RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000610404.4

TTR-204, Transcript of transthyretin, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene TTR, Length 1,040 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTR-204ENST00000610404 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa14.96□□□□□ -0.01
TTR-204ENST00000610404 PLSCR2Q9NRY7 297 aa14.96□□□□□ -0.01
TTR-204ENST00000610404 NEO1Q92859 1461 aa14.95□□□□□ -0.02
TTR-204ENST00000610404 SAMD9Q5K651 1589 aa14.95□□□□□ -0.02
TTR-204ENST00000610404 FBXO41Q8TF61 875 aa14.95□□□□□ -0.02
TTR-204ENST00000610404 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa14.94□□□□□ -0.02
TTR-204ENST00000610404 BCORL1Q5H9F3 1711 aa14.93□□□□□ -0.02
TTR-204ENST00000610404 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
TTR-204ENST00000610404 MADDQ8WXG6 1647 aa14.92□□□□□ -0.02
TTR-204ENST00000610404 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
TTR-204ENST00000610404 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
TTR-204ENST00000610404 PCDH10Q9P2E7 1040 aa14.91□□□□□ -0.02
TTR-204ENST00000610404 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
TTR-204ENST00000610404 SLAIN1Q8ND83 568 aa14.9□□□□□ -0.02
TTR-204ENST00000610404 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
TTR-204ENST00000610404 LMTK3Q96Q04 1460 aa14.89□□□□□ -0.03
TTR-204ENST00000610404 GOLGA2Q08379 1002 aa14.88□□□□□ -0.03
TTR-204ENST00000610404 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
TTR-204ENST00000610404 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa14.87□□□□□ -0.03
TTR-204ENST00000610404 FHOD3Q2V2M9 1422 aa14.87□□□□□ -0.03
TTR-204ENST00000610404 PSEN1P49768 467 aa14.86□□□□□ -0.03
TTR-204ENST00000610404 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
TTR-204ENST00000610404 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
TTR-204ENST00000610404 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
TTR-204ENST00000610404 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
TTR-204ENST00000610404 RICTORQ6R327 1708 aa14.85□□□□□ -0.03
TTR-204ENST00000610404 AKNAQ7Z591 1439 aa14.83□□□□□ -0.03
TTR-204ENST00000610404 FANCAO15360 1455 aa14.82□□□□□ -0.04
TTR-204ENST00000610404 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa14.82□□□□□ -0.04
TTR-204ENST00000610404 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP14.82□□□□□ -0.04
TTR-204ENST00000610404 PLEKHD1A6NEE1 506 aa14.81□□□□□ -0.04
TTR-204ENST00000610404 HSPA2P54652 639 aa14.81□□□□□ -0.04
TTR-204ENST00000610404 PDAP1Q13442 181 aaKnown RBP14.81□□□□□ -0.04
TTR-204ENST00000610404 YEATS2Q9ULM3 1422 aa14.81□□□□□ -0.04
TTR-204ENST00000610404 TTC37Q6PGP7 1564 aa14.81□□□□□ -0.04
TTR-204ENST00000610404 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa14.8□□□□□ -0.04
TTR-204ENST00000610404 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP14.79□□□□□ -0.04
TTR-204ENST00000610404 CFAP74Q9C0B2 1584 aa14.78□□□□□ -0.04
TTR-204ENST00000610404 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa14.78□□□□□ -0.04
TTR-204ENST00000610404 PDCD7Q8N8D1 485 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
TTR-204ENST00000610404 EFCAB5A4FU69 1503 aa14.76□□□□□ -0.05
TTR-204ENST00000610404 POGZQ7Z3K3 1410 aa14.75□□□□□ -0.05
TTR-204ENST00000610404 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
TTR-204ENST00000610404 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP14.75□□□□□ -0.05
TTR-204ENST00000610404 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
TTR-204ENST00000610404 HECW1Q76N89 1606 aa14.74□□□□□ -0.05
TTR-204ENST00000610404 MAGI2Q86UL8 1455 aa14.74□□□□□ -0.05
TTR-204ENST00000610404 EEA1Q15075 1411 aa14.74□□□□□ -0.05
TTR-204ENST00000610404 MLECQ14165 292 aa14.73□□□□□ -0.05
TTR-204ENST00000610404 SCAPERQ9BY12 1400 aa14.72□□□□□ -0.05
TTR-204ENST00000610404 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa14.71□□□□□ -0.05
TTR-204ENST00000610404 ST18O60284 1047 aa14.71□□□□□ -0.05
TTR-204ENST00000610404 PLCH2O75038 1416 aa14.71□□□□□ -0.05
TTR-204ENST00000610404 SNPHO15079 494 aa14.7□□□□□ -0.06
TTR-204ENST00000610404 CERKQ8TCT0 537 aa14.69□□□□□ -0.06
TTR-204ENST00000610404 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa14.69□□□□□ -0.06
TTR-204ENST00000610404 C3orf67Q6ZVT6 689 aa14.68□□□□□ -0.06
TTR-204ENST00000610404 CABP2Q9NPB3 220 aa14.67□□□□□ -0.06
TTR-204ENST00000610404 ATP10AO60312 1499 aa14.67□□□□□ -0.06
TTR-204ENST00000610404 C9orf84Q5VXU9 1444 aa14.66□□□□□ -0.06
TTR-204ENST00000610404 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
TTR-204ENST00000610404 KIF14Q15058 1648 aa14.63□□□□□ -0.07
TTR-204ENST00000610404 PREX1Q8TCU6 1659 aa14.63□□□□□ -0.07
TTR-204ENST00000610404 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa14.63□□□□□ -0.07
TTR-204ENST00000610404 MYO5CQ9NQX4 1742 aa14.63□□□□□ -0.07
TTR-204ENST00000610404 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
TTR-204ENST00000610404 CDAN1Q8IWY9 1227 aa14.61□□□□□ -0.07
TTR-204ENST00000610404 TMEM121BQ9BXQ6 578 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
TTR-204ENST00000610404 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa14.6□□□□□ -0.07
TTR-204ENST00000610404 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa14.6□□□□□ -0.07
TTR-204ENST00000610404 STRCQ7RTU9 1775 aa14.6□□□□□ -0.07
TTR-204ENST00000610404 KDM5CP41229 1560 aa14.6□□□□□ -0.07
TTR-204ENST00000610404 FMN1Q68DA7 1419 aa14.59□□□□□ -0.07
TTR-204ENST00000610404 AFAP1Q8N556 730 aa14.59□□□□□ -0.07
TTR-204ENST00000610404 ARHGAP5Q13017 1502 aa14.58□□□□□ -0.08
TTR-204ENST00000610404 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa14.58□□□□□ -0.08
TTR-204ENST00000610404 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
TTR-204ENST00000610404 G3V3G9 751 aa14.56□□□□□ -0.08
TTR-204ENST00000610404 UBTFP17480 764 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
TTR-204ENST00000610404 DPY19L2Q6NUT2 758 aa14.56□□□□□ -0.08
TTR-204ENST00000610404 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
TTR-204ENST00000610404 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa14.56□□□□□ -0.08
TTR-204ENST00000610404 ABCA6Q8N139 1617 aa14.55□□□□□ -0.08
TTR-204ENST00000610404 REREQ9P2R6 1566 aa14.54□□□□□ -0.08
TTR-204ENST00000610404 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa14.54□□□□□ -0.08
TTR-204ENST00000610404 CLIP1P30622 1438 aa14.53□□□□□ -0.08
TTR-204ENST00000610404 ILDR2Q71H61 639 aa14.53□□□□□ -0.08
TTR-204ENST00000610404 MYT1LQ9UL68 1186 aa14.53□□□□□ -0.08
TTR-204ENST00000610404 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
TTR-204ENST00000610404 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa14.52□□□□□ -0.08
TTR-204ENST00000610404 C3P01024 1663 aa14.52□□□□□ -0.08
TTR-204ENST00000610404 MLH3Q9UHC1 1453 aa14.52□□□□□ -0.08
TTR-204ENST00000610404 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa14.52□□□□□ -0.08
TTR-204ENST00000610404 DISP3Q9P2K9 1392 aa14.52□□□□□ -0.08
TTR-204ENST00000610404 BOLA1Q9Y3E2 137 aa14.52□□□□□ -0.09
TTR-204ENST00000610404 ABCC1P33527 1531 aa14.51□□□□□ -0.09
TTR-204ENST00000610404 AGLP35573 1532 aa14.51□□□□□ -0.09
TTR-204ENST00000610404 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
TTR-204ENST00000610404 PTPRTO14522 1441 aa14.49□□□□□ -0.09
TTR-204ENST00000610404 EFCAB3Q8N7B9 438 aa14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 55.3 ms