RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000595594.1

FCHO1-210, Transcript of FCH domain only 1, humanhuman

TSL 3

Gene FCHO1, Length 898 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FCHO1-210ENST00000595594 TSPY4P0CV99 314 aa29.23■■■□□ 2.27
FCHO1-210ENST00000595594 TSPY10P0CW01 314 aa29.23■■■□□ 2.27
FCHO1-210ENST00000595594 PLA2R1Q13018 1463 aa29.22■■■□□ 2.27
FCHO1-210ENST00000595594 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP29.21■■■□□ 2.27
FCHO1-210ENST00000595594 A2ML1A8K2U0 1454 aa29.21■■■□□ 2.27
FCHO1-210ENST00000595594 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa29.2■■■□□ 2.27
FCHO1-210ENST00000595594 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP29.2■■■□□ 2.26
FCHO1-210ENST00000595594 TNRQ92752 1358 aa29.19■■■□□ 2.26
FCHO1-210ENST00000595594 PZPP20742 1482 aa29.18■■■□□ 2.26
FCHO1-210ENST00000595594 MAP3K1Q13233 1512 aa29.18■■■□□ 2.26
FCHO1-210ENST00000595594 MAST1Q9Y2H9 1570 aa29.18■■■□□ 2.26
FCHO1-210ENST00000595594 PKD2Q13563 968 aa29.17■■■□□ 2.26
FCHO1-210ENST00000595594 MYOM3Q5VTT5 1437 aa29.17■■■□□ 2.26
FCHO1-210ENST00000595594 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP29.16■■■□□ 2.26
FCHO1-210ENST00000595594 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP29.14■■■□□ 2.26
FCHO1-210ENST00000595594 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP29.13■■■□□ 2.25
FCHO1-210ENST00000595594 FAM135AQ9P2D6 1515 aa29.13■■■□□ 2.25
FCHO1-210ENST00000595594 CEP152O94986 1710 aa29.11■■■□□ 2.25
FCHO1-210ENST00000595594 MIA2Q96PC5 1412 aa29.1■■■□□ 2.25
FCHO1-210ENST00000595594 NEURL4Q96JN8 1562 aa29.09■■■□□ 2.25
FCHO1-210ENST00000595594 IQSEC2Q5JU85 1478 aa29.09■■■□□ 2.25
FCHO1-210ENST00000595594 ABCC3O15438 1527 aa29.09■■■□□ 2.25
FCHO1-210ENST00000595594 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP29.08■■■□□ 2.25
FCHO1-210ENST00000595594 MROH1Q8NDA8 1641 aa29.07■■■□□ 2.24
FCHO1-210ENST00000595594 CROCC2H7BZ55 1655 aa29.06■■■□□ 2.24
FCHO1-210ENST00000595594 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP29.05■■■□□ 2.24
FCHO1-210ENST00000595594 PTPN23Q9H3S7 1636 aa29.05■■■□□ 2.24
FCHO1-210ENST00000595594 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP29.05■■■□□ 2.24
FCHO1-210ENST00000595594 UGGT1Q9NYU2 1555 aa29.02■■■□□ 2.24
FCHO1-210ENST00000595594 APLP2Q06481 763 aa29.02■■■□□ 2.24
FCHO1-210ENST00000595594 UBAP1LF5GYI3 381 aa29.01■■■□□ 2.23
FCHO1-210ENST00000595594 DISP3Q9P2K9 1392 aa29.01■■■□□ 2.23
FCHO1-210ENST00000595594 NLRP1Q9C000 1473 aa29■■■□□ 2.23
FCHO1-210ENST00000595594 DUOX2Q9NRD8 1548 aa28.99■■■□□ 2.23
FCHO1-210ENST00000595594 ABCC5O15440 1437 aa28.99■■■□□ 2.23
FCHO1-210ENST00000595594 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa28.97■■■□□ 2.23
FCHO1-210ENST00000595594 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa28.97■■■□□ 2.23
FCHO1-210ENST00000595594 ERVK-7P63135 1459 aa28.97■■■□□ 2.23
FCHO1-210ENST00000595594 KIF15Q9NS87 1388 aa28.96■■■□□ 2.23
FCHO1-210ENST00000595594 ANKLE2Q86XL3 938 aa28.95■■■□□ 2.22
FCHO1-210ENST00000595594 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP28.95■■■□□ 2.22
FCHO1-210ENST00000595594 DAPK1P53355 1430 aa28.93■■■□□ 2.22
FCHO1-210ENST00000595594 SHANK2Q9UPX8 1470 aa28.92■■■□□ 2.22
FCHO1-210ENST00000595594 FGD6Q6ZV73 1430 aa28.92■■■□□ 2.22
FCHO1-210ENST00000595594 DEPDC5O75140 1603 aa28.91■■■□□ 2.22
FCHO1-210ENST00000595594 IQGAP1P46940 1657 aa28.9■■■□□ 2.22
FCHO1-210ENST00000595594 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP28.9■■■□□ 2.22
FCHO1-210ENST00000595594 ILDR2Q71H61 639 aa28.9■■■□□ 2.22
FCHO1-210ENST00000595594 VWDEQ8N2E2 1590 aa28.9■■■□□ 2.22
FCHO1-210ENST00000595594 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP28.9■■■□□ 2.22
FCHO1-210ENST00000595594 CHIC2Q9UKJ5 165 aa28.9■■■□□ 2.22
FCHO1-210ENST00000595594 UBR1Q8IWV7 1749 aa28.89■■■□□ 2.22
FCHO1-210ENST00000595594 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP28.89■■■□□ 2.21
FCHO1-210ENST00000595594 ERBINQ96RT1 1412 aa28.86■■■□□ 2.21
FCHO1-210ENST00000595594 STRCP1A6NGW2 1772 aa28.85■■■□□ 2.21
FCHO1-210ENST00000595594 CPS1P31327 1500 aa28.85■■■□□ 2.21
FCHO1-210ENST00000595594 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP28.85■■■□□ 2.21
FCHO1-210ENST00000595594 MED14O60244 1454 aa28.85■■■□□ 2.21
FCHO1-210ENST00000595594 PIP4K2BP78356 416 aa28.83■■■□□ 2.21
FCHO1-210ENST00000595594 PIK3C2BO00750 1634 aa28.78■■■□□ 2.2
FCHO1-210ENST00000595594 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa28.76■■■□□ 2.2
FCHO1-210ENST00000595594 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa28.76■■■□□ 2.19
FCHO1-210ENST00000595594 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP28.75■■■□□ 2.19
FCHO1-210ENST00000595594 KANK1Q14678 1352 aa28.74■■■□□ 2.19
FCHO1-210ENST00000595594 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP28.72■■■□□ 2.19
FCHO1-210ENST00000595594 LTKP29376 864 aa28.72■■■□□ 2.19
FCHO1-210ENST00000595594 HSPA1LP34931 641 aa28.72■■■□□ 2.19
FCHO1-210ENST00000595594 TOM1O60784 492 aa28.71■■■□□ 2.19
FCHO1-210ENST00000595594 ALKQ9UM73 1620 aa28.71■■■□□ 2.19
FCHO1-210ENST00000595594 TXNDC2Q86VQ3 553 aa28.69■■■□□ 2.18
FCHO1-210ENST00000595594 ARHGAP23Q9P227 1491 aa28.69■■■□□ 2.18
FCHO1-210ENST00000595594 SLIT1O75093 1534 aa28.69■■■□□ 2.18
FCHO1-210ENST00000595594 LRRC7Q96NW7 1537 aa28.68■■■□□ 2.18
FCHO1-210ENST00000595594 SYNMO15061 1565 aa28.67■■■□□ 2.18
FCHO1-210ENST00000595594 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP28.67■■■□□ 2.18
FCHO1-210ENST00000595594 LMTK2Q8IWU2 1503 aa28.66■■■□□ 2.18
FCHO1-210ENST00000595594 ADGRL2O95490 1459 aa28.66■■■□□ 2.18
FCHO1-210ENST00000595594 STAG3Q9UJ98 1225 aa28.65■■■□□ 2.18
FCHO1-210ENST00000595594 EFCAB6Q5THR3 1501 aa28.64■■■□□ 2.17
FCHO1-210ENST00000595594 IDI1Q13907 227 aa28.62■■■□□ 2.17
FCHO1-210ENST00000595594 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP28.62■■■□□ 2.17
FCHO1-210ENST00000595594 SOCS7O14512 581 aa28.6■■■□□ 2.17
FCHO1-210ENST00000595594 EID1Q9Y6B2 187 aa28.6■■■□□ 2.17
FCHO1-210ENST00000595594 TMEM2Q9UHN6 1383 aa28.6■■■□□ 2.17
FCHO1-210ENST00000595594 MYO5BQ9ULV0 1848 aa28.58■■■□□ 2.17
FCHO1-210ENST00000595594 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa28.58■■■□□ 2.17
FCHO1-210ENST00000595594 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP28.58■■■□□ 2.16
FCHO1-210ENST00000595594 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP28.57■■■□□ 2.16
FCHO1-210ENST00000595594 NOS1P29475 1434 aa28.55■■■□□ 2.16
FCHO1-210ENST00000595594 ADGRB3O60242 1522 aa28.54■■■□□ 2.16
FCHO1-210ENST00000595594 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP28.54■■■□□ 2.16
FCHO1-210ENST00000595594 TET3O43151 1660 aa28.51■■■□□ 2.16
FCHO1-210ENST00000595594 GCC2Q8IWJ2 1684 aa28.5■■■□□ 2.15
FCHO1-210ENST00000595594 SLC26A8Q96RN1 970 aa28.49■■■□□ 2.15
FCHO1-210ENST00000595594 UNC13BO14795 1591 aa28.47■■■□□ 2.15
FCHO1-210ENST00000595594 ITGAEP38570 1179 aa28.46■■■□□ 2.15
FCHO1-210ENST00000595594 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP28.46■■■□□ 2.15
FCHO1-210ENST00000595594 E9PCH4 1651 aa28.44■■■□□ 2.14
FCHO1-210ENST00000595594 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP28.43■■■□□ 2.14
FCHO1-210ENST00000595594 BCANQ96GW7 911 aa28.43■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 59.6 ms