RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000606892.1

TRAF3IP2-AS1-211, TRAF3IP2 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3

Gene TRAF3IP2-AS1, Length 730 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3IP2-AS1-211ENST00000606892 KCNH8Q96L42 1107 aa14.04□□□□□ -0.16
TRAF3IP2-AS1-211ENST00000606892 JPH4Q96JJ6 628 aa14.03□□□□□ -0.16
TRAF3IP2-AS1-211ENST00000606892 WDR70Q9NW82 654 aa14.01□□□□□ -0.17
TRAF3IP2-AS1-211ENST00000606892 MYT1LQ9UL68 1186 aa14.01□□□□□ -0.17
TRAF3IP2-AS1-211ENST00000606892 BCL2L12Q9HB09 334 aa13.99□□□□□ -0.17
TRAF3IP2-AS1-211ENST00000606892 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP13.98□□□□□ -0.17
TRAF3IP2-AS1-211ENST00000606892 TK2O00142 265 aa13.98□□□□□ -0.17
TRAF3IP2-AS1-211ENST00000606892 PSEN2P49810 448 aa13.98□□□□□ -0.17
TRAF3IP2-AS1-211ENST00000606892 DPYSL4O14531 572 aa13.97□□□□□ -0.17
TRAF3IP2-AS1-211ENST00000606892 ZDHHC16Q969W1 377 aa13.97□□□□□ -0.17
TRAF3IP2-AS1-211ENST00000606892 RNF166Q96A37 237 aaPredicted RBP13.97□□□□□ -0.17
TRAF3IP2-AS1-211ENST00000606892 KCNK17Q96T54 332 aa13.97□□□□□ -0.17
TRAF3IP2-AS1-211ENST00000606892 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa13.97□□□□□ -0.17
TRAF3IP2-AS1-211ENST00000606892 E2F4Q16254 413 aa13.96□□□□□ -0.17
TRAF3IP2-AS1-211ENST00000606892 ADGRD1Q6QNK2 874 aa13.96□□□□□ -0.17
TRAF3IP2-AS1-211ENST00000606892 DMRTA1Q5VZB9 504 aa13.94□□□□□ -0.18
TRAF3IP2-AS1-211ENST00000606892 PTPREP23469 700 aa13.93□□□□□ -0.18
TRAF3IP2-AS1-211ENST00000606892 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP13.92□□□□□ -0.18
TRAF3IP2-AS1-211ENST00000606892 PDS5BQ9NTI5 1447 aa13.92□□□□□ -0.18
TRAF3IP2-AS1-211ENST00000606892 PHF14O94880 888 aa13.92□□□□□ -0.18
TRAF3IP2-AS1-211ENST00000606892 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP13.91□□□□□ -0.18
TRAF3IP2-AS1-211ENST00000606892 FBXW7Q969H0 707 aa13.91□□□□□ -0.18
TRAF3IP2-AS1-211ENST00000606892 PCDHGA10Q9Y5H3 936 aa13.91□□□□□ -0.18
TRAF3IP2-AS1-211ENST00000606892 ADAM33Q9BZ11 813 aa13.9□□□□□ -0.18
TRAF3IP2-AS1-211ENST00000606892 ARIH1Q9Y4X5 557 aaPredicted RBP13.9□□□□□ -0.18
TRAF3IP2-AS1-211ENST00000606892 CADPSQ9ULU8 1353 aa13.9□□□□□ -0.18
TRAF3IP2-AS1-211ENST00000606892 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa13.89□□□□□ -0.19
TRAF3IP2-AS1-211ENST00000606892 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP13.88□□□□□ -0.19
TRAF3IP2-AS1-211ENST00000606892 TYW1BQ6NUM6 668 aa13.88□□□□□ -0.19
TRAF3IP2-AS1-211ENST00000606892 PDIA6Q15084 440 aa13.87□□□□□ -0.19
TRAF3IP2-AS1-211ENST00000606892 EPAS1Q99814 870 aa13.87□□□□□ -0.19
TRAF3IP2-AS1-211ENST00000606892 SLC4A5Q9BY07 1137 aa13.87□□□□□ -0.19
TRAF3IP2-AS1-211ENST00000606892 HRO43593 1189 aa13.85□□□□□ -0.19
TRAF3IP2-AS1-211ENST00000606892 VPS9D1Q9Y2B5 631 aa13.85□□□□□ -0.19
TRAF3IP2-AS1-211ENST00000606892 STAC3Q96MF2 364 aa13.83□□□□□ -0.2
TRAF3IP2-AS1-211ENST00000606892 PRDM2Q13029 1718 aa13.81□□□□□ -0.2
TRAF3IP2-AS1-211ENST00000606892 MRC2Q9UBG0 1479 aa13.81□□□□□ -0.2
TRAF3IP2-AS1-211ENST00000606892 CFTRP13569 1480 aa13.8□□□□□ -0.2
TRAF3IP2-AS1-211ENST00000606892 WDR62O43379 1518 aa13.8□□□□□ -0.2
TRAF3IP2-AS1-211ENST00000606892 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa13.8□□□□□ -0.2
TRAF3IP2-AS1-211ENST00000606892 DDX12PQ92771 950 aa13.8□□□□□ -0.2
TRAF3IP2-AS1-211ENST00000606892 ZBED2Q9BTP6 218 aa13.8□□□□□ -0.2
TRAF3IP2-AS1-211ENST00000606892 PLCB2Q00722 1185 aa13.79□□□□□ -0.2
TRAF3IP2-AS1-211ENST00000606892 CEP164Q9UPV0 1460 aa13.79□□□□□ -0.2
TRAF3IP2-AS1-211ENST00000606892 FANCD2Q9BXW9 1451 aa13.76□□□□□ -0.21
TRAF3IP2-AS1-211ENST00000606892 C6orf132Q5T0Z8 1188 aa13.75□□□□□ -0.21
TRAF3IP2-AS1-211ENST00000606892 NBR1Q14596 966 aa13.74□□□□□ -0.21
TRAF3IP2-AS1-211ENST00000606892 BHMG1C9JSJ3 638 aaPredicted RBP13.73□□□□□ -0.21
TRAF3IP2-AS1-211ENST00000606892 COL9A1P20849 921 aa13.72□□□□□ -0.21
TRAF3IP2-AS1-211ENST00000606892 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP13.71□□□□□ -0.21
TRAF3IP2-AS1-211ENST00000606892 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP13.71□□□□□ -0.21
TRAF3IP2-AS1-211ENST00000606892 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP13.71□□□□□ -0.21
TRAF3IP2-AS1-211ENST00000606892 NBPF3Q9H094 633 aa13.71□□□□□ -0.21
TRAF3IP2-AS1-211ENST00000606892 HCSTQ9UBK5 93 aa13.71□□□□□ -0.21
TRAF3IP2-AS1-211ENST00000606892 CCDC88BA6NC98 1476 aa13.68□□□□□ -0.22
TRAF3IP2-AS1-211ENST00000606892 MAP3K7O43318 606 aa13.68□□□□□ -0.22
TRAF3IP2-AS1-211ENST00000606892 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP13.68□□□□□ -0.22
TRAF3IP2-AS1-211ENST00000606892 RABGEF1Q9UJ41 708 aa13.68□□□□□ -0.22
TRAF3IP2-AS1-211ENST00000606892 GRXCR2A6NFK2 248 aa13.67□□□□□ -0.22
TRAF3IP2-AS1-211ENST00000606892 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP13.67□□□□□ -0.22
TRAF3IP2-AS1-211ENST00000606892 PROX2Q3B8N5 592 aa13.66□□□□□ -0.22
TRAF3IP2-AS1-211ENST00000606892 KCTD12Q96CX2 325 aaKnown RBP13.66□□□□□ -0.22
TRAF3IP2-AS1-211ENST00000606892 GOLGA8CPA6NN73 597 aa13.65□□□□□ -0.22
TRAF3IP2-AS1-211ENST00000606892 P3H3Q8IVL6 736 aa13.65□□□□□ -0.22
TRAF3IP2-AS1-211ENST00000606892 KCNV2Q8TDN2 545 aa13.65□□□□□ -0.22
TRAF3IP2-AS1-211ENST00000606892 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP13.64□□□□□ -0.23
TRAF3IP2-AS1-211ENST00000606892 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP13.62□□□□□ -0.23
TRAF3IP2-AS1-211ENST00000606892 OSBPP22059 807 aa13.61□□□□□ -0.23
TRAF3IP2-AS1-211ENST00000606892 CERKQ8TCT0 537 aa13.61□□□□□ -0.23
TRAF3IP2-AS1-211ENST00000606892 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa13.6□□□□□ -0.23
TRAF3IP2-AS1-211ENST00000606892 LAPTM4BQ86VI4 370 aa13.6□□□□□ -0.23
TRAF3IP2-AS1-211ENST00000606892 KIAA1468Q9P260 1216 aa13.6□□□□□ -0.23
TRAF3IP2-AS1-211ENST00000606892 WNT2BQ93097 391 aa13.58□□□□□ -0.24
TRAF3IP2-AS1-211ENST00000606892 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP13.57□□□□□ -0.24
TRAF3IP2-AS1-211ENST00000606892 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP13.56□□□□□ -0.24
TRAF3IP2-AS1-211ENST00000606892 THSD4Q6ZMP0 1018 aa13.55□□□□□ -0.24
TRAF3IP2-AS1-211ENST00000606892 PACS2Q86VP3 889 aa13.55□□□□□ -0.24
TRAF3IP2-AS1-211ENST00000606892 ABCC8Q09428 1581 aa13.54□□□□□ -0.24
TRAF3IP2-AS1-211ENST00000606892 ANKK1Q8NFD2 765 aa13.53□□□□□ -0.24
TRAF3IP2-AS1-211ENST00000606892 TOPBP1Q92547 1522 aa13.53□□□□□ -0.24
TRAF3IP2-AS1-211ENST00000606892 PTPN5P54829 565 aa13.52□□□□□ -0.25
TRAF3IP2-AS1-211ENST00000606892 PRSS12P56730 875 aa13.52□□□□□ -0.25
TRAF3IP2-AS1-211ENST00000606892 DNMBPQ6XZF7 1577 aa13.52□□□□□ -0.25
TRAF3IP2-AS1-211ENST00000606892 CDCA7LQ96GN5 454 aa13.51□□□□□ -0.25
TRAF3IP2-AS1-211ENST00000606892 TSKSQ9UJT2 592 aa13.51□□□□□ -0.25
TRAF3IP2-AS1-211ENST00000606892 IFT140Q96RY7 1462 aa13.5□□□□□ -0.25
TRAF3IP2-AS1-211ENST00000606892 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP13.5□□□□□ -0.25
TRAF3IP2-AS1-211ENST00000606892 MLLT3P42568 568 aaPredicted RBP13.49□□□□□ -0.25
TRAF3IP2-AS1-211ENST00000606892 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP13.49□□□□□ -0.25
TRAF3IP2-AS1-211ENST00000606892 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP13.48□□□□□ -0.25
TRAF3IP2-AS1-211ENST00000606892 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP13.48□□□□□ -0.25
TRAF3IP2-AS1-211ENST00000606892 CDHR5Q9HBB8 845 aa13.47□□□□□ -0.25
TRAF3IP2-AS1-211ENST00000606892 PLA2G2EQ9NZK7 142 aa13.47□□□□□ -0.25
TRAF3IP2-AS1-211ENST00000606892 SOWAHBA6NEL2 793 aa13.44□□□□□ -0.26
TRAF3IP2-AS1-211ENST00000606892 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP13.44□□□□□ -0.26
TRAF3IP2-AS1-211ENST00000606892 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP13.43□□□□□ -0.26
TRAF3IP2-AS1-211ENST00000606892 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP13.42□□□□□ -0.26
TRAF3IP2-AS1-211ENST00000606892 NBPF26B4DH59 902 aa13.42□□□□□ -0.26
TRAF3IP2-AS1-211ENST00000606892 NPDC1Q9NQX5 325 aaPredicted RBP13.42□□□□□ -0.26
TRAF3IP2-AS1-211ENST00000606892 SEMA3EO15041 775 aa13.41□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.4 ms