RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000606213.5

PTPRN-219, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type N, humanhuman

TSL 4

Gene PTPRN, Length 592 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRN-219ENST00000606213 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa36.13■■■■□ 3.37
PTPRN-219ENST00000606213 CHIC2Q9UKJ5 165 aa36.12■■■■□ 3.37
PTPRN-219ENST00000606213 CROCC2H7BZ55 1655 aa36.12■■■■□ 3.37
PTPRN-219ENST00000606213 KIF15Q9NS87 1388 aa36.12■■■■□ 3.37
PTPRN-219ENST00000606213 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP36.11■■■■□ 3.37
PTPRN-219ENST00000606213 DUOX2Q9NRD8 1548 aa36.1■■■■□ 3.37
PTPRN-219ENST00000606213 KDM5DQ9BY66 1539 aa36.08■■■■□ 3.37
PTPRN-219ENST00000606213 FAM135AQ9P2D6 1515 aa36.08■■■■□ 3.37
PTPRN-219ENST00000606213 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa36.07■■■■□ 3.36
PTPRN-219ENST00000606213 PTPRKQ15262 1439 aa36.05■■■■□ 3.36
PTPRN-219ENST00000606213 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP36.05■■■■□ 3.36
PTPRN-219ENST00000606213 ERBINQ96RT1 1412 aa36■■■■□ 3.35
PTPRN-219ENST00000606213 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP35.99■■■■□ 3.35
PTPRN-219ENST00000606213 DMRT2Q9Y5R5 561 aa35.97■■■■□ 3.35
PTPRN-219ENST00000606213 PZPP20742 1482 aa35.94■■■■□ 3.34
PTPRN-219ENST00000606213 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP35.94■■■■□ 3.34
PTPRN-219ENST00000606213 NCOA1Q15788 1441 aa35.93■■■■□ 3.34
PTPRN-219ENST00000606213 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP35.93■■■■□ 3.34
PTPRN-219ENST00000606213 MYO3AQ8NEV4 1616 aa35.9■■■■□ 3.34
PTPRN-219ENST00000606213 TNRQ92752 1358 aa35.9■■■■□ 3.34
PTPRN-219ENST00000606213 ABCC3O15438 1527 aa35.89■■■■□ 3.34
PTPRN-219ENST00000606213 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP35.89■■■■□ 3.34
PTPRN-219ENST00000606213 KANK1Q14678 1352 aa35.89■■■■□ 3.34
PTPRN-219ENST00000606213 ADGRL2O95490 1459 aa35.87■■■■□ 3.33
PTPRN-219ENST00000606213 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP35.85■■■■□ 3.33
PTPRN-219ENST00000606213 MROH1Q8NDA8 1641 aa35.85■■■■□ 3.33
PTPRN-219ENST00000606213 ITGAEP38570 1179 aa35.84■■■■□ 3.33
PTPRN-219ENST00000606213 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa35.83■■■■□ 3.33
PTPRN-219ENST00000606213 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP35.81■■■■□ 3.32
PTPRN-219ENST00000606213 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP35.81■■■■□ 3.32
PTPRN-219ENST00000606213 STRCQ7RTU9 1775 aa35.81■■■■□ 3.32
PTPRN-219ENST00000606213 A2ML1A8K2U0 1454 aa35.8■■■■□ 3.32
PTPRN-219ENST00000606213 CEP152O94986 1710 aa35.78■■■■□ 3.32
PTPRN-219ENST00000606213 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa35.77■■■■□ 3.32
PTPRN-219ENST00000606213 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP35.76■■■■□ 3.31
PTPRN-219ENST00000606213 DEPDC5O75140 1603 aa35.74■■■■□ 3.31
PTPRN-219ENST00000606213 FBXO41Q8TF61 875 aa35.73■■■■□ 3.31
PTPRN-219ENST00000606213 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa35.73■■■■□ 3.31
PTPRN-219ENST00000606213 PTPRTO14522 1441 aa35.73■■■■□ 3.31
PTPRN-219ENST00000606213 NLRP1Q9C000 1473 aa35.73■■■■□ 3.31
PTPRN-219ENST00000606213 PKD2Q13563 968 aa35.72■■■■□ 3.31
PTPRN-219ENST00000606213 ROCK1Q13464 1354 aa35.71■■■■□ 3.31
PTPRN-219ENST00000606213 PLA2R1Q13018 1463 aa35.71■■■■□ 3.31
PTPRN-219ENST00000606213 ERVK-7P63135 1459 aa35.7■■■■□ 3.31
PTPRN-219ENST00000606213 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP35.69■■■■□ 3.3
PTPRN-219ENST00000606213 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa35.68■■■■□ 3.3
PTPRN-219ENST00000606213 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa35.67■■■■□ 3.3
PTPRN-219ENST00000606213 UGGT1Q9NYU2 1555 aa35.64■■■■□ 3.3
PTPRN-219ENST00000606213 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP35.62■■■■□ 3.29
PTPRN-219ENST00000606213 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP35.62■■■■□ 3.29
PTPRN-219ENST00000606213 CERKQ8TCT0 537 aa35.6■■■■□ 3.29
PTPRN-219ENST00000606213 LMTK2Q8IWU2 1503 aa35.6■■■■□ 3.29
PTPRN-219ENST00000606213 VWDEQ8N2E2 1590 aa35.59■■■■□ 3.29
PTPRN-219ENST00000606213 ANKLE2Q86XL3 938 aa35.58■■■■□ 3.29
PTPRN-219ENST00000606213 STAG3Q9UJ98 1225 aa35.52■■■■□ 3.28
PTPRN-219ENST00000606213 EFCAB6Q5THR3 1501 aa35.51■■■■□ 3.27
PTPRN-219ENST00000606213 UNC13BO14795 1591 aa35.47■■■■□ 3.27
PTPRN-219ENST00000606213 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP35.46■■■■□ 3.27
PTPRN-219ENST00000606213 NUP155O75694 1391 aa35.45■■■■□ 3.27
PTPRN-219ENST00000606213 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP35.43■■■■□ 3.26
PTPRN-219ENST00000606213 TET3O43151 1660 aa35.42■■■■□ 3.26
PTPRN-219ENST00000606213 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP35.41■■■■□ 3.26
PTPRN-219ENST00000606213 IDI1Q13907 227 aa35.4■■■■□ 3.26
PTPRN-219ENST00000606213 UBR1Q8IWV7 1749 aa35.4■■■■□ 3.26
PTPRN-219ENST00000606213 SLC52A1Q9NWF4 448 aa35.39■■■■□ 3.26
PTPRN-219ENST00000606213 NOS1P29475 1434 aa35.39■■■■□ 3.26
PTPRN-219ENST00000606213 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP35.38■■■■□ 3.25
PTPRN-219ENST00000606213 NEURL4Q96JN8 1562 aa35.38■■■■□ 3.25
PTPRN-219ENST00000606213 EID1Q9Y6B2 187 aa35.37■■■■□ 3.25
PTPRN-219ENST00000606213 PIK3C2BO00750 1634 aa35.35■■■■□ 3.25
PTPRN-219ENST00000606213 GCC2Q8IWJ2 1684 aa35.35■■■■□ 3.25
PTPRN-219ENST00000606213 LTBP4Q8N2S1 1624 aa35.35■■■■□ 3.25
PTPRN-219ENST00000606213 SYNMO15061 1565 aa35.34■■■■□ 3.25
PTPRN-219ENST00000606213 TXNDC2Q86VQ3 553 aa35.34■■■■□ 3.25
PTPRN-219ENST00000606213 IQGAP3Q86VI3 1631 aa35.34■■■■□ 3.25
PTPRN-219ENST00000606213 MED14O60244 1454 aa35.33■■■■□ 3.25
PTPRN-219ENST00000606213 NAIPQ13075 1403 aa35.31■■■■□ 3.24
PTPRN-219ENST00000606213 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP35.3■■■■□ 3.24
PTPRN-219ENST00000606213 SLIT1O75093 1534 aa35.27■■■■□ 3.24
PTPRN-219ENST00000606213 TMEM2Q9UHN6 1383 aa35.27■■■■□ 3.24
PTPRN-219ENST00000606213 IQGAP1P46940 1657 aa35.27■■■■□ 3.24
PTPRN-219ENST00000606213 ARHGAP23Q9P227 1491 aa35.26■■■■□ 3.23
PTPRN-219ENST00000606213 LTKP29376 864 aa35.25■■■■□ 3.23
PTPRN-219ENST00000606213 HFM1A2PYH4 1435 aa35.24■■■■□ 3.23
PTPRN-219ENST00000606213 E9PCH4 1651 aa35.24■■■■□ 3.23
PTPRN-219ENST00000606213 TRIM52Q96A61 297 aa35.24■■■■□ 3.23
PTPRN-219ENST00000606213 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP35.24■■■■□ 3.23
PTPRN-219ENST00000606213 ADGRB3O60242 1522 aa35.23■■■■□ 3.23
PTPRN-219ENST00000606213 CHGAP10645 457 aaKnown RBP35.23■■■■□ 3.23
PTPRN-219ENST00000606213 IQSEC2Q5JU85 1478 aa35.22■■■■□ 3.23
PTPRN-219ENST00000606213 HDGFP51858 240 aaKnown RBP35.17■■■■□ 3.22
PTPRN-219ENST00000606213 BCANQ96GW7 911 aa35.16■■■■□ 3.22
PTPRN-219ENST00000606213 CPS1P31327 1500 aa35.16■■■■□ 3.22
PTPRN-219ENST00000606213 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP35.13■■■■□ 3.21
PTPRN-219ENST00000606213 UBAP1LF5GYI3 381 aa35.09■■■■□ 3.21
PTPRN-219ENST00000606213 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP35.06■■■■□ 3.2
PTPRN-219ENST00000606213 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa35.06■■■■□ 3.2
PTPRN-219ENST00000606213 RIMS2Q9UQ26 1411 aa35.06■■■■□ 3.2
PTPRN-219ENST00000606213 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP35.05■■■■□ 3.2
PTPRN-219ENST00000606213 SLC26A8Q96RN1 970 aa35.03■■■■□ 3.2
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