RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628306.2

CAPNS1-216, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,389 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-216ENST00000628306 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP38.34■■■■□ 3.73
CAPNS1-216ENST00000628306 SOCS7O14512 581 aa38.32■■■■□ 3.73
CAPNS1-216ENST00000628306 KIF3BO15066 747 aa38.32■■■■□ 3.73
CAPNS1-216ENST00000628306 PZPP20742 1482 aa38.32■■■■□ 3.73
CAPNS1-216ENST00000628306 KDM5DQ9BY66 1539 aa38.31■■■■□ 3.72
CAPNS1-216ENST00000628306 FAM135AQ9P2D6 1515 aa38.31■■■■□ 3.72
CAPNS1-216ENST00000628306 NEURL4Q96JN8 1562 aa38.31■■■■□ 3.72
CAPNS1-216ENST00000628306 TNRQ92752 1358 aa38.3■■■■□ 3.72
CAPNS1-216ENST00000628306 UBAP1LF5GYI3 381 aa38.27■■■■□ 3.72
CAPNS1-216ENST00000628306 ARHGEF5Q12774 1597 aa38.26■■■■□ 3.72
CAPNS1-216ENST00000628306 RSPH4AQ5TD94 716 aa38.24■■■■□ 3.71
CAPNS1-216ENST00000628306 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP38.24■■■■□ 3.71
CAPNS1-216ENST00000628306 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa38.17■■■■□ 3.7
CAPNS1-216ENST00000628306 MIA2Q96PC5 1412 aa38.16■■■■□ 3.7
CAPNS1-216ENST00000628306 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa38.15■■■■□ 3.7
CAPNS1-216ENST00000628306 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP38.13■■■■□ 3.69
CAPNS1-216ENST00000628306 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa38.12■■■■□ 3.69
CAPNS1-216ENST00000628306 NLRP1Q9C000 1473 aa38.12■■■■□ 3.69
CAPNS1-216ENST00000628306 SHANK2Q9UPX8 1470 aa38.12■■■■□ 3.69
CAPNS1-216ENST00000628306 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP38.12■■■■□ 3.69
CAPNS1-216ENST00000628306 CPS1P31327 1500 aa38.1■■■■□ 3.69
CAPNS1-216ENST00000628306 VWDEQ8N2E2 1590 aa38.1■■■■□ 3.69
CAPNS1-216ENST00000628306 MAST1Q9Y2H9 1570 aa38.1■■■■□ 3.69
CAPNS1-216ENST00000628306 MED14O60244 1454 aa38.07■■■■□ 3.69
CAPNS1-216ENST00000628306 UGGT1Q9NYU2 1555 aa38.07■■■■□ 3.69
CAPNS1-216ENST00000628306 ABCC3O15438 1527 aa38.07■■■■□ 3.68
CAPNS1-216ENST00000628306 VPS8Q8N3P4 1428 aa38.07■■■■□ 3.68
CAPNS1-216ENST00000628306 TSPY4P0CV99 314 aa38.06■■■■□ 3.68
CAPNS1-216ENST00000628306 TSPY10P0CW01 314 aa38.06■■■■□ 3.68
CAPNS1-216ENST00000628306 DEPDC5O75140 1603 aa38.05■■■■□ 3.68
CAPNS1-216ENST00000628306 ANKLE2Q86XL3 938 aa38.05■■■■□ 3.68
CAPNS1-216ENST00000628306 MROH1Q8NDA8 1641 aa38.04■■■■□ 3.68
CAPNS1-216ENST00000628306 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP38.03■■■■□ 3.68
CAPNS1-216ENST00000628306 ALKQ9UM73 1620 aa38.01■■■■□ 3.67
CAPNS1-216ENST00000628306 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP38.01■■■■□ 3.67
CAPNS1-216ENST00000628306 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP38■■■■□ 3.67
CAPNS1-216ENST00000628306 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP37.99■■■■□ 3.67
CAPNS1-216ENST00000628306 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP37.99■■■■□ 3.67
CAPNS1-216ENST00000628306 HSPA1LP34931 641 aa37.98■■■■□ 3.67
CAPNS1-216ENST00000628306 ERVK-7P63135 1459 aa37.96■■■■□ 3.67
CAPNS1-216ENST00000628306 MAP3K1Q13233 1512 aa37.95■■■■□ 3.67
CAPNS1-216ENST00000628306 IQGAP1P46940 1657 aa37.93■■■■□ 3.66
CAPNS1-216ENST00000628306 STRCP1A6NGW2 1772 aa37.92■■■■□ 3.66
CAPNS1-216ENST00000628306 PIP4K2BP78356 416 aa37.92■■■■□ 3.66
CAPNS1-216ENST00000628306 MYOM3Q5VTT5 1437 aa37.91■■■■□ 3.66
CAPNS1-216ENST00000628306 TOM1O60784 492 aa37.91■■■■□ 3.66
CAPNS1-216ENST00000628306 CEP152O94986 1710 aa37.87■■■■□ 3.65
CAPNS1-216ENST00000628306 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP37.86■■■■□ 3.65
CAPNS1-216ENST00000628306 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP37.86■■■■□ 3.65
CAPNS1-216ENST00000628306 UBR1Q8IWV7 1749 aa37.83■■■■□ 3.65
CAPNS1-216ENST00000628306 DUOX2Q9NRD8 1548 aa37.83■■■■□ 3.65
CAPNS1-216ENST00000628306 LRRC7Q96NW7 1537 aa37.82■■■■□ 3.64
CAPNS1-216ENST00000628306 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP37.78■■■■□ 3.64
CAPNS1-216ENST00000628306 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP37.77■■■■□ 3.64
CAPNS1-216ENST00000628306 ABCC5O15440 1437 aa37.76■■■■□ 3.63
CAPNS1-216ENST00000628306 ARHGAP23Q9P227 1491 aa37.75■■■■□ 3.63
CAPNS1-216ENST00000628306 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa37.75■■■■□ 3.63
CAPNS1-216ENST00000628306 CROCC2H7BZ55 1655 aa37.73■■■■□ 3.63
CAPNS1-216ENST00000628306 SYNMO15061 1565 aa37.73■■■■□ 3.63
CAPNS1-216ENST00000628306 SLIT1O75093 1534 aa37.72■■■■□ 3.63
CAPNS1-216ENST00000628306 KIF15Q9NS87 1388 aa37.72■■■■□ 3.63
CAPNS1-216ENST00000628306 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP37.72■■■■□ 3.63
CAPNS1-216ENST00000628306 LTKP29376 864 aa37.7■■■■□ 3.63
CAPNS1-216ENST00000628306 ERBINQ96RT1 1412 aa37.69■■■■□ 3.62
CAPNS1-216ENST00000628306 PTPN23Q9H3S7 1636 aa37.66■■■■□ 3.62
CAPNS1-216ENST00000628306 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa37.64■■■■□ 3.62
CAPNS1-216ENST00000628306 DAPK1P53355 1430 aa37.61■■■■□ 3.61
CAPNS1-216ENST00000628306 PIK3C2BO00750 1634 aa37.6■■■■□ 3.61
CAPNS1-216ENST00000628306 TXNDC2Q86VQ3 553 aa37.59■■■■□ 3.61
CAPNS1-216ENST00000628306 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP37.59■■■■□ 3.61
CAPNS1-216ENST00000628306 FGD6Q6ZV73 1430 aa37.54■■■■□ 3.6
CAPNS1-216ENST00000628306 LMTK2Q8IWU2 1503 aa37.54■■■■□ 3.6
CAPNS1-216ENST00000628306 TMEM2Q9UHN6 1383 aa37.53■■■■□ 3.6
CAPNS1-216ENST00000628306 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP37.52■■■■□ 3.6
CAPNS1-216ENST00000628306 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP37.49■■■■□ 3.59
CAPNS1-216ENST00000628306 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP37.47■■■■□ 3.59
CAPNS1-216ENST00000628306 IDI1Q13907 227 aa37.45■■■■□ 3.59
CAPNS1-216ENST00000628306 EFCAB6Q5THR3 1501 aa37.45■■■■□ 3.58
CAPNS1-216ENST00000628306 EID1Q9Y6B2 187 aa37.44■■■■□ 3.58
CAPNS1-216ENST00000628306 NOS1P29475 1434 aa37.43■■■■□ 3.58
CAPNS1-216ENST00000628306 KANK1Q14678 1352 aa37.43■■■■□ 3.58
CAPNS1-216ENST00000628306 TET3O43151 1660 aa37.42■■■■□ 3.58
CAPNS1-216ENST00000628306 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa37.42■■■■□ 3.58
CAPNS1-216ENST00000628306 CHIC2Q9UKJ5 165 aa37.42■■■■□ 3.58
CAPNS1-216ENST00000628306 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP37.39■■■■□ 3.58
CAPNS1-216ENST00000628306 ADGRL2O95490 1459 aa37.36■■■■□ 3.57
CAPNS1-216ENST00000628306 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP37.34■■■■□ 3.57
CAPNS1-216ENST00000628306 FAM135BQ49AJ0 1406 aa37.33■■■■□ 3.57
CAPNS1-216ENST00000628306 TMEM94Q12767 1356 aa37.33■■■■□ 3.57
CAPNS1-216ENST00000628306 ADGRB3O60242 1522 aa37.33■■■■□ 3.57
CAPNS1-216ENST00000628306 APLP2Q06481 763 aa37.32■■■■□ 3.57
CAPNS1-216ENST00000628306 STAG3Q9UJ98 1225 aa37.32■■■■□ 3.57
CAPNS1-216ENST00000628306 KCNA6P17658 529 aa37.3■■■■□ 3.56
CAPNS1-216ENST00000628306 SLC26A8Q96RN1 970 aa37.29■■■■□ 3.56
CAPNS1-216ENST00000628306 NWD1Q149M9 1564 aa37.27■■■■□ 3.56
CAPNS1-216ENST00000628306 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP37.23■■■■□ 3.55
CAPNS1-216ENST00000628306 SLC52A1Q9NWF4 448 aa37.22■■■■□ 3.55
CAPNS1-216ENST00000628306 ZFYVE9O95405 1425 aa37.21■■■■□ 3.55
CAPNS1-216ENST00000628306 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP37.21■■■■□ 3.55
CAPNS1-216ENST00000628306 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP37.2■■■■□ 3.55
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