RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000624145.3

ANKRD28-215, Transcript of ankyrin repeat domain 28, human

TSL 2 BASIC

Gene ANKRD28, Length 6,383 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ANKRD28-215	ENST00000624145	SAFB2	Q14151	953 aa	Known RBP eCLIP	4.99	□□□□□ -1.61
ANKRD28-215	ENST00000624145	MLEC	Q14165	292 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ANKRD28-215	ENST00000624145	HSP90AA2P	Q14568	343 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
ANKRD28-215	ENST00000624145	CCDC191	Q8NCU4	936 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ANKRD28-215	ENST00000624145	NOM1	Q5C9Z4	860 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
ANKRD28-215	ENST00000624145	CLIP1	P30622	1438 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ANKRD28-215	ENST00000624145	RDX	P35241	583 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
ANKRD28-215	ENST00000624145	ATP6V1D	Q9Y5K8	247 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ANKRD28-215	ENST00000624145	ACBD3	Q9H3P7	528 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ANKRD28-215	ENST00000624145	TRIM29	Q14134	588 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ANKRD28-215	ENST00000624145	DCTN1	Q14203	1278 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ANKRD28-215	ENST00000624145	R3HCC1	Q9Y3T6	440 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
ANKRD28-215	ENST00000624145	KTN1	Q86UP2	1357 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
ANKRD28-215	ENST00000624145	ZCCHC6	Q5VYS8	1495 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
ANKRD28-215	ENST00000624145	DDX11L8	A8MPP1	907 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ANKRD28-215	ENST00000624145	U2AF1L5	P0DN76	240 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
ANKRD28-215	ENST00000624145	U2AF1	Q01081	240 aa	Known RBP eCLIP	4.97	□□□□□ -1.61	1e-6	■■■■□ 24.5
ANKRD28-215	ENST00000624145	CPLX2	Q6PUV4	134 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
ANKRD28-215	ENST00000624145	MAP7D2	Q96T17	732 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ANKRD28-215	ENST00000624145	HOOK1	Q9UJC3	728 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
ANKRD28-215	ENST00000624145	LRRFIP1	Q32MZ4	808 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
ANKRD28-215	ENST00000624145	FOXD4L1	Q9NU39	408 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ANKRD28-215	ENST00000624145	SLC4A10	Q6U841	1118 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ANKRD28-215	ENST00000624145	ZNF592	Q92610	1267 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ANKRD28-215	ENST00000624145	PAF1	Q8N7H5	531 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ANKRD28-215	ENST00000624145	DHX16	O60231	1041 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
ANKRD28-215	ENST00000624145	DCAF11	Q8TEB1	546 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ANKRD28-215	ENST00000624145	CCDC173	Q0VFZ6	552 aa		4.96	□□□□□ -1.61
ANKRD28-215	ENST00000624145	SMC4	Q9NTJ3	1288 aa		4.96	□□□□□ -1.61
ANKRD28-215	ENST00000624145	HSP90AB2P	Q58FF8	381 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ANKRD28-215	ENST00000624145	FOXD4L5	Q5VV16	416 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
ANKRD28-215	ENST00000624145	FOXD4L4	Q8WXT5	416 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
ANKRD28-215	ENST00000624145	STK26	Q9P289	416 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ANKRD28-215	ENST00000624145	NAP1L1	P55209	391 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
ANKRD28-215	ENST00000624145	LMOD3	Q0VAK6	560 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ANKRD28-215	ENST00000624145	ZRSR2	Q15696	482 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
ANKRD28-215	ENST00000624145	MSH5	O43196	834 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ANKRD28-215	ENST00000624145	MCTP1	Q6DN14	999 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ANKRD28-215	ENST00000624145	HOMER1	Q86YM7	354 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ANKRD28-215	ENST00000624145	MYO6	Q9UM54	1294 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ANKRD28-215	ENST00000624145	ZFYVE27	Q5T4F4	411 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ANKRD28-215	ENST00000624145	ARGLU1	Q9NWB6	273 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
ANKRD28-215	ENST00000624145	RSPH6A	Q9H0K4	717 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ANKRD28-215	ENST00000624145	SKOR2	Q2VWA4	1001 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
ANKRD28-215	ENST00000624145	HSP90B2P	Q58FF3	399 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ANKRD28-215	ENST00000624145	RCAN3	Q9UKA8	241 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ANKRD28-215	ENST00000624145	EPS15	P42566	896 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ANKRD28-215	ENST00000624145	WWC2	Q6AWC2	1192 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ANKRD28-215	ENST00000624145		H0YHG0	523 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ANKRD28-215	ENST00000624145	NEXN	Q0ZGT2	675 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ANKRD28-215	ENST00000624145	FBXW7	Q969H0	707 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ANKRD28-215	ENST00000624145	EIF3A	Q14152	1382 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
ANKRD28-215	ENST00000624145	CCNB3	Q8WWL7	1395 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ANKRD28-215	ENST00000624145	CPLX1	O14810	134 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ANKRD28-215	ENST00000624145	MNS1	Q8NEH6	495 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ANKRD28-215	ENST00000624145	RILPL2	Q969X0	211 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ANKRD28-215	ENST00000624145	DDX49	Q9Y6V7	483 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
ANKRD28-215	ENST00000624145	DCAF8L1	A6NGE4	600 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ANKRD28-215	ENST00000624145	ERICH2	A1L162	156 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ANKRD28-215	ENST00000624145	AMPH	P49418	695 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ANKRD28-215	ENST00000624145	OFD1	O75665	1012 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ANKRD28-215	ENST00000624145	DIAPH3	Q9NSV4	1193 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ANKRD28-215	ENST00000624145	VPS37D	Q86XT2	251 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ANKRD28-215	ENST00000624145	ERCC4	Q92889	916 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
ANKRD28-215	ENST00000624145	RBM19	Q9Y4C8	960 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
ANKRD28-215	ENST00000624145	SCRIB	Q14160	1630 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ANKRD28-215	ENST00000624145	TRDN	Q13061	729 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ANKRD28-215	ENST00000624145	ANKRD18A	Q8IVF6	992 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ANKRD28-215	ENST00000624145	VSIG10	Q8N0Z9	540 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ANKRD28-215	ENST00000624145	CAGE1	Q8TC20	777 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ANKRD28-215	ENST00000624145	RUFY2	Q8WXA3	655 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ANKRD28-215	ENST00000624145	CWC15	Q9P013	229 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
ANKRD28-215	ENST00000624145	TMEM132A	Q24JP5	1023 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ANKRD28-215	ENST00000624145	PLCD4	Q9BRC7	762 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ANKRD28-215	ENST00000624145	TERF2IP	Q9NYB0	399 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ANKRD28-215	ENST00000624145	APP	P05067	770 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ANKRD28-215	ENST00000624145	NFXL1	Q6ZNB6	911 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ANKRD28-215	ENST00000624145	NGDN	Q8NEJ9	315 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
ANKRD28-215	ENST00000624145	BICD2	Q8TD16	824 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ANKRD28-215	ENST00000624145	GOLGA3	Q08378	1498 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ANKRD28-215	ENST00000624145	CCER2	I3L3R5	266 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ANKRD28-215	ENST00000624145	ZKSCAN1	P17029	563 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
ANKRD28-215	ENST00000624145	CENPJ	Q9HC77	1338 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
ANKRD28-215	ENST00000624145	RALBP1	Q15311	655 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ANKRD28-215	ENST00000624145	C1orf141	Q5JVX7	400 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ANKRD28-215	ENST00000624145	SAFB	Q15424	915 aa	Known RBP eCLIP	4.91	□□□□□ -1.62
ANKRD28-215	ENST00000624145	IPO9	Q96P70	1041 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
ANKRD28-215	ENST00000624145	ANO2	Q9NQ90	1003 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ANKRD28-215	ENST00000624145	EID1	Q9Y6B2	187 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ANKRD28-215	ENST00000624145	NEFH	P12036	1026 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ANKRD28-215	ENST00000624145	FOXD4L6	Q3SYB3	417 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
ANKRD28-215	ENST00000624145	GGT6	Q6P531	493 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ANKRD28-215	ENST00000624145	SAMD1	Q6SPF0	538 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
ANKRD28-215	ENST00000624145	FOXD4L3	Q6VB84	417 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
ANKRD28-215	ENST00000624145	LTV1	Q96GA3	475 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
ANKRD28-215	ENST00000624145	SASS6	Q6UVJ0	657 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ANKRD28-215	ENST00000624145	BRMS1	Q9HCU9	246 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ANKRD28-215	ENST00000624145	SIN3A	Q96ST3	1273 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ANKRD28-215	ENST00000624145	RNF20	Q5VTR2	975 aa		4.9	□□□□□ -1.62
ANKRD28-215	ENST00000624145	CLUAP1	Q96AJ1	413 aa		4.9	□□□□□ -1.62

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 87.7 ms