RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000618673.4

SYTL1-211, Transcript of synaptotagmin like 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene SYTL1, Length 1,712 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYTL1-211ENST00000618673 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP29.55■■■□□ 2.32
SYTL1-211ENST00000618673 TEX14Q8IWB6 1497 aa29.55■■■□□ 2.32
SYTL1-211ENST00000618673 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP29.52■■■□□ 2.323e-9■■■□□ 16.3
SYTL1-211ENST00000618673 DEPDC5O75140 1603 aa29.52■■■□□ 2.32
SYTL1-211ENST00000618673 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP29.52■■■□□ 2.32
SYTL1-211ENST00000618673 RICTORQ6R327 1708 aa29.51■■■□□ 2.31
SYTL1-211ENST00000618673 A2MP01023 1474 aa29.49■■■□□ 2.31
SYTL1-211ENST00000618673 RAPGEF3O95398 923 aa29.48■■■□□ 2.31
SYTL1-211ENST00000618673 KIF13AQ9H1H9 1805 aa29.47■■■□□ 2.31
SYTL1-211ENST00000618673 TSPOAP1O95153 1857 aa29.44■■■□□ 2.3
SYTL1-211ENST00000618673 ABCA6Q8N139 1617 aa29.44■■■□□ 2.3
SYTL1-211ENST00000618673 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa29.43■■■□□ 2.3
SYTL1-211ENST00000618673 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP29.42■■■□□ 2.3
SYTL1-211ENST00000618673 KIF3BO15066 747 aa29.42■■■□□ 2.3
SYTL1-211ENST00000618673 KANK1Q14678 1352 aa29.42■■■□□ 2.3
SYTL1-211ENST00000618673 VWDEQ8N2E2 1590 aa29.41■■■□□ 2.3
SYTL1-211ENST00000618673 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa29.4■■■□□ 2.3
SYTL1-211ENST00000618673 L3MBTL2Q969R5 705 aa29.4■■■□□ 2.3
SYTL1-211ENST00000618673 MROH1Q8NDA8 1641 aa29.39■■■□□ 2.29
SYTL1-211ENST00000618673 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa29.38■■■□□ 2.29
SYTL1-211ENST00000618673 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP29.37■■■□□ 2.29
SYTL1-211ENST00000618673 BCORL1Q5H9F3 1711 aa29.36■■■□□ 2.29
SYTL1-211ENST00000618673 ATP10AO60312 1499 aa29.35■■■□□ 2.29
SYTL1-211ENST00000618673 TET3O43151 1660 aa29.34■■■□□ 2.29
SYTL1-211ENST00000618673 PLA2R1Q13018 1463 aa29.33■■■□□ 2.29
SYTL1-211ENST00000618673 CCDC144AA2RUR9 1427 aa29.32■■■□□ 2.28
SYTL1-211ENST00000618673 YEATS2Q9ULM3 1422 aa29.3■■■□□ 2.28
SYTL1-211ENST00000618673 E9PCH4 1651 aa29.29■■■□□ 2.28
SYTL1-211ENST00000618673 LMTK2Q8IWU2 1503 aa29.27■■■□□ 2.28
SYTL1-211ENST00000618673 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP29.25■■■□□ 2.27
SYTL1-211ENST00000618673 EFCAB6Q5THR3 1501 aa29.22■■■□□ 2.27
SYTL1-211ENST00000618673 PTPRTO14522 1441 aa29.22■■■□□ 2.27
SYTL1-211ENST00000618673 TRPM2O94759 1503 aa29.21■■■□□ 2.27
SYTL1-211ENST00000618673 REREQ9P2R6 1566 aa29.19■■■□□ 2.26
SYTL1-211ENST00000618673 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa29.18■■■□□ 2.26
SYTL1-211ENST00000618673 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP29.18■■■□□ 2.26
SYTL1-211ENST00000618673 GGT6Q6P531 493 aa29.17■■■□□ 2.26
SYTL1-211ENST00000618673 CEP152O94986 1710 aa29.16■■■□□ 2.26
SYTL1-211ENST00000618673 NBPF8Q3BBV2 869 aa29.15■■■□□ 2.26
SYTL1-211ENST00000618673 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa29.14■■■□□ 2.26
SYTL1-211ENST00000618673 ABCC3O15438 1527 aa29.14■■■□□ 2.26
SYTL1-211ENST00000618673 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa29.11■■■□□ 2.25
SYTL1-211ENST00000618673 AGLP35573 1532 aa29.1■■■□□ 2.25
SYTL1-211ENST00000618673 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa29.1■■■□□ 2.25
SYTL1-211ENST00000618673 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP29.09■■■□□ 2.25
SYTL1-211ENST00000618673 TRHP20396 242 aaPredicted RBP29.08■■■□□ 2.25
SYTL1-211ENST00000618673 CLTCL1P53675 1640 aa29.07■■■□□ 2.24
SYTL1-211ENST00000618673 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa29.07■■■□□ 2.24
SYTL1-211ENST00000618673 NPATQ14207 1427 aa29.06■■■□□ 2.24
SYTL1-211ENST00000618673 DCAF11Q8TEB1 546 aa29.06■■■□□ 2.24
SYTL1-211ENST00000618673 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa29.05■■■□□ 2.24
SYTL1-211ENST00000618673 NEURL4Q96JN8 1562 aa29.02■■■□□ 2.24
SYTL1-211ENST00000618673 RALGAPBQ86X10 1494 aa29.02■■■□□ 2.24
SYTL1-211ENST00000618673 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP29.02■■■□□ 2.242e-7■■□□□ 13.7
SYTL1-211ENST00000618673 RGL3Q3MIN7 710 aa29.02■■■□□ 2.24
SYTL1-211ENST00000618673 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP29.02■■■□□ 2.24
SYTL1-211ENST00000618673 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa29.01■■■□□ 2.23
SYTL1-211ENST00000618673 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa29■■■□□ 2.23
SYTL1-211ENST00000618673 CNTLNQ9NXG0 1405 aa28.99■■■□□ 2.23
SYTL1-211ENST00000618673 PRAG1Q86YV5 1406 aa28.98■■■□□ 2.23
SYTL1-211ENST00000618673 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP28.97■■■□□ 2.23
SYTL1-211ENST00000618673 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP28.97■■■□□ 2.23
SYTL1-211ENST00000618673 PPP6R1Q9UPN7 881 aa28.97■■■□□ 2.23
SYTL1-211ENST00000618673 UGGT1Q9NYU2 1555 aa28.94■■■□□ 2.22
SYTL1-211ENST00000618673 NOS1P29475 1434 aa28.93■■■□□ 2.22
SYTL1-211ENST00000618673 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa28.93■■■□□ 2.22
SYTL1-211ENST00000618673 STAC3Q96MF2 364 aa28.92■■■□□ 2.22
SYTL1-211ENST00000618673 KIF1BO60333 1816 aa28.89■■■□□ 2.22
SYTL1-211ENST00000618673 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa28.89■■■□□ 2.21
SYTL1-211ENST00000618673 USP47Q96K76 1375 aa28.86■■■□□ 2.21
SYTL1-211ENST00000618673 ADGRB3O60242 1522 aa28.86■■■□□ 2.21
SYTL1-211ENST00000618673 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP28.85■■■□□ 2.21
SYTL1-211ENST00000618673 CARD11Q9BXL7 1154 aa28.84■■■□□ 2.21
SYTL1-211ENST00000618673 SYNMO15061 1565 aa28.84■■■□□ 2.21
SYTL1-211ENST00000618673 PIK3C2BO00750 1634 aa28.83■■■□□ 2.21
SYTL1-211ENST00000618673 MADDQ8WXG6 1647 aa28.82■■■□□ 2.2
SYTL1-211ENST00000618673 GPRASP1Q5JY77 1395 aa28.82■■■□□ 2.2
SYTL1-211ENST00000618673 MROH2AA6NES4 1674 aa28.81■■■□□ 2.2
SYTL1-211ENST00000618673 PREX1Q8TCU6 1659 aa28.81■■■□□ 2.2
SYTL1-211ENST00000618673 MYOM2P54296 1465 aa28.8■■■□□ 2.2
SYTL1-211ENST00000618673 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP28.8■■■□□ 2.2
SYTL1-211ENST00000618673 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP28.8■■■□□ 2.2
SYTL1-211ENST00000618673 LAMC1P11047 1609 aa28.79■■■□□ 2.2
SYTL1-211ENST00000618673 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP28.77■■■□□ 2.2
SYTL1-211ENST00000618673 MLECQ14165 292 aa28.77■■■□□ 2.2
SYTL1-211ENST00000618673 MIER1Q8N108 512 aa28.77■■■□□ 2.2
SYTL1-211ENST00000618673 SLC52A1Q9NWF4 448 aa28.77■■■□□ 2.2
SYTL1-211ENST00000618673 IFT172Q9UG01 1749 aa28.76■■■□□ 2.19
SYTL1-211ENST00000618673 ERVK-7P63135 1459 aa28.75■■■□□ 2.19
SYTL1-211ENST00000618673 WASHC2AQ641Q2 1341 aa28.74■■■□□ 2.19
SYTL1-211ENST00000618673 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP28.73■■■□□ 2.19
SYTL1-211ENST00000618673 CHGAP10645 457 aaKnown RBP28.72■■■□□ 2.19
SYTL1-211ENST00000618673 NBPF1Q3BBV0 1214 aa28.72■■■□□ 2.19
SYTL1-211ENST00000618673 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa28.71■■■□□ 2.19
SYTL1-211ENST00000618673 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP28.71■■■□□ 2.19
SYTL1-211ENST00000618673 CCDC7Q96M83 1385 aa28.7■■■□□ 2.19
SYTL1-211ENST00000618673 NRXN1Q9ULB1 1477 aa28.69■■■□□ 2.18
SYTL1-211ENST00000618673 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa28.69■■■□□ 2.18
SYTL1-211ENST00000618673 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP28.69■■■□□ 2.18
SYTL1-211ENST00000618673 IDI1Q13907 227 aa28.69■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 7.8 ms