RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000626667.1

PCAT5-201, prostate cancer associated transcript 5, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PCAT5, Length 3,550 nt, Biotype lincRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCAT5-201ENST00000626667 REREQ9P2R6 1566 aa10.43□□□□□ -0.74
PCAT5-201ENST00000626667 PLA2R1Q13018 1463 aa10.43□□□□□ -0.74
PCAT5-201ENST00000626667 PLB1Q6P1J6 1458 aa10.43□□□□□ -0.74
PCAT5-201ENST00000626667 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa10.41□□□□□ -0.74
PCAT5-201ENST00000626667 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP10.4□□□□□ -0.74
PCAT5-201ENST00000626667 ABCB7O75027 752 aa10.4□□□□□ -0.74
PCAT5-201ENST00000626667 ERCC6Q03468 1493 aa10.4□□□□□ -0.75
PCAT5-201ENST00000626667 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP10.39□□□□□ -0.75
PCAT5-201ENST00000626667 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP10.39□□□□□ -0.75
PCAT5-201ENST00000626667 GLI2P10070 1586 aa10.39□□□□□ -0.75
PCAT5-201ENST00000626667 RALGAPBQ86X10 1494 aa10.39□□□□□ -0.75
PCAT5-201ENST00000626667 TRPM2O94759 1503 aa10.39□□□□□ -0.75
PCAT5-201ENST00000626667 SYNMO15061 1565 aa10.38□□□□□ -0.75
PCAT5-201ENST00000626667 PTPRTO14522 1441 aa10.36□□□□□ -0.75
PCAT5-201ENST00000626667 FBLN2P98095 1184 aa10.36□□□□□ -0.75
PCAT5-201ENST00000626667 CFAP74Q9C0B2 1584 aa10.36□□□□□ -0.75
PCAT5-201ENST00000626667 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa10.35□□□□□ -0.75
PCAT5-201ENST00000626667 CLTCL1P53675 1640 aa10.35□□□□□ -0.75
PCAT5-201ENST00000626667 GPRASP1Q5JY77 1395 aa10.34□□□□□ -0.75
PCAT5-201ENST00000626667 HECW2Q9P2P5 1572 aa10.34□□□□□ -0.75
PCAT5-201ENST00000626667 FAM135AQ9P2D6 1515 aa10.34□□□□□ -0.75
PCAT5-201ENST00000626667 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa10.34□□□□□ -0.75
PCAT5-201ENST00000626667 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa10.33□□□□□ -0.76
PCAT5-201ENST00000626667 SHPRHQ149N8 1683 aa10.33□□□□□ -0.76
PCAT5-201ENST00000626667 USP54Q70EL1 1684 aa10.32□□□□□ -0.76
PCAT5-201ENST00000626667 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP10.31□□□□□ -0.76
PCAT5-201ENST00000626667 INSRP06213 1382 aa10.31□□□□□ -0.76
PCAT5-201ENST00000626667 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa10.3□□□□□ -0.76
PCAT5-201ENST00000626667 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa10.3□□□□□ -0.76
PCAT5-201ENST00000626667 ERBINQ96RT1 1412 aa10.3□□□□□ -0.76
PCAT5-201ENST00000626667 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP10.29□□□□□ -0.76
PCAT5-201ENST00000626667 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP10.29□□□□□ -0.76
PCAT5-201ENST00000626667 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP10.29□□□□□ -0.76
PCAT5-201ENST00000626667 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP10.29□□□□□ -0.76
PCAT5-201ENST00000626667 CCDC141Q6ZP82 1450 aa10.28□□□□□ -0.76
PCAT5-201ENST00000626667 ADGRB3O60242 1522 aa10.28□□□□□ -0.76
PCAT5-201ENST00000626667 SYCP2Q9BX26 1530 aa10.28□□□□□ -0.76
PCAT5-201ENST00000626667 PROM2Q8N271 834 aa10.27□□□□□ -0.77
PCAT5-201ENST00000626667 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP10.27□□□□□ -0.77
PCAT5-201ENST00000626667 EFCAB6Q5THR3 1501 aa10.27□□□□□ -0.77
PCAT5-201ENST00000626667 KIF13AQ9H1H9 1805 aa10.26□□□□□ -0.77
PCAT5-201ENST00000626667 UBTFP17480 764 aaKnown RBP10.26□□□□□ -0.77
PCAT5-201ENST00000626667 KNDC1Q76NI1 1749 aa10.25□□□□□ -0.77
PCAT5-201ENST00000626667 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP10.25□□□□□ -0.77
PCAT5-201ENST00000626667 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa10.23□□□□□ -0.77
PCAT5-201ENST00000626667 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa10.23□□□□□ -0.77
PCAT5-201ENST00000626667 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa10.23□□□□□ -0.77
PCAT5-201ENST00000626667 MYOM2P54296 1465 aa10.23□□□□□ -0.77
PCAT5-201ENST00000626667 ADGRB1O14514 1584 aa10.23□□□□□ -0.77
PCAT5-201ENST00000626667 PLCH2O75038 1416 aa10.22□□□□□ -0.77
PCAT5-201ENST00000626667 UGGT1Q9NYU2 1555 aa10.21□□□□□ -0.77
PCAT5-201ENST00000626667 KIF1BO60333 1816 aa10.21□□□□□ -0.77
PCAT5-201ENST00000626667 FKBP8Q14318 412 aa10.21□□□□□ -0.78
PCAT5-201ENST00000626667 ABCC3O15438 1527 aa10.21□□□□□ -0.78
PCAT5-201ENST00000626667 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa10.2□□□□□ -0.78
PCAT5-201ENST00000626667 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP10.2□□□□□ -0.78
PCAT5-201ENST00000626667 MYO5BQ9ULV0 1848 aa10.2□□□□□ -0.78
PCAT5-201ENST00000626667 A2MP01023 1474 aa10.2□□□□□ -0.78
PCAT5-201ENST00000626667 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa10.2□□□□□ -0.78
PCAT5-201ENST00000626667 SCAPERQ9BY12 1400 aa10.19□□□□□ -0.78
PCAT5-201ENST00000626667 SPDYE2BA6NHP3 402 aa10.19□□□□□ -0.78
PCAT5-201ENST00000626667 SPDYE6P0CI01 402 aa10.19□□□□□ -0.78
PCAT5-201ENST00000626667 SPDYE2Q495Y8 402 aa10.19□□□□□ -0.78
PCAT5-201ENST00000626667 SSUH2Q9Y2M2 353 aa10.19□□□□□ -0.78
PCAT5-201ENST00000626667 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa10.18□□□□□ -0.78
PCAT5-201ENST00000626667 C9orf84Q5VXU9 1444 aa10.17□□□□□ -0.78
PCAT5-201ENST00000626667 NEUROD1Q13562 356 aa10.17□□□□□ -0.78
PCAT5-201ENST00000626667 PRAG1Q86YV5 1406 aa10.17□□□□□ -0.78
PCAT5-201ENST00000626667 ATP7AQ04656 1500 aa10.16□□□□□ -0.78
PCAT5-201ENST00000626667 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa10.16□□□□□ -0.78
PCAT5-201ENST00000626667 FANCAO15360 1455 aa10.16□□□□□ -0.78
PCAT5-201ENST00000626667 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP10.16□□□□□ -0.78
PCAT5-201ENST00000626667 RNF123Q5XPI4 1314 aa10.15□□□□□ -0.78
PCAT5-201ENST00000626667 PREX1Q8TCU6 1659 aa10.15□□□□□ -0.78
PCAT5-201ENST00000626667 NRKQ7Z2Y5 1582 aa10.15□□□□□ -0.78
PCAT5-201ENST00000626667 CNTLNQ9NXG0 1405 aa10.15□□□□□ -0.79
PCAT5-201ENST00000626667 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP10.15□□□□□ -0.79
PCAT5-201ENST00000626667 SPDYE4A6NLX3 237 aa10.15□□□□□ -0.79
PCAT5-201ENST00000626667 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP10.14□□□□□ -0.79
PCAT5-201ENST00000626667 OSCARQ8IYS5 282 aa10.14□□□□□ -0.79
PCAT5-201ENST00000626667 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa10.13□□□□□ -0.79
PCAT5-201ENST00000626667 MLH3Q9UHC1 1453 aa10.13□□□□□ -0.79
PCAT5-201ENST00000626667 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP10.13□□□□□ -0.79
PCAT5-201ENST00000626667 NALCNQ8IZF0 1738 aa10.12□□□□□ -0.79
PCAT5-201ENST00000626667 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa10.12□□□□□ -0.79
PCAT5-201ENST00000626667 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa10.12□□□□□ -0.79
PCAT5-201ENST00000626667 DIP2BQ9P265 1576 aa10.11□□□□□ -0.79
PCAT5-201ENST00000626667 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa10.11□□□□□ -0.79
PCAT5-201ENST00000626667 MIER1Q8N108 512 aa10.11□□□□□ -0.79
PCAT5-201ENST00000626667 ADGRB2O60241 1585 aa10.1□□□□□ -0.79
PCAT5-201ENST00000626667 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP10.1□□□□□ -0.79
PCAT5-201ENST00000626667 QRICH2Q9H0J4 1663 aa10.1□□□□□ -0.79
PCAT5-201ENST00000626667 AKAP12Q02952 1782 aa10.1□□□□□ -0.79
PCAT5-201ENST00000626667 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP10.09□□□□□ -0.79
PCAT5-201ENST00000626667 MTUS2Q5JR59 1369 aa10.09□□□□□ -0.79
PCAT5-201ENST00000626667 CCER2I3L3R5 266 aa10.09□□□□□ -0.79
PCAT5-201ENST00000626667 AGLP35573 1532 aa10.08□□□□□ -0.8
PCAT5-201ENST00000626667 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa10.07□□□□□ -0.8
PCAT5-201ENST00000626667 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa10.06□□□□□ -0.8
PCAT5-201ENST00000626667 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP10.06□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.9 ms