RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000612839.1

CCL3L3-201, Transcript of C-C motif chemokine ligand 3 like 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CCL3L3, Length 1,458 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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CCL3L3-201ENST00000612839 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP17.4■□□□□ 0.38
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CCL3L3-201ENST00000612839 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP17.38■□□□□ 0.37
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CCL3L3-201ENST00000612839 STRCQ7RTU9 1775 aa16.96■□□□□ 0.31
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CCL3L3-201ENST00000612839 UGGT1Q9NYU2 1555 aa16.95■□□□□ 0.3
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CCL3L3-201ENST00000612839 IDI1Q13907 227 aa16.91■□□□□ 0.3
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CCL3L3-201ENST00000612839 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP16.89■□□□□ 0.29
CCL3L3-201ENST00000612839 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP16.88■□□□□ 0.29
CCL3L3-201ENST00000612839 SLC52A1Q9NWF4 448 aa16.88■□□□□ 0.29
CCL3L3-201ENST00000612839 PTPRTO14522 1441 aa16.88■□□□□ 0.29
CCL3L3-201ENST00000612839 PKD2Q13563 968 aa16.87■□□□□ 0.29
CCL3L3-201ENST00000612839 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP16.87■□□□□ 0.29
CCL3L3-201ENST00000612839 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP16.86■□□□□ 0.29
CCL3L3-201ENST00000612839 ADGRB3O60242 1522 aa16.85■□□□□ 0.29
CCL3L3-201ENST00000612839 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa16.85■□□□□ 0.29
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