■■ 4.55
LEMD1-210ENST00000629113 PIP4K2BP78356 416 aa43.44■■■■■ 4.54
LEMD1-210ENST00000629113 TXNDC2Q86VQ3 553 aa43.44■■■■■ 4.54
LEMD1-210ENST00000629113 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP43.44■■■■■ 4.54
LEMD1-210ENST00000629113 ILDR2Q71H61 639 aa43.43■■■■■ 4.54
LEMD1-210ENST00000629113 ARHGAP23Q9P227 1491 aa43.43■■■■■ 4.54
LEMD1-210ENST00000629113 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP43.43■■■■■ 4.54
LEMD1-210ENST00000629113 SLIT1O75093 1534 aa43.41■■■■■ 4.54
LEMD1-210ENST00000629113 IDI1Q13907 227 aa43.39■■■■■ 4.54
LEMD1-210ENST00000629113 TOM1O60784 492 aa43.37■■■■■ 4.53
LEMD1-210ENST00000629113 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa43.37■■■■■ 4.53
LEMD1-210ENST00000629113 STAG3Q9UJ98 1225 aa43.36■■■■■ 4.53
LEMD1-210ENST00000629113 SYNMO15061 1565 aa43.36■■■■■ 4.53
LEMD1-210ENST00000629113 EFCAB6Q5THR3 1501 aa43.33■■■■■ 4.53
LEMD1-210ENST00000629113 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP43.33■■■■■ 4.53
LEMD1-210ENST00000629113 LRRC7Q96NW7 1537 aa43.32■■■■■ 4.52
LEMD1-210ENST00000629113 TMEM2Q9UHN6 1383 aa43.31■■■■■ 4.52
LEMD1-210ENST00000629113 HSPA1LP34931 641 aa43.31■■■■■ 4.52
LEMD1-210ENST00000629113 EID1Q9Y6B2 187 aa43.31■■■■■ 4.52
LEMD1-210ENST00000629113 NOS1P29475 1434 aa43.31■■■■■ 4.52
LEMD1-210ENST00000629113 ALKQ9UM73 1620 aa43.3■■■■■ 4.52
LEMD1-210ENST00000629113 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP43.21■■■■■ 4.51
LEMD1-210ENST00000629113 ITGAEP38570 1179 aa43.16■■■■■ 4.5
LEMD1-210ENST00000629113 ADGRB3O60242 1522 aa43.15■■■■■ 4.5
LEMD1-210ENST00000629113 TET3O43151 1660 aa43.14■■■■■ 4.5
LEMD1-210ENST00000629113 SLC52A1Q9NWF4 448 aa43.14■■■■■ 4.5
LEMD1-210ENST00000629113 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP43.12■■■■■ 4.49
LEMD1-210ENST00000629113 UNC13BO14795 1591 aa43.12■■■■■ 4.49
LEMD1-210ENST00000629113 SLC26A8Q96RN1 970 aa43.11■■■■■ 4.49
LEMD1-210ENST00000629113 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP43.11■■■■■ 4.49
LEMD1-210ENST00000629113 ROCK1Q13464 1354 aa43.1■■■■■ 4.49
LEMD1-210ENST00000629113 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP43.1■■■■■ 4.49
LEMD1-210ENST00000629113 MYO5BQ9ULV0 1848 aa43.08■■■■■ 4.49
LEMD1-210ENST00000629113 GCC2Q8IWJ2 1684 aa43.06■■■■■ 4.48
LEMD1-210ENST00000629113 E9PCH4 1651 aa43.01■■■■■ 4.48
LEMD1-210ENST00000629113 SOCS7O14512 581 aa42.99■■■■■ 4.47
LEMD1-210ENST00000629113 KCNA6P17658 529 aa42.98■■■■■ 4.47
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