RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592358.1

UBXN6-208, Transcript of UBX domain protein 6, humanhuman

TSL 2

Gene UBXN6, Length 626 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN6-208ENST00000592358 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa23.28■■□□□ 1.32
UBXN6-208ENST00000592358 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa23.28■■□□□ 1.32
UBXN6-208ENST00000592358 A2MP01023 1474 aa23.28■■□□□ 1.32
UBXN6-208ENST00000592358 CERKQ8TCT0 537 aa23.27■■□□□ 1.32
UBXN6-208ENST00000592358 TSPY4P0CV99 314 aa23.26■■□□□ 1.31
UBXN6-208ENST00000592358 TSPY10P0CW01 314 aa23.26■■□□□ 1.31
UBXN6-208ENST00000592358 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP23.26■■□□□ 1.31
UBXN6-208ENST00000592358 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa23.26■■□□□ 1.31
UBXN6-208ENST00000592358 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP23.24■■□□□ 1.31
UBXN6-208ENST00000592358 MAST1Q9Y2H9 1570 aa23.23■■□□□ 1.31
UBXN6-208ENST00000592358 CLSPNQ9HAW4 1339 aa23.21■■□□□ 1.31
UBXN6-208ENST00000592358 NCOA1Q15788 1441 aa23.21■■□□□ 1.31
UBXN6-208ENST00000592358 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP23.2■■□□□ 1.3
UBXN6-208ENST00000592358 DMRT2Q9Y5R5 561 aa23.16■■□□□ 1.3
UBXN6-208ENST00000592358 PREX1Q8TCU6 1659 aa23.16■■□□□ 1.3
UBXN6-208ENST00000592358 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP23.15■■□□□ 1.3
UBXN6-208ENST00000592358 CNTLNQ9NXG0 1405 aa23.15■■□□□ 1.3
UBXN6-208ENST00000592358 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP23.14■■□□□ 1.3
UBXN6-208ENST00000592358 C3P01024 1663 aa23.12■■□□□ 1.29
UBXN6-208ENST00000592358 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa23.11■■□□□ 1.29
UBXN6-208ENST00000592358 MROH2AA6NES4 1674 aa23.11■■□□□ 1.29
UBXN6-208ENST00000592358 KIF15Q9NS87 1388 aa23.11■■□□□ 1.29
UBXN6-208ENST00000592358 GGT6Q6P531 493 aa23.1■■□□□ 1.29
UBXN6-208ENST00000592358 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP23.09■■□□□ 1.29
UBXN6-208ENST00000592358 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa23.09■■□□□ 1.29
UBXN6-208ENST00000592358 TRIM52Q96A61 297 aa23.08■■□□□ 1.29
UBXN6-208ENST00000592358 STRCQ7RTU9 1775 aa23.07■■□□□ 1.28
UBXN6-208ENST00000592358 KIF3BO15066 747 aa23.06■■□□□ 1.28
UBXN6-208ENST00000592358 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP23.04■■□□□ 1.28
UBXN6-208ENST00000592358 DUOX2Q9NRD8 1548 aa23.04■■□□□ 1.28
UBXN6-208ENST00000592358 KDM5DQ9BY66 1539 aa23.02■■□□□ 1.28
UBXN6-208ENST00000592358 FAM135AQ9P2D6 1515 aa23.02■■□□□ 1.28
UBXN6-208ENST00000592358 PPP6R1Q9UPN7 881 aa23.01■■□□□ 1.27
UBXN6-208ENST00000592358 ZMYM3Q14202 1370 aa23.01■■□□□ 1.27
UBXN6-208ENST00000592358 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP23■■□□□ 1.27
UBXN6-208ENST00000592358 ERBINQ96RT1 1412 aa22.98■■□□□ 1.27
UBXN6-208ENST00000592358 NPATQ14207 1427 aa22.97■■□□□ 1.27
UBXN6-208ENST00000592358 PTPRTO14522 1441 aa22.95■■□□□ 1.26
UBXN6-208ENST00000592358 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
UBXN6-208ENST00000592358 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa22.94■■□□□ 1.26
UBXN6-208ENST00000592358 MPHOSPH9Q99550 1183 aa22.94■■□□□ 1.26
UBXN6-208ENST00000592358 MROH1Q8NDA8 1641 aa22.93■■□□□ 1.26
UBXN6-208ENST00000592358 UNC13BO14795 1591 aa22.93■■□□□ 1.26
UBXN6-208ENST00000592358 PZPP20742 1482 aa22.91■■□□□ 1.26
UBXN6-208ENST00000592358 MYO3AQ8NEV4 1616 aa22.9■■□□□ 1.26
UBXN6-208ENST00000592358 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa22.9■■□□□ 1.26
UBXN6-208ENST00000592358 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
UBXN6-208ENST00000592358 ABCC3O15438 1527 aa22.9■■□□□ 1.26
UBXN6-208ENST00000592358 NUP155O75694 1391 aa22.89■■□□□ 1.26
UBXN6-208ENST00000592358 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.26
UBXN6-208ENST00000592358 CEP152O94986 1710 aa22.87■■□□□ 1.25
UBXN6-208ENST00000592358 DISP3Q9P2K9 1392 aa22.87■■□□□ 1.25
UBXN6-208ENST00000592358 DEPDC5O75140 1603 aa22.86■■□□□ 1.25
UBXN6-208ENST00000592358 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP22.85■■□□□ 1.25
UBXN6-208ENST00000592358 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa22.85■■□□□ 1.25
UBXN6-208ENST00000592358 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP22.83■■□□□ 1.25
UBXN6-208ENST00000592358 IQGAP3Q86VI3 1631 aa22.82■■□□□ 1.24
UBXN6-208ENST00000592358 SIN3AQ96ST3 1273 aa22.82■■□□□ 1.24
UBXN6-208ENST00000592358 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa22.82■■□□□ 1.24
UBXN6-208ENST00000592358 LTBP4Q8N2S1 1624 aa22.82■■□□□ 1.24
UBXN6-208ENST00000592358 KANK1Q14678 1352 aa22.81■■□□□ 1.24
UBXN6-208ENST00000592358 TNRQ92752 1358 aa22.81■■□□□ 1.24
UBXN6-208ENST00000592358 NEUROD1Q13562 356 aa22.81■■□□□ 1.24
UBXN6-208ENST00000592358 ILDR2Q71H61 639 aa22.81■■□□□ 1.24
UBXN6-208ENST00000592358 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP22.8■■□□□ 1.24
UBXN6-208ENST00000592358 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP22.79■■□□□ 1.24
UBXN6-208ENST00000592358 PKD2Q13563 968 aa22.78■■□□□ 1.24
UBXN6-208ENST00000592358 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP22.78■■□□□ 1.24
UBXN6-208ENST00000592358 A2ML1A8K2U0 1454 aa22.77■■□□□ 1.24
UBXN6-208ENST00000592358 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa22.76■■□□□ 1.23
UBXN6-208ENST00000592358 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa22.76■■□□□ 1.23
UBXN6-208ENST00000592358 ERVK-7P63135 1459 aa22.75■■□□□ 1.23
UBXN6-208ENST00000592358 FOXD1Q16676 465 aa22.75■■□□□ 1.23
UBXN6-208ENST00000592358 VWDEQ8N2E2 1590 aa22.75■■□□□ 1.23
UBXN6-208ENST00000592358 TONSLQ96HA7 1378 aa22.75■■□□□ 1.23
UBXN6-208ENST00000592358 LMTK2Q8IWU2 1503 aa22.73■■□□□ 1.23
UBXN6-208ENST00000592358 UBAP1LF5GYI3 381 aa22.73■■□□□ 1.23
UBXN6-208ENST00000592358 NLRP1Q9C000 1473 aa22.73■■□□□ 1.23
UBXN6-208ENST00000592358 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa22.72■■□□□ 1.23
UBXN6-208ENST00000592358 PLA2R1Q13018 1463 aa22.7■■□□□ 1.22
UBXN6-208ENST00000592358 EFCAB6Q5THR3 1501 aa22.7■■□□□ 1.22
UBXN6-208ENST00000592358 IQSEC2Q5JU85 1478 aa22.69■■□□□ 1.22
UBXN6-208ENST00000592358 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
UBXN6-208ENST00000592358 TET3O43151 1660 aa22.68■■□□□ 1.22
UBXN6-208ENST00000592358 SOCS7O14512 581 aa22.67■■□□□ 1.22
UBXN6-208ENST00000592358 UGGT1Q9NYU2 1555 aa22.67■■□□□ 1.22
UBXN6-208ENST00000592358 E9PCH4 1651 aa22.62■■□□□ 1.21
UBXN6-208ENST00000592358 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP22.61■■□□□ 1.21
UBXN6-208ENST00000592358 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP22.6■■□□□ 1.21
UBXN6-208ENST00000592358 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP22.59■■□□□ 1.21
UBXN6-208ENST00000592358 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP22.59■■□□□ 1.21
UBXN6-208ENST00000592358 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.21
UBXN6-208ENST00000592358 ANKLE2Q86XL3 938 aa22.58■■□□□ 1.21
UBXN6-208ENST00000592358 SYNMO15061 1565 aa22.58■■□□□ 1.2
UBXN6-208ENST00000592358 UBR1Q8IWV7 1749 aa22.57■■□□□ 1.2
UBXN6-208ENST00000592358 CCDC144AA2RUR9 1427 aa22.57■■□□□ 1.2
UBXN6-208ENST00000592358 PIP4K2BP78356 416 aa22.56■■□□□ 1.2
UBXN6-208ENST00000592358 PIK3C2BO00750 1634 aa22.56■■□□□ 1.2
UBXN6-208ENST00000592358 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa22.55■■□□□ 1.2
UBXN6-208ENST00000592358 NOS1P29475 1434 aa22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.8 ms